Doublet Group distance statistics: 54113

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.015, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.013, 0.025, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.029 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.014, 0.031, 0.049, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.017, 0.037, 0.058, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.037 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.023, 0.044, 0.065, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.044 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.017, 0.045, 0.072, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.045 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.014, 0.045, 0.077, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.045 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.057, 0.124, 0.191, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.124 std_dev=0.067
C2'	A	0, 0.086, 0.170, 0.253, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.170 std_dev=0.084
C4'	A	0, 0.106, 0.222, 0.337, 0.395 max_d=0.395 avg_d=0.222 std_dev=0.116
C3'	A	0, 0.103, 0.227, 0.350, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.227 std_dev=0.123
P	A	0, 0.135, 0.271, 0.407, 0.411 max_d=0.411 avg_d=0.271 std_dev=0.136
OP1	A	0, 0.119, 0.280, 0.442, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.280 std_dev=0.161
O2'	A	0, 0.180, 0.347, 0.514, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.347 std_dev=0.167
O3'	A	0, 0.178, 0.367, 0.556, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.367 std_dev=0.189
C5'	A	0, 0.129, 0.322, 0.515, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.322 std_dev=0.193
O5'	A	0, 0.046, 0.244, 0.441, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.244 std_dev=0.198
OP2	A	0, 0.178, 0.386, 0.595, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.386 std_dev=0.208
OP1	B	0, 0.260, 0.551, 0.842, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.551 std_dev=0.291
C4'	B	0, 0.379, 0.787, 1.194, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.787 std_dev=0.408
C5'	B	0, 0.508, 0.924, 1.340, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.924 std_dev=0.416
O3'	B	0, 0.412, 0.837, 1.261, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.837 std_dev=0.424
P	B	0, 0.269, 0.716, 1.164, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.716 std_dev=0.447
C3'	B	0, 0.382, 0.837, 1.291, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.837 std_dev=0.455
OP2	B	0, 0.365, 0.848, 1.332, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.848 std_dev=0.484
O4'	B	0, 0.510, 1.129, 1.748, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.129 std_dev=0.619
O5'	B	0, 0.068, 0.701, 1.334, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.701 std_dev=0.633
C8	B	0, 0.656, 1.346, 2.036, 2.326 max_d=2.326 avg_d=1.346 std_dev=0.690
N7	B	0, 0.604, 1.295, 1.987, 2.373 max_d=2.373 avg_d=1.295 std_dev=0.692
C4	B	0, 0.485, 1.187, 1.889, 2.414 max_d=2.414 avg_d=1.187 std_dev=0.702
C5	B	0, 0.496, 1.203, 1.909, 2.442 max_d=2.442 avg_d=1.203 std_dev=0.707
N9	B	0, 0.630, 1.343, 2.056, 2.415 max_d=2.415 avg_d=1.343 std_dev=0.713
N3	B	0, 0.400, 1.117, 1.835, 2.451 max_d=2.451 avg_d=1.117 std_dev=0.717
C6	B	0, 0.441, 1.174, 1.907, 2.524 max_d=2.524 avg_d=1.174 std_dev=0.733
C2	B	0, 0.297, 1.044, 1.791, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.044 std_dev=0.747
O6	B	0, 0.530, 1.280, 2.031, 2.569 max_d=2.569 avg_d=1.280 std_dev=0.750
N1	B	0, 0.308, 1.066, 1.824, 2.565 max_d=2.565 avg_d=1.066 std_dev=0.758
N2	B	0, 0.253, 1.023, 1.792, 2.583 max_d=2.583 avg_d=1.023 std_dev=0.770
C1'	B	0, 0.811, 1.610, 2.408, 2.638 max_d=2.638 avg_d=1.610 std_dev=0.798
C2'	B	0, 1.214, 2.218, 3.222, 2.999 max_d=2.999 avg_d=2.218 std_dev=1.004
O2'	B	0, 2.145, 3.887, 5.630, 4.814 max_d=4.814 avg_d=3.887 std_dev=1.742

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.10	0.08
C2	0.03	0.00	0.14	0.11	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.20	0.16	0.01	0.05	0.07	0.11	0.08
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.00	0.09	0.03	0.12	0.14	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.08	0.09	0.11	0.07	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.07	0.06
C4	0.02	0.01	0.09	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.01	0.05	0.06	0.11	0.07
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.07	0.03	0.05	0.06	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01
C5	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.07
C5'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.08	0.11	0.05	0.03	0.11	0.11	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.08	0.02	0.07	0.07	0.11	0.08
C8	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.08	0.04	0.09	0.05
N1	0.02	0.01	0.12	0.09	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.13	0.01	0.06	0.07	0.11	0.07
N3	0.03	0.00	0.14	0.11	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.14	0.01	0.05	0.06	0.11	0.08
N6	0.03	0.02	0.08	0.07	0.01	0.06	0.02	0.11	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.12	0.08	0.04	0.11	0.10	0.12	0.10
N7	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.09	0.06	0.09	0.06
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.10	0.07
O2'	0.02	0.20	0.00	0.02	0.11	0.04	0.09	0.04	0.13	0.02	0.18	0.19	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.12	0.05	0.04
O3'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.08	0.09	0.13	0.14	0.08	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.20	0.16	0.14
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.08	0.08	0.15	0.13
O5'	0.04	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.05	0.11	0.09	0.03	0.02	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.03	0.07	0.07	0.10	0.06	0.03	0.06	0.02	0.07	0.04	0.07	0.06	0.10	0.06	0.04	0.12	0.20	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.11	0.05	0.07	0.11	0.03	0.10	0.01	0.11	0.09	0.11	0.11	0.12	0.09	0.10	0.05	0.16	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.08	0.02	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.05	0.07	0.08	0.10	0.06	0.07	0.04	0.14	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.04	0.16	0.17	0.10	0.18	0.10	0.24	0.04	0.18	0.03	0.11	0.04	0.15	0.15	0.20	0.50	0.18	0.36	0.04	0.18	0.26	0.22
C2	0.06	0.23	0.08	0.07	0.11	0.13	0.13	0.19	0.20	0.09	0.24	0.30	0.16	0.10	0.08	0.05	0.39	0.15	0.16	0.22	0.10	0.21	0.14
C2'	0.11	0.07	0.10	0.10	0.06	0.15	0.06	0.23	0.04	0.14	0.06	0.14	0.02	0.12	0.11	0.15	0.40	0.14	0.31	0.05	0.18	0.24	0.20
C3'	0.05	0.13	0.04	0.04	0.03	0.10	0.04	0.19	0.07	0.08	0.12	0.20	0.09	0.07	0.05	0.09	0.29	0.07	0.26	0.08	0.16	0.18	0.16
C4	0.08	0.12	0.08	0.11	0.04	0.13	0.05	0.20	0.09	0.10	0.13	0.20	0.06	0.08	0.08	0.10	0.44	0.14	0.27	0.10	0.14	0.22	0.17
C4'	0.10	0.11	0.08	0.07	0.03	0.12	0.03	0.18	0.05	0.10	0.10	0.19	0.07	0.09	0.07	0.14	0.35	0.10	0.31	0.06	0.15	0.17	0.16
C5	0.06	0.15	0.05	0.08	0.05	0.12	0.07	0.20	0.11	0.09	0.15	0.22	0.09	0.08	0.06	0.06	0.40	0.14	0.25	0.13	0.15	0.21	0.17
C5'	0.07	0.18	0.05	0.05	0.06	0.07	0.06	0.15	0.10	0.06	0.16	0.25	0.14	0.05	0.04	0.10	0.26	0.04	0.26	0.11	0.14	0.11	0.12
C6	0.07	0.23	0.08	0.06	0.12	0.13	0.14	0.19	0.20	0.10	0.24	0.30	0.16	0.11	0.09	0.07	0.34	0.15	0.16	0.22	0.11	0.19	0.14
C8	0.14	0.05	0.13	0.15	0.08	0.18	0.08	0.24	0.04	0.16	0.04	0.12	0.03	0.14	0.14	0.16	0.47	0.17	0.37	0.04	0.19	0.24	0.23
N1	0.08	0.26	0.10	0.07	0.15	0.14	0.17	0.20	0.24	0.11	0.28	0.33	0.19	0.13	0.11	0.08	0.34	0.17	0.13	0.26	0.10	0.20	0.14
N3	0.06	0.16	0.08	0.09	0.05	0.12	0.07	0.19	0.13	0.09	0.17	0.24	0.09	0.07	0.06	0.08	0.43	0.14	0.23	0.15	0.12	0.21	0.15
N6	0.12	0.27	0.12	0.09	0.17	0.17	0.19	0.20	0.24	0.14	0.28	0.34	0.21	0.16	0.14	0.12	0.30	0.19	0.11	0.26	0.10	0.17	0.13
N7	0.09	0.09	0.07	0.10	0.04	0.14	0.05	0.22	0.06	0.12	0.09	0.17	0.04	0.10	0.09	0.09	0.42	0.15	0.32	0.07	0.18	0.22	0.21
N9	0.14	0.06	0.13	0.15	0.07	0.17	0.07	0.23	0.03	0.16	0.05	0.13	0.01	0.13	0.13	0.16	0.48	0.17	0.34	0.04	0.17	0.24	0.21
O2'	0.11	0.05	0.11	0.11	0.06	0.15	0.07	0.24	0.03	0.14	0.05	0.11	0.01	0.12	0.11	0.14	0.41	0.14	0.33	0.04	0.20	0.28	0.22
O3'	0.04	0.17	0.04	0.05	0.07	0.06	0.07	0.16	0.11	0.05	0.16	0.24	0.13	0.05	0.04	0.06	0.21	0.03	0.22	0.11	0.15	0.16	0.14
O4'	0.19	0.05	0.19	0.18	0.11	0.21	0.11	0.24	0.05	0.20	0.03	0.11	0.06	0.17	0.17	0.24	0.51	0.20	0.40	0.05	0.19	0.23	0.23
O5'	0.05	0.15	0.02	0.02	0.04	0.09	0.05	0.18	0.08	0.08	0.13	0.22	0.11	0.08	0.04	0.08	0.25	0.06	0.26	0.09	0.15	0.11	0.13
OP1	0.18	0.04	0.17	0.10	0.13	0.21	0.16	0.26	0.12	0.22	0.06	0.08	0.06	0.22	0.17	0.24	0.25	0.18	0.35	0.13	0.20	0.16	0.20
OP2	0.17	0.07	0.17	0.12	0.13	0.21	0.15	0.28	0.11	0.21	0.07	0.10	0.08	0.20	0.17	0.26	0.25	0.18	0.35	0.12	0.21	0.19	0.23
P	0.13	0.05	0.11	0.06	0.07	0.16	0.10	0.23	0.06	0.16	0.03	0.12	0.04	0.15	0.12	0.18	0.26	0.13	0.33	0.07	0.18	0.15	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.06	0.10	0.08	0.01	0.00	0.03	0.24	0.00	0.08	0.04	0.10	0.13	0.04
C2	0.08	0.00	0.21	0.08	0.02	0.21	0.01	0.34	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.23	0.14	0.13	0.24	0.02	0.29	0.36	0.26
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.10	0.03	0.06	0.12	0.11	0.07	0.17	0.25	0.20	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.12	0.09	0.10	0.25	0.11
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.05	0.10	0.06	0.13	0.07	0.09	0.06	0.01	0.01	0.02	0.22	0.06	0.08	0.13	0.12
C4	0.04	0.02	0.10	0.03	0.00	0.09	0.01	0.18	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.06	0.11	0.02	0.16	0.24	0.12
C4'	0.01	0.21	0.03	0.01	0.09	0.00	0.08	0.01	0.12	0.03	0.18	0.26	0.18	0.03	0.02	0.14	0.07	0.00	0.02	0.12	0.12	0.13	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.17	0.05	0.12	0.02	0.17	0.27	0.13
C5'	0.03	0.34	0.12	0.02	0.18	0.01	0.18	0.00	0.25	0.06	0.31	0.41	0.28	0.11	0.08	0.10	0.11	0.01	0.01	0.24	0.11	0.18	0.02
C6	0.04	0.02	0.11	0.05	0.02	0.12	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.19	0.16	0.07	0.18	0.01	0.23	0.33	0.20
C8	0.02	0.03	0.07	0.10	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.21	0.03	0.08	0.02	0.11	0.18	0.06
N1	0.06	0.01	0.17	0.06	0.02	0.18	0.01	0.31	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.23	0.14	0.11	0.23	0.02	0.28	0.38	0.26
N2	0.10	0.01	0.25	0.13	0.02	0.26	0.01	0.41	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.26	0.13	0.15	0.32	0.03	0.37	0.43	0.35
N3	0.08	0.01	0.20	0.07	0.01	0.18	0.01	0.28	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.20	0.15	0.12	0.17	0.03	0.21	0.28	0.18
N7	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.10	0.19	0.02	0.08	0.02	0.13	0.22	0.09
N9	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.07	0.20	0.02	0.08	0.02	0.11	0.17	0.06
O2'	0.03	0.23	0.00	0.01	0.15	0.14	0.15	0.10	0.19	0.06	0.23	0.26	0.20	0.10	0.07	0.00	0.05	0.10	0.22	0.19	0.14	0.21	0.11
O3'	0.24	0.14	0.04	0.01	0.16	0.07	0.17	0.11	0.16	0.21	0.14	0.13	0.15	0.19	0.20	0.05	0.00	0.20	0.31	0.17	0.24	0.21	0.24
O4'	0.00	0.13	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.11	0.15	0.12	0.02	0.02	0.10	0.20	0.00	0.12	0.07	0.15	0.13	0.10
O5'	0.08	0.24	0.12	0.22	0.11	0.02	0.12	0.01	0.18	0.08	0.23	0.32	0.17	0.08	0.08	0.22	0.31	0.12	0.00	0.19	0.02	0.01	0.01
O6	0.04	0.02	0.09	0.06	0.02	0.12	0.02	0.24	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.19	0.17	0.07	0.19	0.00	0.24	0.35	0.21
OP1	0.10	0.29	0.10	0.08	0.16	0.12	0.17	0.11	0.23	0.11	0.28	0.37	0.21	0.13	0.11	0.14	0.24	0.15	0.02	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.36	0.25	0.13	0.24	0.13	0.27	0.18	0.33	0.18	0.38	0.43	0.28	0.22	0.17	0.21	0.21	0.13	0.01	0.35	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.26	0.11	0.12	0.12	0.04	0.13	0.02	0.20	0.06	0.26	0.35	0.18	0.09	0.06	0.11	0.24	0.10	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00