Doublet Group distance statistics: 54178

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.035 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.075, 0.226, 0.377, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.226 std_dev=0.151
C6	B	0, 0.121, 0.283, 0.445, 0.451 max_d=0.451 avg_d=0.283 std_dev=0.162
C1'	B	0, 0.127, 0.299, 0.471, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.299 std_dev=0.172
N1	B	0, 0.111, 0.284, 0.457, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.284 std_dev=0.173
O4'	A	0, 0.090, 0.267, 0.444, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.267 std_dev=0.177
O4'	B	0, 0.125, 0.307, 0.490, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.307 std_dev=0.183
C5	B	0, 0.123, 0.317, 0.511, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.317 std_dev=0.194
C2	B	0, 0.093, 0.304, 0.514, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.304 std_dev=0.211
C3'	A	0, 0.161, 0.375, 0.590, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.375 std_dev=0.215
C4	B	0, 0.097, 0.328, 0.560, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.328 std_dev=0.231
O2	B	0, 0.112, 0.346, 0.581, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.346 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.073, 0.312, 0.550, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.312 std_dev=0.239
O2'	A	0, 0.157, 0.397, 0.637, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.397 std_dev=0.240
C4'	B	0, 0.129, 0.382, 0.635, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.382 std_dev=0.253
O3'	B	0, 0.149, 0.407, 0.665, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.407 std_dev=0.258
C2'	B	0, 0.146, 0.406, 0.666, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.406 std_dev=0.260
O4	B	0, 0.127, 0.397, 0.668, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.397 std_dev=0.270
O3'	A	0, 0.104, 0.381, 0.659, 0.712 max_d=0.712 avg_d=0.381 std_dev=0.278
C4'	A	0, 0.150, 0.432, 0.714, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.432 std_dev=0.282
C3'	B	0, 0.136, 0.430, 0.723, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.430 std_dev=0.293
O2'	B	0, 0.188, 0.491, 0.795, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.491 std_dev=0.304
O5'	B	0, 0.240, 0.564, 0.888, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.564 std_dev=0.324
P	A	0, 0.269, 0.646, 1.022, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.646 std_dev=0.377
C5'	B	0, 0.177, 0.569, 0.961, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.569 std_dev=0.392
OP1	A	0, 0.320, 0.764, 1.209, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.764 std_dev=0.445
OP2	A	0, 0.280, 0.733, 1.185, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.733 std_dev=0.452
P	B	0, 0.307, 0.760, 1.213, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.760 std_dev=0.453
OP2	B	0, 0.320, 0.782, 1.243, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.782 std_dev=0.462
C5'	A	0, 0.303, 0.778, 1.252, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.778 std_dev=0.475
OP1	B	0, 0.348, 0.933, 1.517, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.933 std_dev=0.584
O5'	A	0, 0.324, 0.940, 1.556, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.940 std_dev=0.616

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.42	0.27	0.39	0.23
C2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.11	0.07	0.41	0.27	0.29	0.18
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.08	0.05	0.02	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.52	0.34	0.49	0.37
C3'	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.01	0.09	0.03	0.08	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.01	0.02	0.21	0.32	0.34	0.17
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.14	0.00	0.44	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.05	0.03	0.43	0.22	0.16	0.11
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.14	0.00	0.20	0.02	0.19	0.09	0.09	0.16	0.10	0.02	0.01	0.01	0.02	0.36	0.27	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.20	0.00	0.50	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.02	0.04	0.46	0.20	0.15	0.12
C5'	0.14	0.28	0.08	0.03	0.44	0.02	0.50	0.00	0.46	0.30	0.36	0.47	0.19	0.07	0.02	0.04	0.02	0.45	0.40	0.04
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.19	0.00	0.46	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.02	0.06	0.49	0.23	0.24	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.05	0.01	0.45	0.26	0.31	0.20
N3	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.09	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.09	0.06	0.41	0.25	0.22	0.14
N4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.16	0.01	0.47	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.18	0.05	0.04	0.41	0.21	0.11	0.09
O2	0.03	0.00	0.03	0.07	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.17	0.13	0.39	0.29	0.34	0.21
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.16	0.02	0.18	0.07	0.16	0.09	0.13	0.18	0.09	0.00	0.01	0.03	0.52	0.39	0.51	0.43
O3'	0.05	0.11	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.09	0.05	0.17	0.01	0.00	0.05	0.10	0.31	0.24	0.11
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.01	0.06	0.04	0.13	0.03	0.05	0.00	0.27	0.23	0.36	0.13
O5'	0.42	0.41	0.52	0.21	0.43	0.02	0.46	0.02	0.49	0.45	0.41	0.41	0.39	0.52	0.10	0.27	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.27	0.27	0.34	0.32	0.22	0.36	0.20	0.45	0.23	0.26	0.25	0.21	0.29	0.39	0.31	0.23	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.29	0.49	0.34	0.16	0.27	0.15	0.40	0.24	0.31	0.22	0.11	0.34	0.51	0.24	0.36	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.18	0.37	0.17	0.11	0.04	0.12	0.04	0.17	0.20	0.14	0.09	0.21	0.43	0.11	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.16	0.14	0.14	0.13	0.13	0.12	0.12	0.12	0.14	0.16	0.18	0.18	0.13	0.13	0.13	0.11	0.09	0.11	0.10
C2	0.17	0.20	0.16	0.14	0.19	0.14	0.17	0.13	0.16	0.17	0.21	0.22	0.21	0.13	0.19	0.15	0.13	0.12	0.14	0.14
C2'	0.11	0.12	0.12	0.13	0.10	0.12	0.10	0.12	0.11	0.11	0.11	0.13	0.15	0.12	0.09	0.11	0.13	0.07	0.12	0.11
C3'	0.18	0.19	0.14	0.12	0.18	0.16	0.17	0.17	0.17	0.18	0.19	0.19	0.16	0.12	0.17	0.17	0.14	0.22	0.16	0.18
C4	0.17	0.20	0.16	0.14	0.19	0.15	0.17	0.15	0.16	0.18	0.20	0.21	0.18	0.12	0.18	0.16	0.15	0.16	0.17	0.16
C4'	0.28	0.29	0.22	0.18	0.30	0.23	0.30	0.24	0.29	0.29	0.31	0.28	0.24	0.17	0.30	0.27	0.27	0.38	0.29	0.32
C5	0.16	0.16	0.15	0.16	0.14	0.17	0.13	0.17	0.13	0.15	0.16	0.18	0.17	0.13	0.13	0.16	0.14	0.15	0.15	0.15
C5'	0.58	0.60	0.50	0.44	0.60	0.50	0.60	0.48	0.59	0.59	0.61	0.58	0.51	0.43	0.60	0.57	0.54	0.61	0.55	0.57
C6	0.15	0.16	0.16	0.16	0.13	0.16	0.12	0.16	0.12	0.14	0.15	0.18	0.19	0.15	0.12	0.14	0.13	0.12	0.14	0.13
N1	0.15	0.17	0.15	0.14	0.15	0.14	0.13	0.13	0.13	0.15	0.17	0.19	0.19	0.13	0.15	0.14	0.12	0.11	0.13	0.12
N3	0.18	0.22	0.17	0.14	0.21	0.14	0.19	0.14	0.17	0.19	0.22	0.23	0.21	0.14	0.21	0.16	0.15	0.15	0.16	0.16
N4	0.17	0.21	0.16	0.14	0.21	0.15	0.20	0.16	0.19	0.19	0.22	0.22	0.17	0.13	0.20	0.17	0.17	0.18	0.19	0.19
O2	0.17	0.22	0.17	0.14	0.21	0.13	0.18	0.12	0.16	0.18	0.23	0.24	0.22	0.14	0.21	0.14	0.13	0.11	0.14	0.13
O2'	0.22	0.17	0.26	0.29	0.20	0.25	0.24	0.24	0.25	0.21	0.16	0.14	0.25	0.27	0.20	0.23	0.32	0.26	0.31	0.29
O3'	0.11	0.11	0.12	0.12	0.11	0.11	0.11	0.13	0.11	0.11	0.11	0.11	0.14	0.13	0.10	0.11	0.10	0.16	0.11	0.12
O4'	0.14	0.16	0.12	0.11	0.14	0.10	0.13	0.09	0.12	0.14	0.17	0.19	0.16	0.11	0.14	0.11	0.10	0.17	0.10	0.12
O5'	0.43	0.39	0.50	0.54	0.37	0.47	0.38	0.39	0.40	0.40	0.37	0.39	0.49	0.56	0.35	0.41	0.36	0.23	0.30	0.28
OP1	0.09	0.12	0.12	0.17	0.08	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.11	0.17	0.16	0.19	0.07	0.10	0.05	0.19	0.11	0.12
OP2	0.08	0.10	0.16	0.21	0.12	0.12	0.12	0.15	0.10	0.08	0.11	0.13	0.20	0.25	0.14	0.08	0.15	0.36	0.26	0.26
P	0.09	0.07	0.21	0.26	0.06	0.15	0.09	0.11	0.09	0.08	0.06	0.10	0.23	0.27	0.05	0.07	0.07	0.16	0.07	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.08	0.12	0.07
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.03	0.00	0.05	0.07	0.10	0.18	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.06	0.09	0.01	0.02	0.09	0.00	0.02	0.05	0.01	0.17	0.22	0.21	0.19
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.12	0.13	0.11	0.12
C4	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.08	0.16	0.26	0.14
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.08	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.05	0.02	0.02	0.08	0.17	0.26	0.15
C5'	0.04	0.07	0.06	0.02	0.12	0.01	0.12	0.00	0.10	0.07	0.09	0.06	0.05	0.02	0.13	0.02	0.01	0.12	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.03	0.08	0.13	0.20	0.12
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.10	0.16	0.09
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.00	0.04	0.08	0.13	0.22	0.12
O2	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.06	0.02	0.08	0.07	0.09	0.17	0.09
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.03	0.02	0.08	0.05	0.09	0.01	0.06	0.18	0.00	0.06	0.05	0.02	0.20	0.30	0.27	0.24
O3'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.06	0.06	0.00	0.03	0.02	0.10	0.10	0.10	0.09
O4	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.07	0.02	0.13	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.00	0.05	0.09	0.19	0.28	0.16
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.08	0.02	0.02	0.05	0.00	0.12	0.14	0.04	0.10
O5'	0.07	0.07	0.17	0.12	0.08	0.02	0.08	0.01	0.08	0.08	0.08	0.07	0.20	0.10	0.09	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.08	0.10	0.22	0.13	0.16	0.08	0.17	0.12	0.13	0.10	0.13	0.09	0.30	0.10	0.19	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.12	0.18	0.21	0.11	0.26	0.02	0.26	0.02	0.20	0.16	0.22	0.17	0.27	0.10	0.28	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.10	0.19	0.12	0.14	0.02	0.15	0.02	0.12	0.09	0.12	0.09	0.24	0.09	0.16	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00