Doublet Group distance statistics: 54189

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.009, 0.031, 0.054, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.031 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.010, 0.035, 0.061, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.048, 0.169, 0.290, 0.277 max_d=0.277 avg_d=0.169 std_dev=0.121
C2'	A	0, 0.062, 0.238, 0.414, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.238 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.072, 0.280, 0.488, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.280 std_dev=0.208
C2'	B	0, 0.089, 0.306, 0.523, 0.484 max_d=0.484 avg_d=0.306 std_dev=0.217
O2'	B	0, 0.096, 0.337, 0.577, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.337 std_dev=0.240
C3'	A	0, 0.102, 0.388, 0.674, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.388 std_dev=0.286
O2'	A	0, 0.116, 0.423, 0.730, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.423 std_dev=0.307
C5'	A	0, 0.154, 0.574, 0.993, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.574 std_dev=0.419
O3'	A	0, 0.148, 0.579, 1.010, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.579 std_dev=0.431
OP2	A	0, 0.185, 0.679, 1.174, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.679 std_dev=0.494
C3'	B	0, 0.400, 1.377, 2.354, 2.159 max_d=2.159 avg_d=1.377 std_dev=0.977
O5'	A	0, 0.431, 1.472, 2.513, 2.218 max_d=2.218 avg_d=1.472 std_dev=1.041
P	A	0, 0.477, 1.628, 2.779, 2.457 max_d=2.457 avg_d=1.628 std_dev=1.151
C1'	B	0, 0.511, 1.781, 3.050, 2.872 max_d=2.872 avg_d=1.781 std_dev=1.270
C4'	B	0, 0.721, 2.502, 4.284, 4.008 max_d=4.008 avg_d=2.502 std_dev=1.782
O4'	B	0, 0.738, 2.569, 4.400, 4.131 max_d=4.131 avg_d=2.569 std_dev=1.831
O3'	B	0, 0.766, 2.618, 4.471, 4.005 max_d=4.005 avg_d=2.618 std_dev=1.852
N1	B	0, 0.791, 2.706, 4.620, 4.143 max_d=4.143 avg_d=2.706 std_dev=1.915
O2	B	0, 0.804, 2.752, 4.700, 4.228 max_d=4.228 avg_d=2.752 std_dev=1.948
OP1	A	0, 0.843, 2.877, 4.912, 4.328 max_d=4.328 avg_d=2.877 std_dev=2.035
C2	B	0, 0.891, 3.044, 5.196, 4.594 max_d=4.594 avg_d=3.044 std_dev=2.152
O5'	B	0, 0.880, 3.059, 5.237, 4.906 max_d=4.906 avg_d=3.059 std_dev=2.178
OP2	B	0, 0.863, 3.225, 5.587, 5.591 max_d=5.591 avg_d=3.225 std_dev=2.362
C5'	B	0, 1.052, 3.605, 6.158, 5.578 max_d=5.578 avg_d=3.605 std_dev=2.553
C6	B	0, 1.087, 3.723, 6.359, 5.747 max_d=5.747 avg_d=3.723 std_dev=2.636
N3	B	0, 1.235, 4.216, 7.197, 6.335 max_d=6.335 avg_d=4.216 std_dev=2.981
P	B	0, 1.224, 4.275, 7.327, 6.924 max_d=6.924 avg_d=4.275 std_dev=3.052
C5	B	0, 1.389, 4.749, 8.108, 7.248 max_d=7.248 avg_d=4.749 std_dev=3.359
C4	B	0, 1.467, 5.009, 8.551, 7.578 max_d=7.578 avg_d=5.009 std_dev=3.542
OP1	B	0, 1.605, 5.540, 9.476, 8.768 max_d=8.768 avg_d=5.540 std_dev=3.935
O4	B	0, 1.776, 6.064, 10.352, 9.177 max_d=9.177 avg_d=6.064 std_dev=4.288

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.54	0.20	0.20
C2	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.02	0.00	0.37	0.75	0.14	0.41
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.07	0.00	0.02	0.01	0.18	0.36	0.15	0.16
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.11	0.05	0.03	0.08	0.05	0.01	0.00	0.01	0.19	0.21	0.10	0.13
C4	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.52	0.84	0.07	0.56
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.03	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.20	0.14	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.13	0.02	0.55	0.80	0.07	0.56
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.13	0.00	0.15	0.00	0.13	0.07	0.09	0.14	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.48	0.73	0.13	0.46
N1	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.36	0.69	0.16	0.37
N3	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.46	0.82	0.10	0.50
N4	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.55	0.86	0.04	0.60
O2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.07	0.01	0.30	0.71	0.16	0.35
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.11	0.00	0.03	0.04	0.07	0.32	0.14	0.10
O3'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.01	0.13	0.04	0.11	0.05	0.04	0.10	0.07	0.03	0.00	0.01	0.10	0.04	0.07	0.04
O4'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.47	0.23	0.10
O5'	0.17	0.37	0.18	0.19	0.52	0.02	0.55	0.01	0.48	0.36	0.46	0.55	0.30	0.07	0.10	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.54	0.75	0.36	0.21	0.84	0.20	0.80	0.08	0.73	0.69	0.82	0.86	0.71	0.32	0.04	0.47	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.20	0.14	0.15	0.10	0.07	0.14	0.07	0.09	0.13	0.16	0.10	0.04	0.16	0.14	0.07	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.41	0.16	0.13	0.56	0.02	0.56	0.01	0.46	0.37	0.50	0.60	0.35	0.10	0.04	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	1.03	0.06	0.46	1.30	0.47	1.03	0.65	0.77	0.72	1.32	1.03	0.18	0.95	1.49	0.15	0.51	1.43	0.56	0.72
C2	0.22	0.83	0.03	0.37	0.91	0.42	0.64	0.55	0.45	0.50	1.01	0.96	0.15	0.71	1.05	0.18	0.43	1.18	0.49	0.57
C2'	0.37	1.06	0.06	0.49	1.39	0.40	1.11	0.56	0.83	0.76	1.38	1.03	0.18	0.99	1.60	0.18	0.45	1.33	0.51	0.64
C3'	0.38	1.06	0.12	0.56	1.47	0.41	1.21	0.56	0.91	0.79	1.43	0.94	0.24	1.09	1.70	0.21	0.47	1.33	0.52	0.64
C4	0.14	0.54	0.04	0.27	0.49	0.38	0.28	0.44	0.18	0.27	0.61	0.72	0.15	0.45	0.56	0.25	0.35	0.94	0.47	0.45
C4'	0.41	1.08	0.12	0.57	1.55	0.49	1.30	0.69	0.99	0.83	1.48	0.91	0.25	1.12	1.79	0.20	0.57	1.54	0.64	0.82
C5	0.21	0.61	0.05	0.34	0.61	0.42	0.44	0.49	0.33	0.38	0.69	0.74	0.20	0.64	0.68	0.23	0.39	1.04	0.51	0.52
C5'	0.44	1.05	0.19	0.62	1.61	0.53	1.38	0.72	1.07	0.86	1.49	0.78	0.31	1.18	1.83	0.25	0.61	1.57	0.69	0.87
C6	0.28	0.83	0.06	0.43	0.93	0.45	0.73	0.58	0.56	0.56	0.99	0.90	0.20	0.86	1.03	0.18	0.46	1.23	0.54	0.62
N1	0.29	0.91	0.04	0.42	1.05	0.45	0.80	0.60	0.60	0.60	1.12	0.99	0.18	0.85	1.19	0.16	0.47	1.29	0.53	0.64
N3	0.16	0.67	0.03	0.30	0.65	0.39	0.40	0.48	0.25	0.35	0.78	0.84	0.13	0.53	0.76	0.22	0.38	1.02	0.46	0.48
N4	0.15	0.32	0.05	0.16	0.19	0.32	0.07	0.34	0.14	0.09	0.34	0.53	0.10	0.18	0.24	0.31	0.29	0.74	0.44	0.35
O2	0.23	0.89	0.02	0.37	1.00	0.42	0.71	0.57	0.49	0.54	1.10	1.00	0.14	0.73	1.17	0.16	0.44	1.23	0.48	0.58
O2'	0.37	1.06	0.06	0.51	1.45	0.44	1.17	0.63	0.86	0.77	1.41	1.00	0.19	1.02	1.70	0.17	0.52	1.46	0.57	0.73
O3'	0.38	1.02	0.17	0.59	1.55	0.38	1.29	0.53	0.97	0.80	1.44	0.85	0.27	1.11	1.83	0.24	0.45	1.30	0.51	0.62
O4'	0.39	1.07	0.10	0.48	1.43	0.50	1.17	0.72	0.90	0.80	1.40	1.00	0.21	1.02	1.63	0.15	0.57	1.55	0.62	0.82
O5'	0.25	0.54	0.52	1.00	1.19	0.91	0.99	1.05	0.66	0.40	1.00	0.24	0.66	1.55	1.44	0.44	0.89	1.74	0.82	1.07
OP1	0.19	0.59	0.45	1.01	1.51	1.07	1.33	1.29	0.87	0.48	1.14	0.22	0.66	1.61	1.84	0.47	0.97	1.83	0.65	1.11
OP2	0.23	0.56	0.10	0.61	1.05	0.56	1.05	0.81	0.85	0.58	0.85	0.28	0.16	0.97	1.13	0.15	0.77	1.65	0.87	1.05
P	0.26	0.43	0.50	1.04	1.13	1.02	1.00	1.19	0.67	0.35	0.88	0.14	0.62	1.59	1.36	0.51	0.97	1.80	0.82	1.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.38	0.19
C2	0.01	0.00	0.15	0.28	0.00	0.17	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.26	0.00	0.07	0.44	0.50	0.37	0.28
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.27	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.39	0.38	0.15
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.14	0.06	0.23	0.47	0.00	0.00	0.09	0.02	0.08	0.50	0.34	0.21
C4	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.00	0.00	0.22	0.18	0.33	0.16
C4'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.10	0.03	0.14	0.27	0.02	0.05	0.06	0.00	0.01	0.22	0.23	0.08
C5	0.00	0.00	0.08	0.09	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.13	0.43	0.73	0.51
C5'	0.01	0.29	0.00	0.01	0.13	0.00	0.05	0.00	0.11	0.08	0.27	0.43	0.02	0.07	0.15	0.01	0.00	0.16	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.14	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.00	0.08	0.19	0.41	0.79	0.57
N1	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.00	0.15	0.11	0.38	0.18
N3	0.01	0.00	0.10	0.23	0.00	0.14	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.23	0.00	0.05	0.42	0.41	0.33	0.24
O2	0.02	0.00	0.27	0.47	0.01	0.27	0.00	0.43	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.45	0.01	0.11	0.63	0.87	0.65	0.58
O2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.08	0.16	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.41	0.33	0.09
O3'	0.01	0.26	0.02	0.00	0.09	0.05	0.09	0.07	0.13	0.04	0.23	0.45	0.01	0.00	0.10	0.03	0.13	0.69	0.38	0.31
O4	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.00	0.00	0.25	0.20	0.28	0.14
O4'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.05	0.11	0.03	0.03	0.00	0.00	0.10	0.07	0.40	0.29
O5'	0.06	0.44	0.05	0.08	0.22	0.01	0.13	0.00	0.19	0.15	0.42	0.63	0.03	0.13	0.25	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.50	0.39	0.50	0.18	0.22	0.43	0.16	0.41	0.11	0.41	0.87	0.41	0.69	0.20	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.38	0.37	0.38	0.34	0.33	0.23	0.73	0.09	0.79	0.38	0.33	0.65	0.33	0.38	0.28	0.40	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.19	0.28	0.15	0.21	0.16	0.08	0.51	0.01	0.57	0.18	0.24	0.58	0.09	0.31	0.14	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00