Doublet Group distance statistics: 54118

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.034 std_dev=0.034
C4	A	0, 0.000, 0.039, 0.079, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C2	A	0, 0.000, 0.042, 0.084, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.042
N6	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
N9	A	0, 0.000, 0.047, 0.095, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.047 std_dev=0.047
N3	A	0, 0.000, 0.051, 0.102, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.051 std_dev=0.051
C8	A	0, 0.000, 0.053, 0.107, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.053 std_dev=0.053
C1'	A	0, 0.000, 0.059, 0.118, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.059 std_dev=0.059
OP2	B	0, 0.000, 0.472, 0.945, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.472 std_dev=0.472
OP1	B	0, 0.000, 0.563, 1.125, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.563 std_dev=0.563
C2'	A	0, 0.000, 0.615, 1.229, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.615 std_dev=0.615
P	B	0, 0.000, 0.726, 1.452, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.726 std_dev=0.726
O4'	A	0, 0.000, 0.774, 1.548, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.774 std_dev=0.774
O2'	A	0, 0.000, 0.979, 1.958, 1.958 max_d=1.958 avg_d=0.979 std_dev=0.979
C3'	A	0, 0.000, 1.072, 2.145, 2.145 max_d=2.145 avg_d=1.072 std_dev=1.072
O3'	A	0, 0.000, 1.195, 2.391, 2.391 max_d=2.391 avg_d=1.195 std_dev=1.195
C4'	A	0, 0.000, 1.335, 2.670, 2.670 max_d=2.670 avg_d=1.335 std_dev=1.335
O5'	A	0, 0.000, 1.725, 3.450, 3.450 max_d=3.450 avg_d=1.725 std_dev=1.725
O5'	B	0, 0.000, 1.778, 3.556, 3.556 max_d=3.556 avg_d=1.778 std_dev=1.778
C5'	B	0, 0.000, 1.843, 3.686, 3.686 max_d=3.686 avg_d=1.843 std_dev=1.843
C5'	A	0, 0.000, 2.255, 4.509, 4.509 max_d=4.509 avg_d=2.255 std_dev=2.255
P	A	0, 0.000, 2.589, 5.178, 5.178 max_d=5.178 avg_d=2.589 std_dev=2.589
OP2	A	0, 0.000, 2.768, 5.535, 5.535 max_d=5.535 avg_d=2.768 std_dev=2.768
C4'	B	0, 0.000, 3.212, 6.425, 6.425 max_d=6.425 avg_d=3.212 std_dev=3.212
OP1	A	0, 0.000, 3.275, 6.551, 6.551 max_d=6.551 avg_d=3.275 std_dev=3.275
O4'	B	0, 0.000, 3.523, 7.045, 7.045 max_d=7.045 avg_d=3.523 std_dev=3.523
C3'	B	0, 0.000, 3.973, 7.946, 7.946 max_d=7.946 avg_d=3.973 std_dev=3.973
O6	B	0, 0.000, 4.190, 8.380, 8.380 max_d=8.380 avg_d=4.190 std_dev=4.190
C6	B	0, 0.000, 4.279, 8.558, 8.558 max_d=8.558 avg_d=4.279 std_dev=4.279
N7	B	0, 0.000, 4.310, 8.621, 8.621 max_d=8.621 avg_d=4.310 std_dev=4.310
C5	B	0, 0.000, 4.328, 8.657, 8.657 max_d=8.657 avg_d=4.328 std_dev=4.328
N1	B	0, 0.000, 4.356, 8.711, 8.711 max_d=8.711 avg_d=4.356 std_dev=4.356
C8	B	0, 0.000, 4.420, 8.840, 8.840 max_d=8.840 avg_d=4.420 std_dev=4.420
C4	B	0, 0.000, 4.442, 8.883, 8.883 max_d=8.883 avg_d=4.442 std_dev=4.442
O3'	B	0, 0.000, 4.443, 8.885, 8.885 max_d=8.885 avg_d=4.443 std_dev=4.443
C2	B	0, 0.000, 4.458, 8.916, 8.916 max_d=8.916 avg_d=4.458 std_dev=4.458
N9	B	0, 0.000, 4.486, 8.972, 8.972 max_d=8.972 avg_d=4.486 std_dev=4.486
N3	B	0, 0.000, 4.507, 9.015, 9.015 max_d=9.015 avg_d=4.507 std_dev=4.507
N2	B	0, 0.000, 4.521, 9.043, 9.043 max_d=9.043 avg_d=4.521 std_dev=4.521
C1'	B	0, 0.000, 4.610, 9.220, 9.220 max_d=9.220 avg_d=4.610 std_dev=4.610
C2'	B	0, 0.000, 5.068, 10.136, 10.136 max_d=10.136 avg_d=5.068 std_dev=5.068
O2'	B	0, 0.000, 6.127, 12.254, 12.254 max_d=12.254 avg_d=6.127 std_dev=6.127

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.16	0.01	0.04	0.05	0.53	0.22
C2	0.07	0.00	0.26	0.29	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.01	0.18	0.02	0.40	0.93	0.47
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.16	0.00	0.09	0.01	0.13	0.09	0.21	0.26	0.10	0.04	0.03	0.00	0.05	0.02	0.23	0.22	0.35	0.00
C3'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.25	0.00	0.29	0.01	0.33	0.17	0.32	0.24	0.35	0.25	0.17	0.03	0.01	0.01	0.19	0.26	0.39	0.02
C4	0.04	0.00	0.16	0.25	0.00	0.02	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.02	0.09	0.07	0.43	0.90	0.51
C4'	0.04	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.09	0.21	0.01	0.09	0.15	0.21	0.07	0.15	0.03	0.01	0.00	0.09	0.38	0.08
C5	0.02	0.00	0.09	0.29	0.00	0.12	0.00	0.31	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.10	0.02	0.21	0.70	1.08	0.73
C5'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.16	0.00	0.31	0.00	0.30	0.37	0.19	0.02	0.38	0.42	0.18	0.12	0.07	0.01	0.01	0.10	0.30	0.00
C6	0.03	0.00	0.13	0.33	0.01	0.09	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.11	0.06	0.21	0.76	1.13	0.75
C8	0.02	0.00	0.09	0.17	0.00	0.21	0.01	0.37	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.06	0.13	0.26	0.64	0.96	0.73
N1	0.05	0.00	0.21	0.32	0.00	0.01	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.08	0.13	0.12	0.61	1.06	0.63
N3	0.08	0.00	0.26	0.24	0.00	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.19	0.03	0.27	0.82	0.37
N6	0.02	0.01	0.10	0.35	0.01	0.15	0.00	0.38	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.25	0.16	0.02	0.29	0.95	1.21	0.88
N7	0.01	0.00	0.04	0.25	0.01	0.21	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.11	0.09	0.32	0.85	1.13	0.86
N9	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.01	0.00	0.08	0.35	0.79	0.47
O2'	0.00	0.10	0.00	0.03	0.14	0.15	0.21	0.12	0.22	0.22	0.17	0.06	0.25	0.25	0.14	0.00	0.08	0.13	0.03	0.12	0.41	0.12
O3'	0.16	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.10	0.07	0.11	0.06	0.08	0.03	0.16	0.11	0.01	0.08	0.00	0.08	0.07	0.20	0.44	0.03
O4'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.06	0.13	0.13	0.19	0.02	0.09	0.00	0.13	0.08	0.00	0.02	0.06	0.41	0.19
O5'	0.04	0.02	0.23	0.19	0.07	0.00	0.21	0.01	0.21	0.26	0.12	0.03	0.29	0.32	0.08	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.40	0.22	0.26	0.43	0.09	0.70	0.10	0.76	0.64	0.61	0.27	0.95	0.85	0.35	0.12	0.20	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.53	0.93	0.35	0.39	0.90	0.38	1.08	0.30	1.13	0.96	1.06	0.82	1.21	1.13	0.79	0.41	0.44	0.41	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.47	0.00	0.02	0.51	0.08	0.73	0.00	0.75	0.73	0.63	0.37	0.88	0.86	0.47	0.12	0.03	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	1.44	1.97	1.14	0.65	1.64	0.98	1.57	0.48	1.77	1.15	1.96	2.08	1.83	1.22	1.42	1.47	0.71	1.35	0.21	1.70	0.28	0.09	0.07
C2	2.37	2.44	2.00	1.38	2.35	1.65	2.19	0.91	2.15	2.06	2.30	2.49	2.46	1.98	2.29	2.44	1.48	2.07	0.70	1.93	0.39	0.01	0.02
C2'	1.37	1.92	1.01	0.54	1.54	0.94	1.45	0.49	1.66	1.04	1.89	2.08	1.77	1.09	1.32	1.34	0.57	1.33	0.28	1.60	0.25	0.00	0.01
C3'	0.97	1.48	0.60	0.13	1.14	0.55	1.08	0.13	1.29	0.72	1.48	1.61	1.32	0.78	0.94	0.94	0.14	0.95	0.11	1.29	0.61	0.34	0.34
C4	1.84	2.29	1.47	0.93	2.02	1.26	1.89	0.67	1.98	1.48	2.19	2.37	2.21	1.51	1.81	1.80	0.98	1.69	0.44	1.78	0.32	0.03	0.02
C4'	1.00	1.44	0.71	0.24	1.16	0.59	1.13	0.17	1.32	0.81	1.46	1.54	1.31	0.86	0.99	1.05	0.27	0.95	0.14	1.33	0.55	0.36	0.35
C5	1.72	2.25	1.33	0.83	1.91	1.20	1.67	0.65	1.77	1.19	2.08	2.37	2.17	1.17	1.65	1.59	0.85	1.64	0.43	1.49	0.32	0.02	0.02
C5'	0.52	1.00	0.23	0.21	0.69	0.16	0.65	0.19	0.87	0.34	1.04	1.12	0.84	0.39	0.51	0.54	0.22	0.52	0.52	0.92	0.83	0.65	0.65
C6	2.03	2.30	1.62	1.10	2.07	1.46	1.76	0.82	1.78	1.43	2.08	2.42	2.31	1.32	1.90	1.90	1.13	1.91	0.64	1.47	0.38	0.02	0.01
C8	1.12	1.94	0.79	0.39	1.39	0.76	1.19	0.36	1.47	0.59	1.86	2.13	1.73	0.61	1.05	1.02	0.40	1.14	0.11	1.27	0.25	0.09	0.08
N1	2.36	2.40	1.97	1.38	2.29	1.68	2.03	0.94	1.98	1.89	2.20	2.47	2.44	1.74	2.23	2.35	1.47	2.11	0.77	1.71	0.40	0.03	0.04
N3	2.15	2.39	1.79	1.19	2.24	1.47	2.13	0.79	2.15	1.89	2.29	2.44	2.36	1.89	2.12	2.20	1.27	1.90	0.57	1.98	0.36	0.01	0.00
N6	1.89	2.17	1.47	1.03	1.85	1.44	1.44	0.84	1.48	1.05	1.86	2.34	2.19	0.91	1.66	1.68	1.03	1.88	0.71	1.16	0.40	0.04	0.03
N7	1.20	2.03	0.85	0.44	1.46	0.83	1.19	0.42	1.42	0.55	1.87	2.23	1.85	0.54	1.10	1.05	0.44	1.23	0.19	1.14	0.27	0.07	0.07
N9	1.49	2.10	1.15	0.66	1.72	1.01	1.60	0.51	1.81	1.11	2.05	2.23	1.95	1.16	1.46	1.45	0.70	1.41	0.26	1.66	0.28	0.07	0.06
O2'	1.66	2.00	1.32	0.87	1.72	1.27	1.59	0.79	1.71	1.31	1.92	2.13	1.91	1.30	1.57	1.69	0.97	1.61	0.61	1.59	0.04	0.27	0.31
O3'	1.15	1.44	0.78	0.29	1.23	0.73	1.18	0.29	1.30	0.96	1.43	1.52	1.35	0.99	1.12	1.16	0.32	1.12	0.06	1.28	0.54	0.23	0.22
O4'	1.22	1.77	0.96	0.49	1.44	0.79	1.39	0.34	1.63	0.97	1.79	1.87	1.62	1.05	1.22	1.27	0.53	1.14	0.01	1.62	0.35	0.21	0.20
O5'	0.28	0.89	0.03	0.33	0.46	0.03	0.37	0.24	0.64	0.00	0.92	1.08	0.69	0.02	0.24	0.28	0.33	0.34	0.58	0.64	0.68	0.58	0.59
OP1	1.02	0.49	1.29	1.57	0.90	1.15	0.99	1.29	0.78	1.23	0.48	0.25	0.69	1.23	1.06	1.07	1.61	0.85	1.60	0.79	1.55	1.41	1.47
OP2	0.50	0.62	0.75	1.13	0.16	0.76	0.30	0.98	0.16	0.90	0.67	0.99	0.24	0.85	0.53	0.57	1.23	0.40	1.34	0.17	1.36	1.29	1.32
P	0.51	0.27	0.73	1.08	0.29	0.73	0.40	0.95	0.06	0.80	0.30	0.54	0.00	0.78	0.54	0.51	1.12	0.42	1.31	0.05	1.30	1.23	1.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.01	0.17	0.02	0.17	0.24	0.02
C2	0.02	0.00	0.19	0.05	0.01	0.46	0.01	0.72	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.35	0.05	0.58	0.54	0.00	0.92	1.29	0.97
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.14	0.02	0.14	0.01	0.17	0.03	0.19	0.21	0.17	0.08	0.07	0.00	0.02	0.00	0.21	0.16	0.39	0.04	0.19
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.15	0.00	0.30	0.00	0.25	0.45	0.10	0.17	0.08	0.45	0.24	0.01	0.00	0.00	0.23	0.32	0.51	0.13	0.31
C4	0.01	0.01	0.14	0.15	0.00	0.14	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.10	0.29	0.11	0.00	0.02	0.40	0.13
C4'	0.03	0.46	0.02	0.00	0.14	0.00	0.03	0.00	0.09	0.39	0.30	0.61	0.44	0.30	0.09	0.15	0.09	0.01	0.01	0.02	0.13	0.27	0.04
C5	0.01	0.01	0.14	0.30	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.21	0.14	0.46	0.00	0.38	0.08	0.28
C5'	0.01	0.72	0.01	0.00	0.15	0.00	0.14	0.00	0.07	0.73	0.45	1.03	0.65	0.61	0.21	0.13	0.03	0.00	0.00	0.07	0.02	0.16	0.00
C6	0.02	0.00	0.17	0.25	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.22	0.27	0.23	0.00	0.07	0.23	0.02
C8	0.01	0.01	0.03	0.45	0.00	0.39	0.00	0.73	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.21	0.28	1.12	0.01	1.12	0.86	1.04
N1	0.02	0.00	0.19	0.10	0.00	0.30	0.01	0.45	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.15	0.45	0.22	0.00	0.53	0.88	0.60
N2	0.01	0.00	0.21	0.17	0.00	0.61	0.00	1.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.50	0.01	0.68	0.90	0.01	1.47	1.76	1.45
N3	0.02	0.00	0.17	0.08	0.00	0.44	0.00	0.65	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.00	0.56	0.45	0.00	0.73	1.11	0.81
N7	0.01	0.01	0.08	0.45	0.00	0.30	0.00	0.61	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.27	0.13	1.01	0.01	1.05	0.85	0.97
N9	0.01	0.01	0.07	0.24	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.08	0.00	0.49	0.01	0.44	0.06	0.31
O2'	0.00	0.35	0.00	0.01	0.09	0.15	0.05	0.13	0.05	0.35	0.23	0.50	0.33	0.27	0.10	0.00	0.10	0.15	0.19	0.01	0.45	0.08	0.19
O3'	0.14	0.05	0.02	0.00	0.10	0.09	0.21	0.03	0.22	0.21	0.15	0.01	0.00	0.27	0.08	0.10	0.00	0.11	0.05	0.28	0.67	0.13	0.30
O4'	0.01	0.58	0.00	0.00	0.29	0.01	0.14	0.00	0.27	0.28	0.45	0.68	0.56	0.13	0.00	0.15	0.11	0.00	0.05	0.21	0.07	0.49	0.18
O5'	0.17	0.54	0.21	0.23	0.11	0.01	0.46	0.00	0.23	1.12	0.22	0.90	0.45	1.01	0.49	0.19	0.05	0.05	0.00	0.38	0.00	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.16	0.32	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.21	0.38	0.00	0.28	0.03	0.19
OP1	0.17	0.92	0.39	0.51	0.02	0.13	0.38	0.02	0.07	1.12	0.53	1.47	0.73	1.05	0.44	0.45	0.67	0.07	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	1.29	0.04	0.13	0.40	0.27	0.08	0.16	0.23	0.86	0.88	1.76	1.11	0.85	0.06	0.08	0.13	0.49	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.97	0.19	0.31	0.13	0.04	0.28	0.00	0.02	1.04	0.60	1.45	0.81	0.97	0.31	0.19	0.30	0.18	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00