Doublet Group distance statistics: 54139

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.012, 0.026, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.029, 0.071, 0.114, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.071 std_dev=0.043
N4	A	0, 0.053, 0.100, 0.147, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.100 std_dev=0.047
C2'	A	0, 0.100, 0.232, 0.363, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.232 std_dev=0.131
O4'	A	0, 0.110, 0.258, 0.407, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.258 std_dev=0.149
O2'	A	0, 0.160, 0.313, 0.465, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.313 std_dev=0.153
C3'	A	0, 0.177, 0.407, 0.637, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.407 std_dev=0.230
C4'	A	0, 0.140, 0.375, 0.611, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.375 std_dev=0.235
O5'	A	0, 0.298, 0.576, 0.855, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.576 std_dev=0.278
O3'	A	0, 0.274, 0.581, 0.888, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.581 std_dev=0.307
P	A	0, 0.385, 0.726, 1.066, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.726 std_dev=0.340
O2'	B	0, 0.297, 0.685, 1.073, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.685 std_dev=0.388
O3'	B	0, 0.382, 0.776, 1.170, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.776 std_dev=0.394
C2'	B	0, 0.371, 0.774, 1.177, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.774 std_dev=0.403
C5'	A	0, 0.208, 0.622, 1.037, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.622 std_dev=0.415
OP1	A	0, 0.379, 0.806, 1.233, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.806 std_dev=0.427
C3'	B	0, 0.423, 0.884, 1.346, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.884 std_dev=0.461
N3	B	0, 0.453, 0.928, 1.404, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.928 std_dev=0.476
C1'	B	0, 0.427, 0.918, 1.410, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.918 std_dev=0.491
N2	B	0, 0.489, 0.996, 1.502, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.996 std_dev=0.506
C2	B	0, 0.501, 1.016, 1.532, 1.744 max_d=1.744 avg_d=1.016 std_dev=0.515
O5'	B	0, 0.494, 1.020, 1.545, 1.796 max_d=1.796 avg_d=1.020 std_dev=0.525
C4	B	0, 0.502, 1.030, 1.558, 1.673 max_d=1.673 avg_d=1.030 std_dev=0.528
N9	B	0, 0.494, 1.031, 1.568, 1.770 max_d=1.770 avg_d=1.031 std_dev=0.537
OP2	A	0, 0.331, 0.872, 1.412, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.872 std_dev=0.541
C4'	B	0, 0.460, 1.011, 1.561, 1.879 max_d=1.879 avg_d=1.011 std_dev=0.550
O4'	B	0, 0.471, 1.041, 1.611, 1.989 max_d=1.989 avg_d=1.041 std_dev=0.570
N1	B	0, 0.572, 1.173, 1.774, 1.992 max_d=1.992 avg_d=1.173 std_dev=0.601
C5	B	0, 0.583, 1.191, 1.800, 1.977 max_d=1.977 avg_d=1.191 std_dev=0.609
C8	B	0, 0.577, 1.200, 1.823, 2.093 max_d=2.093 avg_d=1.200 std_dev=0.623
C6	B	0, 0.617, 1.267, 1.918, 2.094 max_d=2.094 avg_d=1.267 std_dev=0.651
N7	B	0, 0.622, 1.287, 1.951, 2.212 max_d=2.212 avg_d=1.287 std_dev=0.664
P	B	0, 0.602, 1.287, 1.972, 2.406 max_d=2.406 avg_d=1.287 std_dev=0.685
OP2	B	0, 0.635, 1.357, 2.080, 2.576 max_d=2.576 avg_d=1.357 std_dev=0.722
O6	B	0, 0.684, 1.420, 2.156, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.420 std_dev=0.736
OP1	B	0, 0.607, 1.367, 2.128, 2.784 max_d=2.784 avg_d=1.367 std_dev=0.761
C5'	B	0, 0.504, 1.275, 2.046, 2.495 max_d=2.495 avg_d=1.275 std_dev=0.771

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.48	0.16	0.21
C2	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.01	0.13	0.49	0.17	0.20
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.09	0.00	0.01	0.01	0.16	0.49	0.15	0.24
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.10	0.07	0.11	0.12	0.11	0.02	0.01	0.02	0.25	0.44	0.14	0.23
C4	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.19	0.41	0.17	0.17
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.06	0.07	0.10	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.35	0.05	0.10
C5	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.21	0.39	0.17	0.17
C5'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.20	0.00	0.21	0.00	0.18	0.12	0.17	0.22	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.22	0.06	0.01
C6	0.00	0.00	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.03	0.18	0.46	0.18	0.19
N1	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.12	0.49	0.17	0.20
N3	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.01	0.16	0.46	0.17	0.19
N4	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02	0.21	0.36	0.17	0.16
O2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.12	0.02	0.10	0.50	0.17	0.20
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.03	0.03	0.07	0.06	0.10	0.00	0.03	0.06	0.06	0.41	0.05	0.15
O3'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.11	0.01	0.12	0.02	0.10	0.06	0.10	0.13	0.12	0.03	0.00	0.01	0.25	0.39	0.12	0.19
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.00	0.09	0.44	0.15	0.17
O5'	0.04	0.13	0.16	0.25	0.19	0.01	0.21	0.01	0.18	0.12	0.16	0.21	0.10	0.06	0.25	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.48	0.49	0.49	0.44	0.41	0.35	0.39	0.22	0.46	0.49	0.46	0.36	0.50	0.41	0.39	0.44	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.17	0.15	0.14	0.17	0.05	0.17	0.06	0.18	0.17	0.17	0.17	0.17	0.05	0.12	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.20	0.24	0.23	0.17	0.10	0.17	0.01	0.19	0.20	0.19	0.16	0.20	0.15	0.19	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.10	0.13	0.16	0.08	0.16	0.12	0.34	0.15	0.12	0.13	0.13	0.07	0.14	0.08	0.29	0.18	0.11	0.17	0.19	0.30	0.33	0.17
C2	0.22	0.11	0.18	0.11	0.13	0.14	0.12	0.18	0.13	0.14	0.11	0.12	0.13	0.13	0.15	0.35	0.13	0.18	0.21	0.16	0.36	0.26	0.19
C2'	0.06	0.14	0.07	0.20	0.10	0.17	0.15	0.40	0.18	0.13	0.16	0.18	0.10	0.17	0.08	0.24	0.19	0.10	0.19	0.21	0.30	0.41	0.22
C3'	0.09	0.10	0.12	0.16	0.06	0.17	0.12	0.43	0.14	0.12	0.12	0.14	0.06	0.15	0.07	0.29	0.15	0.10	0.25	0.19	0.33	0.44	0.26
C4	0.30	0.14	0.22	0.09	0.19	0.23	0.16	0.17	0.13	0.22	0.11	0.15	0.19	0.18	0.23	0.37	0.06	0.29	0.25	0.12	0.43	0.18	0.25
C4'	0.20	0.13	0.25	0.20	0.15	0.23	0.17	0.45	0.18	0.19	0.16	0.14	0.13	0.20	0.18	0.36	0.19	0.19	0.27	0.22	0.31	0.36	0.24
C5	0.28	0.14	0.22	0.09	0.18	0.20	0.15	0.14	0.13	0.21	0.11	0.14	0.17	0.17	0.22	0.37	0.06	0.25	0.24	0.12	0.43	0.18	0.24
C5'	0.34	0.25	0.41	0.32	0.28	0.33	0.27	0.49	0.27	0.29	0.25	0.23	0.27	0.27	0.31	0.48	0.29	0.32	0.33	0.29	0.32	0.34	0.25
C6	0.20	0.10	0.19	0.07	0.11	0.12	0.10	0.16	0.09	0.14	0.08	0.12	0.12	0.11	0.15	0.34	0.10	0.15	0.21	0.10	0.37	0.22	0.20
N1	0.17	0.08	0.16	0.11	0.09	0.12	0.09	0.22	0.10	0.11	0.08	0.11	0.09	0.10	0.11	0.33	0.14	0.13	0.19	0.13	0.34	0.27	0.18
N3	0.28	0.13	0.20	0.09	0.16	0.19	0.14	0.14	0.12	0.18	0.11	0.14	0.17	0.14	0.20	0.36	0.09	0.25	0.24	0.13	0.40	0.21	0.22
N4	0.35	0.18	0.23	0.12	0.23	0.30	0.20	0.25	0.16	0.27	0.15	0.18	0.23	0.22	0.28	0.35	0.05	0.36	0.27	0.15	0.47	0.17	0.29
O2	0.21	0.15	0.18	0.14	0.14	0.15	0.16	0.22	0.19	0.15	0.17	0.16	0.15	0.16	0.15	0.34	0.15	0.17	0.21	0.22	0.34	0.29	0.18
O2'	0.06	0.17	0.08	0.18	0.11	0.17	0.17	0.40	0.20	0.14	0.20	0.22	0.12	0.18	0.09	0.24	0.18	0.10	0.25	0.24	0.33	0.42	0.26
O3'	0.12	0.15	0.15	0.15	0.09	0.18	0.12	0.45	0.15	0.13	0.15	0.21	0.12	0.16	0.09	0.29	0.13	0.13	0.34	0.19	0.39	0.50	0.35
O4'	0.15	0.10	0.19	0.18	0.12	0.20	0.16	0.39	0.17	0.17	0.14	0.11	0.09	0.18	0.14	0.32	0.19	0.16	0.18	0.21	0.30	0.31	0.17
O5'	0.23	0.40	0.26	0.15	0.34	0.21	0.35	0.45	0.38	0.26	0.40	0.42	0.37	0.31	0.28	0.29	0.01	0.20	0.20	0.39	0.30	0.37	0.21
OP1	0.05	0.25	0.10	0.03	0.13	0.15	0.16	0.29	0.22	0.12	0.25	0.31	0.20	0.16	0.07	0.16	0.02	0.10	0.35	0.26	0.62	0.32	0.42
OP2	0.09	0.19	0.13	0.08	0.19	0.23	0.28	0.43	0.32	0.26	0.26	0.17	0.15	0.32	0.17	0.07	0.01	0.16	0.30	0.39	0.40	0.31	0.33
P	0.04	0.18	0.11	0.01	0.12	0.13	0.16	0.30	0.20	0.13	0.19	0.20	0.14	0.17	0.08	0.14	0.00	0.07	0.27	0.24	0.44	0.24	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.03	0.16	0.31	0.14
C2	0.02	0.00	0.07	0.11	0.00	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.29	0.01	0.26	0.31	0.22
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.06	0.07	0.05	0.10	0.07	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.23	0.08	0.30	0.21	0.16
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.05	0.09	0.10	0.10	0.14	0.10	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.31	0.11	0.39	0.15	0.23
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.29	0.01	0.24	0.31	0.21
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.05	0.05	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.07	0.14	0.31	0.04
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.36	0.01	0.28	0.31	0.25
C5'	0.04	0.15	0.04	0.05	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.15	0.18	0.14	0.12	0.19	0.11	0.02	0.07	0.01	0.01	0.21	0.19	0.39	0.02
C6	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.38	0.00	0.30	0.31	0.26
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.02	0.35	0.02	0.25	0.31	0.23
N1	0.02	0.00	0.05	0.10	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.35	0.00	0.29	0.31	0.25
N2	0.02	0.01	0.10	0.14	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.27	0.01	0.26	0.32	0.21
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.25	0.01	0.23	0.31	0.19
N7	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.02	0.39	0.01	0.28	0.30	0.26
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.26	0.02	0.22	0.31	0.19
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.06	0.06	0.06	0.08	0.05	0.06	0.03	0.00	0.06	0.02	0.08	0.08	0.23	0.22	0.07
O3'	0.02	0.11	0.03	0.01	0.06	0.02	0.09	0.07	0.11	0.11	0.11	0.14	0.09	0.12	0.04	0.06	0.00	0.02	0.25	0.14	0.45	0.16	0.25
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.02	0.10	0.37	0.16
O5'	0.13	0.29	0.23	0.31	0.29	0.02	0.36	0.01	0.38	0.35	0.35	0.27	0.25	0.39	0.26	0.08	0.25	0.08	0.00	0.42	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.02	0.42	0.00	0.32	0.31	0.29
OP1	0.16	0.26	0.30	0.39	0.24	0.14	0.28	0.19	0.30	0.25	0.29	0.26	0.23	0.28	0.22	0.23	0.45	0.10	0.01	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.31	0.21	0.15	0.31	0.31	0.31	0.39	0.31	0.31	0.31	0.32	0.31	0.30	0.31	0.22	0.16	0.37	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.22	0.16	0.23	0.21	0.04	0.25	0.02	0.26	0.23	0.25	0.21	0.19	0.26	0.19	0.07	0.25	0.16	0.00	0.29	0.01	0.01	0.00