Doublet Group distance statistics: 54151

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O5'	B	0, 0.000, 0.254, 0.509, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.254 std_dev=0.254
C2'	A	0, 0.000, 0.288, 0.575, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.288 std_dev=0.288
O4'	A	0, 0.000, 0.303, 0.605, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.303 std_dev=0.303
C2'	B	0, 0.000, 0.326, 0.653, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.326 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.000, 0.469, 0.937, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.469 std_dev=0.469
C5'	A	0, 0.000, 0.534, 1.069, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.534 std_dev=0.534
C4'	A	0, 0.000, 0.535, 1.070, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.535 std_dev=0.535
C4'	B	0, 0.000, 0.550, 1.101, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.550 std_dev=0.550
C3'	B	0, 0.000, 0.577, 1.154, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.577 std_dev=0.577
O4'	B	0, 0.000, 0.577, 1.154, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.577 std_dev=0.577
O5'	A	0, 0.000, 0.667, 1.335, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.667 std_dev=0.667
O2'	A	0, 0.000, 0.686, 1.372, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.686 std_dev=0.686
C3'	A	0, 0.000, 0.711, 1.422, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.711 std_dev=0.711
OP1	A	0, 0.000, 0.717, 1.434, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.717 std_dev=0.717
N9	B	0, 0.000, 0.728, 1.456, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.728 std_dev=0.728
O2'	B	0, 0.000, 0.777, 1.554, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.777 std_dev=0.777
P	A	0, 0.000, 0.803, 1.606, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.803 std_dev=0.803
C8	B	0, 0.000, 0.813, 1.626, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.813 std_dev=0.813
OP2	A	0, 0.000, 0.893, 1.787, 1.787 max_d=1.787 avg_d=0.893 std_dev=0.893
C4	B	0, 0.000, 1.003, 2.007, 2.007 max_d=2.007 avg_d=1.003 std_dev=1.003
N3	B	0, 0.000, 1.074, 2.148, 2.148 max_d=2.148 avg_d=1.074 std_dev=1.074
N7	B	0, 0.000, 1.098, 2.197, 2.197 max_d=2.197 avg_d=1.098 std_dev=1.098
C5'	B	0, 0.000, 1.145, 2.291, 2.291 max_d=2.291 avg_d=1.145 std_dev=1.145
O3'	B	0, 0.000, 1.191, 2.383, 2.383 max_d=2.383 avg_d=1.191 std_dev=1.191
C5	B	0, 0.000, 1.220, 2.440, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.220 std_dev=1.220
O3'	A	0, 0.000, 1.319, 2.638, 2.638 max_d=2.638 avg_d=1.319 std_dev=1.319
C2	B	0, 0.000, 1.377, 2.754, 2.754 max_d=2.754 avg_d=1.377 std_dev=1.377
P	B	0, 0.000, 1.480, 2.960, 2.960 max_d=2.960 avg_d=1.480 std_dev=1.480
N2	B	0, 0.000, 1.500, 3.001, 3.001 max_d=3.001 avg_d=1.500 std_dev=1.500
C6	B	0, 0.000, 1.549, 3.099, 3.099 max_d=3.099 avg_d=1.549 std_dev=1.549
N1	B	0, 0.000, 1.596, 3.192, 3.192 max_d=3.192 avg_d=1.596 std_dev=1.596
OP1	B	0, 0.000, 1.612, 3.223, 3.223 max_d=3.223 avg_d=1.612 std_dev=1.612
O6	B	0, 0.000, 1.801, 3.603, 3.603 max_d=3.603 avg_d=1.801 std_dev=1.801
OP2	B	0, 0.000, 2.230, 4.460, 4.460 max_d=4.460 avg_d=2.230 std_dev=2.230

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.19	0.00	0.04	0.07	0.06	0.02
C2	0.02	0.00	0.06	0.18	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.23	0.03	0.04	0.13	0.10	0.12	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.10	0.08	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.06	0.14	0.10	0.06
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.26	0.01	0.25	0.01	0.20	0.16	0.23	0.29	0.11	0.00	0.00	0.03	0.03	0.19	0.02	0.02
C4	0.01	0.00	0.01	0.26	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.13	0.01	0.19	0.07	0.20	0.12
C4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.07	0.01	0.26	0.00	0.00	0.02	0.18	0.02	0.00
C5	0.00	0.01	0.06	0.25	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.15	0.02	0.20	0.04	0.22	0.11
C5'	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.14	0.18	0.01	0.01	0.12	0.02	0.02
C6	0.00	0.01	0.08	0.20	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.09	0.03	0.17	0.04	0.19	0.09
N1	0.01	0.01	0.01	0.16	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.02	0.01	0.12	0.08	0.13	0.07
N3	0.01	0.00	0.04	0.23	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.05	0.03	0.16	0.09	0.16	0.10
N4	0.01	0.00	0.01	0.29	0.00	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.17	0.01	0.21	0.07	0.22	0.13
O2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.15	0.06	0.11	0.13	0.09	0.08
O2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.27	0.26	0.22	0.14	0.17	0.16	0.27	0.29	0.22	0.00	0.04	0.16	0.27	0.21	0.24	0.26
O3'	0.19	0.03	0.00	0.00	0.13	0.00	0.15	0.18	0.09	0.02	0.05	0.17	0.15	0.04	0.00	0.13	0.15	0.17	0.33	0.17
O4'	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.16	0.13	0.00	0.02	0.07	0.01	0.00
O5'	0.04	0.13	0.06	0.03	0.19	0.02	0.20	0.01	0.17	0.12	0.16	0.21	0.11	0.27	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.10	0.14	0.19	0.07	0.18	0.04	0.12	0.04	0.08	0.09	0.07	0.13	0.21	0.17	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.12	0.10	0.02	0.20	0.02	0.22	0.02	0.19	0.13	0.16	0.22	0.09	0.24	0.33	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.08	0.06	0.02	0.12	0.00	0.11	0.02	0.09	0.07	0.10	0.13	0.08	0.26	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.11	0.17	0.07	0.13	0.15	0.14	0.23	0.13	0.15	0.12	0.09	0.11	0.15	0.13	0.39	0.11	0.18	0.07	0.13	0.60	1.12	0.81
C2	0.12	0.00	0.18	0.19	0.10	0.28	0.13	0.50	0.11	0.18	0.05	0.08	0.03	0.18	0.13	0.30	0.04	0.21	0.00	0.12	0.58	1.12	0.69
C2'	0.37	0.42	0.39	0.18	0.41	0.29	0.41	0.34	0.42	0.38	0.42	0.41	0.42	0.40	0.38	0.62	0.10	0.41	0.04	0.42	0.45	0.94	0.68
C3'	0.06	0.01	0.15	0.04	0.02	0.07	0.02	0.12	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.04	0.40	0.28	0.13	0.02	0.01	0.30	0.85	0.62
C4	0.07	0.22	0.14	0.25	0.01	0.36	0.08	0.69	0.01	0.18	0.12	0.41	0.15	0.18	0.09	0.15	0.02	0.19	0.06	0.04	0.34	0.76	0.41
C4'	0.09	0.04	0.18	0.00	0.07	0.09	0.07	0.12	0.06	0.10	0.05	0.02	0.04	0.09	0.08	0.43	0.18	0.15	0.08	0.06	0.20	0.68	0.50
C5	0.07	0.22	0.14	0.24	0.01	0.36	0.07	0.67	0.01	0.18	0.11	0.38	0.16	0.17	0.09	0.15	0.04	0.20	0.05	0.04	0.25	0.63	0.36
C5'	0.14	0.09	0.23	0.01	0.12	0.10	0.12	0.10	0.11	0.14	0.10	0.07	0.10	0.14	0.13	0.48	0.26	0.20	0.14	0.11	0.07	0.34	0.28
C6	0.10	0.06	0.17	0.19	0.07	0.31	0.11	0.52	0.07	0.17	0.00	0.15	0.03	0.16	0.12	0.26	0.07	0.22	0.01	0.08	0.35	0.80	0.53
N1	0.12	0.03	0.18	0.16	0.11	0.26	0.13	0.43	0.11	0.17	0.06	0.04	0.04	0.17	0.13	0.32	0.07	0.21	0.02	0.12	0.52	1.05	0.69
N3	0.09	0.10	0.16	0.23	0.06	0.33	0.11	0.61	0.06	0.18	0.03	0.24	0.06	0.18	0.11	0.22	0.03	0.20	0.04	0.09	0.49	0.99	0.56
N4	0.05	0.36	0.12	0.29	0.04	0.38	0.04	0.76	0.05	0.18	0.24	0.62	0.24	0.17	0.07	0.08	0.01	0.18	0.10	0.00	0.25	0.58	0.26
O2	0.14	0.06	0.19	0.17	0.13	0.26	0.15	0.44	0.14	0.19	0.10	0.00	0.08	0.19	0.15	0.34	0.04	0.22	0.01	0.15	0.68	1.24	0.78
O2'	0.28	0.62	0.22	0.05	0.46	0.09	0.48	0.13	0.56	0.34	0.62	0.69	0.53	0.41	0.35	0.46	0.33	0.30	0.14	0.57	0.78	1.16	0.93
O3'	0.06	0.08	0.02	0.14	0.07	0.03	0.06	0.13	0.07	0.06	0.07	0.08	0.08	0.05	0.07	0.22	0.40	0.08	0.10	0.06	0.17	0.74	0.49
O4'	0.02	0.03	0.10	0.01	0.00	0.07	0.02	0.14	0.00	0.04	0.01	0.05	0.03	0.04	0.02	0.32	0.13	0.07	0.01	0.01	0.42	0.89	0.67
O5'	0.23	0.18	0.31	0.11	0.22	0.18	0.24	0.14	0.22	0.26	0.20	0.15	0.19	0.26	0.24	0.52	0.01	0.26	0.33	0.23	0.25	0.05	0.05
OP1	0.19	0.14	0.15	0.35	0.18	0.32	0.20	0.47	0.19	0.22	0.16	0.11	0.15	0.22	0.20	0.13	0.01	0.20	0.08	0.21	0.32	0.02	0.05
OP2	0.46	0.39	0.58	0.19	0.44	0.24	0.46	0.15	0.44	0.48	0.41	0.34	0.39	0.48	0.46	0.86	0.02	0.40	0.44	0.45	0.70	0.44	0.31
P	0.09	0.05	0.21	0.02	0.09	0.02	0.10	0.04	0.09	0.13	0.07	0.03	0.06	0.13	0.11	0.43	0.01	0.09	0.34	0.09	0.58	0.27	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.00	0.19	0.00	0.20	0.23	0.02
C2	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.30	0.06	0.42	0.00	0.30	0.39	0.43
C2'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.05	0.10	0.05	0.08	0.02	0.02	0.00	0.07	0.04	0.00	0.05	0.02	0.03	0.06	0.51	0.56	0.25
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.02	0.08	0.11	0.06	0.01	0.02	0.12	0.06	0.01	0.01	0.01	0.31	0.09	0.70	0.70	0.45
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.22	0.03	0.34	0.00	0.03	0.08	0.14
C4'	0.01	0.09	0.03	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.10	0.08	0.10	0.09	0.08	0.09	0.07	0.08	0.02	0.00	0.02	0.09	0.11	0.17	0.04
C5	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.10	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.15	0.02	0.33	0.01	0.03	0.27	0.02
C5'	0.04	0.24	0.10	0.02	0.20	0.01	0.22	0.00	0.24	0.14	0.26	0.25	0.21	0.18	0.14	0.04	0.10	0.02	0.00	0.23	0.14	0.34	0.00
C6	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.10	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.18	0.02	0.38	0.00	0.11	0.09	0.14
C8	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.04	0.02	0.17	0.02	0.35	0.73	0.28
N1	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.10	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.24	0.05	0.42	0.00	0.25	0.22	0.32
N2	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.34	0.08	0.44	0.01	0.42	0.63	0.57
N3	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.30	0.06	0.39	0.00	0.20	0.28	0.37
N7	0.00	0.00	0.07	0.12	0.00	0.09	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.06	0.01	0.23	0.02	0.24	0.65	0.22
N9	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.16	0.01	0.24	0.01	0.18	0.35	0.04
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.12	0.08	0.20	0.04	0.19	0.27	0.11	0.02	0.02	0.28	0.15	0.00	0.05	0.10	0.09	0.23	0.66	0.57	0.33
O3'	0.24	0.30	0.05	0.01	0.22	0.02	0.15	0.10	0.18	0.04	0.24	0.34	0.30	0.06	0.16	0.05	0.00	0.16	0.53	0.15	1.06	0.68	0.61
O4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.08	0.06	0.01	0.01	0.10	0.16	0.00	0.33	0.01	0.12	0.14	0.31
O5'	0.19	0.42	0.03	0.31	0.34	0.02	0.33	0.00	0.38	0.17	0.42	0.44	0.39	0.23	0.24	0.09	0.53	0.33	0.00	0.38	0.01	0.00	0.01
O6	0.00	0.00	0.06	0.09	0.00	0.09	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.23	0.15	0.01	0.38	0.00	0.10	0.18	0.09
OP1	0.20	0.30	0.51	0.70	0.03	0.11	0.03	0.14	0.11	0.35	0.25	0.42	0.20	0.24	0.18	0.66	1.06	0.12	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.23	0.39	0.56	0.70	0.08	0.17	0.27	0.34	0.09	0.73	0.22	0.63	0.28	0.65	0.35	0.57	0.68	0.14	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.43	0.25	0.45	0.14	0.04	0.02	0.00	0.14	0.28	0.32	0.57	0.37	0.22	0.04	0.33	0.61	0.31	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00