Doublet Group distance statistics: 54188

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.027 std_dev=0.019
O4'	A	0, 0.008, 0.032, 0.056, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.011, 0.036, 0.062, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.036 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.015, 0.051, 0.087, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.051 std_dev=0.036
C4'	A	0, 0.029, 0.101, 0.173, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.101 std_dev=0.072
C5'	A	0, 0.042, 0.145, 0.247, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.145 std_dev=0.103
C3'	A	0, 0.051, 0.176, 0.301, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.176 std_dev=0.125
O5'	A	0, 0.053, 0.183, 0.312, 0.275 max_d=0.275 avg_d=0.183 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.088, 0.303, 0.517, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.303 std_dev=0.214
O3'	A	0, 0.109, 0.377, 0.646, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.377 std_dev=0.269
C2'	B	0, 0.143, 0.488, 0.834, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.488 std_dev=0.346
O2'	B	0, 0.149, 0.511, 0.873, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.511 std_dev=0.362
P	A	0, 0.151, 0.515, 0.878, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.515 std_dev=0.364
O3'	B	0, 0.172, 0.589, 1.005, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.589 std_dev=0.416
OP1	A	0, 0.178, 0.610, 1.043, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.610 std_dev=0.432
OP2	A	0, 0.234, 0.798, 1.363, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.798 std_dev=0.564
C1'	B	0, 0.249, 0.849, 1.449, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.849 std_dev=0.600
N1	B	0, 0.248, 0.849, 1.451, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.849 std_dev=0.601
C3'	B	0, 0.312, 1.064, 1.817, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.064 std_dev=0.753
C6	B	0, 0.339, 1.156, 1.973, 1.736 max_d=1.736 avg_d=1.156 std_dev=0.817
O4'	B	0, 0.399, 1.362, 2.325, 2.065 max_d=2.065 avg_d=1.362 std_dev=0.963
C4'	B	0, 0.554, 1.892, 3.229, 2.863 max_d=2.863 avg_d=1.892 std_dev=1.338
C5	B	0, 0.589, 2.011, 3.433, 3.033 max_d=3.033 avg_d=2.011 std_dev=1.422
O5'	B	0, 0.596, 2.036, 3.477, 3.098 max_d=3.098 avg_d=2.036 std_dev=1.440
C2	B	0, 0.631, 2.156, 3.681, 3.280 max_d=3.280 avg_d=2.156 std_dev=1.525
OP1	B	0, 0.745, 2.546, 4.346, 3.877 max_d=3.877 avg_d=2.546 std_dev=1.801
P	B	0, 0.749, 2.560, 4.370, 3.880 max_d=3.880 avg_d=2.560 std_dev=1.810
OP2	B	0, 0.757, 2.586, 4.414, 3.880 max_d=3.880 avg_d=2.586 std_dev=1.829
C4	B	0, 0.770, 2.632, 4.493, 3.998 max_d=3.998 avg_d=2.632 std_dev=1.861
N3	B	0, 0.808, 2.762, 4.715, 4.198 max_d=4.198 avg_d=2.762 std_dev=1.953
C5'	B	0, 0.831, 2.839, 4.847, 4.298 max_d=4.298 avg_d=2.839 std_dev=2.008
O2	B	0, 0.880, 3.005, 5.130, 4.543 max_d=4.543 avg_d=3.005 std_dev=2.125
O4	B	0, 1.026, 3.505, 5.984, 5.315 max_d=5.315 avg_d=3.505 std_dev=2.479

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01
C2	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.09	0.08	0.05
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.05	0.05	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.04
C4	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.07	0.11	0.07
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.05	0.08	0.14	0.08
C5'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.05	0.09	0.06
N1	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03
N3	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.04	0.08	0.05
N4	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.05	0.10	0.13	0.09
O2	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.06	0.01	0.02	0.06	0.05	0.08	0.00	0.03	0.05	0.02	0.05	0.05	0.01
O3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.07	0.05	0.06	0.09	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.08	0.05	0.02
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.02
O5'	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.01	0.09	0.09	0.07	0.07	0.08	0.06	0.05	0.01	0.04	0.10	0.02	0.05	0.08	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.01	0.05	0.08	0.07	0.11	0.02	0.14	0.01	0.09	0.05	0.08	0.13	0.02	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.01	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.08	0.01	0.06	0.03	0.05	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.17	0.02	0.10	0.23	0.08	0.42	0.10	0.34	0.05	0.05	0.45	0.03	0.02	0.25	0.10	0.07	0.11	0.31	0.05
C2	0.04	0.07	0.04	0.01	0.40	0.23	0.46	0.14	0.34	0.14	0.22	0.14	0.03	0.03	0.46	0.16	0.22	0.28	0.28	0.09
C2'	0.13	0.21	0.04	0.06	0.29	0.13	0.49	0.08	0.37	0.03	0.04	0.55	0.03	0.01	0.34	0.16	0.09	0.12	0.21	0.01
C3'	0.07	0.25	0.05	0.15	0.26	0.01	0.53	0.26	0.44	0.06	0.11	0.63	0.08	0.08	0.29	0.06	0.05	0.03	0.25	0.11
C4	0.01	0.20	0.05	0.04	0.41	0.29	0.39	0.26	0.29	0.19	0.32	0.08	0.05	0.06	0.46	0.16	0.29	0.35	0.28	0.15
C4'	0.05	0.33	0.06	0.20	0.10	0.09	0.41	0.35	0.37	0.02	0.24	0.68	0.09	0.09	0.09	0.01	0.11	0.08	0.33	0.20
C5	0.02	0.08	0.02	0.02	0.30	0.18	0.35	0.10	0.29	0.14	0.17	0.08	0.01	0.02	0.32	0.09	0.19	0.24	0.32	0.04
C5'	0.04	0.42	0.09	0.25	0.03	0.18	0.33	0.47	0.33	0.04	0.38	0.76	0.13	0.12	0.07	0.06	0.19	0.16	0.35	0.27
C6	0.02	0.06	0.02	0.08	0.24	0.10	0.37	0.03	0.31	0.10	0.05	0.28	0.03	0.01	0.26	0.07	0.11	0.16	0.33	0.02
N1	0.05	0.06	0.03	0.06	0.29	0.14	0.42	0.01	0.33	0.10	0.08	0.29	0.02	0.01	0.33	0.11	0.14	0.19	0.30	0.01
N3	0.02	0.18	0.06	0.04	0.45	0.30	0.45	0.26	0.32	0.18	0.33	0.03	0.05	0.06	0.52	0.18	0.29	0.36	0.26	0.16
N4	0.04	0.32	0.08	0.11	0.45	0.37	0.37	0.41	0.26	0.22	0.43	0.29	0.07	0.09	0.51	0.18	0.38	0.44	0.26	0.23
O2	0.06	0.06	0.05	0.01	0.43	0.24	0.49	0.15	0.36	0.14	0.23	0.17	0.04	0.04	0.50	0.18	0.22	0.29	0.27	0.10
O2'	0.12	0.22	0.02	0.09	0.30	0.10	0.53	0.13	0.40	0.04	0.06	0.58	0.02	0.02	0.35	0.14	0.04	0.08	0.24	0.03
O3'	0.03	0.23	0.12	0.21	0.36	0.08	0.66	0.36	0.54	0.11	0.07	0.65	0.13	0.13	0.40	0.01	0.15	0.14	0.27	0.18
O4'	0.05	0.27	0.03	0.16	0.10	0.03	0.34	0.24	0.31	0.02	0.19	0.56	0.06	0.06	0.09	0.03	0.03	0.02	0.37	0.15
O5'	0.03	0.36	0.09	0.23	0.01	0.14	0.33	0.40	0.33	0.01	0.30	0.69	0.13	0.12	0.02	0.05	0.14	0.12	0.34	0.22
OP1	0.06	0.54	0.26	0.43	0.19	0.44	0.29	0.79	0.37	0.04	0.57	0.88	0.26	0.29	0.28	0.24	0.44	0.44	0.42	0.48
OP2	0.04	0.46	0.15	0.31	0.15	0.22	0.16	0.44	0.22	0.09	0.42	0.75	0.22	0.27	0.19	0.07	0.16	0.16	0.34	0.23
P	0.03	0.52	0.13	0.31	0.21	0.27	0.17	0.55	0.23	0.10	0.51	0.81	0.18	0.21	0.27	0.11	0.23	0.22	0.36	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.00	0.00	0.08	0.03	0.11	0.05
C2	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.08	0.08	0.12	0.19	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.08	0.01	0.07	0.15	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.06	0.18	0.01
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.21	0.00	0.23	0.00	0.19	0.12	0.17	0.06	0.01	0.00	0.23	0.01	0.21	0.20	0.24	0.04
C4	0.00	0.00	0.01	0.21	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.11	0.00	0.01	0.27	0.16	0.79	0.47
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.10	0.03	0.01	0.06	0.16	0.02	0.05	0.00	0.01	0.01	0.44	0.13
C5	0.00	0.01	0.06	0.23	0.00	0.10	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.17	0.01	0.05	0.40	0.36	0.95	0.63
C5'	0.04	0.07	0.10	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.05	0.10	0.06	0.12	0.02	0.01	0.00	0.23	0.21	0.01
C6	0.00	0.01	0.08	0.19	0.00	0.10	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.12	0.01	0.07	0.38	0.32	0.70	0.52
N1	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.03	0.01	0.01	0.18	0.05	0.27	0.24
N3	0.01	0.00	0.07	0.17	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.02	0.01	0.06	0.15	0.05	0.46	0.27
O2	0.01	0.00	0.15	0.06	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.18	0.01	0.12	0.02	0.29	0.09	0.04
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.18	0.16	0.23	0.06	0.22	0.12	0.11	0.06	0.00	0.02	0.18	0.09	0.17	0.16	0.21	0.07
O3'	0.17	0.08	0.01	0.00	0.11	0.02	0.17	0.12	0.12	0.03	0.02	0.18	0.02	0.00	0.14	0.12	0.21	0.22	0.45	0.04
O4	0.00	0.01	0.02	0.23	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.14	0.00	0.02	0.27	0.16	0.90	0.51
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.06	0.12	0.09	0.12	0.02	0.00	0.01	0.08	0.20	0.02
O5'	0.08	0.08	0.09	0.21	0.27	0.01	0.40	0.00	0.38	0.18	0.15	0.02	0.17	0.21	0.27	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.12	0.06	0.20	0.16	0.01	0.36	0.23	0.32	0.05	0.05	0.29	0.16	0.22	0.16	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.18	0.24	0.79	0.44	0.95	0.21	0.70	0.27	0.46	0.09	0.21	0.45	0.90	0.20	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.13	0.01	0.04	0.47	0.13	0.63	0.01	0.52	0.24	0.27	0.04	0.07	0.04	0.51	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00