Doublet Group distance statistics: 54198

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 15, 15, 16, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.004, 0.007, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.012, 0.032, 0.053, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.032 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.015, 0.040, 0.066, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.040 std_dev=0.025
O2'	B	0, 0.173, 0.270, 0.367, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.270 std_dev=0.097
C3'	B	0, 0.175, 0.279, 0.384, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.279 std_dev=0.105
O4'	A	0, -0.083, 0.076, 0.235, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.076 std_dev=0.159
O5'	A	0, 0.114, 0.275, 0.435, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.275 std_dev=0.160
C2'	A	0, -0.090, 0.096, 0.283, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.096 std_dev=0.187
C2'	B	0, 0.064, 0.251, 0.438, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.251 std_dev=0.187
C3'	A	0, -0.083, 0.150, 0.384, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.150 std_dev=0.234
P	A	0, 0.072, 0.328, 0.584, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.328 std_dev=0.256
C4'	A	0, -0.089, 0.170, 0.430, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.170 std_dev=0.260
O3'	A	0, -0.074, 0.205, 0.485, 2.085 max_d=2.085 avg_d=0.205 std_dev=0.280
OP2	A	0, 0.078, 0.360, 0.642, 2.062 max_d=2.062 avg_d=0.360 std_dev=0.282
OP1	A	0, 0.047, 0.353, 0.658, 2.224 max_d=2.224 avg_d=0.353 std_dev=0.305
OP2	B	0, 0.187, 0.497, 0.807, 2.365 max_d=2.365 avg_d=0.497 std_dev=0.310
C4'	B	0, 0.001, 0.317, 0.632, 2.410 max_d=2.410 avg_d=0.317 std_dev=0.316
O2'	A	0, -0.145, 0.182, 0.508, 2.402 max_d=2.402 avg_d=0.182 std_dev=0.327
O3'	B	0, 0.055, 0.409, 0.763, 2.714 max_d=2.714 avg_d=0.409 std_dev=0.354
C5'	B	0, -0.010, 0.411, 0.832, 3.214 max_d=3.214 avg_d=0.411 std_dev=0.421
C5'	A	0, -0.120, 0.302, 0.724, 3.156 max_d=3.156 avg_d=0.302 std_dev=0.422
C1'	B	0, -0.221, 0.252, 0.725, 3.477 max_d=3.477 avg_d=0.252 std_dev=0.473
O5'	B	0, -0.050, 0.430, 0.910, 3.645 max_d=3.645 avg_d=0.430 std_dev=0.480
O4'	B	0, -0.242, 0.269, 0.780, 3.767 max_d=3.767 avg_d=0.269 std_dev=0.511
P	B	0, -0.090, 0.511, 1.111, 4.550 max_d=4.550 avg_d=0.511 std_dev=0.601
N1	B	0, -0.440, 0.297, 1.034, 5.372 max_d=5.372 avg_d=0.297 std_dev=0.737
C6	B	0, -0.457, 0.324, 1.105, 5.690 max_d=5.690 avg_d=0.324 std_dev=0.781
OP1	B	0, -0.202, 0.648, 1.499, 6.426 max_d=6.426 avg_d=0.648 std_dev=0.850
O2	B	0, -0.600, 0.344, 1.288, 6.850 max_d=6.850 avg_d=0.344 std_dev=0.944
C2	B	0, -0.648, 0.341, 1.329, 7.164 max_d=7.164 avg_d=0.341 std_dev=0.989
C5	B	0, -0.680, 0.378, 1.436, 7.668 max_d=7.668 avg_d=0.378 std_dev=1.058
N3	B	0, -0.890, 0.400, 1.689, 9.310 max_d=9.310 avg_d=0.400 std_dev=1.290
C4	B	0, -0.912, 0.414, 1.740, 9.571 max_d=9.571 avg_d=0.414 std_dev=1.326
N4	B	0, -1.150, 0.482, 2.115, 11.757 max_d=11.757 avg_d=0.482 std_dev=1.632

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.05	0.10	0.09	0.10
C2	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.04	0.03	0.05	0.12	0.09	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.07	0.01	0.06	0.03	0.14	0.00	0.02	0.01	0.17	0.20	0.21	0.22
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.08	0.07	0.11	0.12	0.10	0.02	0.00	0.01	0.13	0.16	0.08	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.05	0.01	0.07	0.11	0.12	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.03	0.10	0.02	0.01	0.01	0.09	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.06	0.03	0.08	0.11	0.14	0.11
C5'	0.02	0.06	0.03	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.13	0.04	0.07	0.06	0.01	0.01	0.14	0.13	0.01
C6	0.00	0.01	0.07	0.08	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.04	0.07	0.10	0.13	0.11
N1	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.05	0.11	0.10	0.10
N3	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.02	0.06	0.12	0.10	0.11
N4	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.06	0.02	0.08	0.11	0.13	0.11
O2	0.02	0.00	0.14	0.10	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.05	0.05	0.12	0.08	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.14	0.10	0.16	0.07	0.13	0.07	0.09	0.15	0.07	0.00	0.04	0.07	0.08	0.10	0.16	0.14
O3'	0.08	0.04	0.02	0.00	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05	0.03	0.04	0.06	0.07	0.04	0.00	0.04	0.06	0.08	0.11	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.07	0.04	0.00	0.06	0.07	0.04	0.04
O5'	0.05	0.05	0.17	0.13	0.07	0.01	0.08	0.01	0.07	0.05	0.06	0.08	0.05	0.08	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.10	0.12	0.20	0.16	0.11	0.09	0.11	0.14	0.10	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.08	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.09	0.21	0.08	0.12	0.07	0.14	0.13	0.13	0.10	0.10	0.13	0.08	0.16	0.11	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.11	0.22	0.12	0.11	0.03	0.11	0.01	0.11	0.10	0.11	0.11	0.11	0.14	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.29	0.07	0.05	0.27	0.23	0.27	0.25	0.27	0.28	0.28	0.27	0.30	0.10	0.20	0.36	0.22	0.24	0.13	0.24
C2	0.40	0.55	0.12	0.06	0.56	0.18	0.50	0.18	0.45	0.47	0.58	0.58	0.56	0.11	0.28	0.40	0.16	0.09	0.10	0.15
C2'	0.14	0.14	0.12	0.14	0.13	0.09	0.12	0.11	0.12	0.13	0.14	0.13	0.16	0.13	0.27	0.20	0.10	0.13	0.06	0.10
C3'	0.33	0.26	0.16	0.14	0.21	0.33	0.23	0.34	0.26	0.28	0.22	0.19	0.28	0.21	0.09	0.39	0.33	0.38	0.21	0.34
C4	0.46	0.62	0.14	0.07	0.63	0.16	0.57	0.15	0.53	0.55	0.65	0.65	0.62	0.12	0.34	0.44	0.15	0.08	0.10	0.14
C4'	0.37	0.26	0.19	0.17	0.20	0.40	0.24	0.42	0.28	0.30	0.21	0.17	0.27	0.25	0.09	0.46	0.40	0.47	0.26	0.42
C5	0.41	0.45	0.11	0.07	0.43	0.23	0.41	0.22	0.41	0.43	0.44	0.42	0.45	0.11	0.32	0.46	0.22	0.16	0.12	0.22
C5'	0.45	0.26	0.29	0.30	0.18	0.53	0.24	0.55	0.32	0.34	0.19	0.13	0.28	0.38	0.24	0.55	0.54	0.64	0.37	0.56
C6	0.35	0.34	0.09	0.06	0.31	0.25	0.31	0.26	0.32	0.34	0.33	0.30	0.35	0.10	0.25	0.42	0.25	0.23	0.14	0.25
N1	0.35	0.40	0.09	0.05	0.38	0.22	0.36	0.23	0.35	0.37	0.40	0.39	0.41	0.10	0.24	0.40	0.21	0.18	0.12	0.22
N3	0.44	0.65	0.14	0.06	0.68	0.15	0.59	0.14	0.53	0.55	0.70	0.71	0.66	0.12	0.32	0.41	0.13	0.09	0.09	0.12
N4	0.48	0.72	0.17	0.09	0.76	0.12	0.69	0.10	0.62	0.63	0.78	0.79	0.69	0.13	0.38	0.43	0.11	0.15	0.10	0.09
O2	0.39	0.57	0.13	0.06	0.59	0.17	0.52	0.17	0.46	0.48	0.62	0.63	0.59	0.11	0.26	0.38	0.14	0.09	0.10	0.14
O2'	0.11	0.10	0.29	0.30	0.10	0.11	0.10	0.09	0.10	0.10	0.10	0.11	0.10	0.31	0.40	0.10	0.13	0.11	0.19	0.10
O3'	0.32	0.27	0.18	0.17	0.24	0.32	0.24	0.33	0.27	0.28	0.25	0.22	0.29	0.23	0.14	0.37	0.31	0.37	0.21	0.32
O4'	0.37	0.29	0.14	0.11	0.24	0.36	0.27	0.39	0.30	0.32	0.25	0.22	0.30	0.18	0.08	0.46	0.36	0.40	0.22	0.38
O5'	0.22	0.10	0.10	0.13	0.16	0.38	0.10	0.44	0.12	0.11	0.16	0.22	0.10	0.17	0.10	0.37	0.42	0.59	0.25	0.46
OP1	0.17	0.19	0.10	0.11	0.30	0.37	0.19	0.45	0.11	0.10	0.30	0.40	0.18	0.16	0.10	0.34	0.46	0.69	0.26	0.52
OP2	0.09	0.34	0.14	0.09	0.46	0.25	0.35	0.30	0.23	0.21	0.47	0.56	0.33	0.13	0.11	0.19	0.32	0.54	0.13	0.35
P	0.15	0.19	0.10	0.10	0.29	0.35	0.19	0.41	0.11	0.10	0.29	0.37	0.18	0.16	0.10	0.31	0.41	0.61	0.22	0.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.06	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.06	0.07	0.08	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06	0.00	0.01	0.00	0.09	0.16	0.06	0.09
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.08	0.05	0.07	0.09	0.06	0.01	0.00	0.02	0.13	0.20	0.07	0.12
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.09	0.09	0.13	0.09
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.10	0.10	0.14	0.10
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.13	0.07	0.10	0.16	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.09	0.08	0.11	0.07
N1	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.07	0.08	0.04
N3	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.07	0.08	0.11	0.07
N4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.10	0.11	0.15	0.11
O2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.07	0.02	0.06	0.09	0.07	0.04
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.05	0.09	0.00	0.03	0.03	0.05	0.14	0.06	0.06
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.03	0.08	0.04	0.07	0.10	0.07	0.03	0.00	0.01	0.13	0.25	0.11	0.15
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.09	0.05
O5'	0.04	0.06	0.09	0.13	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.06	0.07	0.10	0.06	0.05	0.13	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.07	0.16	0.20	0.09	0.08	0.10	0.07	0.08	0.07	0.08	0.11	0.09	0.14	0.25	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.08	0.06	0.07	0.13	0.09	0.14	0.14	0.11	0.08	0.11	0.15	0.07	0.06	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.05	0.09	0.12	0.09	0.02	0.10	0.01	0.07	0.04	0.07	0.11	0.04	0.06	0.15	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00