Doublet Group distance statistics: 54116

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.000, 0.243, 0.486, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.243 std_dev=0.243
O2'	A	0, 0.000, 0.264, 0.528, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.264 std_dev=0.264
OP2	A	0, 0.000, 0.265, 0.530, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.265 std_dev=0.265
OP1	B	0, 0.000, 0.271, 0.541, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.271 std_dev=0.271
C2'	A	0, 0.000, 0.272, 0.545, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.272 std_dev=0.272
OP2	B	0, 0.000, 0.307, 0.615, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.307 std_dev=0.307
C3'	B	0, 0.000, 0.318, 0.636, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.318 std_dev=0.318
O3'	B	0, 0.000, 0.349, 0.698, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.349 std_dev=0.349
P	B	0, 0.000, 0.351, 0.702, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.351 std_dev=0.351
C4'	A	0, 0.000, 0.388, 0.776, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.388 std_dev=0.388
N2	B	0, 0.000, 0.397, 0.794, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.397 std_dev=0.397
P	A	0, 0.000, 0.404, 0.808, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.404 std_dev=0.404
C3'	A	0, 0.000, 0.418, 0.837, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.418 std_dev=0.418
C2	B	0, 0.000, 0.430, 0.860, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.430 std_dev=0.430
N1	B	0, 0.000, 0.441, 0.881, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.441 std_dev=0.441
O5'	B	0, 0.000, 0.448, 0.896, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.448 std_dev=0.448
N3	B	0, 0.000, 0.467, 0.935, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.467 std_dev=0.467
C4	B	0, 0.000, 0.491, 0.983, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.491 std_dev=0.491
C6	B	0, 0.000, 0.495, 0.990, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.495 std_dev=0.495
C5	B	0, 0.000, 0.510, 1.021, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.510 std_dev=0.510
O6	B	0, 0.000, 0.523, 1.046, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.523 std_dev=0.523
N9	B	0, 0.000, 0.525, 1.051, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.525 std_dev=0.525
O3'	A	0, 0.000, 0.541, 1.083, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.541 std_dev=0.541
C4'	B	0, 0.000, 0.547, 1.094, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.547 std_dev=0.547
C8	B	0, 0.000, 0.551, 1.102, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.551 std_dev=0.551
N7	B	0, 0.000, 0.553, 1.105, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.553 std_dev=0.553
O5'	A	0, 0.000, 0.555, 1.110, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.555 std_dev=0.555
OP1	A	0, 0.000, 0.561, 1.123, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.561 std_dev=0.561
C1'	B	0, 0.000, 0.600, 1.201, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.600 std_dev=0.600
O4'	B	0, 0.000, 0.660, 1.320, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.660 std_dev=0.660
C5'	A	0, 0.000, 0.675, 1.350, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.675 std_dev=0.675
C5'	B	0, 0.000, 0.832, 1.665, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.832 std_dev=0.832
C2'	B	0, 0.000, 0.947, 1.893, 1.893 max_d=1.893 avg_d=0.947 std_dev=0.947
O2'	B	0, 0.000, 1.799, 3.598, 3.598 max_d=3.598 avg_d=1.799 std_dev=1.799

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.19	0.04	0.08
C2	0.02	0.00	0.12	0.20	0.01	0.12	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.22	0.04	0.24	0.19	0.04	0.15
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.09	0.12	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.16	0.02
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.03	0.12	0.04	0.17	0.20	0.10	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.16	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.12	0.02	0.18	0.16	0.01	0.11
C4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.07	0.05	0.10	0.12	0.06	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.01	0.16	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.15	0.10	0.01	0.08
C5'	0.00	0.13	0.02	0.03	0.06	0.01	0.01	0.00	0.05	0.10	0.10	0.12	0.04	0.08	0.01	0.05	0.08	0.00	0.00	0.14	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.12	0.02	0.07	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.13	0.03	0.19	0.10	0.02	0.10
C8	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.08	0.06	0.03
N1	0.02	0.00	0.09	0.17	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.19	0.03	0.23	0.14	0.03	0.13
N3	0.02	0.00	0.12	0.20	0.01	0.12	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.21	0.03	0.23	0.20	0.03	0.15
N6	0.04	0.01	0.05	0.10	0.03	0.06	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.11	0.04	0.18	0.07	0.02	0.08
N7	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.04	0.05	0.02
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.12	0.15	0.02	0.09
O2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.02
O3'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.12	0.03	0.08	0.08	0.13	0.04	0.19	0.21	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.17	0.06
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.10	0.25	0.04	0.14
O5'	0.08	0.24	0.01	0.02	0.18	0.01	0.15	0.00	0.19	0.04	0.23	0.23	0.18	0.07	0.12	0.01	0.05	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.19	0.19	0.10	0.05	0.16	0.16	0.10	0.14	0.10	0.08	0.14	0.20	0.07	0.04	0.15	0.15	0.04	0.25	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.04	0.16	0.16	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.06	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.14	0.17	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.02	0.05	0.11	0.04	0.08	0.02	0.10	0.03	0.13	0.15	0.08	0.02	0.09	0.02	0.06	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.17	0.08	0.11	0.23	0.26	0.31	0.49	0.32	0.32	0.25	0.10	0.16	0.36	0.22	0.41	0.11	0.23	0.24	0.36	0.04	0.14	0.12
C2	0.16	0.24	0.09	0.07	0.30	0.37	0.35	0.59	0.35	0.36	0.29	0.18	0.25	0.38	0.29	0.16	0.14	0.40	0.07	0.37	0.09	0.03	0.02
C2'	0.05	0.11	0.09	0.02	0.15	0.16	0.22	0.38	0.24	0.22	0.18	0.05	0.09	0.26	0.12	0.36	0.02	0.12	0.32	0.28	0.10	0.17	0.18
C3'	0.13	0.01	0.08	0.02	0.04	0.08	0.09	0.29	0.11	0.09	0.07	0.03	0.00	0.12	0.02	0.30	0.02	0.02	0.33	0.14	0.07	0.17	0.17
C4	0.12	0.22	0.11	0.07	0.28	0.34	0.34	0.58	0.34	0.35	0.28	0.15	0.22	0.38	0.27	0.25	0.12	0.35	0.14	0.37	0.03	0.09	0.05
C4'	0.14	0.03	0.08	0.02	0.01	0.08	0.07	0.28	0.08	0.09	0.02	0.08	0.04	0.12	0.00	0.41	0.01	0.01	0.32	0.12	0.04	0.20	0.17
C5	0.14	0.23	0.13	0.03	0.29	0.35	0.34	0.58	0.34	0.35	0.28	0.16	0.23	0.37	0.28	0.19	0.09	0.38	0.11	0.36	0.04	0.09	0.05
C5'	0.27	0.20	0.11	0.07	0.16	0.05	0.11	0.13	0.11	0.08	0.15	0.23	0.20	0.07	0.16	0.39	0.09	0.15	0.36	0.07	0.05	0.25	0.21
C6	0.18	0.26	0.12	0.03	0.31	0.36	0.35	0.58	0.35	0.36	0.30	0.19	0.27	0.38	0.30	0.10	0.11	0.42	0.03	0.37	0.09	0.03	0.02
C8	0.08	0.19	0.14	0.06	0.26	0.29	0.32	0.52	0.32	0.34	0.26	0.11	0.19	0.37	0.25	0.34	0.06	0.30	0.22	0.35	0.03	0.15	0.13
N1	0.18	0.26	0.10	0.04	0.31	0.37	0.35	0.58	0.35	0.36	0.30	0.20	0.26	0.38	0.30	0.11	0.13	0.42	0.02	0.37	0.10	0.00	0.05
N3	0.13	0.23	0.08	0.09	0.29	0.36	0.34	0.59	0.34	0.35	0.28	0.16	0.23	0.38	0.27	0.23	0.15	0.36	0.12	0.37	0.05	0.06	0.02
N6	0.22	0.29	0.11	0.01	0.33	0.36	0.36	0.54	0.36	0.37	0.32	0.23	0.30	0.39	0.32	0.02	0.09	0.45	0.05	0.37	0.11	0.02	0.07
N7	0.13	0.22	0.16	0.01	0.28	0.32	0.33	0.56	0.33	0.34	0.27	0.14	0.22	0.37	0.27	0.23	0.05	0.36	0.17	0.36	0.01	0.14	0.11
N9	0.08	0.19	0.11	0.09	0.26	0.31	0.32	0.54	0.33	0.34	0.26	0.12	0.19	0.37	0.25	0.33	0.11	0.30	0.20	0.36	0.01	0.13	0.10
O2'	0.03	0.14	0.07	0.07	0.19	0.17	0.27	0.40	0.29	0.26	0.22	0.08	0.12	0.32	0.16	0.40	0.05	0.14	0.31	0.34	0.11	0.17	0.18
O3'	0.16	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.25	0.08	0.04	0.04	0.04	0.03	0.08	0.02	0.25	0.03	0.03	0.34	0.11	0.07	0.17	0.18
O4'	0.01	0.08	0.06	0.13	0.16	0.23	0.23	0.43	0.23	0.26	0.15	0.01	0.08	0.29	0.16	0.45	0.12	0.17	0.23	0.27	0.00	0.16	0.12
O5'	0.13	0.03	0.06	0.02	0.01	0.04	0.02	0.20	0.03	0.02	0.00	0.06	0.04	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.25	0.05	0.04	0.11	0.10
OP1	0.24	0.19	0.22	0.00	0.15	0.23	0.10	0.16	0.09	0.06	0.15	0.23	0.20	0.05	0.14	0.27	0.00	0.32	0.37	0.06	0.13	0.27	0.27
OP2	0.12	0.05	0.32	0.04	0.12	0.05	0.15	0.03	0.14	0.19	0.09	0.00	0.06	0.19	0.15	0.63	0.02	0.06	0.27	0.16	0.12	0.19	0.20
P	0.07	0.06	0.19	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.04	0.08	0.01	0.10	0.06	0.08	0.01	0.26	0.01	0.08	0.32	0.07	0.07	0.20	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.13	0.05	0.19	0.07	0.10
C2	0.00	0.00	0.32	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.26	0.04	0.11	0.23	0.01	0.21	0.18	0.16
C2'	0.00	0.32	0.00	0.01	0.17	0.05	0.09	0.04	0.14	0.13	0.25	0.38	0.30	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.14	0.10	0.01	0.29	0.16
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.11	0.24	0.02	0.15	0.05	0.22	0.14	0.01	0.01	0.03	0.31	0.14	0.10	0.28	0.25
C4	0.00	0.00	0.17	0.07	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.04	0.05	0.21	0.03	0.23	0.16	0.15
C4'	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.05	0.05	0.04	0.00	0.02	0.05	0.04	0.28	0.07	0.00	0.03	0.06	0.18	0.07	0.05
C5	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.09	0.02	0.22	0.03	0.24	0.18	0.16
C5'	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.23	0.17	0.02	0.01	0.02	0.22	0.11	0.03
C6	0.03	0.01	0.14	0.11	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.25	0.08	0.05	0.24	0.01	0.24	0.19	0.17
C8	0.00	0.00	0.13	0.24	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.14	0.05	0.17	0.04	0.23	0.14	0.13
N1	0.02	0.01	0.25	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.02	0.08	0.24	0.01	0.22	0.19	0.16
N2	0.01	0.00	0.38	0.15	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.09	0.12	0.22	0.01	0.18	0.17	0.14
N3	0.00	0.00	0.30	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.04	0.11	0.23	0.02	0.22	0.17	0.16
N7	0.01	0.01	0.05	0.22	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.14	0.03	0.19	0.04	0.24	0.17	0.15
N9	0.00	0.00	0.02	0.14	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.06	0.01	0.17	0.04	0.22	0.13	0.13
O2'	0.03	0.26	0.00	0.01	0.22	0.28	0.24	0.23	0.25	0.13	0.27	0.27	0.22	0.20	0.13	0.00	0.13	0.19	0.18	0.24	0.33	0.03	0.18
O3'	0.07	0.04	0.02	0.01	0.04	0.07	0.09	0.17	0.08	0.14	0.02	0.09	0.04	0.14	0.06	0.13	0.00	0.02	0.29	0.11	0.03	0.19	0.18
O4'	0.00	0.11	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.02	0.05	0.05	0.08	0.12	0.11	0.03	0.01	0.19	0.02	0.00	0.28	0.05	0.30	0.26	0.23
O5'	0.13	0.23	0.14	0.31	0.21	0.03	0.22	0.01	0.24	0.17	0.24	0.22	0.23	0.19	0.17	0.18	0.29	0.28	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01
O6	0.05	0.01	0.10	0.14	0.03	0.06	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.24	0.11	0.05	0.25	0.00	0.24	0.20	0.17
OP1	0.19	0.21	0.01	0.10	0.23	0.18	0.24	0.22	0.24	0.23	0.22	0.18	0.22	0.24	0.22	0.33	0.03	0.30	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.18	0.29	0.28	0.16	0.07	0.18	0.11	0.19	0.14	0.19	0.17	0.17	0.17	0.13	0.03	0.19	0.26	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.16	0.16	0.25	0.15	0.05	0.16	0.03	0.17	0.13	0.16	0.14	0.16	0.15	0.13	0.18	0.18	0.23	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00