Doublet Group distance statistics: 54156

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N4	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
O2	A	0, 0.000, 0.028, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.000, 0.116, 0.233, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.116 std_dev=0.116
O4'	A	0, 0.000, 0.124, 0.248, 0.248 max_d=0.248 avg_d=0.124 std_dev=0.124
C4'	A	0, 0.000, 0.168, 0.337, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.168 std_dev=0.168
C2'	B	0, 0.000, 0.278, 0.556, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.278 std_dev=0.278
P	A	0, 0.000, 0.395, 0.789, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.395 std_dev=0.395
O3'	B	0, 0.000, 0.404, 0.807, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.404 std_dev=0.404
OP2	A	0, 0.000, 0.415, 0.831, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.415 std_dev=0.415
C5'	A	0, 0.000, 0.503, 1.006, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.503 std_dev=0.503
OP1	A	0, 0.000, 0.515, 1.029, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.515 std_dev=0.515
C3'	B	0, 0.000, 0.668, 1.335, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.668 std_dev=0.668
O2'	A	0, 0.000, 0.675, 1.351, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.675 std_dev=0.675
C3'	A	0, 0.000, 0.740, 1.481, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.740 std_dev=0.740
O5'	A	0, 0.000, 0.748, 1.497, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.748 std_dev=0.748
O2'	B	0, 0.000, 0.790, 1.580, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.790 std_dev=0.790
OP2	B	0, 0.000, 0.905, 1.809, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.905 std_dev=0.905
C1'	B	0, 0.000, 1.015, 2.030, 2.030 max_d=2.030 avg_d=1.015 std_dev=1.015
P	B	0, 0.000, 1.017, 2.034, 2.034 max_d=2.034 avg_d=1.017 std_dev=1.017
C4'	B	0, 0.000, 1.134, 2.268, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.134 std_dev=1.134
O5'	B	0, 0.000, 1.185, 2.369, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.185 std_dev=1.185
O4'	B	0, 0.000, 1.210, 2.420, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.210 std_dev=1.210
OP1	B	0, 0.000, 1.323, 2.645, 2.645 max_d=2.645 avg_d=1.323 std_dev=1.323
O3'	A	0, 0.000, 1.570, 3.140, 3.140 max_d=3.140 avg_d=1.570 std_dev=1.570
N9	B	0, 0.000, 1.593, 3.186, 3.186 max_d=3.186 avg_d=1.593 std_dev=1.593
C5'	B	0, 0.000, 1.682, 3.364, 3.364 max_d=3.364 avg_d=1.682 std_dev=1.682
C8	B	0, 0.000, 1.871, 3.742, 3.742 max_d=3.742 avg_d=1.871 std_dev=1.871
C4	B	0, 0.000, 2.094, 4.188, 4.188 max_d=4.188 avg_d=2.094 std_dev=2.094
N3	B	0, 0.000, 2.260, 4.519, 4.519 max_d=4.519 avg_d=2.260 std_dev=2.260
N7	B	0, 0.000, 2.422, 4.845, 4.845 max_d=4.845 avg_d=2.422 std_dev=2.422
C5	B	0, 0.000, 2.524, 5.049, 5.049 max_d=5.049 avg_d=2.524 std_dev=2.524
C2	B	0, 0.000, 2.815, 5.630, 5.630 max_d=5.630 avg_d=2.815 std_dev=2.815
C6	B	0, 0.000, 3.087, 6.173, 6.173 max_d=6.173 avg_d=3.087 std_dev=3.087
N2	B	0, 0.000, 3.137, 6.273, 6.273 max_d=6.273 avg_d=3.137 std_dev=3.137
N1	B	0, 0.000, 3.162, 6.325, 6.325 max_d=6.325 avg_d=3.162 std_dev=3.162
O6	B	0, 0.000, 3.540, 7.079, 7.079 max_d=7.079 avg_d=3.540 std_dev=3.540

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.24	0.00	0.32	0.22	0.20	0.07
C2	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.28	0.22	0.00	0.39	0.15	0.14	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.30	0.20	0.23	0.04
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.25	0.00	0.34	0.01	0.33	0.16	0.14	0.27	0.07	0.00	0.00	0.02	0.14	0.13	0.71	0.39
C4	0.02	0.00	0.01	0.25	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.10	0.04	0.42	0.09	0.07	0.13
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.04	0.03	0.05	0.02	0.24	0.01	0.00	0.00	0.16	0.35	0.11
C5	0.02	0.00	0.01	0.34	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.27	0.05	0.42	0.09	0.08	0.13
C5'	0.05	0.02	0.13	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.02	0.02	0.02	0.12	0.18	0.01	0.01	0.26	0.12	0.01
C6	0.02	0.00	0.02	0.33	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.24	0.05	0.42	0.14	0.14	0.12
N1	0.01	0.01	0.01	0.16	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.05	0.01	0.39	0.17	0.17	0.09
N3	0.02	0.00	0.03	0.14	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.10	0.01	0.41	0.12	0.11	0.11
N4	0.02	0.01	0.01	0.27	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.29	0.14	0.04	0.42	0.06	0.03	0.13
O2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.46	0.02	0.37	0.18	0.15	0.09
O2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.27	0.24	0.19	0.12	0.12	0.16	0.31	0.29	0.32	0.00	0.09	0.16	0.09	0.06	0.25	0.07
O3'	0.24	0.22	0.04	0.00	0.10	0.01	0.27	0.18	0.24	0.05	0.10	0.14	0.46	0.09	0.00	0.16	0.53	0.50	1.07	0.72
O4'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.02	0.16	0.16	0.00	0.25	0.26	0.17	0.07
O5'	0.32	0.39	0.30	0.14	0.42	0.00	0.42	0.01	0.42	0.39	0.41	0.42	0.37	0.09	0.53	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.22	0.15	0.20	0.13	0.09	0.16	0.09	0.26	0.14	0.17	0.12	0.06	0.18	0.06	0.50	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.20	0.14	0.23	0.71	0.07	0.35	0.08	0.12	0.14	0.17	0.11	0.03	0.15	0.25	1.07	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.10	0.04	0.39	0.13	0.11	0.13	0.01	0.12	0.09	0.11	0.13	0.09	0.07	0.72	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.59	1.30	0.03	0.03	0.99	0.25	0.98	0.19	1.12	0.66	1.26	1.42	1.17	0.79	0.75	0.18	0.04	0.48	0.36	1.12	0.73	0.60	0.54
C2	0.62	1.49	0.01	0.01	1.18	0.27	1.25	0.22	1.42	0.90	1.52	1.56	1.30	1.09	0.90	0.22	0.00	0.55	0.48	1.45	0.73	0.62	0.59
C2'	0.57	1.18	0.07	0.03	0.89	0.19	0.86	0.09	0.99	0.56	1.13	1.32	1.07	0.68	0.67	0.01	0.06	0.42	0.32	0.98	0.73	0.64	0.55
C3'	0.86	1.31	0.48	0.45	1.09	0.51	1.05	0.42	1.15	0.80	1.26	1.40	1.24	0.89	0.92	0.41	0.46	0.67	0.62	1.13	1.09	1.03	0.91
C4	0.46	0.98	0.08	0.12	0.95	0.11	1.08	0.07	1.18	0.86	1.12	0.81	0.87	1.02	0.77	0.12	0.09	0.38	0.46	1.22	0.64	0.59	0.55
C4'	0.61	1.12	0.20	0.22	0.86	0.34	0.80	0.27	0.91	0.52	1.05	1.24	1.04	0.61	0.66	0.00	0.22	0.48	0.36	0.88	0.83	0.69	0.61
C5	0.43	0.71	0.08	0.15	0.74	0.04	0.81	0.02	0.84	0.67	0.80	0.59	0.68	0.77	0.64	0.02	0.11	0.29	0.39	0.87	0.64	0.59	0.53
C5'	0.55	0.90	0.20	0.23	0.69	0.34	0.60	0.26	0.68	0.37	0.82	1.01	0.86	0.43	0.54	0.02	0.22	0.45	0.32	0.64	0.82	0.63	0.59
C6	0.51	0.90	0.02	0.08	0.80	0.11	0.81	0.03	0.88	0.62	0.91	0.88	0.86	0.71	0.66	0.06	0.06	0.35	0.37	0.88	0.68	0.60	0.54
N1	0.60	1.25	0.01	0.01	1.02	0.23	1.03	0.16	1.16	0.74	1.24	1.31	1.15	0.88	0.80	0.17	0.00	0.48	0.42	1.16	0.72	0.61	0.57
N3	0.56	1.39	0.05	0.06	1.15	0.22	1.28	0.18	1.45	0.95	1.49	1.35	1.18	1.15	0.89	0.20	0.04	0.50	0.50	1.50	0.69	0.60	0.58
N4	0.34	0.68	0.12	0.16	0.80	0.06	1.05	0.02	1.13	0.87	0.96	0.38	0.56	1.06	0.68	0.09	0.11	0.30	0.47	1.23	0.59	0.55	0.53
O2	0.66	1.68	0.00	0.02	1.27	0.33	1.36	0.29	1.58	0.95	1.72	1.84	1.43	1.17	0.96	0.25	0.03	0.61	0.51	1.63	0.75	0.62	0.61
O2'	0.56	1.14	0.03	0.07	0.85	0.29	0.82	0.18	0.95	0.54	1.09	1.29	1.02	0.64	0.65	0.08	0.15	0.49	0.38	0.93	0.82	0.64	0.60
O3'	0.83	1.17	0.54	0.59	1.01	0.60	0.99	0.56	1.07	0.81	1.15	1.23	1.11	0.87	0.88	0.44	0.60	0.66	0.74	1.06	1.36	1.26	1.11
O4'	0.56	1.18	0.03	0.07	0.90	0.28	0.86	0.23	0.99	0.55	1.12	1.30	1.08	0.67	0.67	0.27	0.05	0.46	0.32	0.97	0.72	0.55	0.51
O5'	0.22	0.34	0.06	0.00	0.22	0.08	0.13	0.02	0.17	0.02	0.26	0.42	0.34	0.02	0.14	0.12	0.01	0.13	0.20	0.13	0.83	0.57	0.54
OP1	0.15	0.17	0.21	0.14	0.09	0.09	0.00	0.10	0.01	0.08	0.10	0.23	0.18	0.10	0.04	0.26	0.01	0.06	0.14	0.03	0.87	0.74	0.62
OP2	0.19	0.20	0.09	0.15	0.10	0.24	0.02	0.45	0.00	0.10	0.10	0.28	0.22	0.13	0.05	0.48	0.01	0.04	0.00	0.06	0.47	0.44	0.32
P	0.19	0.22	0.08	0.01	0.13	0.09	0.04	0.17	0.06	0.05	0.15	0.29	0.24	0.06	0.08	0.18	0.00	0.01	0.12	0.02	0.72	0.57	0.49

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.19	0.00	0.05	0.02	0.21	0.06	0.02
C2	0.00	0.00	0.25	0.12	0.01	0.03	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.22	0.17	0.13	0.01	0.23	0.71	0.43
C2'	0.00	0.25	0.00	0.01	0.11	0.02	0.02	0.07	0.07	0.17	0.17	0.31	0.24	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01	0.49	0.03	0.75	0.61	0.62
C3'	0.03	0.12	0.01	0.00	0.11	0.00	0.14	0.00	0.15	0.12	0.14	0.10	0.09	0.15	0.09	0.00	0.00	0.00	0.32	0.16	0.74	0.47	0.54
C4	0.01	0.01	0.11	0.11	0.00	0.05	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.16	0.10	0.15	0.01	0.26	0.66	0.42
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.10	0.25	0.03	0.09	0.04	0.23	0.12	0.09	0.00	0.00	0.01	0.14	0.29	0.02	0.10
C5	0.02	0.01	0.02	0.14	0.00	0.13	0.00	0.38	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.10	0.06	0.25	0.00	0.54	0.93	0.64
C5'	0.07	0.18	0.07	0.00	0.26	0.00	0.38	0.00	0.37	0.47	0.28	0.12	0.15	0.49	0.28	0.02	0.03	0.00	0.00	0.42	0.12	0.25	0.00
C6	0.01	0.00	0.07	0.15	0.01	0.10	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.09	0.27	0.00	0.61	1.03	0.71
C8	0.01	0.01	0.17	0.12	0.01	0.25	0.00	0.47	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.35	0.02	0.09	0.28	0.00	0.49	0.75	0.56
N1	0.01	0.00	0.17	0.14	0.00	0.03	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.14	0.21	0.00	0.44	0.90	0.59
N2	0.01	0.00	0.31	0.10	0.01	0.09	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.26	0.20	0.09	0.01	0.13	0.64	0.36
N3	0.00	0.00	0.24	0.09	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.23	0.17	0.09	0.01	0.10	0.55	0.32
N7	0.01	0.01	0.11	0.15	0.00	0.23	0.00	0.49	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.35	0.02	0.03	0.33	0.00	0.71	1.05	0.75
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.12	0.01	0.28	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.11	0.01	0.13	0.02	0.17	0.48	0.31
O2'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.05	0.09	0.20	0.02	0.15	0.35	0.00	0.28	0.18	0.35	0.15	0.00	0.06	0.15	0.44	0.22	0.85	0.85	0.71
O3'	0.19	0.22	0.01	0.00	0.16	0.00	0.10	0.03	0.12	0.02	0.18	0.26	0.23	0.02	0.11	0.06	0.00	0.06	0.19	0.09	0.69	0.47	0.46
O4'	0.00	0.17	0.01	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.09	0.14	0.20	0.17	0.03	0.01	0.15	0.06	0.00	0.12	0.08	0.06	0.22	0.13
O5'	0.05	0.13	0.49	0.32	0.15	0.01	0.25	0.00	0.27	0.28	0.21	0.09	0.09	0.33	0.13	0.44	0.19	0.12	0.00	0.31	0.02	0.00	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.16	0.01	0.14	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.22	0.09	0.08	0.31	0.00	0.78	1.16	0.82
OP1	0.21	0.23	0.75	0.74	0.26	0.29	0.54	0.12	0.61	0.49	0.44	0.13	0.10	0.71	0.17	0.85	0.69	0.06	0.02	0.78	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.71	0.61	0.47	0.66	0.02	0.93	0.25	1.03	0.75	0.90	0.64	0.55	1.05	0.48	0.85	0.47	0.22	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.43	0.62	0.54	0.42	0.10	0.64	0.00	0.71	0.56	0.59	0.36	0.32	0.75	0.31	0.71	0.46	0.13	0.00	0.82	0.00	0.00	0.00