Doublet Group distance statistics: 54200

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 2, 2, 3, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.017, 0.032, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.032 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.024 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.011, 0.045, 0.078, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.045 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.053, 0.111, 0.169, 0.198 max_d=0.198 avg_d=0.111 std_dev=0.058
C2'	A	0, 0.052, 0.118, 0.184, 0.227 max_d=0.227 avg_d=0.118 std_dev=0.066
C4'	A	0, 0.106, 0.197, 0.287, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.197 std_dev=0.091
C3'	A	0, 0.131, 0.232, 0.333, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.232 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.114, 0.215, 0.316, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.215 std_dev=0.101
C5'	A	0, 0.180, 0.330, 0.480, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.330 std_dev=0.150
O5'	A	0, 0.079, 0.242, 0.405, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.242 std_dev=0.163
O3'	A	0, 0.178, 0.349, 0.521, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.349 std_dev=0.171
C1'	B	0, 0.262, 0.479, 0.696, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.479 std_dev=0.217
O3'	B	0, 0.243, 0.476, 0.709, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.476 std_dev=0.233
O4'	B	0, 0.235, 0.470, 0.705, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.470 std_dev=0.235
C2'	B	0, 0.226, 0.462, 0.698, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.462 std_dev=0.236
C3'	B	0, 0.207, 0.444, 0.682, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.444 std_dev=0.237
N1	B	0, 0.286, 0.525, 0.764, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.525 std_dev=0.239
C4'	B	0, 0.222, 0.465, 0.709, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.465 std_dev=0.243
C5'	B	0, 0.282, 0.562, 0.841, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.562 std_dev=0.280
P	A	0, 0.319, 0.607, 0.895, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.607 std_dev=0.288
C2	B	0, 0.296, 0.586, 0.876, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.586 std_dev=0.290
O2'	B	0, 0.327, 0.621, 0.914, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.621 std_dev=0.294
C6	B	0, 0.229, 0.550, 0.872, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.550 std_dev=0.321
O2	B	0, 0.264, 0.602, 0.941, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.602 std_dev=0.338
N3	B	0, 0.305, 0.653, 1.001, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.653 std_dev=0.348
C4	B	0, 0.297, 0.654, 1.010, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.654 std_dev=0.357
C5	B	0, 0.217, 0.604, 0.990, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.604 std_dev=0.386
OP1	A	0, 0.467, 0.889, 1.311, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.889 std_dev=0.422
N4	B	0, 0.292, 0.721, 1.149, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.721 std_dev=0.429
OP2	A	0, 0.554, 0.997, 1.441, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.997 std_dev=0.444
OP1	B	0, 0.192, 0.812, 1.432, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.812 std_dev=0.620
P	B	0, 0.165, 0.912, 1.659, 2.077 max_d=2.077 avg_d=0.912 std_dev=0.747
O5'	B	0, 0.118, 0.895, 1.673, 2.119 max_d=2.119 avg_d=0.895 std_dev=0.777
OP2	B	0, 0.158, 1.026, 1.894, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.026 std_dev=0.868

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.07	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.11	0.07
C2	0.03	0.00	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08	0.04	0.07	0.15	0.11	0.07
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.05	0.09	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.14	0.06
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.13	0.01	0.14	0.01	0.13	0.07	0.10	0.14	0.10	0.01	0.01	0.01	0.14	0.14	0.17	0.12
C4	0.03	0.01	0.05	0.13	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.15	0.04	0.10	0.17	0.09	0.07
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.09	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.07	0.09	0.08	0.06	0.02	0.00	0.01	0.09	0.08	0.03
C5	0.03	0.01	0.05	0.14	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.17	0.04	0.09	0.17	0.08	0.07
C5'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.13	0.01	0.14	0.00	0.13	0.07	0.10	0.14	0.09	0.07	0.03	0.01	0.01	0.12	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.14	0.03	0.07	0.16	0.08	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.06	0.14	0.10	0.07
N3	0.03	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.11	0.03	0.08	0.16	0.11	0.07
N4	0.03	0.02	0.05	0.14	0.01	0.09	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.17	0.05	0.11	0.16	0.09	0.07
O2	0.07	0.01	0.09	0.10	0.02	0.08	0.02	0.09	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.11	0.07	0.08	0.15	0.12	0.07
O2'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.06	0.04	0.07	0.05	0.01	0.04	0.03	0.10	0.00	0.03	0.06	0.09	0.12	0.17	0.10
O3'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.15	0.02	0.17	0.03	0.14	0.07	0.11	0.17	0.11	0.03	0.00	0.02	0.22	0.24	0.29	0.24
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.07	0.06	0.02	0.00	0.12	0.11	0.13	0.11
O5'	0.05	0.07	0.06	0.14	0.10	0.01	0.09	0.01	0.07	0.06	0.08	0.11	0.08	0.09	0.22	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.10	0.15	0.08	0.14	0.17	0.09	0.17	0.12	0.16	0.14	0.16	0.16	0.15	0.12	0.24	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.11	0.14	0.17	0.09	0.08	0.08	0.10	0.08	0.10	0.11	0.09	0.12	0.17	0.29	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.07	0.06	0.12	0.07	0.03	0.07	0.01	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.10	0.24	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.33	0.20	0.10	0.37	0.14	0.35	0.25	0.32	0.31	0.36	0.39	0.30	0.33	0.15	0.19	0.23	0.24	0.18	0.15
C2	0.28	0.43	0.23	0.10	0.47	0.15	0.44	0.26	0.38	0.37	0.47	0.50	0.42	0.37	0.15	0.16	0.31	0.25	0.24	0.19
C2'	0.17	0.24	0.14	0.06	0.27	0.17	0.25	0.27	0.23	0.22	0.27	0.29	0.22	0.29	0.06	0.12	0.07	0.15	0.15	0.04
C3'	0.06	0.11	0.06	0.10	0.13	0.23	0.11	0.31	0.09	0.09	0.13	0.14	0.10	0.22	0.07	0.11	0.14	0.16	0.25	0.18
C4	0.29	0.47	0.22	0.10	0.52	0.17	0.48	0.27	0.42	0.40	0.52	0.54	0.45	0.34	0.13	0.15	0.34	0.24	0.25	0.19
C4'	0.13	0.16	0.08	0.06	0.18	0.16	0.17	0.27	0.16	0.15	0.17	0.19	0.14	0.22	0.05	0.11	0.07	0.15	0.17	0.09
C5	0.30	0.42	0.22	0.09	0.45	0.15	0.43	0.26	0.39	0.38	0.44	0.47	0.37	0.31	0.14	0.18	0.31	0.23	0.22	0.16
C5'	0.07	0.09	0.04	0.06	0.10	0.16	0.09	0.28	0.08	0.08	0.10	0.11	0.10	0.18	0.04	0.08	0.18	0.17	0.24	0.18
C6	0.30	0.37	0.22	0.10	0.41	0.13	0.39	0.24	0.36	0.35	0.39	0.42	0.33	0.32	0.16	0.20	0.27	0.24	0.20	0.16
N1	0.29	0.38	0.22	0.10	0.42	0.14	0.40	0.25	0.36	0.35	0.41	0.44	0.36	0.35	0.16	0.19	0.28	0.25	0.21	0.17
N3	0.28	0.47	0.23	0.10	0.52	0.16	0.47	0.27	0.41	0.39	0.52	0.55	0.46	0.37	0.14	0.15	0.34	0.25	0.26	0.20
N4	0.25	0.50	0.20	0.10	0.57	0.19	0.52	0.28	0.43	0.40	0.57	0.60	0.47	0.31	0.11	0.13	0.35	0.22	0.26	0.18
O2	0.27	0.43	0.23	0.10	0.48	0.15	0.43	0.27	0.38	0.36	0.47	0.51	0.42	0.38	0.14	0.16	0.31	0.25	0.24	0.20
O2'	0.15	0.24	0.10	0.08	0.28	0.18	0.25	0.28	0.22	0.21	0.27	0.30	0.22	0.25	0.05	0.13	0.09	0.16	0.16	0.07
O3'	0.12	0.12	0.13	0.21	0.12	0.29	0.10	0.35	0.10	0.10	0.13	0.13	0.15	0.19	0.20	0.19	0.29	0.26	0.39	0.31
O4'	0.27	0.31	0.20	0.12	0.34	0.15	0.33	0.25	0.31	0.31	0.33	0.36	0.27	0.31	0.18	0.22	0.20	0.24	0.16	0.13
O5'	0.06	0.10	0.02	0.06	0.08	0.12	0.07	0.19	0.07	0.07	0.10	0.09	0.15	0.12	0.01	0.08	0.09	0.17	0.19	0.11
OP1	0.06	0.07	0.06	0.04	0.05	0.13	0.09	0.11	0.09	0.05	0.06	0.06	0.14	0.09	0.02	0.15	0.17	0.20	0.16	0.13
OP2	0.05	0.16	0.08	0.08	0.09	0.08	0.06	0.11	0.07	0.06	0.16	0.10	0.27	0.10	0.02	0.07	0.26	0.15	0.29	0.20
P	0.04	0.09	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.03	0.09	0.04	0.18	0.06	0.01	0.07	0.19	0.14	0.23	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.10	0.01	0.04	0.01	0.28	0.15	0.41	0.31
C2	0.06	0.00	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.10	0.06	0.26	0.19	0.40	0.30
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.10	0.00	0.02	0.01	0.63	0.38	0.63	0.58
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.14	0.01	0.01	0.01	0.45	0.19	0.41	0.38
C4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.04	0.02	0.24	0.16	0.35	0.27
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.10	0.01	0.03	0.06	0.15	0.01	0.01	0.00	0.02	0.17	0.19	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.03	0.06	0.26	0.17	0.41	0.31
C5'	0.02	0.04	0.03	0.02	0.15	0.01	0.20	0.00	0.17	0.06	0.08	0.18	0.10	0.03	0.02	0.01	0.01	0.27	0.14	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.10	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.04	0.06	0.31	0.19	0.49	0.37
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.29	0.19	0.45	0.34
N3	0.05	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.10	0.09	0.04	0.24	0.17	0.36	0.27
N4	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.10	0.05	0.03	0.22	0.14	0.29	0.23
O2	0.10	0.01	0.10	0.14	0.02	0.15	0.02	0.10	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.12	0.18	0.13	0.27	0.21	0.41	0.31
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.10	0.01	0.09	0.03	0.08	0.04	0.10	0.10	0.12	0.00	0.06	0.01	0.69	0.51	0.75	0.67
O3'	0.04	0.10	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.09	0.05	0.18	0.06	0.00	0.05	0.27	0.11	0.33	0.24
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.13	0.01	0.05	0.00	0.10	0.11	0.24	0.08
O5'	0.28	0.26	0.63	0.45	0.24	0.02	0.26	0.01	0.31	0.29	0.24	0.22	0.27	0.69	0.27	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.19	0.38	0.19	0.16	0.17	0.17	0.27	0.19	0.19	0.17	0.14	0.21	0.51	0.11	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.40	0.63	0.41	0.35	0.19	0.41	0.14	0.49	0.45	0.36	0.29	0.41	0.75	0.33	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.31	0.30	0.58	0.38	0.27	0.06	0.31	0.02	0.37	0.34	0.27	0.23	0.31	0.67	0.24	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00