Doublet Group distance statistics: 54130

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 4, 6, 9, 5, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.019, 0.028, 0.038, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.019, 0.028, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.020, 0.030, 0.039, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.030 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.019, 0.030, 0.041, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.047, 0.072, 0.097, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.072 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.062, 0.097, 0.133, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.097 std_dev=0.036
C2'	B	0, 0.186, 0.327, 0.468, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.327 std_dev=0.141
O4'	A	0, -0.038, 0.127, 0.293, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.127 std_dev=0.166
C2'	A	0, -0.015, 0.167, 0.349, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.167 std_dev=0.182
C3'	B	0, 0.182, 0.370, 0.557, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.370 std_dev=0.188
O2'	B	0, 0.184, 0.375, 0.566, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.375 std_dev=0.191
O3'	B	0, 0.239, 0.442, 0.645, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.442 std_dev=0.203
C1'	B	0, 0.115, 0.373, 0.630, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.373 std_dev=0.258
C5'	A	0, 0.056, 0.322, 0.588, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.322 std_dev=0.266
C4'	A	0, -0.055, 0.212, 0.478, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.212 std_dev=0.266
P	A	0, 0.091, 0.413, 0.735, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.413 std_dev=0.322
O4'	B	0, 0.085, 0.408, 0.731, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.408 std_dev=0.323
C3'	A	0, -0.137, 0.222, 0.580, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.222 std_dev=0.359
O2'	A	0, -0.031, 0.332, 0.695, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.332 std_dev=0.363
C4'	B	0, 0.071, 0.440, 0.808, 2.213 max_d=2.213 avg_d=0.440 std_dev=0.369
O5'	A	0, -0.038, 0.347, 0.733, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.347 std_dev=0.385
OP2	A	0, 0.219, 0.627, 1.035, 2.226 max_d=2.226 avg_d=0.627 std_dev=0.408
N9	B	0, 0.019, 0.448, 0.877, 2.076 max_d=2.076 avg_d=0.448 std_dev=0.429
OP1	A	0, 0.179, 0.709, 1.238, 3.127 max_d=3.127 avg_d=0.709 std_dev=0.529
C5'	B	0, -0.149, 0.515, 1.178, 3.895 max_d=3.895 avg_d=0.515 std_dev=0.663
O5'	B	0, -0.237, 0.444, 1.125, 3.974 max_d=3.974 avg_d=0.444 std_dev=0.681
C8	B	0, -0.123, 0.577, 1.277, 4.012 max_d=4.012 avg_d=0.577 std_dev=0.700
O3'	A	0, -0.336, 0.367, 1.070, 3.109 max_d=3.109 avg_d=0.367 std_dev=0.703
C4	B	0, -0.193, 0.513, 1.218, 3.993 max_d=3.993 avg_d=0.513 std_dev=0.705
C5	B	0, -0.228, 0.597, 1.423, 4.409 max_d=4.409 avg_d=0.597 std_dev=0.825
N7	B	0, -0.192, 0.664, 1.520, 4.363 max_d=4.363 avg_d=0.664 std_dev=0.856
N3	B	0, -0.381, 0.627, 1.635, 5.254 max_d=5.254 avg_d=0.627 std_dev=1.008
P	B	0, -0.519, 0.562, 1.643, 6.229 max_d=6.229 avg_d=0.562 std_dev=1.081
C6	B	0, -0.428, 0.687, 1.802, 6.272 max_d=6.272 avg_d=0.687 std_dev=1.115
OP2	B	0, -0.647, 0.529, 1.705, 6.817 max_d=6.817 avg_d=0.529 std_dev=1.176
O6	B	0, -0.500, 0.779, 2.059, 6.987 max_d=6.987 avg_d=0.779 std_dev=1.280
OP1	B	0, -0.629, 0.674, 1.978, 7.540 max_d=7.540 avg_d=0.674 std_dev=1.304
C2	B	0, -0.573, 0.762, 2.097, 6.934 max_d=6.934 avg_d=0.762 std_dev=1.335
N1	B	0, -0.575, 0.762, 2.099, 7.419 max_d=7.419 avg_d=0.762 std_dev=1.337
N2	B	0, -0.811, 0.945, 2.701, 8.328 max_d=8.328 avg_d=0.945 std_dev=1.756

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.19	0.00	0.11	0.12	0.36	0.11
C2	0.01	0.00	0.07	0.17	0.01	0.03	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.06	0.03	0.21	0.18	0.34	0.14
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.10	0.18	0.10	0.02	0.04	0.07	0.16	0.01	0.02	0.01	0.11	0.22	0.56	0.29
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.20	0.00	0.19	0.01	0.16	0.14	0.20	0.21	0.16	0.02	0.00	0.01	0.06	0.14	0.31	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.20	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.24	0.14	0.02	0.25	0.23	0.36	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.07	0.03	0.19	0.02	0.01	0.01	0.12	0.25	0.05
C5	0.01	0.00	0.10	0.19	0.00	0.07	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.14	0.04	0.23	0.20	0.36	0.18
C5'	0.11	0.14	0.18	0.01	0.18	0.01	0.20	0.00	0.19	0.15	0.15	0.19	0.11	0.04	0.14	0.02	0.01	0.21	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.09	0.05	0.20	0.16	0.33	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.12	0.05	0.01	0.19	0.15	0.33	0.12
N3	0.01	0.00	0.04	0.20	0.00	0.04	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.21	0.09	0.02	0.24	0.22	0.35	0.17
N4	0.02	0.02	0.07	0.21	0.01	0.07	0.01	0.19	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.28	0.17	0.02	0.26	0.26	0.37	0.21
O2	0.02	0.01	0.16	0.16	0.02	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.11	0.10	0.06	0.20	0.18	0.33	0.12
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.24	0.19	0.21	0.04	0.15	0.12	0.21	0.28	0.11	0.00	0.04	0.14	0.05	0.22	0.62	0.27
O3'	0.19	0.06	0.02	0.00	0.14	0.02	0.14	0.14	0.09	0.05	0.09	0.17	0.10	0.04	0.00	0.19	0.23	0.37	0.28	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.06	0.14	0.19	0.00	0.14	0.20	0.23	0.10
O5'	0.11	0.21	0.11	0.06	0.25	0.01	0.23	0.01	0.20	0.19	0.24	0.26	0.20	0.05	0.23	0.14	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.12	0.18	0.22	0.14	0.23	0.12	0.20	0.21	0.16	0.15	0.22	0.26	0.18	0.22	0.37	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.34	0.56	0.31	0.36	0.25	0.36	0.19	0.33	0.33	0.35	0.37	0.33	0.62	0.28	0.23	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.29	0.13	0.19	0.05	0.18	0.01	0.14	0.12	0.17	0.21	0.12	0.27	0.27	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.75	0.12	0.16	0.44	0.15	0.41	0.34	0.55	0.20	0.71	0.91	0.61	0.26	0.24	0.18	0.08	0.08	0.45	0.53	0.71	0.62	0.59
C2	0.18	1.03	0.09	0.15	0.58	0.19	0.57	0.46	0.77	0.31	0.99	1.25	0.83	0.40	0.31	0.11	0.07	0.08	0.58	0.77	0.98	0.86	0.82
C2'	0.14	0.57	0.13	0.34	0.30	0.38	0.32	0.54	0.45	0.19	0.57	0.71	0.43	0.22	0.15	0.07	0.26	0.25	0.55	0.46	0.81	0.60	0.66
C3'	0.14	0.50	0.17	0.07	0.36	0.09	0.39	0.18	0.47	0.25	0.52	0.56	0.41	0.33	0.25	0.18	0.08	0.07	0.19	0.48	0.32	0.19	0.23
C4	0.20	1.10	0.08	0.13	0.65	0.20	0.67	0.49	0.86	0.43	1.06	1.31	0.90	0.53	0.37	0.07	0.07	0.09	0.64	0.85	1.06	0.98	0.92
C4'	0.10	0.34	0.12	0.11	0.22	0.10	0.22	0.16	0.27	0.14	0.32	0.41	0.29	0.17	0.15	0.14	0.07	0.08	0.21	0.26	0.31	0.26	0.25
C5	0.18	0.92	0.08	0.13	0.57	0.18	0.54	0.43	0.67	0.37	0.84	1.08	0.79	0.43	0.32	0.08	0.07	0.09	0.58	0.64	0.88	0.83	0.78
C5'	0.11	0.24	0.15	0.19	0.16	0.17	0.14	0.22	0.17	0.08	0.21	0.29	0.21	0.09	0.12	0.14	0.11	0.14	0.25	0.16	0.34	0.29	0.29
C6	0.16	0.79	0.09	0.15	0.48	0.16	0.43	0.38	0.56	0.25	0.72	0.95	0.68	0.30	0.26	0.10	0.07	0.09	0.51	0.53	0.75	0.70	0.66
N1	0.16	0.87	0.10	0.16	0.50	0.17	0.47	0.40	0.63	0.24	0.82	1.05	0.72	0.31	0.27	0.12	0.07	0.08	0.52	0.61	0.83	0.74	0.70
N3	0.19	1.13	0.08	0.14	0.65	0.20	0.66	0.49	0.88	0.39	1.10	1.36	0.91	0.50	0.35	0.08	0.07	0.08	0.63	0.89	1.09	0.97	0.91
N4	0.21	1.17	0.08	0.11	0.71	0.20	0.77	0.52	0.99	0.54	1.15	1.40	0.95	0.66	0.41	0.08	0.08	0.09	0.67	1.01	1.15	1.10	1.00
O2	0.17	1.04	0.09	0.16	0.58	0.19	0.57	0.46	0.79	0.29	1.01	1.27	0.82	0.38	0.30	0.12	0.07	0.08	0.58	0.79	0.99	0.86	0.82
O2'	0.10	0.64	0.10	0.31	0.32	0.40	0.32	0.61	0.47	0.14	0.62	0.80	0.49	0.18	0.14	0.15	0.21	0.24	0.62	0.48	0.98	0.71	0.78
O3'	0.21	0.44	0.23	0.13	0.36	0.12	0.39	0.10	0.44	0.30	0.47	0.47	0.38	0.36	0.29	0.21	0.21	0.16	0.13	0.46	0.20	0.08	0.13
O4'	0.24	0.58	0.22	0.15	0.39	0.14	0.35	0.19	0.42	0.24	0.53	0.70	0.51	0.27	0.28	0.26	0.13	0.19	0.30	0.39	0.44	0.46	0.38
O5'	0.09	0.11	0.11	0.10	0.08	0.08	0.12	0.12	0.13	0.14	0.12	0.15	0.09	0.15	0.09	0.14	0.01	0.07	0.17	0.14	0.19	0.18	0.17
OP1	0.14	0.27	0.07	0.03	0.12	0.11	0.13	0.14	0.13	0.21	0.19	0.38	0.26	0.22	0.09	0.13	0.01	0.14	0.31	0.16	0.56	0.56	0.47
OP2	0.12	0.39	0.22	0.03	0.37	0.17	0.44	0.20	0.48	0.36	0.46	0.38	0.33	0.44	0.30	0.20	0.02	0.09	0.09	0.52	0.16	0.18	0.10
P	0.06	0.11	0.09	0.01	0.10	0.09	0.15	0.04	0.16	0.17	0.13	0.14	0.09	0.20	0.09	0.10	0.01	0.08	0.13	0.19	0.23	0.26	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.14	0.00	0.13	0.02	0.12	0.20	0.14
C2	0.03	0.00	0.16	0.13	0.01	0.17	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.15	0.42	0.02	0.49	0.68	0.56
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.07	0.01	0.02	0.09	0.05	0.11	0.10	0.21	0.16	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.20	0.03	0.18	0.28	0.22
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.12	0.10	0.18	0.13	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.07	0.04	0.04
C4	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.10	0.07	0.15	0.01	0.15	0.28	0.21
C4'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.12	0.12	0.23	0.17	0.10	0.02	0.12	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.06	0.04	0.20	0.01	0.22	0.33	0.26
C5'	0.05	0.32	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.00	0.10	0.29	0.21	0.45	0.29	0.24	0.09	0.04	0.09	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.07	0.17	0.01	0.20	0.33	0.25
C8	0.02	0.01	0.11	0.12	0.00	0.12	0.01	0.29	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.07	0.10	0.47	0.02	0.50	0.61	0.54
N1	0.02	0.00	0.10	0.10	0.02	0.12	0.02	0.21	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.12	0.11	0.28	0.02	0.33	0.49	0.39
N2	0.05	0.01	0.21	0.18	0.01	0.23	0.01	0.45	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.19	0.18	0.60	0.03	0.74	0.99	0.81
N3	0.03	0.01	0.16	0.13	0.00	0.17	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.16	0.15	0.38	0.01	0.41	0.58	0.48
N7	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.10	0.00	0.24	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.16	0.06	0.07	0.41	0.02	0.47	0.59	0.51
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.02	0.20	0.02	0.20	0.28	0.23
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.10	0.12	0.14	0.04	0.14	0.15	0.12	0.15	0.10	0.16	0.09	0.00	0.04	0.06	0.15	0.17	0.14	0.30	0.17
O3'	0.14	0.15	0.02	0.01	0.10	0.02	0.06	0.09	0.08	0.07	0.12	0.19	0.16	0.06	0.08	0.04	0.00	0.09	0.14	0.06	0.27	0.19	0.20
O4'	0.00	0.15	0.02	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.10	0.11	0.18	0.15	0.07	0.02	0.06	0.09	0.00	0.06	0.05	0.06	0.09	0.06
O5'	0.13	0.42	0.20	0.04	0.15	0.01	0.20	0.01	0.17	0.47	0.28	0.60	0.38	0.41	0.20	0.15	0.14	0.06	0.00	0.21	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.17	0.06	0.05	0.21	0.00	0.25	0.37	0.29
OP1	0.12	0.49	0.18	0.07	0.15	0.05	0.22	0.05	0.20	0.50	0.33	0.74	0.41	0.47	0.20	0.14	0.27	0.06	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.68	0.28	0.04	0.28	0.03	0.33	0.02	0.33	0.61	0.49	0.99	0.58	0.59	0.28	0.30	0.19	0.09	0.02	0.37	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.56	0.22	0.04	0.21	0.01	0.26	0.01	0.25	0.54	0.39	0.81	0.48	0.51	0.23	0.17	0.20	0.06	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00