Doublet Group distance statistics: 54153

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C1'	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.000, 0.004, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N4	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C2'	B	0, 0.000, 0.268, 0.537, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.268 std_dev=0.268
C3'	B	0, 0.000, 0.343, 0.687, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.343 std_dev=0.343
OP2	A	0, 0.000, 0.373, 0.746, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.373 std_dev=0.373
O3'	B	0, 0.000, 0.412, 0.824, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.412 std_dev=0.412
C1'	B	0, 0.000, 0.459, 0.919, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.459 std_dev=0.459
O2'	B	0, 0.000, 0.477, 0.954, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.477 std_dev=0.477
P	A	0, 0.000, 0.486, 0.971, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.486 std_dev=0.486
N9	B	0, 0.000, 0.561, 1.123, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.561 std_dev=0.561
C4'	B	0, 0.000, 0.606, 1.211, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.606 std_dev=0.606
O5'	A	0, 0.000, 0.629, 1.257, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.629 std_dev=0.629
O4'	A	0, 0.000, 0.634, 1.268, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.634 std_dev=0.634
O4'	B	0, 0.000, 0.642, 1.284, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.642 std_dev=0.642
C2'	A	0, 0.000, 0.684, 1.368, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.684 std_dev=0.684
C5'	B	0, 0.000, 0.763, 1.526, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.763 std_dev=0.763
OP1	A	0, 0.000, 0.793, 1.586, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.793 std_dev=0.793
C3'	A	0, 0.000, 0.893, 1.785, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.893 std_dev=0.893
C4'	A	0, 0.000, 0.906, 1.813, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.906 std_dev=0.906
C5	B	0, 0.000, 1.059, 2.118, 2.118 max_d=2.118 avg_d=1.059 std_dev=1.059
O2'	A	0, 0.000, 1.060, 2.120, 2.120 max_d=2.120 avg_d=1.060 std_dev=1.060
O3'	A	0, 0.000, 1.147, 2.295, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.147 std_dev=1.147
C4	B	0, 0.000, 1.187, 2.373, 2.373 max_d=2.373 avg_d=1.187 std_dev=1.187
C5'	A	0, 0.000, 1.270, 2.539, 2.539 max_d=2.539 avg_d=1.270 std_dev=1.270
C8	B	0, 0.000, 1.333, 2.666, 2.666 max_d=2.666 avg_d=1.333 std_dev=1.333
N7	B	0, 0.000, 1.375, 2.751, 2.751 max_d=2.751 avg_d=1.375 std_dev=1.375
C6	B	0, 0.000, 1.672, 3.344, 3.344 max_d=3.344 avg_d=1.672 std_dev=1.672
O6	B	0, 0.000, 1.717, 3.434, 3.434 max_d=3.434 avg_d=1.717 std_dev=1.717
O5'	B	0, 0.000, 1.830, 3.660, 3.660 max_d=3.660 avg_d=1.830 std_dev=1.830
P	B	0, 0.000, 2.065, 4.129, 4.129 max_d=4.129 avg_d=2.065 std_dev=2.065
N3	B	0, 0.000, 2.297, 4.594, 4.594 max_d=4.594 avg_d=2.297 std_dev=2.297
OP1	B	0, 0.000, 2.595, 5.190, 5.190 max_d=5.190 avg_d=2.595 std_dev=2.595
N1	B	0, 0.000, 2.657, 5.313, 5.313 max_d=5.313 avg_d=2.657 std_dev=2.657
C2	B	0, 0.000, 3.015, 6.029, 6.029 max_d=6.029 avg_d=3.015 std_dev=3.015
OP2	B	0, 0.000, 3.030, 6.059, 6.059 max_d=6.059 avg_d=3.030 std_dev=3.030
N2	B	0, 0.000, 4.234, 8.468, 8.468 max_d=8.468 avg_d=4.234 std_dev=4.234

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.25	0.00	0.25	0.10	0.12	0.08
C2	0.00	0.00	0.17	0.16	0.00	0.02	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.12	0.34	0.27	0.15	0.18
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.17	0.01	0.13	0.01	0.31	0.00	0.02	0.01	0.60	0.46	0.54	0.49
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.20	0.00	0.18	0.01	0.13	0.12	0.19	0.22	0.13	0.00	0.00	0.01	0.35	0.25	0.25	0.20
C4	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.01	0.02	0.41	0.42	0.18	0.27
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.01	0.02	0.06	0.21	0.00	0.00	0.01	0.07	0.04	0.07
C5	0.00	0.00	0.12	0.18	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	0.04	0.07	0.42	0.42	0.17	0.28
C5'	0.08	0.13	0.16	0.01	0.11	0.00	0.06	0.00	0.05	0.09	0.14	0.11	0.14	0.05	0.19	0.01	0.00	0.26	0.08	0.02
C6	0.00	0.00	0.17	0.13	0.00	0.08	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.01	0.11	0.40	0.32	0.16	0.23
N1	0.01	0.00	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.10	0.01	0.34	0.24	0.14	0.16
N3	0.00	0.00	0.13	0.19	0.00	0.01	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.05	0.10	0.38	0.36	0.17	0.23
N4	0.00	0.01	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.05	0.03	0.42	0.47	0.18	0.30
O2	0.01	0.00	0.31	0.13	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.18	0.19	0.29	0.21	0.14	0.14
O2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.21	0.21	0.32	0.05	0.31	0.13	0.06	0.23	0.24	0.00	0.03	0.12	0.37	0.25	0.46	0.36
O3'	0.25	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.19	0.01	0.10	0.05	0.05	0.18	0.03	0.00	0.17	0.11	0.11	0.01	0.01
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.10	0.03	0.19	0.12	0.17	0.00	0.06	0.10	0.19	0.22
O5'	0.25	0.34	0.60	0.35	0.41	0.01	0.42	0.00	0.40	0.34	0.38	0.42	0.29	0.37	0.11	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.10	0.27	0.46	0.25	0.42	0.07	0.42	0.26	0.32	0.24	0.36	0.47	0.21	0.25	0.11	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.12	0.15	0.54	0.25	0.18	0.04	0.17	0.08	0.16	0.14	0.17	0.18	0.14	0.46	0.01	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.18	0.49	0.20	0.27	0.07	0.28	0.02	0.23	0.16	0.23	0.30	0.14	0.36	0.01	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.51	0.15	0.21	0.29	0.42	0.15	0.49	0.19	0.01	0.37	0.66	0.50	0.02	0.19	0.14	0.13	0.42	0.69	0.10	0.15	0.74	0.54
C2	0.32	0.65	0.12	0.18	0.41	0.41	0.30	0.53	0.37	0.09	0.55	0.80	0.61	0.11	0.28	0.03	0.03	0.45	1.02	0.30	0.49	1.27	0.89
C2'	0.09	0.19	0.28	0.24	0.24	0.03	0.35	0.09	0.37	0.34	0.28	0.11	0.15	0.40	0.23	0.22	0.33	0.04	0.28	0.44	0.05	0.30	0.19
C3'	0.46	0.22	0.28	0.22	0.22	0.49	0.09	0.44	0.03	0.14	0.11	0.27	0.30	0.04	0.27	0.47	0.10	0.55	0.49	0.06	0.13	0.35	0.37
C4	0.31	0.81	0.08	0.13	0.51	0.34	0.42	0.50	0.53	0.13	0.72	0.97	0.73	0.20	0.33	0.08	0.07	0.44	1.20	0.48	0.75	1.54	1.10
C4'	0.61	0.71	0.53	0.43	0.50	0.58	0.30	0.47	0.32	0.17	0.52	0.87	0.73	0.11	0.43	0.71	0.36	0.63	0.41	0.19	0.16	0.24	0.23
C5	0.31	0.82	0.09	0.14	0.51	0.37	0.39	0.51	0.50	0.08	0.71	0.99	0.75	0.15	0.31	0.07	0.09	0.44	1.09	0.43	0.58	1.26	0.94
C5'	0.67	0.85	0.65	0.42	0.58	0.49	0.35	0.28	0.38	0.15	0.63	1.04	0.87	0.10	0.47	0.90	0.33	0.59	0.08	0.23	0.48	0.19	0.11
C6	0.32	0.72	0.13	0.18	0.43	0.42	0.30	0.52	0.38	0.03	0.59	0.89	0.68	0.07	0.27	0.02	0.01	0.45	0.87	0.30	0.34	0.96	0.71
N1	0.32	0.63	0.14	0.20	0.38	0.43	0.25	0.52	0.32	0.04	0.51	0.79	0.60	0.06	0.25	0.06	0.06	0.45	0.87	0.24	0.33	1.00	0.72
N3	0.32	0.74	0.10	0.16	0.47	0.37	0.37	0.52	0.47	0.13	0.65	0.89	0.67	0.18	0.31	0.04	0.02	0.45	1.15	0.41	0.67	1.50	1.05
N4	0.30	0.88	0.06	0.10	0.56	0.28	0.49	0.45	0.63	0.18	0.81	1.03	0.77	0.27	0.35	0.13	0.11	0.41	1.28	0.58	0.97	1.80	1.27
O2	0.32	0.59	0.13	0.20	0.37	0.42	0.26	0.53	0.32	0.09	0.49	0.73	0.56	0.10	0.27	0.06	0.07	0.45	0.99	0.25	0.46	1.25	0.86
O2'	0.38	0.51	0.51	0.36	0.52	0.17	0.59	0.04	0.62	0.54	0.57	0.48	0.48	0.60	0.48	0.52	0.35	0.23	0.17	0.67	0.12	0.25	0.10
O3'	0.61	0.27	0.45	0.33	0.36	0.55	0.26	0.47	0.17	0.38	0.20	0.26	0.37	0.27	0.45	0.64	0.20	0.64	0.52	0.10	0.18	0.36	0.40
O4'	0.66	0.98	0.56	0.56	0.67	0.70	0.47	0.66	0.54	0.23	0.80	1.19	0.96	0.22	0.52	0.61	0.50	0.71	0.69	0.42	0.02	0.63	0.49
O5'	0.06	0.60	0.07	0.01	0.17	0.00	0.05	0.06	0.07	0.39	0.38	0.88	0.54	0.36	0.06	0.17	0.02	0.02	0.31	0.06	0.79	0.44	0.41
OP1	0.06	1.16	0.03	0.07	0.32	0.18	0.01	0.29	0.26	0.70	0.82	1.68	0.98	0.59	0.15	0.06	0.03	0.15	0.72	0.08	1.40	0.81	0.86
OP2	0.10	0.74	0.17	0.00	0.23	0.02	0.05	0.12	0.10	0.45	0.47	1.04	0.69	0.42	0.05	0.28	0.01	0.02	0.64	0.06	0.86	0.90	0.65
P	0.03	0.85	0.08	0.02	0.25	0.06	0.03	0.13	0.15	0.52	0.57	1.21	0.76	0.45	0.09	0.15	0.01	0.03	0.52	0.00	0.93	0.65	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.17	0.03	0.35	0.28	0.06
C2	0.01	0.00	0.16	0.67	0.00	0.62	0.00	0.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.70	0.34	0.47	0.00	1.03	0.42	0.84
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.10	0.21	0.17	0.11	0.04	0.01	0.02	0.01	0.24	0.02	0.02	0.34	0.08
C3'	0.01	0.67	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.15	0.46	0.45	0.89	0.66	0.35	0.09	0.02	0.01	0.01	0.31	0.04	0.28	0.33	0.19
C4	0.01	0.00	0.05	0.24	0.00	0.25	0.00	0.36	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.21	0.17	0.08	0.01	0.58	0.26	0.25
C4'	0.00	0.62	0.01	0.00	0.25	0.00	0.05	0.00	0.18	0.39	0.45	0.80	0.60	0.27	0.05	0.04	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.02	0.07
C5	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.07	0.42	0.01	0.33	0.72	0.10
C5'	0.01	0.96	0.00	0.00	0.36	0.00	0.08	0.00	0.30	0.58	0.70	1.27	0.87	0.41	0.07	0.04	0.01	0.00	0.00	0.15	0.24	0.13	0.00
C6	0.02	0.00	0.01	0.15	0.01	0.18	0.01	0.30	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.13	0.13	0.24	0.00	0.49	0.52	0.10
C8	0.00	0.00	0.14	0.46	0.00	0.39	0.00	0.58	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.46	0.19	1.01	0.03	0.20	1.33	0.74
N1	0.01	0.00	0.10	0.45	0.01	0.45	0.00	0.70	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.47	0.26	0.18	0.01	0.84	0.04	0.56
N2	0.01	0.00	0.21	0.89	0.00	0.80	0.00	1.27	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.97	0.41	0.78	0.01	1.27	0.85	1.17
N3	0.01	0.00	0.17	0.66	0.00	0.60	0.00	0.87	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.64	0.34	0.42	0.00	0.95	0.34	0.75
N7	0.01	0.01	0.11	0.35	0.00	0.27	0.00	0.41	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.38	0.11	0.92	0.03	0.13	1.38	0.67
N9	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.41	0.02	0.27	0.60	0.12
O2'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.06	0.03	0.07	0.13	0.10	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.09	0.05	0.09	0.18	0.01
O3'	0.02	0.70	0.02	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.13	0.46	0.47	0.97	0.64	0.38	0.10	0.03	0.00	0.02	0.23	0.01	0.49	0.24	0.22
O4'	0.00	0.34	0.01	0.01	0.17	0.00	0.07	0.00	0.13	0.19	0.26	0.41	0.34	0.11	0.00	0.05	0.02	0.00	0.00	0.08	0.45	0.02	0.21
O5'	0.17	0.47	0.24	0.31	0.08	0.00	0.42	0.00	0.24	1.01	0.18	0.78	0.42	0.92	0.41	0.09	0.23	0.00	0.00	0.41	0.00	0.01	0.00
O6	0.03	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.01	0.08	0.41	0.00	0.33	0.79	0.10
OP1	0.35	1.03	0.02	0.28	0.58	0.03	0.33	0.24	0.49	0.20	0.84	1.27	0.95	0.13	0.27	0.09	0.49	0.45	0.00	0.33	0.00	0.00	0.01
OP2	0.28	0.42	0.34	0.33	0.26	0.02	0.72	0.13	0.52	1.33	0.04	0.85	0.34	1.38	0.60	0.18	0.24	0.02	0.01	0.79	0.00	0.00	0.01
P	0.06	0.84	0.08	0.19	0.25	0.07	0.10	0.00	0.10	0.74	0.56	1.17	0.75	0.67	0.12	0.01	0.22	0.21	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00