Doublet Group distance statistics: 54129

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 1, 15, 10, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C5	A	0, -0.005, 0.010, 0.026, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.010 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.012, 0.036, 0.060, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.036 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.001, 0.043, 0.085, 0.175 max_d=0.175 avg_d=0.043 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.015, 0.090, 0.165, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.090 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.003, 0.101, 0.198, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.101 std_dev=0.097
C2'	B	0, 0.207, 0.306, 0.406, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.306 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.040, 0.164, 0.287, 0.527 max_d=0.527 avg_d=0.164 std_dev=0.124
C3'	A	0, 0.030, 0.182, 0.333, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.182 std_dev=0.152
C1'	B	0, 0.265, 0.419, 0.574, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.419 std_dev=0.155
O2'	B	0, 0.253, 0.414, 0.576, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.414 std_dev=0.161
C3'	B	0, 0.274, 0.439, 0.603, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.439 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.017, 0.190, 0.364, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.190 std_dev=0.174
O4'	B	0, 0.334, 0.525, 0.716, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.525 std_dev=0.191
O5'	A	0, 0.122, 0.314, 0.506, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.314 std_dev=0.192
O3'	B	0, 0.264, 0.459, 0.654, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.459 std_dev=0.195
N9	B	0, 0.215, 0.417, 0.619, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.417 std_dev=0.202
P	A	0, 0.189, 0.410, 0.631, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.410 std_dev=0.221
C5'	A	0, 0.048, 0.275, 0.503, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.275 std_dev=0.228
OP2	A	0, 0.324, 0.552, 0.780, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.552 std_dev=0.228
C4'	B	0, 0.344, 0.572, 0.800, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.572 std_dev=0.228
C4	B	0, 0.180, 0.418, 0.656, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.418 std_dev=0.238
N3	B	0, 0.202, 0.447, 0.692, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.447 std_dev=0.245
O3'	A	0, 0.058, 0.305, 0.552, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.305 std_dev=0.247
OP1	A	0, 0.218, 0.474, 0.731, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.474 std_dev=0.257
C8	B	0, 0.236, 0.510, 0.784, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.510 std_dev=0.274
C5	B	0, 0.171, 0.478, 0.785, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.478 std_dev=0.307
N7	B	0, 0.223, 0.553, 0.882, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.553 std_dev=0.329
C2	B	0, 0.165, 0.497, 0.829, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.497 std_dev=0.332
C5'	B	0, 0.389, 0.754, 1.119, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.754 std_dev=0.365
C6	B	0, 0.143, 0.527, 0.911, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.527 std_dev=0.384
N1	B	0, 0.127, 0.511, 0.895, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.511 std_dev=0.384
N2	B	0, 0.202, 0.609, 1.017, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.609 std_dev=0.407
O6	B	0, 0.176, 0.628, 1.081, 2.164 max_d=2.164 avg_d=0.628 std_dev=0.452
O5'	B	0, 0.328, 0.915, 1.502, 2.427 max_d=2.427 avg_d=0.915 std_dev=0.587
P	B	0, 0.436, 1.377, 2.318, 3.668 max_d=3.668 avg_d=1.377 std_dev=0.941
OP2	B	0, 0.479, 1.532, 2.586, 4.016 max_d=4.016 avg_d=1.532 std_dev=1.054
OP1	B	0, 0.653, 1.857, 3.062, 4.476 max_d=4.476 avg_d=1.857 std_dev=1.204

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.06	0.05	0.16	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.11	0.12	0.24	0.15
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.05	0.06	0.08	0.01	0.02	0.01	0.13	0.12	0.20	0.13
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.03	0.11	0.07	0.09	0.12	0.10	0.02	0.01	0.01	0.17	0.16	0.15	0.15
C4	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.14	0.05	0.18	0.22	0.31	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.04	0.08	0.09	0.03
C5	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.16	0.06	0.19	0.22	0.29	0.22
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.14	0.01	0.15	0.00	0.12	0.07	0.10	0.15	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03
C6	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.13	0.05	0.15	0.15	0.22	0.16
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.03	0.10	0.10	0.21	0.13
N3	0.02	0.00	0.05	0.09	0.01	0.06	0.02	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.04	0.14	0.17	0.29	0.19
N4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.09	0.01	0.15	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.15	0.06	0.20	0.26	0.35	0.26
O2	0.02	0.01	0.08	0.10	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.11	0.03	0.09	0.09	0.22	0.13
O2'	0.03	0.07	0.01	0.02	0.06	0.06	0.04	0.05	0.03	0.03	0.08	0.08	0.10	0.00	0.06	0.08	0.08	0.08	0.16	0.08
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.14	0.02	0.16	0.04	0.13	0.07	0.10	0.15	0.11	0.06	0.00	0.02	0.17	0.21	0.15	0.17
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.06	0.03	0.08	0.02	0.00	0.10	0.09	0.14	0.10
O5'	0.06	0.11	0.13	0.17	0.18	0.04	0.19	0.01	0.15	0.10	0.14	0.20	0.09	0.08	0.17	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.12	0.12	0.16	0.22	0.08	0.22	0.09	0.15	0.10	0.17	0.26	0.09	0.08	0.21	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.24	0.20	0.15	0.31	0.09	0.29	0.11	0.22	0.21	0.29	0.35	0.22	0.16	0.15	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.13	0.15	0.22	0.03	0.22	0.03	0.16	0.13	0.19	0.26	0.13	0.08	0.17	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.31	0.15	0.18	0.21	0.14	0.25	0.19	0.30	0.25	0.32	0.40	0.24	0.26	0.20	0.18	0.16	0.17	0.36	0.33	0.69	0.66	0.50
C2	0.19	0.24	0.13	0.20	0.22	0.18	0.30	0.27	0.33	0.31	0.29	0.36	0.18	0.34	0.23	0.13	0.17	0.18	0.48	0.39	0.95	0.82	0.68
C2'	0.15	0.30	0.12	0.15	0.19	0.12	0.23	0.18	0.28	0.24	0.31	0.41	0.23	0.26	0.18	0.18	0.16	0.13	0.37	0.32	0.73	0.75	0.56
C3'	0.13	0.28	0.11	0.14	0.15	0.12	0.19	0.17	0.23	0.23	0.26	0.39	0.21	0.24	0.15	0.19	0.18	0.11	0.38	0.27	0.67	0.75	0.54
C4	0.21	0.28	0.12	0.22	0.22	0.22	0.27	0.35	0.22	0.35	0.22	0.39	0.23	0.37	0.26	0.10	0.20	0.21	0.58	0.27	1.10	0.93	0.82
C4'	0.13	0.29	0.12	0.12	0.16	0.11	0.17	0.12	0.22	0.19	0.27	0.39	0.23	0.19	0.14	0.19	0.13	0.12	0.29	0.24	0.52	0.59	0.39
C5	0.20	0.25	0.11	0.22	0.17	0.22	0.19	0.33	0.15	0.32	0.18	0.34	0.21	0.31	0.23	0.10	0.20	0.20	0.55	0.18	1.01	0.87	0.76
C5'	0.16	0.27	0.15	0.12	0.16	0.15	0.17	0.14	0.19	0.21	0.24	0.36	0.23	0.20	0.15	0.22	0.15	0.15	0.30	0.21	0.48	0.56	0.37
C6	0.18	0.21	0.12	0.20	0.14	0.18	0.18	0.27	0.17	0.27	0.18	0.31	0.17	0.26	0.20	0.12	0.18	0.17	0.47	0.21	0.85	0.76	0.64
N1	0.18	0.25	0.14	0.19	0.19	0.16	0.25	0.24	0.27	0.27	0.26	0.35	0.19	0.29	0.21	0.14	0.17	0.17	0.43	0.31	0.83	0.75	0.61
N3	0.20	0.24	0.12	0.21	0.22	0.20	0.31	0.32	0.31	0.34	0.24	0.38	0.19	0.37	0.25	0.11	0.19	0.20	0.54	0.38	1.06	0.90	0.77
N4	0.24	0.37	0.13	0.23	0.28	0.25	0.32	0.39	0.29	0.38	0.33	0.46	0.30	0.41	0.28	0.09	0.22	0.24	0.63	0.30	1.21	1.01	0.90
O2	0.19	0.28	0.14	0.19	0.24	0.16	0.33	0.25	0.39	0.30	0.36	0.36	0.20	0.36	0.24	0.15	0.17	0.19	0.45	0.46	0.92	0.80	0.65
O2'	0.22	0.35	0.17	0.16	0.24	0.14	0.27	0.16	0.33	0.26	0.36	0.45	0.29	0.27	0.23	0.19	0.14	0.19	0.35	0.36	0.66	0.70	0.49
O3'	0.12	0.29	0.12	0.14	0.15	0.13	0.20	0.18	0.23	0.24	0.27	0.41	0.22	0.25	0.15	0.20	0.19	0.11	0.38	0.27	0.66	0.77	0.54
O4'	0.16	0.30	0.15	0.18	0.18	0.14	0.20	0.16	0.25	0.20	0.28	0.38	0.24	0.20	0.17	0.19	0.17	0.15	0.29	0.26	0.56	0.56	0.40
O5'	0.16	0.29	0.17	0.07	0.17	0.07	0.17	0.07	0.20	0.22	0.24	0.37	0.26	0.21	0.16	0.27	0.02	0.12	0.33	0.20	0.55	0.62	0.43
OP1	0.05	0.23	0.08	0.03	0.12	0.06	0.16	0.15	0.18	0.23	0.20	0.31	0.19	0.24	0.11	0.15	0.03	0.03	0.35	0.21	0.63	0.69	0.47
OP2	0.12	0.27	0.11	0.06	0.23	0.10	0.29	0.23	0.29	0.34	0.28	0.31	0.24	0.36	0.22	0.14	0.02	0.11	0.47	0.32	0.74	0.79	0.64
P	0.07	0.23	0.09	0.02	0.14	0.04	0.17	0.12	0.19	0.24	0.20	0.29	0.20	0.24	0.13	0.15	0.01	0.03	0.35	0.21	0.58	0.65	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.10	0.03	0.34	0.21	0.15
C2	0.05	0.00	0.14	0.12	0.04	0.05	0.01	0.10	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.21	0.17	0.07	0.24	0.02	0.74	0.49	0.38
C2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.10	0.02	0.07	0.03	0.10	0.06	0.12	0.17	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.15	0.12	0.37	0.31	0.22
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.03	0.09	0.14	0.09	0.15	0.11	0.12	0.07	0.02	0.01	0.02	0.20	0.12	0.31	0.36	0.24
C4	0.02	0.04	0.10	0.07	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.13	0.09	0.03	0.26	0.02	0.71	0.45	0.38
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.04	0.07	0.05	0.09	0.05	0.09	0.02	0.00	0.02	0.09	0.13	0.21	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.06	0.00	0.17	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.11	0.09	0.04	0.31	0.04	0.85	0.57	0.47
C5'	0.04	0.10	0.03	0.03	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.20	0.14	0.09	0.08	0.22	0.12	0.08	0.03	0.02	0.01	0.21	0.18	0.25	0.01
C6	0.02	0.03	0.10	0.09	0.01	0.06	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.16	0.11	0.04	0.33	0.01	0.93	0.62	0.51
C8	0.01	0.04	0.06	0.14	0.01	0.10	0.03	0.20	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.15	0.04	0.31	0.03	0.73	0.49	0.42
N1	0.04	0.01	0.12	0.09	0.04	0.04	0.01	0.14	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.19	0.14	0.06	0.29	0.01	0.86	0.57	0.46
N2	0.05	0.01	0.17	0.15	0.03	0.07	0.01	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.26	0.23	0.07	0.23	0.01	0.71	0.47	0.36
N3	0.05	0.01	0.13	0.11	0.01	0.05	0.02	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.19	0.15	0.06	0.21	0.04	0.65	0.42	0.33
N7	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.09	0.00	0.22	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.15	0.05	0.35	0.06	0.88	0.62	0.50
N9	0.00	0.04	0.04	0.07	0.01	0.05	0.02	0.12	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.05	0.06	0.02	0.23	0.03	0.59	0.37	0.31
O2'	0.02	0.21	0.00	0.02	0.13	0.09	0.11	0.08	0.16	0.03	0.19	0.26	0.19	0.05	0.05	0.00	0.04	0.08	0.13	0.16	0.29	0.29	0.15
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.09	0.02	0.09	0.03	0.11	0.15	0.14	0.23	0.15	0.15	0.06	0.04	0.00	0.02	0.22	0.13	0.37	0.45	0.27
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.06	0.05	0.02	0.08	0.02	0.00	0.10	0.04	0.21	0.18	0.14
O5'	0.10	0.24	0.15	0.20	0.26	0.02	0.31	0.01	0.33	0.31	0.29	0.23	0.21	0.35	0.23	0.13	0.22	0.10	0.00	0.36	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.12	0.12	0.02	0.09	0.04	0.21	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.16	0.13	0.04	0.36	0.00	1.05	0.68	0.59
OP1	0.34	0.74	0.37	0.31	0.71	0.13	0.85	0.18	0.93	0.73	0.86	0.71	0.65	0.88	0.59	0.29	0.37	0.21	0.02	1.05	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.49	0.31	0.36	0.45	0.21	0.57	0.25	0.62	0.49	0.57	0.47	0.42	0.62	0.37	0.29	0.45	0.18	0.02	0.68	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.38	0.22	0.24	0.38	0.05	0.47	0.01	0.51	0.42	0.46	0.36	0.33	0.50	0.31	0.15	0.27	0.14	0.01	0.59	0.01	0.01	0.00