Doublet Group distance statistics: 54184

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.031, 0.051, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.031 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.018, 0.050, 0.082, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.050 std_dev=0.032
N4	A	0, 0.011, 0.051, 0.090, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.051 std_dev=0.040
O2'	A	0, 0.058, 0.177, 0.297, 0.305 max_d=0.305 avg_d=0.177 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.059, 0.181, 0.304, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.181 std_dev=0.122
O4'	A	0, 0.089, 0.247, 0.405, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.247 std_dev=0.158
N3	B	0, 0.168, 0.399, 0.630, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.399 std_dev=0.231
C4	B	0, 0.171, 0.417, 0.664, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.417 std_dev=0.247
C3'	A	0, 0.147, 0.401, 0.654, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.401 std_dev=0.254
C2'	B	0, 0.152, 0.409, 0.666, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.409 std_dev=0.257
C2	B	0, 0.174, 0.431, 0.689, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.431 std_dev=0.258
O4	B	0, 0.161, 0.422, 0.683, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.422 std_dev=0.261
C3'	B	0, 0.150, 0.413, 0.675, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.413 std_dev=0.262
O2	B	0, 0.203, 0.485, 0.768, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.485 std_dev=0.282
C5	B	0, 0.190, 0.476, 0.762, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.476 std_dev=0.286
C4'	A	0, 0.154, 0.448, 0.741, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.448 std_dev=0.294
N1	B	0, 0.161, 0.461, 0.762, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.461 std_dev=0.301
C6	B	0, 0.181, 0.491, 0.802, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.491 std_dev=0.311
C1'	B	0, 0.177, 0.517, 0.857, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.517 std_dev=0.340
C4'	B	0, 0.242, 0.590, 0.938, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.590 std_dev=0.348
O3'	A	0, 0.235, 0.600, 0.965, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.600 std_dev=0.365
O4'	B	0, 0.207, 0.584, 0.962, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.584 std_dev=0.377
C5'	B	0, 0.281, 0.672, 1.062, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.672 std_dev=0.390
O3'	B	0, 0.265, 0.655, 1.046, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.655 std_dev=0.391
O5'	B	0, 0.249, 0.670, 1.092, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.670 std_dev=0.421
O2'	B	0, 0.252, 0.727, 1.202, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.727 std_dev=0.475
C5'	A	0, 0.250, 0.775, 1.300, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.775 std_dev=0.525
P	A	0, 0.194, 0.757, 1.319, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.757 std_dev=0.562
O5'	A	0, 0.340, 0.974, 1.608, 1.761 max_d=1.761 avg_d=0.974 std_dev=0.634
OP2	A	0, 0.414, 1.058, 1.702, 1.742 max_d=1.742 avg_d=1.058 std_dev=0.644
OP1	A	0, 0.244, 0.888, 1.533, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.888 std_dev=0.645
P	B	0, 0.285, 1.025, 1.764, 2.060 max_d=2.060 avg_d=1.025 std_dev=0.739
OP2	B	0, 0.211, 1.325, 2.439, 3.084 max_d=3.084 avg_d=1.325 std_dev=1.114
OP1	B	0, 0.913, 2.394, 3.876, 3.771 max_d=3.771 avg_d=2.394 std_dev=1.481

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.27	0.22	0.27	0.12
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.27	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.05	0.04	0.30	0.09	0.30	0.13
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.05	0.03	0.03	0.03	0.04	0.00	0.01	0.04	0.13	0.11	0.35	0.14
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.05	0.03	0.01	0.01	0.06	0.07	0.36	0.15
C4	0.03	0.01	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.39	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.06	0.06	0.31	0.09	0.25	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.10	0.05	0.07	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.15	0.24	0.07
C5	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.12	0.00	0.41	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.06	0.32	0.08	0.18	0.10
C5'	0.12	0.27	0.05	0.01	0.39	0.00	0.41	0.00	0.37	0.27	0.34	0.41	0.20	0.03	0.12	0.05	0.02	0.21	0.17	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.10	0.00	0.37	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.06	0.35	0.10	0.18	0.10
N1	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.04	0.31	0.13	0.25	0.11
N3	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.34	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.05	0.31	0.07	0.30	0.14
N4	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.11	0.00	0.41	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.06	0.30	0.14	0.27	0.15
O2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.06	0.05	0.28	0.11	0.33	0.13
O2'	0.02	0.08	0.00	0.03	0.07	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.08	0.07	0.11	0.00	0.07	0.11	0.01	0.08	0.37	0.14
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.12	0.04	0.03	0.06	0.06	0.06	0.07	0.00	0.04	0.14	0.03	0.37	0.16
O4'	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.05	0.06	0.04	0.05	0.06	0.05	0.11	0.04	0.00	0.30	0.35	0.24	0.19
O5'	0.27	0.30	0.13	0.06	0.31	0.01	0.32	0.02	0.35	0.31	0.31	0.30	0.28	0.01	0.14	0.30	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.09	0.11	0.07	0.09	0.15	0.08	0.21	0.10	0.13	0.07	0.14	0.11	0.08	0.03	0.35	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.30	0.35	0.36	0.25	0.24	0.18	0.17	0.18	0.25	0.30	0.27	0.33	0.37	0.37	0.24	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.13	0.14	0.15	0.13	0.07	0.10	0.01	0.10	0.11	0.14	0.15	0.13	0.14	0.16	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.11	0.21	0.13	0.56	0.10	0.70	0.11	0.09	0.17	0.22	0.47	0.16	0.16	0.46	0.51	0.64	0.43	0.60
C2	0.24	0.12	0.12	0.30	0.13	0.63	0.14	0.70	0.18	0.16	0.14	0.13	0.40	0.25	0.16	0.56	0.51	0.58	0.43	0.59
C2'	0.14	0.16	0.14	0.23	0.15	0.53	0.08	0.63	0.10	0.09	0.19	0.23	0.46	0.25	0.18	0.43	0.42	0.54	0.30	0.47
C3'	0.13	0.12	0.11	0.23	0.09	0.50	0.03	0.58	0.08	0.05	0.14	0.20	0.40	0.26	0.12	0.39	0.40	0.53	0.30	0.44
C4	0.30	0.12	0.15	0.33	0.13	0.62	0.15	0.65	0.21	0.20	0.13	0.11	0.35	0.26	0.15	0.60	0.49	0.53	0.43	0.55
C4'	0.15	0.08	0.16	0.27	0.06	0.54	0.12	0.70	0.15	0.10	0.10	0.18	0.39	0.24	0.07	0.40	0.55	0.73	0.48	0.62
C5	0.24	0.11	0.13	0.31	0.12	0.64	0.12	0.67	0.17	0.14	0.15	0.20	0.42	0.23	0.14	0.59	0.50	0.54	0.43	0.56
C5'	0.37	0.29	0.32	0.41	0.32	0.64	0.37	0.77	0.39	0.35	0.29	0.27	0.35	0.37	0.31	0.54	0.66	0.80	0.61	0.71
C6	0.17	0.13	0.11	0.26	0.12	0.62	0.10	0.69	0.13	0.10	0.16	0.23	0.47	0.20	0.14	0.53	0.51	0.58	0.43	0.58
N1	0.18	0.12	0.11	0.26	0.12	0.61	0.11	0.70	0.14	0.11	0.15	0.19	0.45	0.21	0.15	0.52	0.51	0.60	0.43	0.59
N3	0.29	0.13	0.14	0.32	0.14	0.63	0.16	0.67	0.20	0.20	0.14	0.12	0.35	0.27	0.16	0.59	0.50	0.55	0.43	0.57
N4	0.34	0.17	0.19	0.34	0.14	0.58	0.18	0.59	0.23	0.25	0.13	0.14	0.30	0.27	0.15	0.59	0.45	0.50	0.42	0.52
O2	0.24	0.12	0.11	0.29	0.14	0.62	0.14	0.70	0.18	0.17	0.14	0.13	0.39	0.25	0.16	0.56	0.51	0.59	0.43	0.59
O2'	0.14	0.15	0.13	0.25	0.14	0.56	0.07	0.68	0.10	0.08	0.19	0.24	0.45	0.25	0.18	0.44	0.48	0.65	0.37	0.55
O3'	0.10	0.16	0.09	0.18	0.14	0.44	0.04	0.51	0.05	0.06	0.20	0.25	0.38	0.25	0.18	0.34	0.34	0.51	0.27	0.38
O4'	0.07	0.21	0.13	0.12	0.17	0.48	0.11	0.67	0.09	0.11	0.23	0.31	0.50	0.08	0.19	0.35	0.49	0.68	0.44	0.60
O5'	0.26	0.39	0.19	0.10	0.30	0.40	0.21	0.52	0.20	0.28	0.38	0.51	0.47	0.05	0.31	0.33	0.37	0.59	0.32	0.44
OP1	0.08	0.06	0.22	0.21	0.17	0.18	0.25	0.37	0.24	0.12	0.09	0.13	0.15	0.02	0.18	0.11	0.50	0.70	0.64	0.60
OP2	0.14	0.20	0.27	0.22	0.24	0.12	0.23	0.17	0.20	0.19	0.22	0.20	0.28	0.03	0.25	0.11	0.31	0.53	0.53	0.41
P	0.07	0.15	0.08	0.03	0.08	0.11	0.03	0.18	0.01	0.08	0.13	0.23	0.18	0.00	0.08	0.09	0.19	0.39	0.28	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.12	0.04	0.03
C2	0.03	0.00	0.11	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.13	0.01	0.06	0.11	0.29	0.10	0.14
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.09	0.18	0.00	0.07	0.04	0.02	0.05	0.17	0.15	0.07
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.10	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.16	0.14	0.10
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.00	0.06	0.17	0.44	0.18	0.22
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.05	0.05	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.02	0.11	0.13	0.01
C5	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.07	0.01	0.11	0.17	0.43	0.15	0.21
C5'	0.03	0.07	0.01	0.02	0.15	0.00	0.19	0.00	0.18	0.10	0.10	0.05	0.01	0.04	0.16	0.02	0.01	0.18	0.18	0.00
C6	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.06	0.01	0.12	0.15	0.34	0.08	0.16
N1	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.04	0.10	0.26	0.06	0.11
N3	0.03	0.00	0.09	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.12	0.00	0.06	0.14	0.38	0.16	0.19
O2	0.04	0.00	0.18	0.10	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.31	0.17	0.02	0.11	0.09	0.25	0.09	0.13
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.09	0.01	0.16	0.01	0.17	0.05	0.13	0.31	0.00	0.10	0.10	0.00	0.06	0.21	0.21	0.10
O3'	0.09	0.13	0.07	0.01	0.09	0.00	0.07	0.04	0.06	0.10	0.12	0.17	0.10	0.00	0.09	0.07	0.07	0.20	0.14	0.10
O4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.09	0.00	0.06	0.18	0.48	0.22	0.25
O4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.11	0.02	0.12	0.04	0.06	0.11	0.00	0.07	0.06	0.00	0.04	0.03	0.14	0.07
O5'	0.03	0.11	0.05	0.07	0.17	0.02	0.17	0.01	0.15	0.10	0.14	0.09	0.06	0.07	0.18	0.04	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.12	0.29	0.17	0.16	0.44	0.11	0.43	0.18	0.34	0.26	0.38	0.25	0.21	0.20	0.48	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.10	0.15	0.14	0.18	0.13	0.15	0.18	0.08	0.06	0.16	0.09	0.21	0.14	0.22	0.14	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.14	0.07	0.10	0.22	0.01	0.21	0.00	0.16	0.11	0.19	0.13	0.10	0.10	0.25	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00