Doublet Group distance statistics: 54142

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.012, 0.020, 0.028, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.020 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.019, 0.033, 0.048, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.033 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.018, 0.035, 0.053, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.035 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.024, 0.042, 0.061, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.042 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.024, 0.044, 0.064, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.044 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.024, 0.046, 0.067, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.046 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.031, 0.054, 0.077, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.054 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.057, 0.100, 0.142, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.100 std_dev=0.043
N4	A	0, 0.052, 0.099, 0.146, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.099 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.058, 0.110, 0.163, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.110 std_dev=0.052
C2'	A	0, 0.160, 0.316, 0.472, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.316 std_dev=0.156
C4'	A	0, 0.130, 0.306, 0.481, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.306 std_dev=0.175
C5'	A	0, 0.102, 0.297, 0.492, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.297 std_dev=0.195
O2'	B	0, 0.141, 0.370, 0.599, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.370 std_dev=0.229
C3'	A	0, 0.193, 0.440, 0.688, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.440 std_dev=0.247
C2'	B	0, 0.034, 0.296, 0.559, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.296 std_dev=0.263
O2'	A	0, 0.209, 0.474, 0.739, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.474 std_dev=0.265
O5'	A	0, 0.109, 0.391, 0.672, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.391 std_dev=0.282
O3'	B	0, 0.073, 0.364, 0.656, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.364 std_dev=0.292
P	A	0, 0.112, 0.422, 0.732, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.422 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.037, 0.363, 0.689, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.363 std_dev=0.326
OP1	A	0, 0.157, 0.524, 0.891, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.524 std_dev=0.367
OP2	A	0, 0.103, 0.487, 0.872, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.487 std_dev=0.385
C1'	B	0, 0.079, 0.497, 0.916, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.497 std_dev=0.419
O3'	A	0, 0.345, 0.785, 1.224, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.785 std_dev=0.440
C4	B	0, 0.304, 0.763, 1.222, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.763 std_dev=0.459
N9	B	0, 0.260, 0.721, 1.182, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.721 std_dev=0.461
N3	B	0, 0.204, 0.666, 1.128, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.666 std_dev=0.462
C4'	B	0, 0.041, 0.551, 1.062, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.551 std_dev=0.510
O4'	B	0, 0.076, 0.613, 1.149, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.613 std_dev=0.536
C2	B	0, 0.282, 0.822, 1.361, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.822 std_dev=0.539
C5	B	0, 0.476, 1.020, 1.564, 1.723 max_d=1.723 avg_d=1.020 std_dev=0.544
C8	B	0, 0.417, 0.992, 1.566, 1.756 max_d=1.756 avg_d=0.992 std_dev=0.575
N1	B	0, 0.433, 1.020, 1.608, 1.932 max_d=1.932 avg_d=1.020 std_dev=0.587
C6	B	0, 0.541, 1.138, 1.735, 1.959 max_d=1.959 avg_d=1.138 std_dev=0.597
N7	B	0, 0.547, 1.161, 1.775, 1.908 max_d=1.908 avg_d=1.161 std_dev=0.614
N2	B	0, 0.225, 0.859, 1.494, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.859 std_dev=0.634
O6	B	0, 0.670, 1.345, 2.020, 2.305 max_d=2.305 avg_d=1.345 std_dev=0.675
C5'	B	0, 0.054, 0.738, 1.421, 2.042 max_d=2.042 avg_d=0.738 std_dev=0.683
O5'	B	0, 0.264, 1.025, 1.785, 2.554 max_d=2.554 avg_d=1.025 std_dev=0.760
OP2	B	0, 0.511, 1.313, 2.115, 2.580 max_d=2.580 avg_d=1.313 std_dev=0.802
P	B	0, 0.416, 1.260, 2.104, 2.752 max_d=2.752 avg_d=1.260 std_dev=0.844
OP1	B	0, 0.422, 1.374, 2.325, 3.119 max_d=3.119 avg_d=1.374 std_dev=0.952

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.09	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.08	0.10	0.13	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.07	0.05	0.09	0.11	0.06	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.06	0.03
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.18	0.01	0.17	0.02	0.14	0.09	0.14	0.20	0.07	0.03	0.01	0.01	0.05	0.08	0.07	0.05
C4	0.01	0.01	0.10	0.18	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.23	0.01	0.18	0.22	0.24	0.17
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.10	0.01	0.08	0.05	0.08	0.11	0.04	0.05	0.03	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.17	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.21	0.01	0.21	0.21	0.26	0.18
C5'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.14	0.01	0.15	0.00	0.12	0.06	0.10	0.16	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.02	0.17	0.13	0.18	0.12
N1	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.09	0.08	0.13	0.07
N3	0.02	0.00	0.09	0.14	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.19	0.01	0.13	0.17	0.18	0.12
N4	0.01	0.01	0.11	0.20	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.28	0.01	0.21	0.28	0.29	0.21
O2	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.02	0.05	0.08	0.12	0.07
O2'	0.01	0.05	0.00	0.03	0.06	0.05	0.05	0.06	0.04	0.03	0.07	0.08	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.04
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.23	0.03	0.21	0.05	0.15	0.09	0.19	0.28	0.09	0.06	0.00	0.03	0.07	0.13	0.11	0.09
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.08	0.08	0.10	0.08
O5'	0.05	0.08	0.03	0.05	0.18	0.02	0.21	0.01	0.17	0.09	0.13	0.21	0.05	0.04	0.07	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.05	0.10	0.05	0.08	0.22	0.05	0.21	0.07	0.13	0.08	0.17	0.28	0.08	0.06	0.13	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.13	0.06	0.07	0.24	0.04	0.26	0.02	0.18	0.13	0.18	0.29	0.12	0.05	0.11	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.03	0.05	0.17	0.02	0.18	0.01	0.12	0.07	0.12	0.21	0.07	0.04	0.09	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.39	0.14	0.15	0.32	0.12	0.35	0.16	0.39	0.27	0.41	0.40	0.34	0.32	0.25	0.19	0.11	0.15	0.25	0.40	0.30	0.30	0.28
C2	0.15	0.35	0.08	0.17	0.32	0.15	0.41	0.26	0.47	0.34	0.44	0.32	0.28	0.41	0.27	0.14	0.11	0.16	0.40	0.50	0.41	0.48	0.44
C2'	0.17	0.37	0.12	0.11	0.28	0.09	0.31	0.13	0.37	0.23	0.40	0.41	0.31	0.28	0.22	0.23	0.07	0.12	0.24	0.38	0.29	0.29	0.27
C3'	0.17	0.30	0.14	0.07	0.23	0.08	0.24	0.09	0.28	0.19	0.31	0.34	0.26	0.21	0.19	0.25	0.06	0.12	0.19	0.28	0.28	0.23	0.22
C4	0.21	0.15	0.12	0.20	0.29	0.25	0.41	0.37	0.40	0.41	0.26	0.18	0.16	0.47	0.31	0.15	0.11	0.27	0.49	0.44	0.50	0.58	0.55
C4'	0.19	0.30	0.16	0.10	0.23	0.13	0.23	0.11	0.26	0.19	0.29	0.33	0.27	0.20	0.20	0.25	0.07	0.16	0.12	0.26	0.26	0.17	0.17
C5	0.20	0.13	0.13	0.19	0.25	0.24	0.32	0.34	0.27	0.35	0.18	0.17	0.13	0.37	0.28	0.16	0.11	0.25	0.44	0.28	0.43	0.47	0.47
C5'	0.19	0.22	0.18	0.10	0.19	0.15	0.20	0.11	0.21	0.20	0.22	0.24	0.20	0.20	0.19	0.26	0.08	0.17	0.07	0.21	0.27	0.16	0.15
C6	0.13	0.19	0.08	0.17	0.24	0.15	0.29	0.24	0.29	0.28	0.25	0.16	0.17	0.31	0.23	0.14	0.10	0.16	0.34	0.30	0.35	0.36	0.36
N1	0.14	0.33	0.08	0.16	0.30	0.12	0.35	0.21	0.39	0.29	0.37	0.29	0.27	0.34	0.25	0.15	0.10	0.13	0.33	0.40	0.35	0.38	0.36
N3	0.17	0.26	0.09	0.19	0.31	0.21	0.44	0.33	0.48	0.39	0.40	0.21	0.21	0.46	0.29	0.13	0.11	0.22	0.47	0.53	0.48	0.56	0.52
N4	0.27	0.17	0.16	0.22	0.31	0.31	0.44	0.45	0.40	0.48	0.22	0.25	0.19	0.54	0.35	0.16	0.13	0.35	0.56	0.46	0.58	0.68	0.64
O2	0.15	0.42	0.08	0.17	0.34	0.13	0.43	0.24	0.51	0.34	0.50	0.42	0.32	0.42	0.27	0.16	0.12	0.14	0.38	0.55	0.41	0.48	0.43
O2'	0.23	0.44	0.18	0.14	0.33	0.16	0.36	0.14	0.42	0.26	0.46	0.50	0.37	0.31	0.27	0.25	0.09	0.20	0.21	0.44	0.30	0.26	0.25
O3'	0.18	0.31	0.16	0.07	0.22	0.11	0.23	0.07	0.27	0.19	0.31	0.35	0.26	0.21	0.19	0.26	0.08	0.15	0.15	0.28	0.28	0.22	0.20
O4'	0.21	0.34	0.17	0.16	0.29	0.14	0.30	0.15	0.32	0.25	0.34	0.34	0.31	0.27	0.25	0.22	0.12	0.18	0.20	0.33	0.29	0.23	0.23
O5'	0.18	0.23	0.19	0.07	0.22	0.04	0.23	0.09	0.24	0.21	0.24	0.24	0.22	0.22	0.21	0.25	0.02	0.10	0.18	0.24	0.29	0.19	0.21
OP1	0.04	0.18	0.08	0.02	0.16	0.08	0.22	0.15	0.26	0.21	0.23	0.19	0.14	0.25	0.13	0.10	0.02	0.04	0.15	0.30	0.30	0.28	0.20
OP2	0.13	0.34	0.18	0.03	0.30	0.12	0.36	0.27	0.41	0.27	0.39	0.33	0.29	0.34	0.24	0.17	0.02	0.05	0.28	0.44	0.41	0.22	0.29
P	0.08	0.20	0.12	0.02	0.18	0.07	0.23	0.15	0.25	0.20	0.24	0.20	0.16	0.24	0.16	0.13	0.01	0.02	0.17	0.28	0.28	0.19	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.03	0.06	0.13	0.11
C2	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.09	0.02	0.10	0.20	0.16
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.05	0.09	0.11	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.11	0.05	0.03
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.10	0.12	0.10	0.12	0.09	0.11	0.07	0.02	0.01	0.02	0.06	0.12	0.16	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.09	0.02	0.11	0.20	0.16
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.05	0.05	0.06	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.02	0.13	0.02	0.16	0.25	0.21
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.06	0.04	0.09	0.05	0.05	0.03	0.01	0.00	0.09	0.08	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.13	0.03	0.13	0.00	0.16	0.26	0.21
C8	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.02	0.16	0.03	0.18	0.24	0.21
N1	0.03	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.13	0.03	0.12	0.01	0.13	0.24	0.19
N2	0.03	0.00	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.03	0.09	0.03	0.09	0.19	0.15
N3	0.03	0.00	0.09	0.09	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.08	0.01	0.08	0.18	0.14
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.05	0.00	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.02	0.15	0.03	0.20	0.28	0.23
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.03	0.11	0.18	0.15
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.08	0.03	0.10	0.13	0.10	0.04	0.02	0.00	0.04	0.05	0.04	0.08	0.17	0.05	0.05
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.08	0.03	0.12	0.03	0.13	0.13	0.13	0.15	0.10	0.14	0.07	0.04	0.00	0.02	0.10	0.16	0.28	0.20	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.04	0.10	0.14	0.13
O5'	0.05	0.09	0.04	0.06	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.16	0.12	0.09	0.08	0.15	0.10	0.04	0.10	0.07	0.00	0.15	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.08	0.12	0.02	0.06	0.02	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.08	0.16	0.04	0.15	0.00	0.20	0.30	0.24
OP1	0.06	0.10	0.11	0.16	0.11	0.08	0.16	0.08	0.16	0.18	0.13	0.09	0.08	0.20	0.11	0.17	0.28	0.10	0.02	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.20	0.05	0.10	0.20	0.04	0.25	0.02	0.26	0.24	0.24	0.19	0.18	0.28	0.18	0.05	0.20	0.14	0.02	0.30	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.16	0.03	0.07	0.16	0.02	0.21	0.01	0.21	0.21	0.19	0.15	0.14	0.23	0.15	0.05	0.16	0.13	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00