Doublet Group distance statistics: 54180

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.017 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.015, 0.030, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.021, 0.045, 0.068, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.045 std_dev=0.023
O4'	A	0, 0.094, 0.177, 0.261, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.177 std_dev=0.084
C2'	A	0, 0.150, 0.270, 0.389, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.270 std_dev=0.119
C4'	A	0, 0.181, 0.316, 0.451, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.316 std_dev=0.135
C3'	A	0, 0.238, 0.420, 0.601, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.420 std_dev=0.182
O2'	A	0, 0.262, 0.460, 0.657, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.460 std_dev=0.198
C5'	A	0, 0.320, 0.566, 0.812, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.566 std_dev=0.246
O2'	B	0, 0.336, 0.605, 0.874, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.605 std_dev=0.269
O3'	A	0, 0.371, 0.651, 0.930, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.651 std_dev=0.279
O5'	A	0, 0.357, 0.638, 0.919, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.638 std_dev=0.281
P	A	0, 0.463, 0.812, 1.161, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.812 std_dev=0.349
OP2	A	0, 0.479, 0.829, 1.180, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.829 std_dev=0.350
OP1	A	0, 0.547, 0.961, 1.374, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.961 std_dev=0.413
C2'	B	0, 0.792, 1.372, 1.952, 1.868 max_d=1.868 avg_d=1.372 std_dev=0.580
O3'	B	0, 0.894, 1.524, 2.154, 1.955 max_d=1.955 avg_d=1.524 std_dev=0.630
C3'	B	0, 0.848, 1.488, 2.127, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.488 std_dev=0.640
C4'	B	0, 0.994, 1.728, 2.462, 2.394 max_d=2.394 avg_d=1.728 std_dev=0.734
C1'	B	0, 1.114, 1.893, 2.672, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.893 std_dev=0.779
O4'	B	0, 1.195, 2.064, 2.933, 2.814 max_d=2.814 avg_d=2.064 std_dev=0.869
N1	B	0, 1.932, 3.268, 4.604, 3.920 max_d=3.920 avg_d=3.268 std_dev=1.336
C5'	B	0, 1.904, 3.255, 4.605, 4.223 max_d=4.223 avg_d=3.255 std_dev=1.351
O2	B	0, 2.167, 3.667, 5.167, 4.421 max_d=4.421 avg_d=3.667 std_dev=1.500
C2	B	0, 2.230, 3.771, 5.312, 4.516 max_d=4.516 avg_d=3.771 std_dev=1.541
O5'	B	0, 2.424, 4.124, 5.825, 5.250 max_d=5.250 avg_d=4.124 std_dev=1.700
OP2	B	0, 2.569, 4.379, 6.189, 5.562 max_d=5.562 avg_d=4.379 std_dev=1.810
C6	B	0, 2.681, 4.536, 6.391, 5.465 max_d=5.465 avg_d=4.536 std_dev=1.855
N3	B	0, 2.990, 5.055, 7.120, 5.990 max_d=5.990 avg_d=5.055 std_dev=2.065
P	B	0, 2.999, 5.096, 7.194, 6.438 max_d=6.438 avg_d=5.096 std_dev=2.098
C5	B	0, 3.424, 5.789, 8.154, 6.943 max_d=6.943 avg_d=5.789 std_dev=2.365
C4	B	0, 3.533, 5.972, 8.412, 7.138 max_d=7.138 avg_d=5.972 std_dev=2.440
OP1	B	0, 3.530, 5.989, 8.447, 7.505 max_d=7.505 avg_d=5.989 std_dev=2.458
O4	B	0, 4.231, 7.154, 10.076, 8.555 max_d=8.555 avg_d=7.154 std_dev=2.923

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.05	0.04
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.06	0.07	0.07	0.05
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.06	0.04
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.06	0.05
C4	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.08	0.08	0.07
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.02
C5	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.08	0.08	0.07
C5'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.07	0.06
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.07	0.06	0.05
N3	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.07	0.08	0.06
N4	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.08	0.09	0.08
O2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.06	0.07	0.07	0.05
O2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.05	0.04
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.08	0.06
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.05	0.04
O5'	0.05	0.06	0.04	0.04	0.07	0.02	0.08	0.01	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.04	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.07	0.08	0.09	0.08	0.06	0.08	0.05	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.08	0.11	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.07	0.06	0.06	0.08	0.02	0.08	0.01	0.07	0.06	0.08	0.09	0.07	0.05	0.08	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.05	0.04	0.05	0.07	0.02	0.07	0.01	0.06	0.05	0.06	0.08	0.05	0.04	0.06	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.21	0.05	0.07	0.11	0.06	0.10	0.05	0.12	0.08	0.21	0.34	0.03	0.08	0.12	0.05	0.09	0.16	0.15	0.08
C2	0.11	0.33	0.07	0.05	0.30	0.05	0.18	0.06	0.13	0.18	0.38	0.42	0.04	0.11	0.34	0.09	0.18	0.26	0.11	0.14
C2'	0.04	0.14	0.05	0.07	0.07	0.06	0.16	0.05	0.16	0.07	0.14	0.26	0.06	0.08	0.06	0.07	0.09	0.17	0.14	0.09
C3'	0.10	0.08	0.09	0.09	0.16	0.09	0.27	0.09	0.26	0.13	0.08	0.17	0.10	0.08	0.15	0.13	0.06	0.11	0.16	0.07
C4	0.15	0.39	0.11	0.06	0.37	0.07	0.26	0.10	0.20	0.24	0.44	0.46	0.07	0.14	0.42	0.13	0.21	0.28	0.11	0.17
C4'	0.10	0.08	0.11	0.11	0.16	0.12	0.29	0.12	0.28	0.13	0.07	0.20	0.09	0.07	0.15	0.15	0.05	0.07	0.19	0.08
C5	0.10	0.30	0.07	0.06	0.23	0.05	0.13	0.06	0.10	0.16	0.31	0.40	0.04	0.11	0.25	0.07	0.15	0.21	0.12	0.12
C5'	0.14	0.07	0.14	0.14	0.24	0.15	0.37	0.17	0.35	0.19	0.10	0.13	0.12	0.08	0.24	0.20	0.10	0.07	0.23	0.13
C6	0.06	0.24	0.05	0.06	0.15	0.05	0.08	0.04	0.09	0.11	0.24	0.35	0.03	0.09	0.16	0.04	0.11	0.17	0.13	0.08
N1	0.07	0.26	0.05	0.06	0.18	0.05	0.09	0.04	0.08	0.12	0.28	0.37	0.02	0.09	0.21	0.05	0.13	0.20	0.13	0.10
N3	0.15	0.39	0.10	0.06	0.39	0.07	0.27	0.09	0.20	0.24	0.46	0.46	0.06	0.13	0.45	0.13	0.22	0.30	0.11	0.18
N4	0.20	0.46	0.14	0.08	0.49	0.10	0.37	0.14	0.30	0.32	0.54	0.51	0.10	0.16	0.54	0.18	0.26	0.33	0.12	0.21
O2	0.11	0.34	0.07	0.05	0.32	0.05	0.19	0.06	0.13	0.19	0.39	0.42	0.03	0.11	0.37	0.09	0.18	0.27	0.11	0.15
O2'	0.05	0.15	0.06	0.08	0.08	0.07	0.17	0.06	0.18	0.08	0.14	0.27	0.06	0.08	0.07	0.08	0.08	0.16	0.14	0.08
O3'	0.14	0.10	0.12	0.10	0.26	0.11	0.37	0.12	0.34	0.19	0.14	0.12	0.14	0.09	0.26	0.17	0.07	0.10	0.18	0.09
O4'	0.05	0.17	0.06	0.08	0.07	0.08	0.16	0.09	0.17	0.07	0.16	0.31	0.05	0.07	0.06	0.08	0.06	0.11	0.18	0.08
O5'	0.15	0.09	0.15	0.13	0.24	0.15	0.36	0.14	0.35	0.20	0.12	0.11	0.13	0.09	0.24	0.20	0.08	0.07	0.21	0.11
OP1	0.26	0.22	0.23	0.18	0.45	0.23	0.57	0.26	0.53	0.34	0.30	0.08	0.19	0.09	0.47	0.32	0.23	0.21	0.30	0.24
OP2	0.19	0.14	0.18	0.14	0.28	0.16	0.37	0.14	0.37	0.24	0.18	0.05	0.18	0.09	0.28	0.23	0.09	0.08	0.21	0.11
P	0.19	0.13	0.19	0.16	0.31	0.18	0.43	0.19	0.41	0.25	0.18	0.05	0.16	0.09	0.31	0.24	0.15	0.13	0.26	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.01	0.09	0.11	0.17	0.10
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.10	0.14	0.15	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.09	0.08	0.02	0.04	0.09	0.00	0.02	0.05	0.03	0.10	0.12	0.18	0.12
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.18	0.07
C4	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.22	0.34	0.30	0.28
C4'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.19	0.09
C5	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.06	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.30	0.45	0.39	0.38
C5'	0.05	0.08	0.09	0.01	0.19	0.01	0.24	0.00	0.23	0.13	0.12	0.03	0.05	0.09	0.19	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.07	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.01	0.05	0.29	0.40	0.37	0.35
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.00	0.01	0.16	0.21	0.23	0.20
N3	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.14	0.21	0.20	0.18
O2	0.01	0.00	0.09	0.05	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.05	0.00	0.07	0.06	0.07	0.11	0.04
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.03	0.10	0.05	0.10	0.02	0.05	0.15	0.00	0.01	0.07	0.02	0.08	0.10	0.13	0.07
O3'	0.08	0.06	0.02	0.00	0.08	0.02	0.09	0.09	0.09	0.07	0.06	0.05	0.01	0.00	0.08	0.07	0.07	0.09	0.19	0.09
O4	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.23	0.36	0.31	0.30
O4'	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.07	0.02	0.07	0.03	0.00	0.03	0.08	0.23	0.10
O5'	0.09	0.10	0.10	0.04	0.22	0.01	0.30	0.00	0.29	0.16	0.14	0.06	0.08	0.07	0.23	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.14	0.12	0.05	0.34	0.07	0.45	0.01	0.40	0.21	0.21	0.07	0.10	0.09	0.36	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.15	0.18	0.18	0.30	0.19	0.39	0.03	0.37	0.23	0.20	0.11	0.13	0.19	0.31	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.12	0.07	0.28	0.09	0.38	0.01	0.35	0.20	0.18	0.04	0.07	0.09	0.30	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00