Doublet Group distance statistics: 54181

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, -0.003, 0.006, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.006 std_dev=0.009
C4	A	0, -0.001, 0.009, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.010
N3	A	0, -0.002, 0.008, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.008 std_dev=0.010
C6	A	0, -0.003, 0.011, 0.025, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.003, 0.013, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.016
N1	A	0, -0.005, 0.012, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.012 std_dev=0.017
C1'	A	0, -0.003, 0.014, 0.031, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.017
O2	A	0, -0.004, 0.026, 0.056, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.026 std_dev=0.030
N4	A	0, -0.004, 0.030, 0.064, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.030 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.035, 0.113, 0.191, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.113 std_dev=0.078
C2'	A	0, 0.043, 0.138, 0.233, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.138 std_dev=0.095
O2'	A	0, 0.080, 0.213, 0.345, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.213 std_dev=0.132
C3'	A	0, 0.000, 0.174, 0.347, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.174 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.034, 0.212, 0.389, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.212 std_dev=0.178
O3'	A	0, -0.064, 0.159, 0.382, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.159 std_dev=0.223
C3'	B	0, 0.208, 0.438, 0.668, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.438 std_dev=0.230
O3'	B	0, 0.217, 0.470, 0.723, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.470 std_dev=0.253
P	A	0, 0.201, 0.486, 0.770, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.486 std_dev=0.285
C2'	B	0, 0.198, 0.500, 0.803, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.500 std_dev=0.302
C5'	A	0, 0.056, 0.368, 0.681, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.368 std_dev=0.313
C4'	B	0, 0.205, 0.525, 0.845, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.525 std_dev=0.320
O5'	A	0, 0.132, 0.458, 0.785, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.458 std_dev=0.326
O4	B	0, 0.206, 0.543, 0.880, 1.161 max_d=1.161 avg_d=0.543 std_dev=0.337
C4	B	0, 0.186, 0.532, 0.877, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.532 std_dev=0.346
N3	B	0, 0.157, 0.509, 0.861, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.509 std_dev=0.352
C5	B	0, 0.196, 0.558, 0.920, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.558 std_dev=0.362
O2	B	0, 0.168, 0.533, 0.898, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.533 std_dev=0.365
C2	B	0, 0.156, 0.520, 0.885, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.520 std_dev=0.365
O2'	B	0, 0.172, 0.554, 0.936, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.554 std_dev=0.382
N1	B	0, 0.157, 0.541, 0.925, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.541 std_dev=0.384
C6	B	0, 0.171, 0.559, 0.947, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.559 std_dev=0.388
C1'	B	0, 0.161, 0.562, 0.963, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.562 std_dev=0.401
O4'	B	0, 0.178, 0.591, 1.004, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.591 std_dev=0.413
OP2	B	0, 0.221, 0.653, 1.085, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.653 std_dev=0.432
C5'	B	0, 0.155, 0.589, 1.022, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.589 std_dev=0.434
P	B	0, 0.205, 0.686, 1.167, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.686 std_dev=0.481
OP1	B	0, 0.197, 0.680, 1.164, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.680 std_dev=0.484
OP1	A	0, 0.143, 0.633, 1.123, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.633 std_dev=0.490
OP2	A	0, 0.086, 0.637, 1.188, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.637 std_dev=0.551
O5'	B	0, 0.052, 0.711, 1.370, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.711 std_dev=0.659

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.11	0.25	0.17	0.04
C2	0.03	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.18	0.28	0.08	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.07	0.08	0.02	0.05	0.03	0.13	0.00	0.01	0.01	0.22	0.44	0.19	0.13
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.04	0.04	0.13	0.01	0.00	0.00	0.13	0.40	0.30	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.07	0.00	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.28	0.30	0.33	0.21
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.10	0.03	0.02	0.07	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.27	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.11	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.03	0.30	0.28	0.36	0.22
C5'	0.05	0.09	0.07	0.01	0.22	0.00	0.27	0.00	0.23	0.13	0.15	0.25	0.02	0.06	0.03	0.01	0.01	0.05	0.20	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.25	0.25	0.22	0.16
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.25	0.08	0.09
N3	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.24	0.30	0.20	0.16
N4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.07	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.31	0.32	0.42	0.26
O2	0.05	0.00	0.13	0.13	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.14	0.03	0.12	0.26	0.11	0.06
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	0.06	0.01	0.08	0.04	0.18	0.00	0.01	0.00	0.24	0.53	0.15	0.17
O3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.04	0.10	0.40	0.30	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.06	0.07	0.26	0.11
O5'	0.11	0.18	0.22	0.13	0.28	0.01	0.30	0.01	0.25	0.18	0.24	0.31	0.12	0.24	0.10	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.25	0.28	0.44	0.40	0.30	0.18	0.28	0.05	0.25	0.25	0.30	0.32	0.26	0.53	0.40	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.08	0.19	0.30	0.33	0.27	0.36	0.20	0.22	0.08	0.20	0.42	0.11	0.15	0.30	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.13	0.08	0.21	0.02	0.22	0.01	0.16	0.09	0.16	0.26	0.06	0.17	0.07	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.23	0.21	0.10	0.27	0.12	0.36	0.11	0.38	0.32	0.21	0.17	0.26	0.18	0.23	0.24	0.58	0.50	0.21	0.39
C2	0.21	0.12	0.14	0.10	0.24	0.10	0.36	0.13	0.35	0.24	0.11	0.13	0.16	0.16	0.19	0.16	0.67	0.55	0.30	0.47
C2'	0.34	0.22	0.27	0.11	0.23	0.14	0.34	0.11	0.38	0.32	0.17	0.17	0.35	0.11	0.17	0.25	0.59	0.53	0.22	0.41
C3'	0.40	0.27	0.31	0.14	0.26	0.19	0.36	0.11	0.40	0.36	0.21	0.22	0.41	0.13	0.19	0.31	0.59	0.54	0.22	0.41
C4	0.13	0.10	0.13	0.10	0.07	0.10	0.26	0.16	0.29	0.12	0.10	0.23	0.14	0.13	0.06	0.08	0.60	0.52	0.19	0.40
C4'	0.46	0.34	0.35	0.18	0.32	0.25	0.41	0.15	0.46	0.43	0.28	0.28	0.45	0.15	0.26	0.39	0.60	0.56	0.21	0.42
C5	0.20	0.05	0.19	0.10	0.12	0.09	0.28	0.16	0.32	0.19	0.03	0.17	0.20	0.16	0.09	0.11	0.48	0.45	0.08	0.30
C5'	0.63	0.45	0.53	0.34	0.43	0.42	0.55	0.30	0.62	0.58	0.38	0.38	0.64	0.23	0.36	0.55	0.70	0.71	0.33	0.54
C6	0.27	0.13	0.22	0.10	0.21	0.10	0.34	0.14	0.37	0.27	0.10	0.12	0.25	0.19	0.16	0.18	0.49	0.46	0.11	0.32
N1	0.27	0.17	0.18	0.10	0.25	0.10	0.36	0.12	0.38	0.29	0.15	0.13	0.22	0.18	0.21	0.19	0.58	0.50	0.20	0.39
N3	0.15	0.07	0.12	0.10	0.13	0.10	0.32	0.14	0.31	0.16	0.06	0.19	0.13	0.14	0.10	0.11	0.69	0.56	0.31	0.49
N4	0.07	0.20	0.11	0.11	0.09	0.13	0.15	0.20	0.18	0.06	0.21	0.29	0.11	0.12	0.12	0.09	0.61	0.53	0.18	0.41
O2	0.21	0.14	0.13	0.10	0.27	0.10	0.37	0.12	0.34	0.24	0.15	0.11	0.15	0.16	0.25	0.17	0.72	0.57	0.37	0.52
O2'	0.25	0.15	0.20	0.08	0.15	0.09	0.25	0.15	0.29	0.23	0.12	0.15	0.28	0.12	0.10	0.16	0.57	0.49	0.22	0.39
O3'	0.35	0.24	0.25	0.12	0.22	0.16	0.31	0.10	0.35	0.32	0.19	0.21	0.35	0.14	0.17	0.28	0.60	0.51	0.21	0.40
O4'	0.41	0.34	0.27	0.12	0.35	0.18	0.43	0.11	0.45	0.41	0.31	0.27	0.34	0.19	0.31	0.33	0.57	0.50	0.19	0.38
O5'	0.52	0.36	0.44	0.26	0.43	0.30	0.55	0.19	0.59	0.51	0.33	0.23	0.50	0.13	0.38	0.43	0.61	0.67	0.30	0.48
OP1	0.43	0.34	0.35	0.16	0.46	0.17	0.56	0.06	0.56	0.45	0.35	0.21	0.39	0.06	0.44	0.31	0.44	0.56	0.23	0.37
OP2	0.64	0.34	0.64	0.49	0.38	0.49	0.59	0.35	0.67	0.56	0.27	0.20	0.73	0.43	0.29	0.56	0.80	0.93	0.49	0.70
P	0.47	0.29	0.43	0.23	0.35	0.25	0.49	0.11	0.53	0.44	0.25	0.17	0.52	0.12	0.29	0.37	0.51	0.62	0.23	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.21	0.07	0.39	0.10
C2	0.01	0.00	0.14	0.18	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.21	0.00	0.02	0.41	0.17	0.17	0.12
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.10	0.24	0.00	0.01	0.03	0.00	0.23	0.21	0.28	0.01
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.12	0.03	0.15	0.28	0.01	0.01	0.05	0.01	0.27	0.34	0.21	0.11
C4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.02	0.63	0.31	0.15	0.34
C4'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.11	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.12	0.43	0.13
C5	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.02	0.68	0.32	0.14	0.35
C5'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.08	0.00	0.08	0.00	0.09	0.05	0.10	0.13	0.02	0.03	0.08	0.01	0.01	0.24	0.38	0.02
C6	0.00	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.03	0.61	0.24	0.12	0.22
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.42	0.16	0.23	0.09
N3	0.01	0.00	0.10	0.15	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.19	0.00	0.02	0.52	0.24	0.08	0.23
O2	0.01	0.00	0.24	0.28	0.01	0.11	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.33	0.01	0.03	0.30	0.13	0.23	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.05	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.39	0.16
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.12	0.03	0.19	0.33	0.01	0.00	0.08	0.01	0.16	0.40	0.19	0.12
O4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.02	0.66	0.35	0.25	0.40
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.52	0.21
O5'	0.21	0.41	0.23	0.27	0.63	0.01	0.68	0.01	0.61	0.42	0.52	0.30	0.02	0.16	0.66	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.17	0.21	0.34	0.31	0.12	0.32	0.24	0.24	0.16	0.24	0.13	0.07	0.40	0.35	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.17	0.28	0.21	0.15	0.43	0.14	0.38	0.12	0.23	0.08	0.23	0.39	0.19	0.25	0.52	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.01	0.11	0.34	0.13	0.35	0.02	0.22	0.09	0.23	0.06	0.16	0.12	0.40	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00