Doublet Group distance statistics: 54107

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 1, 1, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.018, 0.032, 0.046, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.032 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.012, 0.029, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.014, 0.034, 0.053, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.020
OP2	B	0, 0.301, 0.558, 0.815, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.558 std_dev=0.257
OP1	B	0, 0.208, 0.495, 0.781, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.495 std_dev=0.287
P	B	0, 0.176, 0.465, 0.755, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.465 std_dev=0.289
O5'	B	0, 0.034, 0.608, 1.183, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.608 std_dev=0.574
O4'	A	0, -0.158, 0.486, 1.129, 2.548 max_d=2.548 avg_d=0.486 std_dev=0.643
C2'	A	0, -0.186, 0.473, 1.133, 2.620 max_d=2.620 avg_d=0.473 std_dev=0.659
O3'	A	0, 0.037, 0.833, 1.628, 3.007 max_d=3.007 avg_d=0.833 std_dev=0.795
C3'	A	0, -0.119, 0.692, 1.503, 3.190 max_d=3.190 avg_d=0.692 std_dev=0.811
C4'	A	0, -0.132, 0.689, 1.509, 3.241 max_d=3.241 avg_d=0.689 std_dev=0.820
C5'	B	0, 0.125, 0.983, 1.841, 3.311 max_d=3.311 avg_d=0.983 std_dev=0.858
O2'	A	0, -0.410, 0.569, 1.547, 3.878 max_d=3.878 avg_d=0.569 std_dev=0.979
C4'	B	0, -0.027, 1.335, 2.697, 5.267 max_d=5.267 avg_d=1.335 std_dev=1.362
O3'	B	0, 0.162, 1.586, 3.009, 6.022 max_d=6.022 avg_d=1.586 std_dev=1.424
O5'	A	0, -0.075, 1.371, 2.818, 5.588 max_d=5.588 avg_d=1.371 std_dev=1.446
C5'	A	0, -0.249, 1.233, 2.715, 5.861 max_d=5.861 avg_d=1.233 std_dev=1.482
C3'	B	0, 0.022, 1.747, 3.472, 6.610 max_d=6.610 avg_d=1.747 std_dev=1.725
O4'	B	0, -0.347, 1.388, 3.124, 6.935 max_d=6.935 avg_d=1.388 std_dev=1.736
P	A	0, -0.171, 1.804, 3.780, 7.637 max_d=7.637 avg_d=1.804 std_dev=1.975
OP1	A	0, -0.002, 1.998, 3.999, 7.574 max_d=7.574 avg_d=1.998 std_dev=2.001
OP2	A	0, -0.276, 1.765, 3.805, 8.015 max_d=8.015 avg_d=1.765 std_dev=2.040
C1'	B	0, -0.411, 1.918, 4.246, 9.203 max_d=9.203 avg_d=1.918 std_dev=2.328
C2'	B	0, -0.037, 2.370, 4.777, 9.326 max_d=9.326 avg_d=2.370 std_dev=2.407
N9	B	0, -0.757, 1.956, 4.668, 10.831 max_d=10.831 avg_d=1.956 std_dev=2.713
C8	B	0, -0.845, 1.959, 4.763, 11.268 max_d=11.268 avg_d=1.959 std_dev=2.804
O2'	B	0, 0.351, 3.206, 6.061, 10.763 max_d=10.763 avg_d=3.206 std_dev=2.855
C4	B	0, -0.916, 2.279, 5.474, 12.729 max_d=12.729 avg_d=2.279 std_dev=3.195
N7	B	0, -1.209, 2.078, 5.364, 13.181 max_d=13.181 avg_d=2.078 std_dev=3.287
N3	B	0, -0.668, 2.756, 6.180, 13.507 max_d=13.507 avg_d=2.756 std_dev=3.424
C5	B	0, -1.268, 2.234, 5.736, 14.017 max_d=14.017 avg_d=2.234 std_dev=3.502
C2	B	0, -0.753, 3.178, 7.109, 15.558 max_d=15.558 avg_d=3.178 std_dev=3.931
C6	B	0, -1.450, 2.600, 6.651, 16.234 max_d=16.234 avg_d=2.600 std_dev=4.050
N1	B	0, -1.112, 3.085, 7.281, 16.786 max_d=16.786 avg_d=3.085 std_dev=4.196
N2	B	0, -0.505, 3.803, 8.111, 16.823 max_d=16.823 avg_d=3.803 std_dev=4.308
O6	B	0, -1.819, 2.636, 7.090, 17.818 max_d=17.818 avg_d=2.636 std_dev=4.454

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.16	0.11	0.10	0.14
C2	0.03	0.00	0.26	0.58	0.00	0.48	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.40	0.26	0.63	0.64	0.42	0.57
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.12	0.01	0.05	0.10	0.10	0.15	0.19	0.26	0.07	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.39	0.34	0.24	0.33
C3'	0.00	0.58	0.00	0.00	0.33	0.00	0.24	0.01	0.35	0.10	0.49	0.55	0.30	0.06	0.09	0.02	0.00	0.01	0.25	0.31	0.11	0.15
C4	0.02	0.00	0.12	0.33	0.00	0.24	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.19	0.16	0.13	0.21	0.21	0.29	0.22
C4'	0.00	0.48	0.01	0.00	0.24	0.00	0.13	0.00	0.23	0.18	0.38	0.46	0.17	0.09	0.03	0.15	0.02	0.00	0.01	0.09	0.34	0.09
C5	0.01	0.00	0.05	0.24	0.00	0.13	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.13	0.05	0.18	0.17	0.59	0.37
C5'	0.04	0.77	0.10	0.01	0.32	0.00	0.17	0.00	0.34	0.35	0.61	0.70	0.24	0.22	0.06	0.06	0.11	0.01	0.01	0.21	0.22	0.01
C6	0.02	0.00	0.10	0.35	0.00	0.23	0.00	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.23	0.10	0.23	0.23	0.52	0.32
C8	0.01	0.00	0.15	0.10	0.00	0.18	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.15	0.15	0.58	0.53	0.94	0.78
N1	0.02	0.00	0.19	0.49	0.00	0.38	0.00	0.61	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.34	0.20	0.47	0.48	0.37	0.42
N3	0.03	0.00	0.26	0.55	0.00	0.46	0.00	0.70	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.33	0.27	0.55	0.55	0.37	0.49
N6	0.01	0.01	0.07	0.30	0.01	0.17	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.20	0.06	0.20	0.20	0.70	0.41
N7	0.01	0.00	0.09	0.06	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.09	0.09	0.46	0.46	0.98	0.73
N9	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.05	0.01	0.23	0.18	0.42	0.34
O2'	0.01	0.27	0.00	0.02	0.19	0.15	0.18	0.06	0.22	0.11	0.26	0.25	0.21	0.14	0.11	0.00	0.02	0.10	0.21	0.15	0.11	0.10
O3'	0.13	0.40	0.01	0.00	0.16	0.02	0.13	0.11	0.23	0.15	0.34	0.33	0.20	0.09	0.05	0.02	0.00	0.09	0.09	0.17	0.44	0.13
O4'	0.00	0.26	0.01	0.01	0.13	0.00	0.05	0.01	0.10	0.15	0.20	0.27	0.06	0.09	0.01	0.10	0.09	0.00	0.06	0.16	0.17	0.07
O5'	0.16	0.63	0.39	0.25	0.21	0.01	0.18	0.01	0.23	0.58	0.47	0.55	0.20	0.46	0.23	0.21	0.09	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.11	0.64	0.34	0.31	0.21	0.09	0.17	0.21	0.23	0.53	0.48	0.55	0.20	0.46	0.18	0.15	0.17	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.42	0.24	0.11	0.29	0.34	0.59	0.22	0.52	0.94	0.37	0.37	0.70	0.98	0.42	0.11	0.44	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.57	0.33	0.15	0.22	0.09	0.37	0.01	0.32	0.78	0.42	0.49	0.41	0.73	0.34	0.10	0.13	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	1.40	2.61	1.26	0.85	2.29	0.77	2.68	0.59	3.05	2.08	2.96	2.59	2.26	2.58	1.91	1.09	0.55	1.18	0.46	3.37	0.18	0.14	0.21
C2	1.69	3.00	1.49	1.11	2.55	1.01	2.73	0.64	3.09	1.96	3.19	3.05	2.68	2.37	2.07	1.46	0.93	1.40	0.45	3.20	0.14	0.16	0.17
C2'	1.50	2.84	1.37	0.94	2.49	0.80	2.93	0.61	3.36	2.25	3.25	2.81	2.45	2.80	2.06	1.21	0.63	1.22	0.43	3.75	0.16	0.18	0.15
C3'	1.70	3.20	1.52	1.07	2.76	0.95	3.20	0.73	3.69	2.44	3.63	3.21	2.76	3.01	2.27	1.37	0.75	1.41	0.58	4.11	0.19	0.12	0.23
C4	1.45	2.59	1.27	0.90	2.28	0.84	2.58	0.59	2.89	1.99	2.85	2.59	2.29	2.43	1.90	1.13	0.65	1.24	0.46	3.10	0.14	0.13	0.19
C4'	1.47	2.91	1.25	0.82	2.48	0.76	2.89	0.56	3.36	2.19	3.31	2.93	2.48	2.73	2.02	1.07	0.49	1.23	0.46	3.75	0.17	0.15	0.17
C5	1.34	2.28	1.16	0.82	2.06	0.78	2.31	0.57	2.54	1.86	2.49	2.26	2.04	2.23	1.75	0.99	0.56	1.17	0.46	2.70	0.15	0.14	0.19
C5'	1.35	2.86	1.08	0.66	2.39	0.64	2.80	0.44	3.30	2.07	3.26	2.90	2.41	2.62	1.91	0.87	0.34	1.13	0.38	3.68	0.15	0.24	0.13
C6	1.42	2.30	1.22	0.91	2.06	0.88	2.21	0.60	2.41	1.73	2.43	2.32	2.11	2.04	1.75	1.10	0.69	1.26	0.46	2.48	0.15	0.16	0.18
C8	1.20	2.12	1.09	0.71	1.95	0.65	2.30	0.56	2.54	1.92	2.41	2.06	1.87	2.33	1.67	0.88	0.37	1.03	0.46	2.80	0.21	0.16	0.22
N1	1.63	2.72	1.42	1.08	2.36	1.01	2.45	0.63	2.71	1.80	2.82	2.76	2.49	2.12	1.95	1.38	0.90	1.39	0.45	2.74	0.16	0.18	0.17
N3	1.61	2.92	1.42	1.03	2.50	0.94	2.77	0.62	3.16	2.04	3.18	2.96	2.58	2.50	2.04	1.34	0.82	1.34	0.46	3.37	0.12	0.14	0.18
N6	1.27	1.92	1.08	0.82	1.74	0.83	1.82	0.58	1.95	1.48	1.99	1.93	1.79	1.69	1.51	0.95	0.62	1.18	0.47	1.98	0.19	0.18	0.18
N7	1.16	1.97	1.04	0.68	1.83	0.64	2.14	0.55	2.32	1.82	2.21	1.91	1.75	2.17	1.59	0.82	0.36	1.01	0.46	2.52	0.21	0.16	0.21
N9	1.36	2.46	1.21	0.82	2.19	0.75	2.54	0.58	2.85	2.01	2.76	2.43	2.15	2.47	1.84	1.02	0.52	1.16	0.46	3.13	0.17	0.14	0.20
O2'	1.28	2.57	1.20	0.81	2.23	0.65	2.66	0.46	3.09	2.01	2.98	2.55	2.19	2.55	1.81	1.07	0.53	1.01	0.26	3.49	0.27	0.30	0.18
O3'	1.72	3.32	1.57	1.09	2.82	0.93	3.27	0.69	3.82	2.45	3.77	3.36	2.84	3.05	2.31	1.46	0.79	1.39	0.52	4.26	0.15	0.12	0.18
O4'	1.36	2.63	1.15	0.75	2.27	0.71	2.65	0.53	3.05	2.03	2.99	2.64	2.27	2.52	1.86	0.96	0.44	1.15	0.44	3.39	0.19	0.15	0.19
O5'	0.91	2.33	0.63	0.33	1.89	0.35	2.30	0.21	2.76	1.63	2.72	2.38	1.91	2.15	1.45	0.40	0.27	0.75	0.15	3.14	0.28	0.48	0.30
OP1	0.66	1.99	0.34	0.29	1.60	0.32	2.02	0.24	2.46	1.41	2.39	2.02	1.58	1.92	1.19	0.16	0.53	0.58	0.20	2.86	0.31	0.61	0.39
OP2	0.30	1.53	0.33	0.74	1.09	0.78	1.55	0.79	2.05	0.87	1.97	1.57	1.09	1.44	0.64	0.60	1.11	0.43	0.81	2.50	1.08	1.45	1.16
P	0.48	1.90	0.17	0.37	1.46	0.39	1.89	0.39	2.37	1.23	2.31	1.94	1.46	1.77	1.01	0.21	0.71	0.40	0.38	2.78	0.63	0.94	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.32	0.01	0.17	0.02	0.18	0.28	0.11
C2	0.02	0.00	0.33	0.28	0.01	0.11	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.51	0.18	0.33	0.01	0.58	0.09	0.27
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.18	0.02	0.12	0.20	0.18	0.12	0.27	0.38	0.31	0.06	0.04	0.00	0.08	0.02	0.23	0.15	0.19	0.41	0.21
C3'	0.02	0.28	0.01	0.00	0.20	0.01	0.22	0.02	0.26	0.14	0.28	0.30	0.24	0.18	0.12	0.03	0.01	0.02	0.03	0.26	0.09	0.35	0.15
C4	0.01	0.01	0.18	0.20	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.35	0.10	0.32	0.01	0.51	0.20	0.28
C4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.10	0.08	0.14	0.10	0.08	0.03	0.15	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.28	0.12
C5	0.01	0.01	0.12	0.22	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.27	0.06	0.40	0.01	0.67	0.30	0.41
C5'	0.08	0.08	0.20	0.02	0.09	0.00	0.14	0.00	0.11	0.25	0.07	0.12	0.08	0.23	0.14	0.08	0.23	0.01	0.01	0.13	0.03	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.18	0.26	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.34	0.10	0.40	0.00	0.73	0.27	0.42
C8	0.01	0.01	0.12	0.14	0.00	0.10	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.08	0.09	0.50	0.01	0.65	0.45	0.50
N1	0.02	0.00	0.27	0.28	0.01	0.08	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.45	0.15	0.36	0.01	0.68	0.14	0.35
N2	0.03	0.00	0.38	0.30	0.01	0.14	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.36	0.58	0.21	0.36	0.01	0.59	0.15	0.28
N3	0.02	0.00	0.31	0.24	0.00	0.10	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.25	0.48	0.17	0.30	0.01	0.48	0.12	0.21
N7	0.01	0.01	0.06	0.18	0.00	0.08	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.13	0.04	0.50	0.01	0.76	0.45	0.54
N9	0.00	0.01	0.04	0.12	0.00	0.03	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.23	0.01	0.32	0.01	0.43	0.28	0.29
O2'	0.02	0.25	0.00	0.03	0.11	0.15	0.16	0.08	0.15	0.28	0.18	0.36	0.25	0.26	0.13	0.00	0.10	0.08	0.11	0.17	0.21	0.65	0.31
O3'	0.32	0.51	0.08	0.01	0.35	0.02	0.27	0.23	0.34	0.08	0.45	0.58	0.48	0.13	0.23	0.10	0.00	0.22	0.20	0.31	0.35	0.59	0.43
O4'	0.01	0.18	0.02	0.02	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.09	0.15	0.21	0.17	0.04	0.01	0.08	0.22	0.00	0.12	0.08	0.16	0.21	0.08
O5'	0.17	0.33	0.23	0.03	0.32	0.01	0.40	0.01	0.40	0.50	0.36	0.36	0.30	0.50	0.32	0.11	0.20	0.12	0.00	0.44	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.15	0.26	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.31	0.08	0.44	0.00	0.83	0.34	0.50
OP1	0.18	0.58	0.19	0.09	0.51	0.06	0.67	0.03	0.73	0.65	0.68	0.59	0.48	0.76	0.43	0.21	0.35	0.16	0.02	0.83	0.00	0.00	0.00
OP2	0.28	0.09	0.41	0.35	0.20	0.28	0.30	0.07	0.27	0.45	0.14	0.15	0.12	0.45	0.28	0.65	0.59	0.21	0.01	0.34	0.00	0.00	0.01
P	0.11	0.27	0.21	0.15	0.28	0.12	0.41	0.01	0.42	0.50	0.35	0.28	0.21	0.54	0.29	0.31	0.43	0.08	0.00	0.50	0.00	0.01	0.00