Doublet Group distance statistics: 54141

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.020, 0.048, 0.077, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.048 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.068, 0.197, 0.326, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.197 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.090, 0.225, 0.360, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.225 std_dev=0.135
O4'	A	0, 0.048, 0.192, 0.336, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.192 std_dev=0.144
C4'	A	0, 0.109, 0.334, 0.559, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.334 std_dev=0.225
C3'	A	0, 0.082, 0.315, 0.549, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.315 std_dev=0.233
O3'	A	0, 0.108, 0.414, 0.721, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.414 std_dev=0.306
C2'	B	0, 0.298, 0.604, 0.910, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.604 std_dev=0.306
O2'	B	0, 0.353, 0.673, 0.992, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.673 std_dev=0.320
C3'	B	0, 0.288, 0.629, 0.970, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.629 std_dev=0.341
O3'	B	0, 0.338, 0.706, 1.075, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.706 std_dev=0.369
OP2	A	0, 0.474, 0.858, 1.242, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.858 std_dev=0.384
C5'	A	0, 0.220, 0.613, 1.007, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.613 std_dev=0.394
P	A	0, 0.442, 0.841, 1.239, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.841 std_dev=0.399
C1'	B	0, 0.285, 0.700, 1.116, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.700 std_dev=0.415
O5'	B	0, 0.562, 0.988, 1.414, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.988 std_dev=0.426
O4'	B	0, 0.339, 0.814, 1.289, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.814 std_dev=0.475
C4'	B	0, 0.316, 0.797, 1.278, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.797 std_dev=0.481
N9	B	0, 0.238, 0.735, 1.233, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.735 std_dev=0.497
N3	B	0, 0.337, 0.839, 1.341, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.839 std_dev=0.502
C5'	B	0, 0.471, 1.000, 1.529, 1.750 max_d=1.750 avg_d=1.000 std_dev=0.529
P	B	0, 0.731, 1.263, 1.796, 1.840 max_d=1.840 avg_d=1.263 std_dev=0.533
O5'	A	0, 0.307, 0.841, 1.375, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.841 std_dev=0.534
C4	B	0, 0.255, 0.790, 1.325, 1.991 max_d=1.991 avg_d=0.790 std_dev=0.535
C8	B	0, 0.262, 0.839, 1.415, 2.148 max_d=2.148 avg_d=0.839 std_dev=0.577
OP1	B	0, 0.816, 1.396, 1.977, 1.903 max_d=1.903 avg_d=1.396 std_dev=0.581
OP1	A	0, 0.643, 1.228, 1.813, 2.012 max_d=2.012 avg_d=1.228 std_dev=0.585
OP2	B	0, 0.734, 1.339, 1.943, 2.049 max_d=2.049 avg_d=1.339 std_dev=0.604
C2	B	0, 0.367, 0.976, 1.585, 2.336 max_d=2.336 avg_d=0.976 std_dev=0.609
C5	B	0, 0.232, 0.883, 1.534, 2.405 max_d=2.405 avg_d=0.883 std_dev=0.651
N2	B	0, 0.452, 1.109, 1.766, 2.495 max_d=2.495 avg_d=1.109 std_dev=0.657
N7	B	0, 0.224, 0.908, 1.591, 2.496 max_d=2.496 avg_d=0.908 std_dev=0.683
N1	B	0, 0.311, 1.038, 1.765, 2.684 max_d=2.684 avg_d=1.038 std_dev=0.727
C6	B	0, 0.240, 1.001, 1.761, 2.748 max_d=2.748 avg_d=1.001 std_dev=0.761
O6	B	0, 0.203, 1.107, 2.011, 3.132 max_d=3.132 avg_d=1.107 std_dev=0.904

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.20	0.07	0.43	0.13
C2	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.13	0.03	0.36	0.16	0.39	0.15
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.07	0.03	0.07	0.05	0.15	0.00	0.02	0.01	0.28	0.19	0.38	0.08
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.09	0.04	0.13	0.09	0.19	0.02	0.01	0.02	0.36	0.34	0.31	0.14
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.10	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.03	0.48	0.25	0.33	0.22
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.06	0.06	0.10	0.11	0.09	0.06	0.03	0.00	0.02	0.15	0.45	0.10
C5	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.08	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.04	0.50	0.27	0.34	0.24
C5'	0.03	0.17	0.02	0.03	0.22	0.01	0.20	0.00	0.16	0.13	0.21	0.24	0.16	0.06	0.05	0.02	0.00	0.31	0.45	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.04	0.45	0.20	0.38	0.19
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.35	0.14	0.41	0.14
N3	0.02	0.00	0.07	0.13	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.43	0.21	0.36	0.18
N4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.50	0.29	0.31	0.25
O2	0.03	0.00	0.15	0.19	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.21	0.04	0.29	0.11	0.41	0.13
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.05	0.04	0.09	0.00	0.06	0.03	0.10	0.12	0.41	0.12
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.09	0.03	0.09	0.05	0.11	0.04	0.13	0.10	0.21	0.06	0.00	0.03	0.27	0.41	0.27	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.00	0.07	0.09	0.47	0.19
O5'	0.20	0.36	0.28	0.36	0.48	0.02	0.50	0.00	0.45	0.35	0.43	0.50	0.29	0.10	0.27	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.16	0.19	0.34	0.25	0.15	0.27	0.31	0.20	0.14	0.21	0.29	0.11	0.12	0.41	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.43	0.39	0.38	0.31	0.33	0.45	0.34	0.45	0.38	0.41	0.36	0.31	0.41	0.41	0.27	0.47	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.15	0.08	0.14	0.22	0.10	0.24	0.02	0.19	0.14	0.18	0.25	0.13	0.12	0.14	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.34	0.15	0.22	0.34	0.16	0.42	0.22	0.43	0.41	0.38	0.37	0.31	0.46	0.32	0.22	0.16	0.18	0.39	0.46	0.34	0.54	0.41
C2	0.29	0.34	0.19	0.20	0.42	0.23	0.57	0.31	0.56	0.56	0.42	0.43	0.31	0.64	0.42	0.35	0.09	0.30	0.46	0.62	0.54	0.76	0.59
C2'	0.19	0.42	0.14	0.16	0.38	0.11	0.47	0.17	0.52	0.41	0.49	0.42	0.35	0.48	0.33	0.20	0.11	0.15	0.37	0.57	0.30	0.50	0.37
C3'	0.16	0.33	0.15	0.13	0.27	0.13	0.35	0.15	0.40	0.30	0.37	0.37	0.28	0.37	0.23	0.31	0.15	0.14	0.35	0.45	0.29	0.43	0.31
C4	0.26	0.45	0.23	0.20	0.24	0.27	0.36	0.41	0.26	0.53	0.31	0.65	0.35	0.58	0.33	0.37	0.12	0.33	0.53	0.33	0.70	0.89	0.72
C4'	0.15	0.28	0.14	0.13	0.20	0.13	0.25	0.14	0.28	0.24	0.27	0.35	0.25	0.29	0.17	0.33	0.13	0.13	0.38	0.32	0.26	0.36	0.30
C5	0.19	0.45	0.21	0.19	0.20	0.26	0.23	0.39	0.24	0.40	0.37	0.59	0.36	0.40	0.22	0.34	0.14	0.28	0.51	0.25	0.65	0.79	0.66
C5'	0.24	0.21	0.26	0.18	0.13	0.26	0.16	0.19	0.19	0.18	0.17	0.30	0.22	0.23	0.13	0.48	0.26	0.24	0.41	0.26	0.29	0.33	0.30
C6	0.15	0.32	0.14	0.18	0.21	0.21	0.27	0.32	0.25	0.38	0.25	0.44	0.28	0.40	0.23	0.31	0.09	0.22	0.46	0.28	0.51	0.65	0.54
N1	0.21	0.28	0.14	0.19	0.32	0.19	0.42	0.28	0.39	0.46	0.30	0.36	0.26	0.50	0.33	0.31	0.10	0.23	0.44	0.44	0.46	0.65	0.51
N3	0.30	0.36	0.22	0.20	0.38	0.27	0.55	0.37	0.52	0.59	0.33	0.56	0.31	0.68	0.41	0.37	0.10	0.34	0.51	0.60	0.65	0.87	0.68
N4	0.28	0.57	0.26	0.21	0.26	0.30	0.31	0.46	0.24	0.53	0.47	0.77	0.41	0.57	0.32	0.37	0.15	0.36	0.56	0.27	0.80	0.99	0.80
O2	0.32	0.48	0.21	0.21	0.51	0.23	0.66	0.29	0.71	0.58	0.62	0.46	0.41	0.69	0.46	0.34	0.11	0.31	0.45	0.78	0.50	0.75	0.56
O2'	0.24	0.49	0.22	0.24	0.42	0.17	0.49	0.21	0.55	0.42	0.55	0.51	0.40	0.49	0.36	0.15	0.20	0.19	0.37	0.60	0.28	0.48	0.36
O3'	0.15	0.37	0.14	0.13	0.28	0.15	0.36	0.16	0.43	0.29	0.42	0.41	0.30	0.36	0.22	0.27	0.18	0.13	0.36	0.49	0.27	0.39	0.28
O4'	0.13	0.27	0.11	0.18	0.21	0.10	0.25	0.17	0.25	0.27	0.24	0.34	0.25	0.30	0.19	0.30	0.17	0.11	0.37	0.28	0.27	0.41	0.33
O5'	0.19	0.43	0.21	0.11	0.31	0.07	0.29	0.15	0.34	0.20	0.40	0.50	0.40	0.24	0.22	0.23	0.02	0.10	0.35	0.34	0.28	0.30	0.26
OP1	0.14	0.18	0.07	0.13	0.17	0.24	0.24	0.35	0.24	0.31	0.20	0.22	0.15	0.32	0.20	0.05	0.01	0.22	0.54	0.28	0.45	0.38	0.45
OP2	0.10	0.25	0.17	0.06	0.14	0.19	0.12	0.36	0.17	0.10	0.22	0.30	0.22	0.11	0.08	0.17	0.02	0.14	0.47	0.17	0.49	0.42	0.44
P	0.04	0.19	0.09	0.02	0.09	0.11	0.11	0.18	0.14	0.13	0.16	0.25	0.17	0.14	0.05	0.10	0.01	0.06	0.38	0.15	0.27	0.21	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.11	0.19	0.13
C2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.14	0.03	0.21	0.00	0.24	0.45	0.32
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.09	0.12	0.10	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.06	0.09	0.11	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.11	0.11	0.11	0.12	0.09	0.12	0.06	0.01	0.01	0.02	0.18	0.13	0.13	0.07	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.08	0.01	0.23	0.00	0.27	0.42	0.33
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.09	0.13	0.06	0.05	0.03	0.13	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.12	0.12	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.31	0.01	0.41	0.56	0.45
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.13	0.01	0.21	0.00	0.21	0.24	0.16	0.06	0.07	0.26	0.13	0.03	0.05	0.01	0.01	0.26	0.14	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.09	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.12	0.02	0.33	0.00	0.45	0.61	0.49
C8	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.13	0.01	0.24	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.12	0.03	0.33	0.02	0.39	0.47	0.42
N1	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.13	0.02	0.28	0.01	0.35	0.55	0.42
N2	0.04	0.00	0.12	0.12	0.02	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.17	0.04	0.17	0.01	0.19	0.41	0.28
N3	0.03	0.01	0.10	0.09	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.12	0.03	0.16	0.00	0.19	0.37	0.26
N7	0.00	0.02	0.04	0.12	0.00	0.13	0.00	0.26	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.02	0.37	0.02	0.50	0.62	0.52
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.21	0.01	0.24	0.34	0.28
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.03	0.07	0.03	0.11	0.02	0.15	0.21	0.16	0.03	0.03	0.00	0.03	0.05	0.06	0.10	0.13	0.10	0.04
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.08	0.02	0.10	0.05	0.12	0.12	0.13	0.17	0.12	0.12	0.05	0.03	0.00	0.02	0.25	0.14	0.23	0.13	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.03	0.12	0.12	0.07
O5'	0.09	0.21	0.10	0.18	0.23	0.01	0.31	0.01	0.33	0.33	0.28	0.17	0.16	0.37	0.21	0.06	0.25	0.13	0.00	0.37	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.12	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.14	0.03	0.37	0.00	0.54	0.69	0.56
OP1	0.11	0.24	0.09	0.13	0.27	0.12	0.41	0.14	0.45	0.39	0.35	0.19	0.19	0.50	0.24	0.13	0.23	0.12	0.02	0.54	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.45	0.11	0.07	0.42	0.07	0.56	0.06	0.61	0.47	0.55	0.41	0.37	0.62	0.34	0.10	0.13	0.12	0.01	0.69	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.32	0.07	0.08	0.33	0.02	0.45	0.01	0.49	0.42	0.42	0.28	0.26	0.52	0.28	0.04	0.16	0.07	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00