Doublet Group distance statistics: 54110

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.004, 0.023, 0.042, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.006, 0.032, 0.057, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.032 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.008, 0.037, 0.065, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.037 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.048, 0.146, 0.244, 0.263 max_d=0.263 avg_d=0.146 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.026, 0.184, 0.342, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.184 std_dev=0.158
C4'	A	0, 0.099, 0.274, 0.450, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.274 std_dev=0.175
P	B	0, 0.149, 0.388, 0.626, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.388 std_dev=0.239
OP2	B	0, 0.139, 0.378, 0.617, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.378 std_dev=0.239
C3'	A	0, 0.015, 0.270, 0.525, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.270 std_dev=0.255
OP1	B	0, 0.089, 0.346, 0.604, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.346 std_dev=0.257
O5'	B	0, 0.177, 0.494, 0.812, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.494 std_dev=0.317
O2'	A	0, 0.102, 0.421, 0.739, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.421 std_dev=0.319
C5'	A	0, 0.144, 0.498, 0.851, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.498 std_dev=0.354
O5'	A	0, 0.168, 0.536, 0.904, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.536 std_dev=0.368
C2'	B	0, 0.180, 0.558, 0.937, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.558 std_dev=0.378
C5'	B	0, 0.206, 0.620, 1.034, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.620 std_dev=0.414
N2	B	0, 0.179, 0.595, 1.011, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.595 std_dev=0.416
C2	B	0, 0.178, 0.595, 1.013, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.595 std_dev=0.418
C3'	B	0, 0.218, 0.638, 1.058, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.638 std_dev=0.420
N3	B	0, 0.175, 0.604, 1.033, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.604 std_dev=0.429
N1	B	0, 0.211, 0.649, 1.087, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.649 std_dev=0.438
C4'	B	0, 0.261, 0.704, 1.147, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.704 std_dev=0.443
C4	B	0, 0.177, 0.633, 1.089, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.633 std_dev=0.456
O3'	B	0, 0.191, 0.662, 1.132, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.662 std_dev=0.471
C6	B	0, 0.236, 0.716, 1.197, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.716 std_dev=0.481
C5	B	0, 0.206, 0.688, 1.170, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.688 std_dev=0.482
C1'	B	0, 0.176, 0.663, 1.149, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.663 std_dev=0.487
N9	B	0, 0.170, 0.660, 1.150, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.660 std_dev=0.490
O2'	B	0, 0.147, 0.644, 1.141, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.644 std_dev=0.497
O4'	B	0, 0.235, 0.763, 1.290, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.763 std_dev=0.528
C8	B	0, 0.182, 0.711, 1.240, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.711 std_dev=0.529
N7	B	0, 0.210, 0.741, 1.273, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.741 std_dev=0.532
O6	B	0, 0.283, 0.817, 1.351, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.817 std_dev=0.534
O3'	A	0, -0.075, 0.486, 1.047, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.486 std_dev=0.561
P	A	0, 0.082, 0.650, 1.218, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.650 std_dev=0.568
OP2	A	0, 0.108, 0.731, 1.354, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.731 std_dev=0.623
OP1	A	0, 0.009, 0.773, 1.536, 1.892 max_d=1.892 avg_d=0.773 std_dev=0.763

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.23	0.01	0.06	0.10	0.13	0.09
C2	0.05	0.00	0.08	0.05	0.02	0.08	0.02	0.23	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.20	0.36	0.09	0.20	0.17	0.28	0.18
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.07	0.04	0.09	0.05	0.09	0.05	0.08	0.02	0.01	0.07	0.02	0.10	0.11	0.09	0.08
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.08	0.15	0.03	0.07	0.11	0.15	0.07	0.03	0.01	0.01	0.10	0.27	0.18	0.15
C4	0.03	0.02	0.04	0.04	0.00	0.09	0.01	0.24	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.15	0.23	0.06	0.22	0.19	0.30	0.20
C4'	0.01	0.08	0.03	0.01	0.09	0.00	0.12	0.01	0.11	0.15	0.09	0.07	0.13	0.15	0.10	0.03	0.04	0.01	0.02	0.13	0.08	0.04
C5	0.03	0.02	0.04	0.09	0.01	0.12	0.00	0.30	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.19	0.15	0.05	0.29	0.26	0.37	0.28
C5'	0.06	0.23	0.07	0.02	0.24	0.01	0.30	0.00	0.31	0.29	0.28	0.20	0.34	0.33	0.22	0.05	0.07	0.02	0.01	0.07	0.08	0.02
C6	0.04	0.02	0.04	0.08	0.02	0.11	0.01	0.31	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.19	0.19	0.05	0.30	0.25	0.38	0.28
C8	0.03	0.02	0.09	0.15	0.01	0.15	0.02	0.29	0.02	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.23	0.07	0.07	0.32	0.32	0.37	0.31
N1	0.03	0.01	0.05	0.03	0.02	0.09	0.03	0.28	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.19	0.29	0.08	0.26	0.21	0.32	0.23
N3	0.05	0.01	0.09	0.07	0.01	0.07	0.02	0.20	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.19	0.36	0.08	0.17	0.15	0.26	0.16
N6	0.04	0.02	0.05	0.11	0.03	0.13	0.02	0.34	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.21	0.13	0.05	0.33	0.30	0.44	0.33
N7	0.02	0.02	0.08	0.15	0.01	0.15	0.00	0.33	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.24	0.07	0.06	0.34	0.32	0.42	0.34
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.02	0.22	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.13	0.14	0.03	0.21	0.21	0.27	0.21
O2'	0.01	0.20	0.01	0.03	0.15	0.03	0.19	0.05	0.19	0.23	0.19	0.19	0.21	0.24	0.13	0.00	0.09	0.07	0.13	0.12	0.15	0.11
O3'	0.23	0.36	0.07	0.01	0.23	0.04	0.15	0.07	0.19	0.07	0.29	0.36	0.13	0.07	0.14	0.09	0.00	0.12	0.15	0.49	0.32	0.30
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.05	0.07	0.08	0.08	0.05	0.06	0.03	0.07	0.12	0.00	0.10	0.07	0.13	0.12
O5'	0.06	0.20	0.10	0.10	0.22	0.02	0.29	0.01	0.30	0.32	0.26	0.17	0.33	0.34	0.21	0.13	0.15	0.10	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.10	0.17	0.11	0.27	0.19	0.13	0.26	0.07	0.25	0.32	0.21	0.15	0.30	0.32	0.21	0.12	0.49	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.13	0.28	0.09	0.18	0.30	0.08	0.37	0.08	0.38	0.37	0.32	0.26	0.44	0.42	0.27	0.15	0.32	0.13	0.03	0.03	0.00	0.02
P	0.09	0.18	0.08	0.15	0.20	0.04	0.28	0.02	0.28	0.31	0.23	0.16	0.33	0.34	0.21	0.11	0.30	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.34	0.29	0.25	0.26	0.26	0.24	0.34	0.25	0.21	0.30	0.41	0.31	0.21	0.23	0.54	0.21	0.26	0.33	0.24	0.24	0.26	0.29
C2	0.19	0.24	0.19	0.18	0.22	0.20	0.24	0.32	0.25	0.23	0.25	0.28	0.21	0.24	0.21	0.45	0.18	0.20	0.37	0.27	0.21	0.23	0.26
C2'	0.30	0.33	0.31	0.28	0.28	0.29	0.26	0.35	0.27	0.26	0.30	0.40	0.32	0.26	0.26	0.51	0.19	0.29	0.33	0.26	0.32	0.34	0.37
C3'	0.11	0.24	0.08	0.08	0.13	0.08	0.12	0.16	0.15	0.10	0.21	0.33	0.20	0.11	0.09	0.27	0.13	0.08	0.17	0.15	0.32	0.18	0.25
C4	0.15	0.25	0.20	0.18	0.16	0.21	0.17	0.33	0.20	0.15	0.23	0.33	0.19	0.17	0.13	0.48	0.19	0.18	0.35	0.21	0.22	0.24	0.27
C4'	0.18	0.23	0.09	0.11	0.17	0.10	0.16	0.11	0.18	0.12	0.21	0.29	0.21	0.13	0.14	0.30	0.15	0.16	0.13	0.17	0.26	0.08	0.16
C5	0.11	0.20	0.15	0.18	0.10	0.20	0.14	0.32	0.18	0.14	0.21	0.28	0.13	0.16	0.10	0.39	0.21	0.17	0.35	0.21	0.23	0.24	0.27
C5'	0.13	0.13	0.12	0.09	0.14	0.11	0.14	0.09	0.15	0.12	0.13	0.14	0.15	0.13	0.12	0.14	0.16	0.14	0.13	0.15	0.42	0.16	0.22
C6	0.17	0.15	0.14	0.20	0.17	0.19	0.22	0.30	0.23	0.23	0.21	0.19	0.09	0.25	0.19	0.33	0.21	0.20	0.35	0.26	0.22	0.23	0.25
C8	0.20	0.30	0.25	0.23	0.20	0.25	0.19	0.33	0.22	0.12	0.27	0.36	0.28	0.15	0.15	0.44	0.25	0.22	0.29	0.23	0.24	0.23	0.26
N1	0.20	0.21	0.17	0.19	0.24	0.20	0.27	0.31	0.27	0.27	0.26	0.20	0.19	0.28	0.24	0.39	0.19	0.22	0.37	0.30	0.21	0.23	0.26
N3	0.18	0.25	0.20	0.18	0.19	0.21	0.20	0.33	0.21	0.18	0.24	0.32	0.20	0.20	0.17	0.49	0.18	0.18	0.36	0.23	0.21	0.24	0.27
N6	0.22	0.11	0.13	0.25	0.20	0.21	0.26	0.27	0.26	0.30	0.21	0.14	0.10	0.31	0.25	0.24	0.25	0.26	0.32	0.31	0.20	0.21	0.22
N7	0.11	0.25	0.17	0.20	0.12	0.22	0.14	0.33	0.19	0.07	0.24	0.31	0.21	0.12	0.06	0.35	0.25	0.18	0.31	0.21	0.24	0.23	0.27
N9	0.19	0.29	0.24	0.21	0.20	0.24	0.19	0.33	0.22	0.14	0.26	0.36	0.26	0.16	0.16	0.49	0.20	0.21	0.32	0.22	0.23	0.24	0.27
O2'	0.36	0.39	0.38	0.36	0.35	0.40	0.35	0.51	0.35	0.35	0.37	0.45	0.37	0.36	0.34	0.54	0.23	0.38	0.49	0.35	0.46	0.54	0.55
O3'	0.14	0.44	0.11	0.11	0.25	0.13	0.26	0.20	0.34	0.15	0.42	0.56	0.34	0.20	0.16	0.26	0.21	0.09	0.20	0.35	0.30	0.20	0.27
O4'	0.36	0.37	0.33	0.31	0.33	0.31	0.31	0.36	0.32	0.30	0.34	0.40	0.37	0.30	0.32	0.59	0.28	0.35	0.38	0.30	0.22	0.28	0.30
O5'	0.15	0.16	0.16	0.10	0.16	0.07	0.17	0.11	0.16	0.17	0.16	0.17	0.16	0.18	0.16	0.27	0.02	0.11	0.16	0.17	0.42	0.16	0.24
OP1	0.14	0.12	0.08	0.03	0.11	0.10	0.11	0.22	0.10	0.11	0.11	0.14	0.12	0.11	0.11	0.18	0.02	0.13	0.28	0.10	0.46	0.22	0.29
OP2	0.12	0.19	0.13	0.11	0.14	0.11	0.15	0.15	0.17	0.11	0.18	0.23	0.17	0.14	0.11	0.17	0.04	0.11	0.40	0.19	0.55	0.26	0.37
P	0.11	0.11	0.07	0.03	0.08	0.03	0.08	0.14	0.09	0.08	0.09	0.15	0.10	0.08	0.07	0.13	0.01	0.09	0.26	0.09	0.47	0.19	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.08	0.05	0.03	0.05	0.10	0.07	0.03	0.01	0.01	0.12	0.01	0.23	0.05	0.32	0.18	0.11
C2	0.07	0.00	0.15	0.12	0.02	0.13	0.01	0.32	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.35	0.16	0.08	0.53	0.03	0.17	0.25	0.29
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.10	0.01	0.11	0.15	0.13	0.08	0.14	0.17	0.14	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.31	0.14	0.23	0.12	0.13
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.08	0.16	0.12	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.10	0.06	0.39	0.13	0.17
C4	0.04	0.02	0.10	0.05	0.00	0.07	0.01	0.25	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.22	0.12	0.04	0.45	0.03	0.13	0.20	0.18
C4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.10	0.09	0.12	0.15	0.12	0.10	0.04	0.13	0.03	0.00	0.03	0.10	0.29	0.10	0.10
C5	0.03	0.01	0.11	0.04	0.01	0.08	0.00	0.28	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.22	0.11	0.04	0.46	0.02	0.12	0.22	0.22
C5'	0.08	0.32	0.15	0.02	0.25	0.01	0.28	0.00	0.31	0.22	0.33	0.34	0.28	0.26	0.18	0.03	0.13	0.02	0.01	0.32	0.08	0.06	0.03
C6	0.05	0.02	0.13	0.06	0.02	0.10	0.01	0.31	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.28	0.13	0.05	0.51	0.01	0.21	0.27	0.29
C8	0.03	0.02	0.08	0.07	0.01	0.09	0.02	0.22	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.06	0.31	0.05	0.28	0.20	0.14
N1	0.05	0.01	0.14	0.08	0.02	0.12	0.01	0.33	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.33	0.14	0.06	0.55	0.03	0.23	0.27	0.32
N2	0.10	0.01	0.17	0.16	0.03	0.15	0.02	0.34	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.40	0.20	0.10	0.54	0.05	0.19	0.26	0.31
N3	0.07	0.02	0.14	0.12	0.01	0.12	0.01	0.28	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.31	0.15	0.08	0.47	0.02	0.12	0.22	0.22
N7	0.03	0.01	0.10	0.07	0.01	0.10	0.01	0.26	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.15	0.10	0.06	0.38	0.05	0.14	0.19	0.15
N9	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.02	0.18	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.11	0.10	0.02	0.34	0.04	0.26	0.18	0.12
O2'	0.01	0.35	0.01	0.02	0.22	0.13	0.22	0.03	0.28	0.09	0.33	0.40	0.31	0.15	0.11	0.00	0.08	0.08	0.26	0.28	0.22	0.10	0.14
O3'	0.12	0.16	0.01	0.01	0.12	0.03	0.11	0.13	0.13	0.10	0.14	0.20	0.15	0.10	0.10	0.08	0.00	0.11	0.15	0.12	0.40	0.15	0.20
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.10	0.08	0.06	0.02	0.08	0.11	0.00	0.14	0.05	0.39	0.26	0.22
O5'	0.23	0.53	0.31	0.10	0.45	0.03	0.46	0.01	0.51	0.31	0.55	0.54	0.47	0.38	0.34	0.26	0.15	0.14	0.00	0.51	0.01	0.03	0.01
O6	0.05	0.03	0.14	0.06	0.03	0.10	0.02	0.32	0.01	0.05	0.03	0.05	0.02	0.05	0.04	0.28	0.12	0.05	0.51	0.00	0.27	0.29	0.31
OP1	0.32	0.17	0.23	0.39	0.13	0.29	0.12	0.08	0.21	0.28	0.23	0.19	0.12	0.14	0.26	0.22	0.40	0.39	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.25	0.12	0.13	0.20	0.10	0.22	0.06	0.27	0.20	0.27	0.26	0.22	0.19	0.18	0.10	0.15	0.26	0.03	0.29	0.02	0.00	0.02
P	0.11	0.29	0.13	0.17	0.18	0.10	0.22	0.03	0.29	0.14	0.32	0.31	0.22	0.15	0.12	0.14	0.20	0.22	0.01	0.31	0.01	0.02	0.00