Doublet Group distance statistics: 54173

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 2, 3, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.008, 0.017, 0.027, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, -0.002, 0.013, 0.028, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.013 std_dev=0.015
C6	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.002, 0.020, 0.037, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.020 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.018, 0.036, 0.054, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.036 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.018, 0.050, 0.082, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.050 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.020, 0.087, 0.154, 0.227 max_d=0.227 avg_d=0.087 std_dev=0.067
O4'	A	0, 0.049, 0.123, 0.196, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.123 std_dev=0.073
O2'	A	0, 0.061, 0.144, 0.227, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.144 std_dev=0.083
C4'	A	0, 0.057, 0.145, 0.232, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.145 std_dev=0.088
C3'	A	0, 0.048, 0.143, 0.238, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.143 std_dev=0.095
O2	B	0, 0.204, 0.344, 0.484, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.344 std_dev=0.140
O3'	A	0, 0.075, 0.224, 0.373, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.224 std_dev=0.149
C5'	A	0, 0.087, 0.264, 0.441, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.264 std_dev=0.177
O3'	B	0, 0.091, 0.273, 0.455, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.273 std_dev=0.182
P	A	0, 0.117, 0.308, 0.498, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.308 std_dev=0.191
C2	B	0, 0.189, 0.389, 0.590, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.389 std_dev=0.200
C1'	B	0, 0.141, 0.350, 0.559, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.350 std_dev=0.209
C3'	B	0, 0.161, 0.382, 0.603, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.382 std_dev=0.221
OP2	A	0, 0.125, 0.356, 0.587, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.356 std_dev=0.231
O2'	B	0, 0.241, 0.474, 0.708, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.474 std_dev=0.233
C4'	B	0, 0.166, 0.404, 0.642, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.404 std_dev=0.238
C2'	B	0, 0.190, 0.428, 0.666, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.428 std_dev=0.238
O4'	B	0, 0.184, 0.428, 0.672, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.428 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.175, 0.433, 0.691, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.433 std_dev=0.258
C5'	B	0, 0.227, 0.502, 0.777, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.502 std_dev=0.275
N3	B	0, 0.237, 0.516, 0.794, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.516 std_dev=0.278
OP1	A	0, 0.125, 0.431, 0.737, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.431 std_dev=0.306
O5'	A	0, 0.015, 0.341, 0.667, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.341 std_dev=0.326
O5'	B	0, 0.217, 0.552, 0.887, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.552 std_dev=0.335
C6	B	0, 0.251, 0.625, 0.998, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.625 std_dev=0.373
C4	B	0, 0.260, 0.658, 1.055, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.658 std_dev=0.398
P	B	0, 0.258, 0.665, 1.071, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.665 std_dev=0.406
OP1	B	0, 0.279, 0.713, 1.146, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.713 std_dev=0.433
OP2	B	0, 0.304, 0.741, 1.177, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.741 std_dev=0.437
C5	B	0, 0.284, 0.723, 1.161, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.723 std_dev=0.438
O4	B	0, 0.300, 0.763, 1.227, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.763 std_dev=0.463

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.14	0.13	0.21	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.21	0.07	0.21	0.07
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.07	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.18	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.05	0.09	0.01	0.00	0.01	0.06	0.17	0.16	0.05
C4	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.04	0.24	0.12	0.24	0.10
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.20	0.20	0.03
C5	0.03	0.01	0.03	0.05	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.05	0.27	0.11	0.26	0.11
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.05	0.08	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.22	0.18	0.02
C6	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.05	0.27	0.09	0.25	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.22	0.08	0.22	0.05
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.03	0.22	0.09	0.22	0.09
N4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.05	0.23	0.17	0.24	0.12
O2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.10	0.02	0.18	0.10	0.19	0.08
O2'	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.03	0.04	0.02	0.17	0.18	0.05
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.10	0.03	0.00	0.01	0.17	0.19	0.13	0.07
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.14	0.16	0.23	0.03
O5'	0.14	0.21	0.04	0.06	0.24	0.01	0.27	0.01	0.27	0.22	0.22	0.23	0.18	0.02	0.17	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.13	0.07	0.14	0.17	0.12	0.20	0.11	0.22	0.09	0.08	0.09	0.17	0.10	0.17	0.19	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.21	0.18	0.16	0.24	0.20	0.26	0.18	0.25	0.22	0.22	0.24	0.19	0.18	0.13	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.07	0.04	0.05	0.10	0.03	0.11	0.02	0.09	0.05	0.09	0.12	0.08	0.05	0.07	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.06	0.03	0.06	0.08	0.08	0.09	0.08	0.08	0.06	0.08	0.08	0.06	0.07	0.08	0.07	0.05	0.08	0.07	0.05
C2	0.05	0.08	0.07	0.10	0.10	0.10	0.07	0.09	0.06	0.06	0.11	0.09	0.10	0.11	0.12	0.06	0.05	0.06	0.10	0.06
C2'	0.04	0.06	0.04	0.07	0.08	0.07	0.09	0.07	0.08	0.06	0.08	0.07	0.06	0.08	0.09	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05
C3'	0.05	0.07	0.04	0.06	0.08	0.06	0.09	0.07	0.09	0.06	0.08	0.08	0.07	0.07	0.08	0.07	0.05	0.08	0.08	0.06
C4	0.08	0.13	0.10	0.11	0.13	0.10	0.11	0.09	0.10	0.10	0.14	0.14	0.13	0.11	0.14	0.07	0.09	0.08	0.14	0.09
C4'	0.07	0.09	0.07	0.06	0.09	0.05	0.11	0.06	0.12	0.09	0.09	0.10	0.09	0.06	0.09	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07
C5	0.08	0.11	0.08	0.10	0.12	0.10	0.11	0.09	0.10	0.09	0.12	0.12	0.10	0.11	0.13	0.08	0.07	0.08	0.11	0.08
C5'	0.10	0.12	0.10	0.08	0.12	0.06	0.13	0.06	0.14	0.11	0.12	0.13	0.12	0.09	0.11	0.10	0.08	0.09	0.09	0.07
C6	0.06	0.07	0.06	0.09	0.09	0.11	0.09	0.10	0.09	0.07	0.09	0.08	0.07	0.10	0.10	0.08	0.06	0.08	0.09	0.06
N1	0.04	0.05	0.05	0.09	0.07	0.10	0.06	0.09	0.06	0.04	0.07	0.07	0.07	0.09	0.08	0.07	0.04	0.07	0.08	0.05
N3	0.07	0.12	0.10	0.10	0.13	0.10	0.10	0.09	0.09	0.09	0.14	0.13	0.12	0.11	0.15	0.07	0.08	0.07	0.13	0.09
N4	0.12	0.17	0.14	0.11	0.17	0.10	0.15	0.09	0.14	0.15	0.18	0.18	0.18	0.10	0.18	0.09	0.12	0.10	0.18	0.13
O2	0.06	0.10	0.07	0.10	0.12	0.10	0.09	0.09	0.07	0.07	0.13	0.10	0.10	0.11	0.14	0.07	0.05	0.06	0.10	0.06
O2'	0.05	0.08	0.03	0.05	0.10	0.07	0.11	0.08	0.10	0.07	0.10	0.09	0.05	0.07	0.11	0.08	0.06	0.09	0.07	0.06
O3'	0.05	0.07	0.04	0.06	0.08	0.06	0.09	0.08	0.09	0.06	0.08	0.08	0.07	0.07	0.08	0.07	0.06	0.08	0.08	0.06
O4'	0.07	0.08	0.06	0.06	0.09	0.07	0.10	0.08	0.11	0.08	0.09	0.09	0.08	0.06	0.08	0.08	0.08	0.09	0.09	0.07
O5'	0.24	0.23	0.25	0.28	0.22	0.29	0.22	0.31	0.23	0.24	0.22	0.23	0.25	0.27	0.23	0.25	0.28	0.31	0.29	0.29
OP1	0.11	0.08	0.14	0.13	0.06	0.10	0.10	0.10	0.12	0.09	0.07	0.09	0.17	0.16	0.06	0.12	0.10	0.13	0.10	0.10
OP2	0.27	0.30	0.22	0.17	0.31	0.18	0.31	0.15	0.30	0.29	0.31	0.30	0.22	0.16	0.31	0.27	0.16	0.15	0.17	0.16
P	0.08	0.08	0.06	0.07	0.09	0.08	0.11	0.11	0.12	0.09	0.09	0.09	0.08	0.07	0.08	0.11	0.09	0.15	0.10	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.06	0.09	0.06
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.16	0.11	0.15	0.12
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.06	0.09	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.22	0.17	0.20	0.18
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.22	0.17	0.18	0.17
C5'	0.03	0.06	0.03	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.08	0.04	0.03	0.02	0.11	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.20	0.14	0.14	0.13
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.16	0.11	0.13	0.11
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.20	0.14	0.19	0.15
O2	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.13	0.09	0.14	0.10
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.00	0.02	0.07	0.01	0.06	0.07	0.11	0.07
O3'	0.04	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.03	0.07	0.04
O4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.03	0.22	0.18	0.23	0.19
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.07	0.05	0.07	0.04
O5'	0.10	0.16	0.06	0.04	0.22	0.01	0.22	0.01	0.20	0.16	0.20	0.13	0.06	0.04	0.22	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.11	0.06	0.03	0.17	0.04	0.17	0.05	0.14	0.11	0.14	0.09	0.07	0.03	0.18	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.15	0.09	0.06	0.20	0.04	0.18	0.02	0.14	0.13	0.19	0.14	0.11	0.07	0.23	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.12	0.06	0.04	0.18	0.02	0.17	0.01	0.13	0.11	0.15	0.10	0.07	0.04	0.19	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00