Doublet Group distance statistics: 54190

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.004, 0.023, 0.042, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.008, 0.035, 0.062, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.035 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.011, 0.042, 0.073, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.042 std_dev=0.031
C1'	B	0, 0.060, 0.215, 0.371, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.215 std_dev=0.155
N1	B	0, 0.060, 0.250, 0.441, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.250 std_dev=0.190
C2'	B	0, 0.036, 0.263, 0.489, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.263 std_dev=0.226
O4'	B	0, 0.019, 0.269, 0.519, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.269 std_dev=0.250
C2	B	0, 0.081, 0.348, 0.614, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.348 std_dev=0.267
C3'	B	0, 0.103, 0.378, 0.652, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.378 std_dev=0.274
N3	B	0, 0.109, 0.394, 0.678, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.394 std_dev=0.284
P	A	0, 0.112, 0.426, 0.740, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.426 std_dev=0.314
O2'	B	0, 0.037, 0.352, 0.666, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.352 std_dev=0.314
C2'	A	0, 0.121, 0.445, 0.769, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.445 std_dev=0.324
C4	B	0, 0.126, 0.457, 0.788, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.457 std_dev=0.331
C6	B	0, 0.077, 0.429, 0.780, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.429 std_dev=0.351
O4'	A	0, 0.125, 0.482, 0.839, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.482 std_dev=0.357
C4'	B	0, 0.119, 0.488, 0.858, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.488 std_dev=0.369
O2'	A	0, 0.151, 0.523, 0.894, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.523 std_dev=0.371
OP2	B	0, 0.117, 0.492, 0.868, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.492 std_dev=0.375
OP1	B	0, 0.142, 0.526, 0.911, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.526 std_dev=0.385
O4	B	0, 0.161, 0.550, 0.939, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.550 std_dev=0.389
P	B	0, 0.165, 0.568, 0.971, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.568 std_dev=0.403
C5	B	0, 0.132, 0.551, 0.971, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.551 std_dev=0.420
O2	B	0, 0.125, 0.550, 0.975, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.550 std_dev=0.425
OP1	A	0, 0.168, 0.610, 1.052, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.610 std_dev=0.442
C4'	A	0, 0.162, 0.641, 1.120, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.641 std_dev=0.479
OP2	A	0, 0.204, 0.709, 1.213, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.709 std_dev=0.505
C3'	A	0, 0.192, 0.704, 1.217, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.704 std_dev=0.512
O5'	A	0, 0.195, 0.795, 1.395, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.795 std_dev=0.600
O5'	B	0, 0.235, 0.850, 1.465, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.850 std_dev=0.615
O3'	A	0, 0.262, 0.934, 1.607, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.934 std_dev=0.672
O3'	B	0, 0.335, 1.154, 1.972, 1.813 max_d=1.813 avg_d=1.154 std_dev=0.819
C5'	A	0, 0.301, 1.193, 2.086, 2.146 max_d=2.146 avg_d=1.193 std_dev=0.893
C5'	B	0, 0.376, 1.333, 2.289, 2.200 max_d=2.200 avg_d=1.333 std_dev=0.956

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.10	0.07	0.07	0.08
C2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.09	0.02	0.16	0.03	0.08	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.12	0.00	0.01	0.00	0.14	0.28	0.11	0.07
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.08	0.03	0.08	0.05	0.15	0.01	0.01	0.01	0.16	0.40	0.13	0.15
C4	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.02	0.23	0.09	0.15	0.07
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.03	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.00	0.21	0.12	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.05	0.02	0.26	0.09	0.15	0.06
C5'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.10	0.00	0.10	0.00	0.09	0.04	0.09	0.13	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.24	0.21	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.25	0.04	0.08	0.05
N1	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.17	0.02	0.05	0.07
N3	0.03	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.09	0.02	0.19	0.05	0.11	0.08
N4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.02	0.13	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.05	0.03	0.24	0.13	0.20	0.09
O2	0.03	0.00	0.12	0.15	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.16	0.03	0.12	0.06	0.08	0.08
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.08	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.11	0.09	0.13	0.00	0.03	0.03	0.06	0.28	0.08	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.09	0.05	0.16	0.03	0.00	0.01	0.12	0.52	0.14	0.19
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.06	0.03	0.18	0.16
O5'	0.10	0.16	0.14	0.16	0.23	0.00	0.26	0.01	0.25	0.17	0.19	0.24	0.12	0.06	0.12	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.03	0.28	0.40	0.09	0.21	0.09	0.24	0.04	0.02	0.05	0.13	0.06	0.28	0.52	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.08	0.11	0.13	0.15	0.12	0.15	0.21	0.08	0.05	0.11	0.20	0.08	0.08	0.14	0.18	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.08	0.08	0.07	0.15	0.07	0.03	0.06	0.01	0.05	0.07	0.08	0.09	0.08	0.04	0.19	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.27	0.22	0.20	0.24	0.23	0.20	0.53	0.19	0.21	0.27	0.35	0.25	0.42	0.25	0.18	0.16	0.14	0.14	0.12
C2	0.23	0.31	0.22	0.18	0.30	0.25	0.27	0.52	0.25	0.26	0.32	0.38	0.24	0.45	0.31	0.22	0.24	0.10	0.09	0.09
C2'	0.17	0.24	0.14	0.08	0.24	0.30	0.21	0.58	0.20	0.19	0.26	0.29	0.16	0.26	0.26	0.21	0.21	0.14	0.10	0.10
C3'	0.23	0.30	0.18	0.12	0.30	0.40	0.26	0.65	0.24	0.25	0.33	0.36	0.20	0.11	0.33	0.28	0.30	0.19	0.14	0.14
C4	0.25	0.30	0.22	0.18	0.31	0.25	0.31	0.46	0.29	0.28	0.31	0.34	0.22	0.42	0.31	0.25	0.31	0.13	0.06	0.11
C4'	0.20	0.32	0.19	0.10	0.28	0.31	0.22	0.62	0.19	0.22	0.33	0.41	0.27	0.22	0.31	0.21	0.25	0.19	0.13	0.13
C5	0.23	0.26	0.21	0.17	0.24	0.25	0.25	0.45	0.24	0.24	0.25	0.31	0.21	0.41	0.24	0.23	0.28	0.12	0.05	0.09
C5'	0.20	0.36	0.18	0.11	0.32	0.41	0.24	0.70	0.21	0.24	0.38	0.47	0.29	0.08	0.36	0.26	0.40	0.40	0.36	0.33
C6	0.21	0.25	0.21	0.18	0.22	0.24	0.20	0.49	0.20	0.22	0.24	0.32	0.22	0.44	0.23	0.20	0.23	0.11	0.07	0.08
N1	0.21	0.28	0.21	0.18	0.25	0.24	0.22	0.52	0.20	0.22	0.28	0.35	0.23	0.44	0.26	0.19	0.21	0.10	0.10	0.08
N3	0.25	0.32	0.23	0.18	0.32	0.26	0.31	0.50	0.28	0.28	0.33	0.37	0.24	0.44	0.34	0.24	0.29	0.11	0.08	0.10
N4	0.27	0.31	0.24	0.19	0.35	0.26	0.37	0.43	0.35	0.31	0.33	0.32	0.23	0.40	0.36	0.27	0.35	0.15	0.08	0.14
O2	0.24	0.32	0.22	0.18	0.31	0.25	0.28	0.54	0.25	0.26	0.34	0.39	0.25	0.44	0.34	0.22	0.23	0.10	0.11	0.09
O2'	0.19	0.24	0.18	0.16	0.23	0.28	0.20	0.56	0.19	0.20	0.25	0.29	0.20	0.30	0.24	0.20	0.17	0.23	0.23	0.20
O3'	0.24	0.32	0.21	0.15	0.32	0.41	0.27	0.66	0.25	0.26	0.35	0.38	0.23	0.05	0.35	0.28	0.30	0.21	0.16	0.15
O4'	0.21	0.30	0.25	0.20	0.24	0.21	0.18	0.55	0.16	0.22	0.30	0.41	0.32	0.43	0.26	0.15	0.17	0.12	0.05	0.06
O5'	0.24	0.24	0.16	0.14	0.23	0.47	0.25	0.63	0.26	0.24	0.24	0.29	0.21	0.01	0.24	0.37	0.33	0.18	0.27	0.22
OP1	0.20	0.27	0.29	0.28	0.31	0.12	0.30	0.13	0.28	0.25	0.30	0.28	0.30	0.01	0.33	0.15	0.27	0.11	0.16	0.22
OP2	0.33	0.43	0.29	0.15	0.44	0.37	0.38	0.37	0.35	0.36	0.46	0.47	0.35	0.02	0.46	0.32	0.22	0.19	0.21	0.13
P	0.10	0.21	0.12	0.01	0.19	0.21	0.13	0.27	0.10	0.13	0.22	0.27	0.21	0.01	0.22	0.11	0.10	0.11	0.10	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.19	0.02	0.00	0.13	0.09	0.09	0.00
C2	0.04	0.00	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.21	0.02	0.03	0.15	0.10	0.14	0.03
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.13	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.03	0.00	0.07	0.14	0.09	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.19	0.11	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.14	0.00	0.02	0.17	0.13	0.30	0.16
C4'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.10	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.06	0.14	0.13
C5	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.00	0.03	0.19	0.18	0.33	0.20
C5'	0.05	0.08	0.13	0.00	0.18	0.00	0.23	0.00	0.21	0.12	0.12	0.07	0.07	0.13	0.19	0.01	0.00	0.19	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.10	0.01	0.03	0.18	0.15	0.26	0.16
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.16	0.01	0.00	0.15	0.09	0.16	0.06
N3	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.19	0.02	0.01	0.16	0.09	0.22	0.09
O2	0.08	0.00	0.09	0.10	0.01	0.10	0.02	0.07	0.02	0.02	0.00	0.00	0.09	0.27	0.02	0.07	0.16	0.17	0.04	0.07
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.07	0.05	0.05	0.07	0.04	0.03	0.07	0.09	0.00	0.04	0.08	0.02	0.07	0.19	0.09	0.07
O3'	0.19	0.21	0.05	0.00	0.14	0.02	0.10	0.13	0.10	0.16	0.19	0.27	0.04	0.00	0.14	0.14	0.13	0.27	0.16	0.12
O4	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.19	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.14	0.00	0.02	0.18	0.15	0.34	0.19
O4'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.02	0.14	0.02	0.00	0.16	0.07	0.11	0.04
O5'	0.13	0.15	0.07	0.10	0.17	0.00	0.19	0.00	0.18	0.15	0.16	0.16	0.07	0.13	0.18	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.10	0.14	0.19	0.13	0.06	0.18	0.19	0.15	0.09	0.09	0.17	0.19	0.27	0.15	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.14	0.09	0.11	0.30	0.14	0.33	0.16	0.26	0.16	0.22	0.04	0.09	0.16	0.34	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.00	0.03	0.05	0.10	0.16	0.13	0.20	0.01	0.16	0.06	0.09	0.07	0.07	0.12	0.19	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00