Doublet Group distance statistics: 54111

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.005, 0.028, 0.051, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.028 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.026, 0.074, 0.122, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.074 std_dev=0.048
C4'	A	0, 0.081, 0.180, 0.280, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.180 std_dev=0.099
C3'	A	0, 0.058, 0.202, 0.346, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.202 std_dev=0.144
O3'	A	0, 0.053, 0.198, 0.342, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.198 std_dev=0.145
C2'	A	0, -0.014, 0.170, 0.354, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.170 std_dev=0.184
C5'	A	0, 0.172, 0.373, 0.574, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.373 std_dev=0.201
P	B	0, 0.149, 0.366, 0.583, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.366 std_dev=0.217
OP2	B	0, 0.152, 0.398, 0.645, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.398 std_dev=0.246
OP1	B	0, 0.138, 0.403, 0.668, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.403 std_dev=0.265
O5'	A	0, 0.101, 0.402, 0.704, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.402 std_dev=0.301
O2'	A	0, 0.074, 0.376, 0.678, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.376 std_dev=0.302
O5'	B	0, 0.151, 0.459, 0.767, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.459 std_dev=0.308
P	A	0, 0.018, 0.343, 0.668, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.343 std_dev=0.325
OP2	A	0, 0.093, 0.436, 0.779, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.436 std_dev=0.343
C5'	B	0, 0.119, 0.535, 0.951, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.535 std_dev=0.416
OP1	A	0, -0.066, 0.418, 0.903, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.418 std_dev=0.485
C4'	B	0, 0.113, 0.687, 1.262, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.687 std_dev=0.574
O4'	B	0, 0.144, 0.744, 1.344, 2.018 max_d=2.018 avg_d=0.744 std_dev=0.600
C4	B	0, 0.262, 0.867, 1.472, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.867 std_dev=0.605
N3	B	0, 0.292, 0.925, 1.559, 1.979 max_d=1.979 avg_d=0.925 std_dev=0.634
C3'	B	0, 0.070, 0.758, 1.445, 2.275 max_d=2.275 avg_d=0.758 std_dev=0.688
N9	B	0, 0.175, 0.867, 1.558, 2.163 max_d=2.163 avg_d=0.867 std_dev=0.691
C5	B	0, 0.215, 0.911, 1.606, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.911 std_dev=0.696
O3'	B	0, 0.069, 0.785, 1.501, 2.370 max_d=2.370 avg_d=0.785 std_dev=0.716
C1'	B	0, 0.113, 0.833, 1.552, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.833 std_dev=0.720
C6	B	0, 0.228, 0.989, 1.750, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.989 std_dev=0.761
C2'	B	0, 0.068, 0.857, 1.647, 2.593 max_d=2.593 avg_d=0.857 std_dev=0.789
C2	B	0, 0.273, 1.082, 1.891, 2.523 max_d=2.523 avg_d=1.082 std_dev=0.809
N7	B	0, 0.150, 0.990, 1.830, 2.166 max_d=2.166 avg_d=0.990 std_dev=0.840
N1	B	0, 0.272, 1.116, 1.961, 2.391 max_d=2.391 avg_d=1.116 std_dev=0.845
O6	B	0, 0.183, 1.042, 1.900, 2.227 max_d=2.227 avg_d=1.042 std_dev=0.858
O2'	B	0, 0.043, 0.910, 1.777, 2.860 max_d=2.860 avg_d=0.910 std_dev=0.867
C8	B	0, 0.097, 0.991, 1.885, 2.669 max_d=2.669 avg_d=0.991 std_dev=0.894
N2	B	0, 0.194, 1.262, 2.330, 3.499 max_d=3.499 avg_d=1.262 std_dev=1.068

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.11	0.05	0.22	0.09
C2	0.04	0.00	0.06	0.09	0.02	0.03	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.25	0.05	0.02	0.20	0.17	0.30	0.14
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.11	0.11	0.09	0.05	0.13	0.12	0.06	0.01	0.03	0.02	0.06	0.13	0.34	0.16
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.06	0.09	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.19	0.35	0.19
C4	0.02	0.02	0.06	0.06	0.00	0.04	0.01	0.17	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.15	0.03	0.02	0.22	0.14	0.28	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.05	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.08	0.05	0.01	0.03	0.07	0.20	0.08
C5	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01	0.06	0.00	0.21	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.17	0.03	0.02	0.28	0.18	0.33	0.18
C5'	0.05	0.16	0.02	0.04	0.17	0.01	0.21	0.00	0.21	0.16	0.19	0.14	0.23	0.21	0.14	0.06	0.10	0.02	0.01	0.16	0.12	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.04	0.02	0.05	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.22	0.04	0.01	0.27	0.21	0.36	0.20
C8	0.02	0.01	0.11	0.07	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.08	0.03	0.27	0.12	0.27	0.13
N1	0.04	0.00	0.09	0.06	0.03	0.03	0.02	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.26	0.04	0.01	0.24	0.20	0.34	0.18
N3	0.04	0.01	0.05	0.09	0.00	0.03	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.21	0.05	0.02	0.17	0.13	0.27	0.11
N6	0.03	0.03	0.13	0.04	0.04	0.05	0.03	0.23	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.24	0.05	0.00	0.29	0.24	0.39	0.23
N7	0.01	0.01	0.12	0.05	0.00	0.06	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.12	0.07	0.03	0.31	0.18	0.34	0.20
N9	0.01	0.02	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.14	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.07	0.04	0.02	0.20	0.10	0.24	0.10
O2'	0.04	0.25	0.01	0.03	0.15	0.08	0.17	0.06	0.22	0.06	0.26	0.21	0.24	0.12	0.07	0.00	0.06	0.13	0.12	0.08	0.25	0.04
O3'	0.04	0.05	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.10	0.04	0.08	0.04	0.05	0.05	0.07	0.04	0.06	0.00	0.05	0.07	0.16	0.34	0.17
O4'	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.13	0.05	0.00	0.08	0.05	0.21	0.13
O5'	0.11	0.20	0.06	0.04	0.22	0.03	0.28	0.01	0.27	0.27	0.24	0.17	0.29	0.31	0.20	0.12	0.07	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.17	0.13	0.19	0.14	0.07	0.18	0.16	0.21	0.12	0.20	0.13	0.24	0.18	0.10	0.08	0.16	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.22	0.30	0.34	0.35	0.28	0.20	0.33	0.12	0.36	0.27	0.34	0.27	0.39	0.34	0.24	0.25	0.34	0.21	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.16	0.19	0.12	0.08	0.18	0.02	0.20	0.13	0.18	0.11	0.23	0.20	0.10	0.04	0.17	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.43	0.09	0.13	0.25	0.12	0.32	0.12	0.45	0.17	0.50	0.49	0.31	0.23	0.16	0.09	0.17	0.20	0.11	0.52	0.22	0.13	0.12
C2	0.13	0.41	0.21	0.21	0.28	0.16	0.35	0.20	0.45	0.20	0.47	0.44	0.31	0.31	0.20	0.20	0.19	0.04	0.13	0.50	0.24	0.10	0.14
C2'	0.13	0.36	0.17	0.24	0.16	0.21	0.24	0.24	0.40	0.08	0.44	0.43	0.22	0.13	0.07	0.17	0.25	0.20	0.23	0.49	0.30	0.23	0.23
C3'	0.08	0.45	0.08	0.14	0.22	0.12	0.29	0.15	0.46	0.06	0.52	0.52	0.30	0.16	0.09	0.07	0.17	0.16	0.14	0.55	0.23	0.15	0.16
C4	0.02	0.40	0.09	0.13	0.24	0.10	0.32	0.15	0.44	0.11	0.47	0.44	0.29	0.24	0.12	0.08	0.14	0.09	0.12	0.51	0.24	0.12	0.14
C4'	0.22	0.59	0.18	0.18	0.38	0.16	0.43	0.08	0.58	0.22	0.65	0.66	0.45	0.30	0.26	0.19	0.24	0.26	0.06	0.66	0.15	0.07	0.06
C5	0.04	0.42	0.10	0.13	0.26	0.09	0.35	0.14	0.46	0.14	0.49	0.45	0.31	0.27	0.14	0.09	0.13	0.06	0.11	0.52	0.23	0.11	0.13
C5'	0.35	0.75	0.34	0.31	0.53	0.28	0.57	0.18	0.73	0.33	0.80	0.83	0.62	0.43	0.40	0.35	0.38	0.36	0.17	0.80	0.16	0.14	0.14
C6	0.14	0.44	0.20	0.19	0.32	0.15	0.39	0.18	0.48	0.23	0.50	0.46	0.35	0.35	0.22	0.19	0.16	0.05	0.12	0.53	0.24	0.09	0.13
C8	0.11	0.41	0.10	0.17	0.22	0.14	0.30	0.13	0.44	0.13	0.48	0.47	0.29	0.20	0.12	0.10	0.21	0.19	0.12	0.51	0.20	0.14	0.13
N1	0.18	0.42	0.25	0.25	0.32	0.19	0.38	0.21	0.47	0.25	0.48	0.44	0.34	0.35	0.24	0.24	0.22	0.08	0.13	0.51	0.24	0.10	0.13
N3	0.05	0.40	0.13	0.15	0.25	0.11	0.32	0.17	0.44	0.14	0.46	0.44	0.29	0.26	0.14	0.13	0.14	0.05	0.12	0.50	0.24	0.11	0.14
N6	0.21	0.47	0.25	0.23	0.37	0.18	0.44	0.21	0.51	0.31	0.52	0.48	0.39	0.41	0.29	0.23	0.18	0.11	0.13	0.54	0.24	0.09	0.13
N7	0.04	0.42	0.07	0.14	0.24	0.11	0.32	0.12	0.46	0.09	0.49	0.46	0.29	0.22	0.10	0.07	0.19	0.13	0.11	0.52	0.21	0.13	0.13
N9	0.08	0.41	0.06	0.13	0.22	0.11	0.30	0.13	0.44	0.12	0.47	0.46	0.28	0.21	0.11	0.06	0.17	0.16	0.12	0.51	0.22	0.13	0.14
O2'	0.13	0.44	0.18	0.27	0.21	0.23	0.30	0.26	0.48	0.11	0.53	0.51	0.28	0.19	0.10	0.18	0.30	0.21	0.25	0.57	0.34	0.26	0.25
O3'	0.07	0.49	0.08	0.14	0.25	0.12	0.32	0.16	0.50	0.08	0.57	0.58	0.33	0.19	0.09	0.08	0.15	0.14	0.16	0.59	0.26	0.17	0.18
O4'	0.22	0.47	0.18	0.20	0.30	0.18	0.35	0.13	0.47	0.24	0.52	0.53	0.35	0.27	0.24	0.18	0.25	0.28	0.11	0.54	0.18	0.12	0.10
O5'	0.56	0.76	0.55	0.56	0.62	0.51	0.64	0.40	0.74	0.54	0.79	0.82	0.68	0.56	0.57	0.56	0.63	0.59	0.36	0.78	0.18	0.26	0.25
OP1	0.54	0.74	0.63	0.66	0.58	0.53	0.57	0.39	0.67	0.51	0.76	0.82	0.65	0.50	0.54	0.62	0.76	0.54	0.34	0.71	0.13	0.24	0.18
OP2	0.47	0.81	0.49	0.55	0.60	0.50	0.64	0.42	0.79	0.41	0.86	0.87	0.69	0.48	0.48	0.49	0.65	0.52	0.39	0.87	0.27	0.33	0.30
P	0.54	0.77	0.57	0.59	0.61	0.51	0.62	0.38	0.74	0.51	0.80	0.83	0.67	0.52	0.54	0.57	0.68	0.55	0.34	0.79	0.14	0.23	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.15	0.02	0.12	0.16	0.12
C2	0.05	0.00	0.33	0.27	0.02	0.12	0.03	0.30	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.29	0.33	0.28	0.41	0.02	0.55	0.48	0.53
C2'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.21	0.02	0.16	0.03	0.22	0.13	0.29	0.37	0.31	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.21	0.10	0.13	0.08
C3'	0.01	0.27	0.00	0.00	0.18	0.00	0.16	0.02	0.21	0.12	0.26	0.29	0.23	0.12	0.09	0.01	0.01	0.01	0.04	0.21	0.10	0.06	0.04
C4	0.03	0.02	0.21	0.18	0.00	0.08	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.17	0.20	0.16	0.34	0.01	0.39	0.39	0.40
C4'	0.00	0.12	0.02	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.08	0.06	0.11	0.14	0.11	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.03	0.16	0.16	0.01	0.06	0.00	0.20	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.13	0.20	0.09	0.35	0.02	0.42	0.46	0.43
C5'	0.05	0.30	0.03	0.02	0.22	0.01	0.20	0.00	0.24	0.10	0.30	0.33	0.27	0.13	0.14	0.04	0.05	0.02	0.02	0.22	0.05	0.03	0.03
C6	0.02	0.02	0.22	0.21	0.00	0.08	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.18	0.27	0.14	0.38	0.01	0.51	0.51	0.51
C8	0.02	0.01	0.13	0.12	0.02	0.06	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.12	0.15	0.22	0.03	0.21	0.30	0.22
N1	0.04	0.01	0.29	0.26	0.01	0.11	0.02	0.30	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.24	0.32	0.23	0.41	0.02	0.57	0.52	0.56
N2	0.05	0.01	0.37	0.29	0.02	0.14	0.03	0.33	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.34	0.38	0.33	0.42	0.04	0.59	0.49	0.56
N3	0.05	0.01	0.31	0.23	0.01	0.11	0.02	0.27	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.26	0.27	0.27	0.37	0.01	0.46	0.42	0.45
N7	0.02	0.03	0.09	0.12	0.02	0.05	0.01	0.13	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.09	0.13	0.08	0.28	0.04	0.32	0.42	0.33
N9	0.01	0.02	0.07	0.09	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.08	0.02	0.26	0.02	0.25	0.29	0.27
O2'	0.03	0.29	0.01	0.01	0.17	0.04	0.13	0.04	0.18	0.11	0.24	0.34	0.26	0.09	0.07	0.00	0.09	0.02	0.03	0.18	0.06	0.10	0.02
O3'	0.03	0.33	0.03	0.01	0.20	0.03	0.20	0.05	0.27	0.12	0.32	0.38	0.27	0.13	0.08	0.09	0.00	0.04	0.12	0.28	0.13	0.08	0.11
O4'	0.01	0.28	0.01	0.01	0.16	0.01	0.09	0.02	0.14	0.15	0.23	0.33	0.27	0.08	0.02	0.02	0.04	0.00	0.07	0.10	0.06	0.07	0.06
O5'	0.15	0.41	0.08	0.04	0.34	0.01	0.35	0.02	0.38	0.22	0.41	0.42	0.37	0.28	0.26	0.03	0.12	0.07	0.00	0.34	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.21	0.21	0.01	0.06	0.02	0.22	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.18	0.28	0.10	0.34	0.00	0.50	0.51	0.49
OP1	0.12	0.55	0.10	0.10	0.39	0.04	0.42	0.05	0.51	0.21	0.57	0.59	0.46	0.32	0.25	0.06	0.13	0.06	0.02	0.50	0.00	0.04	0.01
OP2	0.16	0.48	0.13	0.06	0.39	0.02	0.46	0.03	0.51	0.30	0.52	0.49	0.42	0.42	0.29	0.10	0.08	0.07	0.01	0.51	0.04	0.00	0.01
P	0.12	0.53	0.08	0.04	0.40	0.01	0.43	0.03	0.51	0.22	0.56	0.56	0.45	0.33	0.27	0.02	0.11	0.06	0.01	0.49	0.01	0.01	0.00