Doublet Group distance statistics: 54146

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, -0.002, 0.010, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.010, 0.028, 0.046, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.028 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.014, 0.050, 0.086, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.050 std_dev=0.036
N4	A	0, 0.016, 0.055, 0.094, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.055 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.100, 0.250, 0.401, 0.462 max_d=0.462 avg_d=0.250 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.160, 0.377, 0.594, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.377 std_dev=0.217
C2'	A	0, 0.039, 0.292, 0.544, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.292 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.260, 0.557, 0.855, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.557 std_dev=0.297
O2'	B	0, 0.265, 0.565, 0.865, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.565 std_dev=0.300
C3'	A	0, 0.131, 0.489, 0.847, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.489 std_dev=0.358
C1'	B	0, 0.184, 0.560, 0.935, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.560 std_dev=0.376
O2'	A	0, 0.042, 0.437, 0.832, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.437 std_dev=0.395
C5'	A	0, 0.291, 0.688, 1.085, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.688 std_dev=0.397
O4'	B	0, 0.298, 0.726, 1.155, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.726 std_dev=0.429
O5'	A	0, 0.373, 0.807, 1.240, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.807 std_dev=0.433
C3'	B	0, 0.436, 0.879, 1.321, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.879 std_dev=0.442
N9	B	0, 0.170, 0.622, 1.074, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.622 std_dev=0.452
N3	B	0, 0.251, 0.705, 1.159, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.705 std_dev=0.454
C4'	B	0, 0.409, 0.873, 1.338, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.873 std_dev=0.465
P	A	0, 0.378, 0.843, 1.309, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.843 std_dev=0.466
C4	B	0, 0.235, 0.707, 1.179, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.707 std_dev=0.472
C2	B	0, 0.357, 0.860, 1.363, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.860 std_dev=0.503
C8	B	0, 0.207, 0.724, 1.241, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.724 std_dev=0.517
N2	B	0, 0.396, 0.915, 1.434, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.915 std_dev=0.519
C5	B	0, 0.313, 0.858, 1.402, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.858 std_dev=0.545
N7	B	0, 0.295, 0.865, 1.434, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.865 std_dev=0.569
N1	B	0, 0.428, 1.004, 1.581, 1.768 max_d=1.768 avg_d=1.004 std_dev=0.576
O3'	A	0, 0.176, 0.778, 1.380, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.778 std_dev=0.602
C6	B	0, 0.414, 1.020, 1.627, 1.830 max_d=1.830 avg_d=1.020 std_dev=0.606
C5'	B	0, 0.457, 1.079, 1.700, 1.694 max_d=1.694 avg_d=1.079 std_dev=0.622
O3'	B	0, 0.298, 0.959, 1.619, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.959 std_dev=0.660
O5'	B	0, 0.273, 0.961, 1.648, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.961 std_dev=0.687
O6	B	0, 0.497, 1.193, 1.888, 2.009 max_d=2.009 avg_d=1.193 std_dev=0.695
P	B	0, 0.506, 1.319, 2.132, 2.529 max_d=2.529 avg_d=1.319 std_dev=0.813
OP2	A	0, 0.749, 1.615, 2.481, 2.593 max_d=2.593 avg_d=1.615 std_dev=0.866
OP1	A	0, 0.698, 1.575, 2.452, 2.431 max_d=2.431 avg_d=1.575 std_dev=0.877
OP1	B	0, 0.537, 1.598, 2.659, 3.223 max_d=3.223 avg_d=1.598 std_dev=1.061
OP2	B	0, 0.685, 2.457, 4.229, 5.037 max_d=5.037 avg_d=2.457 std_dev=1.772

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.00	0.09	0.10	0.30	0.17
C2	0.02	0.00	0.03	0.10	0.00	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.09	0.03	0.23	0.10	0.30	0.12
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.12	0.01	0.16	0.02	0.14	0.06	0.07	0.13	0.10	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.21	0.10
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.27	0.01	0.33	0.01	0.29	0.15	0.17	0.30	0.06	0.02	0.01	0.03	0.11	0.12	0.19	0.11
C4	0.03	0.00	0.12	0.27	0.00	0.16	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.33	0.05	0.38	0.26	0.38	0.25
C4'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.16	0.00	0.20	0.00	0.18	0.09	0.10	0.17	0.02	0.06	0.05	0.01	0.02	0.07	0.16	0.11
C5	0.04	0.01	0.16	0.33	0.01	0.20	0.00	0.32	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.39	0.06	0.42	0.27	0.37	0.26
C5'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.27	0.00	0.32	0.00	0.27	0.15	0.20	0.30	0.06	0.06	0.05	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01
C6	0.03	0.00	0.14	0.29	0.01	0.18	0.01	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.32	0.05	0.34	0.15	0.30	0.16
N1	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.14	0.03	0.22	0.07	0.29	0.11
N3	0.03	0.00	0.07	0.17	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.19	0.04	0.31	0.18	0.34	0.18
N4	0.04	0.01	0.13	0.30	0.00	0.17	0.01	0.30	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.38	0.06	0.41	0.33	0.43	0.30
O2	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.10	0.04	0.18	0.06	0.29	0.11
O2'	0.03	0.11	0.00	0.02	0.09	0.06	0.09	0.06	0.07	0.04	0.11	0.09	0.19	0.00	0.08	0.08	0.08	0.08	0.19	0.10
O3'	0.03	0.09	0.01	0.01	0.33	0.05	0.39	0.05	0.32	0.14	0.19	0.38	0.10	0.08	0.00	0.04	0.19	0.23	0.24	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.06	0.04	0.08	0.04	0.00	0.09	0.18	0.35	0.25
O5'	0.09	0.23	0.06	0.11	0.38	0.02	0.42	0.01	0.34	0.22	0.31	0.41	0.18	0.08	0.19	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.10	0.04	0.12	0.26	0.07	0.27	0.10	0.15	0.07	0.18	0.33	0.06	0.08	0.23	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.30	0.21	0.19	0.38	0.16	0.37	0.03	0.30	0.29	0.34	0.43	0.29	0.19	0.24	0.35	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.12	0.10	0.11	0.25	0.11	0.26	0.01	0.16	0.11	0.18	0.30	0.11	0.10	0.16	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.46	0.17	0.20	0.41	0.17	0.47	0.24	0.52	0.39	0.51	0.43	0.38	0.45	0.35	0.16	0.31	0.17	0.52	0.53	0.45	0.58	0.47
C2	0.34	0.43	0.21	0.19	0.50	0.20	0.65	0.25	0.69	0.57	0.58	0.35	0.37	0.67	0.46	0.16	0.14	0.28	0.82	0.74	0.76	0.83	0.77
C2'	0.25	0.46	0.17	0.14	0.40	0.14	0.49	0.20	0.56	0.41	0.53	0.46	0.37	0.49	0.35	0.18	0.26	0.15	0.54	0.60	0.51	0.66	0.53
C3'	0.26	0.44	0.22	0.10	0.41	0.12	0.52	0.18	0.57	0.46	0.52	0.44	0.37	0.54	0.38	0.19	0.20	0.15	0.55	0.63	0.53	0.70	0.56
C4	0.27	0.41	0.22	0.22	0.36	0.21	0.47	0.26	0.47	0.48	0.44	0.45	0.35	0.55	0.35	0.19	0.13	0.24	0.91	0.50	0.92	0.92	0.88
C4'	0.22	0.39	0.19	0.10	0.33	0.12	0.38	0.20	0.42	0.34	0.41	0.42	0.33	0.39	0.29	0.20	0.27	0.10	0.41	0.45	0.38	0.57	0.40
C5	0.23	0.36	0.22	0.22	0.31	0.17	0.35	0.21	0.35	0.37	0.35	0.38	0.33	0.40	0.29	0.21	0.14	0.18	0.80	0.36	0.78	0.72	0.72
C5'	0.27	0.40	0.30	0.10	0.37	0.05	0.43	0.13	0.45	0.41	0.43	0.41	0.36	0.45	0.35	0.28	0.13	0.13	0.40	0.48	0.36	0.56	0.39
C6	0.22	0.29	0.21	0.18	0.29	0.15	0.34	0.22	0.33	0.35	0.30	0.30	0.27	0.38	0.28	0.20	0.10	0.15	0.67	0.35	0.60	0.61	0.58
N1	0.28	0.37	0.20	0.18	0.41	0.16	0.50	0.22	0.51	0.45	0.44	0.32	0.33	0.51	0.38	0.17	0.17	0.20	0.68	0.53	0.61	0.67	0.62
N3	0.32	0.40	0.22	0.21	0.44	0.22	0.61	0.28	0.64	0.57	0.49	0.41	0.34	0.68	0.43	0.17	0.10	0.29	0.91	0.71	0.89	0.95	0.89
N4	0.27	0.49	0.22	0.24	0.37	0.22	0.45	0.29	0.51	0.44	0.53	0.53	0.40	0.52	0.33	0.19	0.18	0.24	0.95	0.55	1.04	1.03	0.97
O2	0.39	0.58	0.22	0.18	0.60	0.21	0.75	0.26	0.85	0.62	0.78	0.43	0.48	0.73	0.53	0.15	0.18	0.34	0.81	0.90	0.75	0.86	0.78
O2'	0.29	0.48	0.24	0.20	0.38	0.18	0.43	0.23	0.49	0.36	0.51	0.53	0.40	0.41	0.34	0.29	0.29	0.22	0.49	0.53	0.44	0.59	0.46
O3'	0.19	0.38	0.16	0.08	0.34	0.12	0.46	0.20	0.52	0.42	0.47	0.42	0.30	0.51	0.30	0.18	0.20	0.09	0.53	0.60	0.56	0.76	0.58
O4'	0.24	0.41	0.18	0.19	0.34	0.17	0.37	0.26	0.40	0.30	0.42	0.42	0.37	0.34	0.29	0.21	0.37	0.12	0.38	0.40	0.32	0.51	0.35
O5'	0.29	0.42	0.32	0.14	0.41	0.04	0.48	0.15	0.50	0.46	0.46	0.41	0.38	0.51	0.38	0.27	0.02	0.13	0.49	0.54	0.44	0.63	0.48
OP1	0.21	0.21	0.18	0.18	0.15	0.36	0.16	0.50	0.17	0.20	0.16	0.27	0.21	0.21	0.16	0.19	0.01	0.32	0.30	0.21	0.43	0.68	0.39
OP2	0.18	0.28	0.17	0.17	0.26	0.20	0.31	0.26	0.32	0.34	0.29	0.31	0.27	0.38	0.24	0.15	0.02	0.19	0.55	0.36	0.61	0.60	0.51
P	0.04	0.18	0.10	0.01	0.13	0.15	0.19	0.25	0.20	0.23	0.17	0.23	0.16	0.26	0.12	0.08	0.01	0.09	0.34	0.25	0.38	0.59	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.15	0.01	0.14	0.33	0.16
C2	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.20	0.03	0.37	0.00	0.37	0.54	0.37
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.03	0.04	0.01	0.04	0.08	0.08	0.16	0.14	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.27	0.04	0.22	0.34	0.23
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.10	0.15	0.11	0.19	0.15	0.15	0.06	0.02	0.01	0.02	0.34	0.12	0.27	0.36	0.26
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.13	0.01	0.38	0.01	0.37	0.51	0.37
C4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.11	0.04	0.09	0.06	0.10	0.04	0.08	0.03	0.00	0.03	0.08	0.07	0.32	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.16	0.02	0.47	0.01	0.52	0.65	0.49
C5'	0.03	0.09	0.01	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.14	0.20	0.11	0.10	0.07	0.20	0.10	0.08	0.06	0.01	0.02	0.17	0.11	0.34	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.49	0.00	0.57	0.71	0.54
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.23	0.03	0.45	0.03	0.46	0.56	0.43
N1	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.02	0.44	0.00	0.48	0.64	0.47
N2	0.03	0.01	0.16	0.19	0.01	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.27	0.03	0.34	0.00	0.32	0.51	0.34
N3	0.03	0.00	0.14	0.15	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.20	0.03	0.32	0.01	0.29	0.46	0.31
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.24	0.03	0.51	0.03	0.58	0.70	0.55
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.01	0.33	0.02	0.31	0.44	0.30
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.08	0.05	0.08	0.08	0.05	0.12	0.20	0.15	0.04	0.03	0.00	0.15	0.05	0.16	0.06	0.15	0.32	0.17
O3'	0.04	0.20	0.03	0.01	0.13	0.03	0.16	0.06	0.16	0.23	0.16	0.27	0.20	0.24	0.12	0.15	0.00	0.03	0.38	0.19	0.32	0.56	0.40
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00	0.13	0.04	0.14	0.36	0.18
O5'	0.15	0.37	0.27	0.34	0.38	0.03	0.47	0.02	0.49	0.45	0.44	0.34	0.32	0.51	0.33	0.16	0.38	0.13	0.00	0.53	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.04	0.12	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.19	0.04	0.53	0.00	0.66	0.80	0.61
OP1	0.14	0.37	0.22	0.27	0.37	0.07	0.52	0.11	0.57	0.46	0.48	0.32	0.29	0.58	0.31	0.15	0.32	0.14	0.02	0.66	0.00	0.02	0.01
OP2	0.33	0.54	0.34	0.36	0.51	0.32	0.65	0.34	0.71	0.56	0.64	0.51	0.46	0.70	0.44	0.32	0.56	0.36	0.01	0.80	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.37	0.23	0.26	0.37	0.06	0.49	0.02	0.54	0.43	0.47	0.34	0.31	0.55	0.30	0.17	0.40	0.18	0.00	0.61	0.01	0.01	0.00