Doublet Group distance statistics: 54148

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.004, 0.026, 0.047, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.008, 0.033, 0.057, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.008, 0.037, 0.066, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.037 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.003, 0.047, 0.091, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.047 std_dev=0.044
N4	A	0, 0.017, 0.067, 0.117, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.067 std_dev=0.050
C2'	A	0, 0.018, 0.070, 0.122, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.070 std_dev=0.052
O2	A	0, 0.025, 0.087, 0.148, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.087 std_dev=0.061
O4'	A	0, 0.032, 0.109, 0.186, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.109 std_dev=0.077
C4'	A	0, 0.043, 0.146, 0.249, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.146 std_dev=0.103
C2'	B	0, 0.095, 0.333, 0.571, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.333 std_dev=0.238
P	A	0, 0.098, 0.344, 0.590, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.344 std_dev=0.246
O3'	B	0, 0.121, 0.445, 0.770, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.445 std_dev=0.324
O5'	A	0, 0.154, 0.536, 0.918, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.536 std_dev=0.382
C5'	A	0, 0.169, 0.595, 1.020, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.595 std_dev=0.425
O2'	B	0, 0.188, 0.655, 1.123, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.655 std_dev=0.467
C3'	A	0, 0.213, 0.726, 1.240, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.726 std_dev=0.514
OP1	A	0, 0.227, 0.814, 1.401, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.814 std_dev=0.587
N9	B	0, 0.198, 0.793, 1.388, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.793 std_dev=0.595
O2'	A	0, 0.251, 0.859, 1.468, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.859 std_dev=0.609
C8	B	0, 0.215, 0.876, 1.536, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.876 std_dev=0.660
OP2	A	0, 0.292, 1.012, 1.732, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.012 std_dev=0.720
C3'	B	0, 0.284, 1.007, 1.729, 1.660 max_d=1.660 avg_d=1.007 std_dev=0.722
C1'	B	0, 0.297, 1.029, 1.760, 1.638 max_d=1.638 avg_d=1.029 std_dev=0.731
C4	B	0, 0.418, 1.478, 2.537, 2.430 max_d=2.430 avg_d=1.478 std_dev=1.059
O3'	A	0, 0.461, 1.577, 2.692, 2.398 max_d=2.398 avg_d=1.577 std_dev=1.115
N3	B	0, 0.465, 1.614, 2.764, 2.589 max_d=2.589 avg_d=1.614 std_dev=1.150
N7	B	0, 0.472, 1.688, 2.904, 2.815 max_d=2.815 avg_d=1.688 std_dev=1.216
O4'	B	0, 0.585, 2.007, 3.428, 3.114 max_d=3.114 avg_d=2.007 std_dev=1.422
C5	B	0, 0.609, 2.122, 3.635, 3.421 max_d=3.421 avg_d=2.122 std_dev=1.513
C4'	B	0, 0.697, 2.396, 4.094, 3.741 max_d=3.741 avg_d=2.396 std_dev=1.698
C2	B	0, 0.733, 2.514, 4.295, 3.908 max_d=3.908 avg_d=2.514 std_dev=1.781
N2	B	0, 0.817, 2.792, 4.767, 4.255 max_d=4.255 avg_d=2.792 std_dev=1.975
C6	B	0, 0.901, 3.105, 5.309, 4.898 max_d=4.898 avg_d=3.105 std_dev=2.204
N1	B	0, 0.945, 3.243, 5.540, 5.039 max_d=5.039 avg_d=3.243 std_dev=2.298
C5'	B	0, 1.090, 3.746, 6.402, 5.851 max_d=5.851 avg_d=3.746 std_dev=2.656
O6	B	0, 1.107, 3.818, 6.529, 6.035 max_d=6.035 avg_d=3.818 std_dev=2.711
O5'	B	0, 1.407, 4.810, 8.213, 7.345 max_d=7.345 avg_d=4.810 std_dev=3.403
OP2	B	0, 1.738, 5.940, 10.141, 9.064 max_d=9.064 avg_d=5.940 std_dev=4.202
P	B	0, 1.874, 6.404, 10.934, 9.741 max_d=9.741 avg_d=6.404 std_dev=4.530
OP1	B	0, 2.232, 7.624, 13.015, 11.553 max_d=11.553 avg_d=7.624 std_dev=5.392

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.06	0.04	0.02	0.05	0.07	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.36	0.09
C2	0.04	0.00	0.04	0.13	0.01	0.04	0.02	0.08	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.21	0.05	0.04	0.05	0.09	0.37	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.12	0.02	0.02	0.05	0.05	0.06	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.38	0.09
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.21	0.00	0.23	0.01	0.21	0.14	0.17	0.23	0.09	0.02	0.00	0.02	0.25	0.17	0.07	0.16
C4	0.07	0.01	0.05	0.21	0.00	0.07	0.00	0.08	0.02	0.05	0.00	0.01	0.02	0.18	0.18	0.09	0.07	0.14	0.32	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.06	0.08	0.06	0.19	0.01	0.01	0.02	0.08	0.22	0.04
C5	0.05	0.02	0.03	0.23	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.10	0.20	0.09	0.05	0.12	0.30	0.11
C5'	0.06	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.03	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.13	0.02	0.01	0.10	0.24	0.02
C6	0.04	0.03	0.02	0.21	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.15	0.08	0.03	0.08	0.33	0.10
N1	0.02	0.01	0.02	0.14	0.05	0.04	0.02	0.07	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.10	0.05	0.03	0.03	0.07	0.37	0.10
N3	0.05	0.00	0.05	0.17	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.23	0.11	0.06	0.06	0.12	0.37	0.12
N4	0.07	0.02	0.05	0.23	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.20	0.22	0.10	0.09	0.16	0.27	0.11
O2	0.04	0.01	0.06	0.09	0.02	0.06	0.03	0.07	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.25	0.06	0.04	0.07	0.05	0.37	0.09
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.18	0.19	0.10	0.07	0.05	0.10	0.23	0.20	0.25	0.00	0.03	0.14	0.16	0.11	0.34	0.03
O3'	0.11	0.05	0.01	0.00	0.18	0.01	0.20	0.13	0.15	0.05	0.11	0.22	0.06	0.03	0.00	0.09	0.34	0.35	0.13	0.29
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.09	0.01	0.09	0.02	0.08	0.03	0.06	0.10	0.04	0.14	0.09	0.00	0.11	0.03	0.32	0.10
O5'	0.02	0.05	0.05	0.25	0.07	0.02	0.05	0.01	0.03	0.03	0.06	0.09	0.07	0.16	0.34	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.01	0.09	0.04	0.17	0.14	0.08	0.12	0.10	0.08	0.07	0.12	0.16	0.05	0.11	0.35	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.37	0.38	0.07	0.32	0.22	0.30	0.24	0.33	0.37	0.37	0.27	0.37	0.34	0.13	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.11	0.09	0.16	0.12	0.04	0.11	0.02	0.10	0.10	0.12	0.11	0.09	0.03	0.29	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.15	0.16	0.08	0.14	0.15	0.13	0.09	0.12	0.16	0.12	0.18	0.16	0.14	0.15	0.23	0.12	0.17	0.17	0.13	0.55	0.11	0.34
C2	0.11	0.12	0.10	0.18	0.15	0.09	0.18	0.34	0.19	0.19	0.16	0.09	0.12	0.20	0.15	0.23	0.09	0.03	0.68	0.21	1.31	0.64	0.96
C2'	0.11	0.11	0.14	0.08	0.13	0.08	0.14	0.05	0.14	0.15	0.11	0.12	0.13	0.16	0.12	0.21	0.11	0.10	0.23	0.17	0.55	0.16	0.41
C3'	0.18	0.23	0.30	0.19	0.25	0.26	0.30	0.31	0.32	0.30	0.27	0.19	0.22	0.33	0.25	0.31	0.30	0.22	0.14	0.36	0.06	0.26	0.02
C4	0.11	0.31	0.08	0.29	0.26	0.30	0.31	0.67	0.36	0.24	0.36	0.31	0.26	0.30	0.20	0.24	0.09	0.11	1.08	0.39	1.82	1.00	1.39
C4'	0.14	0.15	0.19	0.14	0.15	0.26	0.14	0.36	0.14	0.16	0.13	0.18	0.17	0.16	0.15	0.22	0.19	0.18	0.22	0.15	0.12	0.33	0.14
C5	0.07	0.23	0.07	0.27	0.21	0.26	0.26	0.54	0.30	0.21	0.28	0.21	0.20	0.26	0.17	0.21	0.09	0.10	0.91	0.33	1.45	0.73	1.11
C5'	0.10	0.12	0.19	0.15	0.14	0.23	0.18	0.40	0.19	0.20	0.14	0.13	0.13	0.22	0.14	0.20	0.21	0.14	0.30	0.23	0.29	0.44	0.25
C6	0.08	0.12	0.10	0.16	0.14	0.08	0.17	0.25	0.18	0.17	0.14	0.11	0.13	0.18	0.13	0.20	0.07	0.04	0.55	0.20	0.98	0.40	0.72
N1	0.10	0.10	0.10	0.13	0.12	0.02	0.14	0.18	0.14	0.16	0.11	0.10	0.12	0.16	0.13	0.21	0.09	0.06	0.47	0.16	0.96	0.39	0.68
N3	0.12	0.24	0.09	0.25	0.22	0.22	0.26	0.56	0.30	0.22	0.28	0.23	0.21	0.26	0.19	0.24	0.08	0.05	0.95	0.32	1.71	0.93	1.28
N4	0.13	0.48	0.09	0.33	0.35	0.42	0.42	0.88	0.50	0.29	0.53	0.51	0.38	0.37	0.26	0.24	0.10	0.18	1.35	0.54	2.24	1.31	1.74
O2	0.13	0.08	0.11	0.14	0.13	0.03	0.15	0.26	0.15	0.18	0.11	0.04	0.10	0.18	0.15	0.24	0.10	0.07	0.59	0.17	1.23	0.59	0.88
O2'	0.16	0.14	0.18	0.08	0.14	0.19	0.14	0.14	0.12	0.20	0.10	0.19	0.16	0.19	0.17	0.26	0.20	0.20	0.10	0.13	0.47	0.11	0.32
O3'	0.16	0.15	0.28	0.24	0.20	0.33	0.26	0.45	0.26	0.28	0.20	0.13	0.16	0.31	0.22	0.23	0.34	0.25	0.27	0.30	0.15	0.42	0.18
O4'	0.18	0.22	0.21	0.13	0.20	0.27	0.18	0.29	0.18	0.18	0.20	0.26	0.23	0.17	0.18	0.24	0.17	0.23	0.09	0.18	0.17	0.18	0.04
O5'	0.23	0.11	0.08	0.03	0.10	0.02	0.07	0.18	0.09	0.04	0.08	0.14	0.15	0.07	0.11	0.13	0.02	0.13	0.10	0.13	0.05	0.27	0.05
OP1	0.23	0.07	0.02	0.07	0.05	0.11	0.14	0.34	0.18	0.10	0.13	0.08	0.08	0.18	0.03	0.04	0.01	0.19	0.35	0.25	0.55	0.56	0.40
OP2	0.06	0.35	0.14	0.05	0.36	0.23	0.52	0.21	0.58	0.43	0.49	0.29	0.27	0.56	0.29	0.12	0.00	0.12	0.38	0.67	0.40	0.05	0.37
P	0.17	0.11	0.07	0.01	0.10	0.10	0.20	0.13	0.24	0.16	0.18	0.10	0.09	0.24	0.06	0.08	0.01	0.15	0.12	0.30	0.04	0.27	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.21	0.01	0.14	0.04	0.20	0.18	0.03
C2	0.03	0.00	0.11	0.06	0.01	0.11	0.01	0.29	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.11	0.07	0.72	0.01	1.18	0.46	0.72
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.02	0.07	0.07	0.15	0.12	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.39	0.02	0.58	0.10	0.34
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.14	0.28	0.04	0.15	0.07	0.27	0.14	0.02	0.01	0.02	0.23	0.19	0.32	0.09	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.09	0.04	0.38	0.02	0.57	0.05	0.26
C4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.03	0.19	0.05	0.16	0.10	0.16	0.07	0.19	0.02	0.01	0.01	0.07	0.05	0.15	0.04
C5	0.02	0.01	0.00	0.17	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.23	0.02	0.02	0.25	0.03	0.37	0.21	0.12
C5'	0.02	0.29	0.10	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.03	0.31	0.19	0.41	0.27	0.25	0.08	0.09	0.13	0.02	0.00	0.04	0.13	0.09	0.00
C6	0.03	0.00	0.02	0.14	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.26	0.02	0.03	0.38	0.01	0.61	0.11	0.26
C8	0.01	0.01	0.07	0.28	0.01	0.19	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.10	0.03	0.09	0.28	0.03	0.29	0.70	0.49
N1	0.03	0.01	0.07	0.04	0.01	0.05	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.29	0.05	0.05	0.59	0.01	0.99	0.31	0.55
N2	0.04	0.00	0.15	0.15	0.01	0.16	0.01	0.41	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.31	0.14	0.09	0.88	0.01	1.50	0.68	0.96
N3	0.02	0.01	0.12	0.07	0.01	0.10	0.02	0.27	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.28	0.14	0.07	0.64	0.01	1.01	0.35	0.60
N7	0.01	0.01	0.05	0.27	0.02	0.16	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.16	0.04	0.06	0.20	0.03	0.18	0.61	0.39
N9	0.01	0.01	0.02	0.14	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.09	0.02	0.15	0.04	0.20	0.28	0.10
O2'	0.01	0.30	0.00	0.02	0.23	0.19	0.23	0.09	0.26	0.10	0.29	0.31	0.28	0.16	0.13	0.00	0.04	0.13	0.18	0.25	0.48	0.01	0.20
O3'	0.21	0.11	0.04	0.01	0.09	0.02	0.02	0.13	0.02	0.03	0.05	0.14	0.14	0.04	0.09	0.04	0.00	0.12	0.06	0.05	0.11	0.18	0.03
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.09	0.05	0.09	0.07	0.06	0.02	0.13	0.12	0.00	0.11	0.05	0.08	0.25	0.17
O5'	0.14	0.72	0.39	0.23	0.38	0.01	0.25	0.00	0.38	0.28	0.59	0.88	0.64	0.20	0.15	0.18	0.06	0.11	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00
O6	0.04	0.01	0.02	0.19	0.02	0.07	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.25	0.05	0.05	0.34	0.00	0.51	0.18	0.22
OP1	0.20	1.18	0.58	0.32	0.57	0.05	0.37	0.13	0.61	0.29	0.99	1.50	1.01	0.18	0.20	0.48	0.11	0.08	0.01	0.51	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.46	0.10	0.09	0.05	0.15	0.21	0.09	0.11	0.70	0.31	0.68	0.35	0.61	0.28	0.01	0.18	0.25	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.72	0.34	0.18	0.26	0.04	0.12	0.00	0.26	0.49	0.55	0.96	0.60	0.39	0.10	0.20	0.03	0.17	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00