Doublet Group distance statistics: 54175

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 2, 4, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C4	A	0, -0.002, 0.010, 0.022, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.010 std_dev=0.012
N3	A	0, -0.006, 0.011, 0.028, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.011 std_dev=0.017
C2	A	0, -0.003, 0.014, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.004, 0.017, 0.038, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.017 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.001, 0.026, 0.050, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.026 std_dev=0.024
O2	A	0, -0.013, 0.033, 0.078, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.033 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.015, 0.061, 0.107, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.061 std_dev=0.046
C3'	A	0, 0.073, 0.143, 0.212, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.143 std_dev=0.069
O3'	A	0, 0.125, 0.206, 0.288, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.206 std_dev=0.082
C2'	A	0, -0.009, 0.082, 0.173, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.082 std_dev=0.091
O2'	A	0, 0.021, 0.144, 0.266, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.144 std_dev=0.123
O3'	B	0, 0.142, 0.281, 0.420, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.281 std_dev=0.139
C1'	B	0, 0.070, 0.226, 0.381, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.226 std_dev=0.156
O4'	B	0, 0.058, 0.217, 0.375, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.217 std_dev=0.158
C3'	B	0, 0.099, 0.258, 0.418, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.258 std_dev=0.160
C4'	B	0, 0.074, 0.235, 0.396, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.235 std_dev=0.161
C4'	A	0, 0.017, 0.183, 0.350, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.183 std_dev=0.167
C2'	B	0, 0.100, 0.269, 0.437, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.269 std_dev=0.169
N1	B	0, 0.074, 0.250, 0.426, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.250 std_dev=0.176
O2	B	0, 0.102, 0.290, 0.478, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.290 std_dev=0.188
C6	B	0, 0.132, 0.321, 0.511, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.321 std_dev=0.189
P	A	0, 0.120, 0.311, 0.502, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.311 std_dev=0.191
O2'	B	0, 0.118, 0.314, 0.509, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.314 std_dev=0.196
C2	B	0, 0.046, 0.257, 0.468, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.257 std_dev=0.211
C5'	B	0, 0.102, 0.315, 0.528, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.315 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.140, 0.373, 0.606, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.373 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.061, 0.317, 0.573, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.317 std_dev=0.256
C4	B	0, 0.094, 0.364, 0.634, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.364 std_dev=0.270
O5'	B	0, 0.150, 0.421, 0.692, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.421 std_dev=0.271
OP1	A	0, 0.122, 0.421, 0.720, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.421 std_dev=0.299
O4	B	0, 0.121, 0.434, 0.746, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.434 std_dev=0.313
OP2	A	0, 0.283, 0.605, 0.927, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.605 std_dev=0.322
O5'	A	0, 0.183, 0.558, 0.932, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.558 std_dev=0.374
C5'	A	0, -0.017, 0.385, 0.787, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.385 std_dev=0.402
P	B	0, 0.022, 0.605, 1.188, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.605 std_dev=0.583
OP1	B	0, 0.029, 0.751, 1.473, 2.473 max_d=2.473 avg_d=0.751 std_dev=0.722
OP2	B	0, 0.002, 0.748, 1.494, 2.493 max_d=2.493 avg_d=0.748 std_dev=0.746

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.11	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01	0.21	0.22	0.34	0.12
C2	0.04	0.00	0.06	0.04	0.01	0.08	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.04	0.06	0.20	0.15	0.39	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.07	0.02	0.07	0.07	0.06	0.05	0.07	0.08	0.07	0.00	0.00	0.00	0.16	0.13	0.39	0.12
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.17	0.10	0.36	0.09
C4	0.03	0.01	0.07	0.05	0.00	0.12	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.07	0.20	0.13	0.34	0.10
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.12	0.00	0.13	0.01	0.12	0.09	0.10	0.13	0.07	0.09	0.03	0.01	0.03	0.14	0.28	0.08
C5	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.13	0.00	0.38	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.05	0.20	0.15	0.30	0.10
C5'	0.11	0.28	0.07	0.02	0.36	0.01	0.38	0.00	0.34	0.27	0.33	0.37	0.23	0.05	0.12	0.05	0.01	0.21	0.17	0.04
C6	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.12	0.00	0.34	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.06	0.23	0.19	0.32	0.12
N1	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.09	0.01	0.27	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.21	0.18	0.36	0.12
N3	0.04	0.00	0.07	0.05	0.00	0.10	0.01	0.33	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.06	0.20	0.14	0.38	0.11
N4	0.04	0.01	0.08	0.05	0.01	0.13	0.01	0.37	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.07	0.19	0.11	0.32	0.09
O2	0.06	0.00	0.07	0.05	0.01	0.07	0.01	0.23	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.11	0.05	0.07	0.20	0.15	0.41	0.13
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.08	0.09	0.06	0.05	0.04	0.05	0.09	0.09	0.11	0.00	0.06	0.04	0.14	0.15	0.36	0.10
O3'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.03	0.06	0.12	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.06	0.00	0.03	0.22	0.10	0.30	0.08
O4'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.07	0.07	0.04	0.03	0.00	0.22	0.26	0.29	0.13
O5'	0.21	0.20	0.16	0.17	0.20	0.03	0.20	0.01	0.23	0.21	0.20	0.19	0.20	0.14	0.22	0.22	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.22	0.15	0.13	0.10	0.13	0.14	0.15	0.21	0.19	0.18	0.14	0.11	0.15	0.15	0.10	0.26	0.03	0.00	0.03	0.00
OP2	0.34	0.39	0.39	0.36	0.34	0.28	0.30	0.17	0.32	0.36	0.38	0.32	0.41	0.36	0.30	0.29	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.12	0.12	0.12	0.09	0.10	0.08	0.10	0.04	0.12	0.12	0.11	0.09	0.13	0.10	0.08	0.13	0.01	0.00	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.08	0.07	0.07	0.09	0.09	0.06	0.12	0.05	0.06	0.10	0.12	0.09	0.07	0.10	0.09	0.11	0.25	0.10	0.11
C2	0.06	0.09	0.08	0.07	0.11	0.09	0.08	0.10	0.05	0.05	0.12	0.10	0.12	0.09	0.13	0.09	0.11	0.17	0.14	0.11
C2'	0.10	0.11	0.10	0.09	0.12	0.10	0.10	0.11	0.09	0.09	0.13	0.15	0.12	0.10	0.13	0.12	0.13	0.33	0.13	0.14
C3'	0.08	0.12	0.07	0.07	0.11	0.09	0.08	0.10	0.08	0.08	0.13	0.16	0.10	0.07	0.12	0.10	0.13	0.38	0.18	0.18
C4	0.05	0.09	0.07	0.06	0.12	0.09	0.10	0.11	0.07	0.06	0.12	0.09	0.12	0.09	0.14	0.10	0.16	0.14	0.24	0.19
C4'	0.16	0.14	0.15	0.15	0.15	0.18	0.16	0.19	0.17	0.15	0.14	0.15	0.13	0.14	0.15	0.19	0.22	0.44	0.26	0.27
C5	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.08	0.06	0.10	0.05	0.05	0.08	0.08	0.11	0.09	0.09	0.09	0.13	0.14	0.18	0.15
C5'	0.35	0.36	0.30	0.26	0.36	0.31	0.36	0.26	0.35	0.36	0.36	0.37	0.27	0.26	0.36	0.36	0.31	0.47	0.36	0.35
C6	0.06	0.06	0.07	0.07	0.07	0.09	0.05	0.10	0.05	0.05	0.08	0.09	0.10	0.09	0.08	0.08	0.10	0.18	0.11	0.10
N1	0.05	0.07	0.07	0.07	0.09	0.09	0.06	0.11	0.05	0.05	0.10	0.10	0.10	0.08	0.10	0.08	0.10	0.20	0.11	0.10
N3	0.06	0.10	0.08	0.07	0.14	0.08	0.10	0.10	0.07	0.07	0.14	0.10	0.12	0.09	0.16	0.10	0.14	0.14	0.21	0.17
N4	0.06	0.10	0.07	0.06	0.15	0.09	0.13	0.13	0.10	0.08	0.14	0.08	0.14	0.09	0.17	0.11	0.20	0.18	0.32	0.26
O2	0.06	0.10	0.08	0.08	0.12	0.09	0.08	0.11	0.06	0.06	0.13	0.11	0.12	0.10	0.15	0.09	0.11	0.19	0.13	0.10
O2'	0.08	0.11	0.09	0.08	0.11	0.10	0.08	0.13	0.08	0.08	0.13	0.15	0.11	0.08	0.12	0.10	0.13	0.35	0.13	0.15
O3'	0.11	0.17	0.10	0.08	0.15	0.09	0.11	0.10	0.10	0.12	0.17	0.21	0.15	0.08	0.16	0.11	0.12	0.43	0.22	0.21
O4'	0.08	0.08	0.08	0.09	0.08	0.11	0.07	0.14	0.08	0.08	0.09	0.12	0.08	0.08	0.08	0.11	0.13	0.30	0.13	0.15
O5'	0.10	0.13	0.05	0.09	0.10	0.19	0.10	0.24	0.10	0.10	0.13	0.19	0.10	0.04	0.10	0.16	0.26	0.53	0.33	0.35
OP1	0.04	0.06	0.09	0.05	0.09	0.12	0.11	0.14	0.09	0.06	0.06	0.10	0.14	0.02	0.10	0.11	0.16	0.42	0.36	0.29
OP2	0.06	0.12	0.06	0.07	0.11	0.04	0.09	0.11	0.08	0.08	0.12	0.16	0.06	0.03	0.12	0.05	0.12	0.35	0.26	0.21
P	0.03	0.06	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.05	0.05	0.04	0.06	0.10	0.02	0.01	0.06	0.04	0.13	0.38	0.26	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.11	0.14	0.11
C2	0.03	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.05	0.17	0.18	0.28	0.22
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.05	0.06	0.04	0.05	0.05	0.00	0.02	0.07	0.01	0.08	0.19	0.14	0.13
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.10	0.25	0.17	0.16
C4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.06	0.01	0.05	0.16	0.23	0.34	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.10	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.06	0.01	0.05	0.14	0.23	0.33	0.24
C5'	0.05	0.10	0.05	0.01	0.10	0.01	0.09	0.00	0.09	0.09	0.09	0.13	0.04	0.01	0.10	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.05	0.01	0.05	0.14	0.19	0.28	0.21
N1	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.15	0.16	0.24	0.19
N3	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01	0.05	0.16	0.20	0.32	0.24
O2	0.06	0.00	0.05	0.06	0.01	0.09	0.02	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.10	0.19	0.19	0.26	0.22
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.10	0.01	0.10	0.04	0.08	0.04	0.08	0.06	0.00	0.02	0.11	0.01	0.10	0.25	0.22	0.18
O3'	0.04	0.06	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.05	0.06	0.09	0.02	0.00	0.06	0.04	0.09	0.28	0.18	0.15
O4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.06	0.00	0.05	0.16	0.25	0.36	0.26
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.05	0.10	0.01	0.04	0.05	0.00	0.11	0.09	0.20	0.16
O5'	0.09	0.17	0.08	0.10	0.16	0.01	0.14	0.00	0.14	0.15	0.16	0.19	0.10	0.09	0.16	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.18	0.19	0.25	0.23	0.10	0.23	0.06	0.19	0.16	0.20	0.19	0.25	0.28	0.25	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.28	0.14	0.17	0.34	0.03	0.33	0.01	0.28	0.24	0.32	0.26	0.22	0.18	0.36	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.22	0.13	0.16	0.25	0.02	0.24	0.01	0.21	0.19	0.24	0.22	0.18	0.15	0.26	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00