Doublet Group distance statistics: 54131

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 7, 8, 0, 1, 0, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.019, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.002, 0.021, 0.039, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.004, 0.023, 0.043, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.023 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.027, 0.059, 0.091, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.059 std_dev=0.032
O2	A	0, 0.017, 0.058, 0.099, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.058 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.047, 0.103, 0.158, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.103 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.024, 0.101, 0.179, 0.304 max_d=0.304 avg_d=0.101 std_dev=0.078
O2'	A	0, 0.100, 0.187, 0.273, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.187 std_dev=0.086
C3'	A	0, 0.033, 0.221, 0.408, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.221 std_dev=0.187
C4'	A	0, 0.057, 0.247, 0.438, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.247 std_dev=0.191
O3'	B	0, 0.202, 0.400, 0.598, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.400 std_dev=0.198
C3'	B	0, 0.179, 0.397, 0.615, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.397 std_dev=0.218
C2'	B	0, 0.166, 0.397, 0.627, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.397 std_dev=0.230
P	A	0, 0.169, 0.403, 0.636, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.403 std_dev=0.234
C4'	B	0, 0.171, 0.432, 0.694, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.432 std_dev=0.261
O5'	A	0, 0.225, 0.489, 0.753, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.489 std_dev=0.264
OP2	A	0, 0.183, 0.451, 0.720, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.451 std_dev=0.268
OP1	A	0, 0.253, 0.521, 0.790, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.521 std_dev=0.269
O2'	B	0, 0.154, 0.439, 0.725, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.439 std_dev=0.285
C5'	B	0, 0.167, 0.455, 0.743, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.455 std_dev=0.288
O5'	B	0, 0.178, 0.468, 0.759, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.468 std_dev=0.291
P	B	0, 0.219, 0.512, 0.805, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.512 std_dev=0.293
O3'	A	0, -0.030, 0.281, 0.592, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.281 std_dev=0.311
OP1	B	0, 0.183, 0.517, 0.850, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.517 std_dev=0.333
O4'	B	0, 0.133, 0.506, 0.879, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.506 std_dev=0.373
C1'	B	0, 0.118, 0.497, 0.877, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.497 std_dev=0.379
OP2	B	0, 0.166, 0.596, 1.026, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.596 std_dev=0.430
C5'	A	0, 0.104, 0.565, 1.025, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.565 std_dev=0.461
N9	B	0, 0.093, 0.568, 1.042, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.568 std_dev=0.475
C4	B	0, 0.093, 0.643, 1.194, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.643 std_dev=0.551
N3	B	0, 0.099, 0.684, 1.268, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.684 std_dev=0.584
C8	B	0, 0.046, 0.641, 1.237, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.641 std_dev=0.596
C2	B	0, 0.114, 0.741, 1.368, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.741 std_dev=0.627
C5	B	0, 0.054, 0.730, 1.405, 2.062 max_d=2.062 avg_d=0.730 std_dev=0.675
N1	B	0, 0.103, 0.794, 1.484, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.794 std_dev=0.691
N2	B	0, 0.101, 0.797, 1.493, 2.161 max_d=2.161 avg_d=0.797 std_dev=0.696
N7	B	0, 0.006, 0.753, 1.500, 2.272 max_d=2.272 avg_d=0.753 std_dev=0.747
C6	B	0, 0.053, 0.825, 1.596, 2.363 max_d=2.363 avg_d=0.825 std_dev=0.772
O6	B	0, -0.002, 0.962, 1.926, 2.941 max_d=2.941 avg_d=0.962 std_dev=0.964

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.07	0.03	0.02	0.01	0.15	0.23	0.15	0.10
C2	0.04	0.00	0.04	0.12	0.02	0.06	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.11	0.12	0.04	0.24	0.21	0.20	0.13
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02	0.04	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.18	0.26	0.16	0.14
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.15	0.01	0.14	0.11	0.12	0.09	0.15	0.16	0.12	0.02	0.01	0.02	0.23	0.31	0.16	0.17
C4	0.02	0.02	0.03	0.15	0.00	0.10	0.01	0.24	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.09	0.17	0.04	0.31	0.18	0.24	0.16
C4'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.10	0.00	0.12	0.02	0.11	0.06	0.07	0.11	0.08	0.10	0.04	0.02	0.02	0.24	0.22	0.05
C5	0.02	0.02	0.03	0.14	0.01	0.12	0.00	0.26	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.15	0.05	0.32	0.17	0.24	0.16
C5'	0.05	0.14	0.06	0.11	0.24	0.02	0.26	0.00	0.21	0.14	0.20	0.27	0.11	0.10	0.11	0.02	0.03	0.29	0.30	0.03
C6	0.02	0.02	0.03	0.12	0.02	0.11	0.01	0.21	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.12	0.05	0.29	0.18	0.20	0.13
N1	0.01	0.02	0.02	0.09	0.02	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.09	0.02	0.23	0.20	0.19	0.12
N3	0.03	0.01	0.04	0.15	0.01	0.07	0.02	0.20	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.12	0.16	0.03	0.28	0.20	0.22	0.14
N4	0.03	0.03	0.04	0.16	0.01	0.11	0.02	0.27	0.02	0.03	0.03	0.00	0.05	0.11	0.19	0.04	0.33	0.18	0.26	0.18
O2	0.07	0.02	0.08	0.12	0.03	0.08	0.03	0.11	0.03	0.03	0.03	0.05	0.00	0.15	0.12	0.07	0.20	0.23	0.20	0.13
O2'	0.03	0.11	0.01	0.02	0.09	0.10	0.05	0.10	0.04	0.05	0.12	0.11	0.15	0.00	0.05	0.09	0.06	0.18	0.20	0.08
O3'	0.02	0.12	0.04	0.01	0.17	0.04	0.15	0.11	0.12	0.09	0.16	0.19	0.12	0.05	0.00	0.02	0.18	0.31	0.17	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.07	0.09	0.02	0.00	0.10	0.23	0.16	0.09
O5'	0.15	0.24	0.18	0.23	0.31	0.02	0.32	0.03	0.29	0.23	0.28	0.33	0.20	0.06	0.18	0.10	0.00	0.05	0.08	0.01
OP1	0.23	0.21	0.26	0.31	0.18	0.24	0.17	0.29	0.18	0.20	0.20	0.18	0.23	0.18	0.31	0.23	0.05	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.20	0.16	0.16	0.24	0.22	0.24	0.30	0.20	0.19	0.22	0.26	0.20	0.20	0.17	0.16	0.08	0.02	0.00	0.02
P	0.10	0.13	0.14	0.17	0.16	0.05	0.16	0.03	0.13	0.12	0.14	0.18	0.13	0.08	0.16	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.14	0.14	0.13	0.13	0.13	0.12	0.10	0.11	0.13	0.12	0.16	0.15	0.13	0.13	0.19	0.16	0.15	0.16	0.11	0.31	0.28	0.26
C2	0.25	0.26	0.18	0.18	0.24	0.20	0.23	0.18	0.23	0.22	0.24	0.27	0.26	0.22	0.23	0.19	0.15	0.26	0.20	0.22	0.32	0.27	0.27
C2'	0.15	0.12	0.15	0.14	0.11	0.13	0.11	0.08	0.10	0.13	0.10	0.16	0.14	0.14	0.11	0.20	0.18	0.14	0.15	0.12	0.30	0.31	0.26
C3'	0.16	0.13	0.16	0.17	0.13	0.15	0.15	0.14	0.14	0.18	0.12	0.14	0.14	0.19	0.14	0.18	0.19	0.15	0.24	0.17	0.42	0.38	0.37
C4	0.32	0.35	0.19	0.19	0.32	0.24	0.30	0.22	0.30	0.28	0.33	0.37	0.35	0.28	0.30	0.19	0.13	0.33	0.24	0.29	0.32	0.26	0.28
C4'	0.12	0.08	0.12	0.13	0.10	0.14	0.13	0.16	0.13	0.16	0.09	0.09	0.10	0.18	0.11	0.15	0.14	0.14	0.25	0.16	0.46	0.39	0.40
C5	0.30	0.31	0.19	0.19	0.28	0.23	0.25	0.22	0.24	0.23	0.28	0.34	0.32	0.22	0.27	0.20	0.13	0.31	0.24	0.22	0.32	0.25	0.28
C5'	0.17	0.14	0.13	0.17	0.18	0.19	0.25	0.28	0.24	0.30	0.18	0.12	0.14	0.32	0.21	0.13	0.11	0.21	0.38	0.29	0.63	0.50	0.52
C6	0.25	0.24	0.18	0.17	0.22	0.20	0.18	0.19	0.18	0.18	0.20	0.26	0.25	0.17	0.21	0.21	0.13	0.25	0.22	0.15	0.32	0.25	0.28
N1	0.22	0.21	0.17	0.16	0.19	0.18	0.17	0.15	0.17	0.17	0.18	0.23	0.21	0.17	0.19	0.20	0.15	0.22	0.19	0.16	0.32	0.26	0.26
N3	0.30	0.32	0.18	0.18	0.30	0.23	0.29	0.21	0.29	0.27	0.31	0.33	0.32	0.28	0.28	0.18	0.14	0.31	0.23	0.28	0.32	0.27	0.28
N4	0.35	0.41	0.20	0.20	0.38	0.25	0.36	0.24	0.37	0.32	0.39	0.44	0.41	0.33	0.35	0.19	0.14	0.36	0.25	0.35	0.32	0.26	0.29
O2	0.24	0.24	0.18	0.18	0.23	0.20	0.22	0.16	0.23	0.22	0.23	0.25	0.24	0.23	0.22	0.19	0.17	0.24	0.19	0.22	0.31	0.27	0.26
O2'	0.13	0.12	0.14	0.13	0.13	0.13	0.17	0.12	0.17	0.19	0.13	0.13	0.12	0.21	0.13	0.20	0.18	0.12	0.13	0.20	0.27	0.32	0.21
O3'	0.15	0.13	0.16	0.16	0.14	0.14	0.16	0.13	0.16	0.18	0.13	0.14	0.14	0.21	0.14	0.18	0.18	0.14	0.24	0.20	0.43	0.40	0.38
O4'	0.14	0.11	0.13	0.13	0.10	0.13	0.10	0.13	0.10	0.13	0.09	0.13	0.12	0.14	0.11	0.17	0.16	0.14	0.20	0.11	0.37	0.32	0.32
O5'	0.05	0.06	0.04	0.06	0.10	0.10	0.21	0.18	0.22	0.25	0.13	0.08	0.07	0.30	0.11	0.10	0.03	0.09	0.23	0.29	0.41	0.32	0.32
OP1	0.07	0.16	0.11	0.06	0.15	0.13	0.26	0.23	0.29	0.25	0.23	0.16	0.12	0.32	0.12	0.14	0.03	0.10	0.24	0.36	0.53	0.18	0.35
OP2	0.15	0.19	0.17	0.09	0.17	0.06	0.18	0.06	0.20	0.20	0.17	0.23	0.21	0.23	0.16	0.21	0.04	0.10	0.12	0.25	0.36	0.12	0.21
P	0.04	0.04	0.06	0.02	0.07	0.05	0.18	0.09	0.20	0.22	0.11	0.06	0.04	0.26	0.08	0.11	0.01	0.04	0.11	0.27	0.36	0.11	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.09	0.05
C2	0.04	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.05	0.10	0.03	0.10	0.18	0.14
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.07	0.08	0.06	0.08	0.07	0.09	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.09	0.16	0.07	0.08
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.01	0.12	0.02	0.12	0.15	0.08	0.07	0.05	0.16	0.07	0.03	0.01	0.02	0.05	0.15	0.19	0.07	0.10
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.11	0.02	0.11	0.18	0.14
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.06	0.02	0.01	0.02	0.06	0.08	0.03	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.14	0.02	0.15	0.22	0.17
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.02	0.08	0.00	0.08	0.09	0.07	0.06	0.05	0.10	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.10	0.08	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.12	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.13	0.04	0.14	0.01	0.15	0.22	0.17
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.17	0.06	0.15	0.03	0.16	0.20	0.16
N1	0.03	0.01	0.06	0.08	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.09	0.04	0.12	0.02	0.12	0.20	0.16
N2	0.05	0.01	0.08	0.07	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.13	0.10	0.07	0.10	0.04	0.09	0.18	0.14
N3	0.04	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.06	0.09	0.03	0.09	0.17	0.13
N7	0.01	0.01	0.09	0.16	0.01	0.07	0.00	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.19	0.06	0.16	0.03	0.18	0.23	0.18
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.10	0.03	0.10	0.15	0.12
O2'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.07	0.06	0.05	0.05	0.07	0.05	0.08	0.13	0.12	0.06	0.04	0.00	0.06	0.04	0.04	0.08	0.17	0.06	0.07
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.06	0.02	0.12	0.03	0.13	0.17	0.09	0.10	0.07	0.19	0.06	0.06	0.00	0.02	0.07	0.18	0.25	0.10	0.14
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.07	0.06	0.06	0.02	0.04	0.02	0.00	0.07	0.05	0.09	0.10	0.09
O5'	0.04	0.10	0.05	0.05	0.11	0.02	0.14	0.01	0.14	0.15	0.12	0.10	0.09	0.16	0.10	0.04	0.07	0.07	0.00	0.15	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.03	0.09	0.15	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.08	0.18	0.05	0.15	0.00	0.18	0.24	0.19
OP1	0.06	0.10	0.16	0.19	0.11	0.08	0.15	0.08	0.15	0.16	0.12	0.09	0.09	0.18	0.10	0.17	0.25	0.09	0.02	0.18	0.00	0.02	0.01
OP2	0.09	0.18	0.07	0.07	0.18	0.03	0.22	0.02	0.22	0.20	0.20	0.18	0.17	0.23	0.15	0.06	0.10	0.10	0.03	0.24	0.02	0.00	0.02
P	0.05	0.14	0.08	0.10	0.14	0.03	0.17	0.02	0.17	0.16	0.16	0.14	0.13	0.18	0.12	0.07	0.14	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00