Doublet Group distance statistics: 54152

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.000, 0.068, 0.136, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.068 std_dev=0.068
C5'	B	0, 0.000, 0.130, 0.260, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.130 std_dev=0.130
C4	B	0, 0.000, 0.130, 0.260, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.130 std_dev=0.130
C3'	A	0, 0.000, 0.292, 0.585, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C1'	B	0, 0.000, 0.303, 0.605, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.303 std_dev=0.303
O4'	B	0, 0.000, 0.312, 0.625, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.312 std_dev=0.312
C4'	A	0, 0.000, 0.334, 0.669, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.334 std_dev=0.334
O3'	A	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
P	A	0, 0.000, 0.447, 0.894, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.447 std_dev=0.447
C2'	B	0, 0.000, 0.461, 0.923, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.461 std_dev=0.461
C4'	B	0, 0.000, 0.527, 1.053, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.527 std_dev=0.527
O5'	A	0, 0.000, 0.534, 1.067, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.534 std_dev=0.534
C6	B	0, 0.000, 0.542, 1.084, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.542 std_dev=0.542
O2'	B	0, 0.000, 0.594, 1.189, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.594 std_dev=0.594
C5'	A	0, 0.000, 0.609, 1.217, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.609 std_dev=0.609
C2'	A	0, 0.000, 0.616, 1.233, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.616 std_dev=0.616
N9	B	0, 0.000, 0.661, 1.323, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.661 std_dev=0.661
N1	B	0, 0.000, 0.858, 1.716, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.858 std_dev=0.858
C5	B	0, 0.000, 0.925, 1.850, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.925 std_dev=0.925
C3'	B	0, 0.000, 0.990, 1.980, 1.980 max_d=1.980 avg_d=0.990 std_dev=0.990
OP2	A	0, 0.000, 1.129, 2.257, 2.257 max_d=2.257 avg_d=1.129 std_dev=1.128
O2'	A	0, 0.000, 1.194, 2.387, 2.387 max_d=2.387 avg_d=1.194 std_dev=1.194
O6	B	0, 0.000, 1.275, 2.551, 2.551 max_d=2.551 avg_d=1.275 std_dev=1.275
O5'	B	0, 0.000, 1.286, 2.572, 2.572 max_d=2.572 avg_d=1.286 std_dev=1.286
N3	B	0, 0.000, 1.402, 2.805, 2.805 max_d=2.805 avg_d=1.402 std_dev=1.402
OP1	A	0, 0.000, 1.658, 3.316, 3.316 max_d=3.316 avg_d=1.658 std_dev=1.658
O3'	B	0, 0.000, 1.720, 3.441, 3.441 max_d=3.441 avg_d=1.720 std_dev=1.720
C2	B	0, 0.000, 1.755, 3.511, 3.511 max_d=3.511 avg_d=1.755 std_dev=1.755
P	B	0, 0.000, 1.763, 3.525, 3.525 max_d=3.525 avg_d=1.763 std_dev=1.763
C8	B	0, 0.000, 1.978, 3.956, 3.956 max_d=3.956 avg_d=1.978 std_dev=1.978
OP2	B	0, 0.000, 1.993, 3.986, 3.986 max_d=3.986 avg_d=1.993 std_dev=1.993
N7	B	0, 0.000, 2.196, 4.393, 4.393 max_d=4.393 avg_d=2.196 std_dev=2.196
OP1	B	0, 0.000, 2.423, 4.846, 4.846 max_d=4.846 avg_d=2.423 std_dev=2.423
N2	B	0, 0.000, 3.062, 6.124, 6.124 max_d=6.124 avg_d=3.062 std_dev=3.062

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.17	0.01	0.33	0.49	0.12	0.24
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.00	0.36	0.60	0.24	0.26
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.10	0.01	0.20	0.15	0.21	0.08	0.01	0.10	0.20	0.00	0.02	0.04	0.07	0.01	0.41	0.10
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.03	0.08	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.11	0.02
C4	0.01	0.00	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.17	0.00	0.38	0.77	0.37	0.28
C4'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.10	0.17	0.08	0.01	0.02	0.20	0.05	0.01
C5	0.00	0.00	0.20	0.07	0.01	0.07	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.25	0.18	0.01	0.37	0.82	0.39	0.28
C5'	0.03	0.07	0.15	0.03	0.18	0.01	0.24	0.00	0.23	0.12	0.11	0.20	0.02	0.01	0.22	0.01	0.00	0.28	0.00	0.01
C6	0.00	0.01	0.21	0.08	0.02	0.08	0.01	0.23	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.22	0.18	0.01	0.36	0.76	0.33	0.27
N1	0.00	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.11	0.17	0.01	0.36	0.63	0.24	0.26
N3	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.38	0.68	0.30	0.28
N4	0.02	0.01	0.10	0.03	0.01	0.02	0.01	0.20	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.19	0.17	0.00	0.38	0.81	0.41	0.29
O2	0.02	0.01	0.20	0.08	0.00	0.10	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.17	0.14	0.01	0.35	0.50	0.16	0.25
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.18	0.17	0.25	0.01	0.22	0.11	0.08	0.19	0.17	0.00	0.08	0.09	0.08	0.04	0.44	0.13
O3'	0.17	0.17	0.02	0.01	0.17	0.08	0.18	0.22	0.18	0.17	0.17	0.17	0.14	0.08	0.00	0.09	0.06	0.03	0.15	0.06
O4'	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.09	0.00	0.34	0.64	0.02	0.30
O5'	0.33	0.36	0.07	0.07	0.38	0.02	0.37	0.00	0.36	0.36	0.38	0.38	0.35	0.08	0.06	0.34	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.49	0.60	0.01	0.03	0.77	0.20	0.82	0.28	0.76	0.63	0.68	0.81	0.50	0.04	0.03	0.64	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.24	0.41	0.11	0.37	0.05	0.39	0.00	0.33	0.24	0.30	0.41	0.16	0.44	0.15	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.26	0.10	0.02	0.28	0.01	0.28	0.01	0.27	0.26	0.28	0.29	0.25	0.13	0.06	0.30	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.66	0.21	0.38	0.05	0.27	0.35	0.04	0.19	0.80	0.29	1.04	0.61	0.84	0.22	0.37	0.80	0.16	0.07	0.42	0.14	0.58	0.26
C2	0.14	0.69	0.12	0.19	0.09	0.20	0.31	0.02	0.18	0.62	0.33	1.05	0.59	0.75	0.13	0.34	0.55	0.17	0.33	0.44	0.56	0.95	0.60
C2'	0.40	0.54	0.23	0.01	0.32	0.14	0.77	0.31	0.50	1.45	0.11	1.09	0.41	1.41	0.73	0.02	0.50	0.29	0.38	0.74	0.37	0.84	0.51
C3'	0.19	0.63	0.05	0.35	0.12	0.10	0.55	0.10	0.33	1.16	0.22	1.11	0.54	1.13	0.49	0.21	0.86	0.09	0.01	0.58	0.07	0.44	0.12
C4	0.18	0.15	0.05	0.01	0.08	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.18	0.16	0.07	0.08	0.24	0.23	0.16	0.54	0.08	0.90	1.18	0.86
C4'	0.16	0.43	0.06	0.34	0.12	0.11	0.43	0.13	0.27	0.87	0.13	0.79	0.36	0.85	0.39	0.16	0.80	0.08	0.03	0.45	0.12	0.35	0.07
C5	0.19	0.03	0.07	0.00	0.06	0.12	0.07	0.01	0.02	0.13	0.02	0.06	0.01	0.12	0.13	0.22	0.21	0.17	0.51	0.02	0.81	1.08	0.80
C5'	0.37	0.08	0.09	0.21	0.33	0.09	0.54	0.32	0.42	0.86	0.13	0.35	0.03	0.82	0.53	0.02	0.69	0.32	0.02	0.54	0.16	0.32	0.06
C6	0.18	0.22	0.13	0.15	0.06	0.18	0.09	0.00	0.05	0.19	0.10	0.32	0.24	0.22	0.01	0.28	0.41	0.18	0.34	0.14	0.53	0.84	0.57
N1	0.14	0.56	0.16	0.24	0.07	0.22	0.27	0.02	0.15	0.57	0.25	0.83	0.52	0.64	0.12	0.34	0.59	0.17	0.26	0.34	0.42	0.80	0.49
N3	0.16	0.51	0.08	0.08	0.10	0.16	0.19	0.01	0.12	0.36	0.27	0.74	0.43	0.48	0.03	0.29	0.39	0.17	0.46	0.33	0.77	1.10	0.76
N4	0.19	0.09	0.00	0.11	0.08	0.07	0.15	0.02	0.10	0.20	0.04	0.19	0.02	0.22	0.15	0.20	0.09	0.15	0.65	0.14	1.10	1.31	1.00
O2	0.12	0.86	0.14	0.25	0.09	0.23	0.40	0.04	0.23	0.81	0.42	1.38	0.72	0.97	0.19	0.37	0.66	0.17	0.26	0.57	0.46	0.89	0.52
O2'	0.60	0.35	0.48	0.15	0.60	0.20	1.15	0.32	0.86	1.84	0.14	1.00	0.19	1.91	1.01	0.29	0.35	0.37	0.43	1.16	0.39	0.91	0.53
O3'	0.20	0.60	0.07	0.41	0.19	0.15	0.69	0.06	0.49	1.28	0.14	1.16	0.51	1.33	0.55	0.24	0.97	0.07	0.07	0.79	0.18	0.42	0.05
O4'	0.13	0.48	0.29	0.49	0.06	0.35	0.24	0.07	0.13	0.55	0.21	0.76	0.46	0.58	0.13	0.40	0.89	0.20	0.08	0.30	0.05	0.37	0.08
O5'	0.27	0.69	0.53	0.83	0.34	0.50	0.12	0.27	0.22	0.21	0.49	0.92	0.67	0.18	0.14	0.48	1.21	0.33	0.57	0.09	0.68	0.32	0.51
OP1	0.42	0.65	0.64	1.14	0.49	1.01	0.40	1.05	0.45	0.24	0.58	0.76	0.63	0.26	0.40	0.23	1.19	0.70	1.60	0.38	1.88	1.49	1.69
OP2	0.77	0.38	0.47	0.03	0.67	0.39	0.80	0.37	0.72	1.01	0.52	0.17	0.42	0.97	0.82	0.55	0.45	0.62	0.07	0.80	0.44	0.11	0.14
P	0.11	0.38	0.41	0.81	0.16	0.43	0.03	0.31	0.10	0.16	0.26	0.53	0.36	0.14	0.04	0.24	1.16	0.20	0.76	0.01	0.95	0.57	0.75

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.13	0.04	0.01	0.06	0.09	0.07	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.14	0.02	0.15	0.26	0.19
C2	0.08	0.00	0.28	0.51	0.00	0.33	0.01	0.51	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.24	0.11	1.25	0.00	1.70	1.92	1.59
C2'	0.00	0.28	0.00	0.01	0.16	0.00	0.09	0.16	0.14	0.12	0.22	0.32	0.28	0.06	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.07	0.16	0.10
C3'	0.02	0.51	0.01	0.00	0.25	0.00	0.13	0.01	0.22	0.21	0.39	0.63	0.49	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.18	0.08	0.15	0.10
C4	0.04	0.00	0.16	0.25	0.00	0.12	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.07	0.05	0.61	0.00	0.79	0.96	0.78
C4'	0.00	0.33	0.00	0.00	0.12	0.00	0.02	0.00	0.04	0.29	0.20	0.43	0.33	0.24	0.06	0.08	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01
C5	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.02	0.00	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.34	0.01	0.52	0.64	0.49
C5'	0.13	0.51	0.16	0.01	0.06	0.00	0.20	0.00	0.06	0.69	0.26	0.76	0.48	0.60	0.25	0.04	0.15	0.01	0.00	0.18	0.08	0.20	0.00
C6	0.04	0.00	0.14	0.22	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.57	0.01	0.85	1.00	0.78
C8	0.01	0.02	0.12	0.21	0.01	0.29	0.02	0.69	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.18	0.13	0.34	0.04	0.32	0.27	0.30
N1	0.06	0.00	0.22	0.39	0.00	0.20	0.01	0.26	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.17	0.05	0.98	0.00	1.40	1.59	1.29
N2	0.09	0.00	0.32	0.63	0.00	0.43	0.01	0.76	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.31	0.14	1.59	0.01	2.23	2.40	2.02
N3	0.07	0.01	0.28	0.49	0.00	0.33	0.00	0.48	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.21	0.13	1.15	0.00	1.45	1.65	1.39
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.24	0.01	0.60	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.12	0.12	0.18	0.04	0.12	0.07	0.12
N9	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.16	0.01	0.22	0.34	0.24
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.08	0.02	0.04	0.04	0.05	0.11	0.22	0.17	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.04	0.15	0.09
O3'	0.11	0.24	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02	0.15	0.08	0.18	0.17	0.31	0.21	0.12	0.06	0.04	0.00	0.11	0.12	0.06	0.10	0.15	0.10
O4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.13	0.05	0.14	0.13	0.12	0.03	0.00	0.11	0.00	0.19	0.02	0.20	0.28	0.23
O5'	0.14	1.25	0.06	0.09	0.61	0.00	0.34	0.00	0.57	0.34	0.98	1.59	1.15	0.18	0.16	0.07	0.12	0.19	0.00	0.43	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.12	0.18	0.00	0.01	0.01	0.18	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.02	0.43	0.00	0.70	0.80	0.62
OP1	0.15	1.70	0.07	0.08	0.79	0.01	0.52	0.08	0.85	0.32	1.40	2.23	1.45	0.12	0.22	0.04	0.10	0.20	0.01	0.70	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	1.92	0.16	0.15	0.96	0.01	0.64	0.20	1.00	0.27	1.59	2.40	1.65	0.07	0.34	0.15	0.15	0.28	0.01	0.80	0.01	0.00	0.01
P	0.19	1.59	0.10	0.10	0.78	0.01	0.49	0.00	0.78	0.30	1.29	2.02	1.39	0.12	0.24	0.09	0.10	0.23	0.00	0.62	0.00	0.01	0.00