Doublet Group distance statistics: 54201

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 6, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.014, 0.039, 0.064, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.039 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.013, 0.038, 0.063, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.038 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.125, 0.274, 0.423, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.274 std_dev=0.149
O4'	A	0, 0.099, 0.250, 0.401, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.250 std_dev=0.151
N1	B	0, 0.196, 0.365, 0.533, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.365 std_dev=0.169
O2'	A	0, 0.180, 0.352, 0.525, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.352 std_dev=0.173
C6	B	0, 0.167, 0.352, 0.538, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.352 std_dev=0.185
C1'	B	0, 0.285, 0.487, 0.690, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.487 std_dev=0.202
C2	B	0, 0.189, 0.394, 0.600, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.394 std_dev=0.205
C2'	B	0, 0.232, 0.440, 0.648, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.440 std_dev=0.208
C5	B	0, 0.150, 0.369, 0.588, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.369 std_dev=0.219
N3	B	0, 0.183, 0.411, 0.638, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.411 std_dev=0.227
C4	B	0, 0.157, 0.390, 0.624, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.390 std_dev=0.234
C3'	A	0, 0.193, 0.440, 0.686, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.440 std_dev=0.246
O2'	B	0, 0.331, 0.581, 0.831, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.581 std_dev=0.250
C4'	A	0, 0.134, 0.384, 0.634, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.384 std_dev=0.250
O2	B	0, 0.263, 0.515, 0.766, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.515 std_dev=0.251
P	A	0, 0.337, 0.595, 0.854, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.595 std_dev=0.258
C3'	B	0, 0.319, 0.592, 0.866, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.592 std_dev=0.273
O4'	B	0, 0.291, 0.604, 0.918, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.604 std_dev=0.314
OP1	A	0, 0.363, 0.680, 0.997, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.680 std_dev=0.317
N4	B	0, 0.175, 0.494, 0.813, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.494 std_dev=0.319
OP2	A	0, 0.361, 0.704, 1.047, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.704 std_dev=0.343
O3'	A	0, 0.292, 0.639, 0.986, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.639 std_dev=0.347
C4'	B	0, 0.321, 0.669, 1.018, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.669 std_dev=0.348
O5'	A	0, 0.240, 0.594, 0.947, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.594 std_dev=0.354
O3'	B	0, 0.341, 0.717, 1.094, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.717 std_dev=0.377
C5'	A	0, 0.243, 0.674, 1.106, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.674 std_dev=0.432
C5'	B	0, 0.316, 0.762, 1.208, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.762 std_dev=0.446
P	B	0, 0.240, 0.695, 1.149, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.695 std_dev=0.454
O5'	B	0, 0.225, 0.782, 1.340, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.782 std_dev=0.558
OP1	B	0, 0.251, 1.114, 1.978, 2.988 max_d=2.988 avg_d=1.114 std_dev=0.864
OP2	B	0, 0.467, 1.421, 2.374, 2.833 max_d=2.833 avg_d=1.421 std_dev=0.954

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.40	0.11
C2	0.01	0.00	0.11	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.13	0.07	0.30	0.12	0.33	0.11
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.09	0.04	0.19	0.00	0.01	0.01	0.23	0.30	0.23	0.11
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.11	0.05	0.11	0.11	0.15	0.01	0.01	0.00	0.34	0.43	0.19	0.25
C4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.42	0.15	0.27	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.08	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.17	0.34	0.05
C5	0.01	0.01	0.09	0.10	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.13	0.07	0.43	0.16	0.27	0.17
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.14	0.00	0.17	0.00	0.16	0.08	0.10	0.16	0.08	0.02	0.03	0.00	0.01	0.16	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.11	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.13	0.09	0.38	0.14	0.33	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.29	0.12	0.35	0.11
N3	0.01	0.00	0.09	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.05	0.36	0.13	0.30	0.14
N4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.44	0.17	0.24	0.19
O2	0.03	0.00	0.19	0.15	0.01	0.05	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.19	0.13	0.24	0.12	0.34	0.10
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.03	0.08	0.02	0.09	0.01	0.06	0.04	0.17	0.00	0.02	0.04	0.08	0.28	0.27	0.06
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.12	0.02	0.13	0.03	0.13	0.06	0.14	0.14	0.19	0.02	0.00	0.01	0.34	0.60	0.26	0.37
O4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.05	0.03	0.13	0.04	0.01	0.00	0.13	0.11	0.51	0.23
O5'	0.13	0.30	0.23	0.34	0.42	0.01	0.43	0.01	0.38	0.29	0.36	0.44	0.24	0.08	0.34	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.10	0.12	0.30	0.43	0.15	0.17	0.16	0.16	0.14	0.12	0.13	0.17	0.12	0.28	0.60	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.33	0.23	0.19	0.27	0.34	0.27	0.32	0.33	0.35	0.30	0.24	0.34	0.27	0.26	0.51	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.11	0.11	0.25	0.17	0.05	0.17	0.01	0.14	0.11	0.14	0.19	0.10	0.06	0.37	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.29	0.17	0.22	0.27	0.34	0.19	0.44	0.15	0.22	0.31	0.29	0.31	0.19	0.19	0.34	0.23	0.52	0.47	0.07
C2	0.17	0.29	0.15	0.16	0.23	0.22	0.15	0.33	0.14	0.18	0.32	0.24	0.34	0.22	0.15	0.24	0.28	0.76	0.64	0.09
C2'	0.24	0.28	0.21	0.20	0.25	0.29	0.22	0.35	0.21	0.25	0.28	0.24	0.29	0.25	0.20	0.34	0.27	0.57	0.49	0.15
C3'	0.20	0.14	0.12	0.18	0.08	0.35	0.12	0.45	0.14	0.15	0.10	0.09	0.16	0.19	0.18	0.39	0.15	0.31	0.29	0.01
C4	0.16	0.25	0.18	0.17	0.14	0.13	0.18	0.16	0.12	0.12	0.24	0.20	0.36	0.28	0.23	0.12	0.44	0.76	0.68	0.07
C4'	0.37	0.24	0.32	0.44	0.12	0.58	0.14	0.71	0.23	0.28	0.18	0.11	0.29	0.29	0.42	0.54	0.10	0.14	0.49	0.16
C5	0.17	0.25	0.19	0.18	0.11	0.14	0.12	0.14	0.10	0.12	0.23	0.15	0.34	0.26	0.23	0.14	0.52	0.65	0.67	0.17
C5'	0.61	0.44	0.57	0.70	0.27	0.82	0.31	0.91	0.42	0.49	0.34	0.20	0.49	0.50	0.67	0.74	0.23	0.25	0.70	0.27
C6	0.16	0.27	0.16	0.15	0.15	0.18	0.06	0.23	0.06	0.16	0.26	0.13	0.32	0.21	0.16	0.20	0.48	0.58	0.63	0.17
N1	0.19	0.29	0.16	0.17	0.23	0.25	0.12	0.34	0.12	0.20	0.31	0.22	0.33	0.20	0.15	0.27	0.33	0.64	0.58	0.06
N3	0.15	0.27	0.16	0.14	0.17	0.15	0.17	0.24	0.12	0.14	0.29	0.19	0.36	0.25	0.18	0.17	0.34	0.81	0.68	0.07
N4	0.20	0.22	0.21	0.22	0.19	0.15	0.24	0.13	0.16	0.12	0.18	0.32	0.38	0.31	0.31	0.14	0.47	0.80	0.70	0.09
O2	0.19	0.29	0.16	0.18	0.27	0.28	0.19	0.40	0.18	0.20	0.34	0.31	0.34	0.22	0.16	0.29	0.20	0.77	0.66	0.19
O2'	0.25	0.32	0.19	0.20	0.38	0.29	0.34	0.37	0.28	0.28	0.36	0.40	0.32	0.23	0.19	0.34	0.22	0.52	0.42	0.18
O3'	0.14	0.08	0.12	0.14	0.10	0.30	0.13	0.38	0.11	0.10	0.07	0.12	0.10	0.22	0.17	0.34	0.02	0.02	0.01	0.00
O4'	0.32	0.27	0.29	0.39	0.19	0.50	0.13	0.63	0.18	0.25	0.25	0.21	0.32	0.25	0.35	0.47	0.13	0.30	0.46	0.08
O5'	0.22	0.27	0.23	0.14	0.34	0.24	0.38	0.39	0.36	0.28	0.30	0.36	0.24	0.37	0.11	0.22	0.61	0.33	0.68	0.44
OP1	0.17	0.19	0.20	0.16	0.13	0.15	0.21	0.24	0.21	0.15	0.16	0.13	0.30	0.37	0.25	0.14	0.71	0.56	1.13	0.68
OP2	0.12	0.29	0.10	0.18	0.32	0.21	0.29	0.33	0.24	0.22	0.33	0.35	0.31	0.20	0.21	0.16	0.52	0.26	0.61	0.26
P	0.11	0.15	0.10	0.09	0.14	0.17	0.19	0.30	0.19	0.13	0.14	0.14	0.20	0.27	0.08	0.14	0.61	0.28	0.81	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.23	0.65	0.56	0.10
C2	0.01	0.00	0.10	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.18	0.08	0.09	0.30	0.85	0.77	0.10
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.08	0.05	0.11	0.01	0.07	0.02	0.17	0.00	0.02	0.01	0.45	0.34	0.60	0.21
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.02	0.07	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.01	0.30	0.14	0.52	0.18
C4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.33	0.97	0.90	0.12
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.27	0.25	0.08
C5	0.01	0.01	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.03	0.06	0.33	0.98	0.91	0.13
C5'	0.03	0.11	0.05	0.02	0.12	0.00	0.10	0.00	0.08	0.08	0.12	0.13	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.11	0.28	0.01
C6	0.00	0.01	0.11	0.07	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.04	0.08	0.32	0.93	0.83	0.13
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.30	0.82	0.73	0.11
N3	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.07	0.07	0.33	0.92	0.85	0.11
N4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.34	0.98	0.92	0.12
O2	0.02	0.00	0.17	0.10	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.32	0.12	0.15	0.28	0.78	0.70	0.09
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.04	0.12	0.02	0.15	0.05	0.32	0.00	0.04	0.01	0.48	0.34	0.69	0.27
O3'	0.03	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.07	0.05	0.12	0.04	0.00	0.03	0.15	0.22	0.46	0.11
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.07	0.03	0.15	0.01	0.03	0.00	0.03	0.67	0.51	0.27
O5'	0.23	0.30	0.45	0.30	0.33	0.01	0.33	0.01	0.32	0.30	0.33	0.34	0.28	0.48	0.15	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.65	0.85	0.34	0.14	0.97	0.27	0.98	0.11	0.93	0.82	0.92	0.98	0.78	0.34	0.22	0.67	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.56	0.77	0.60	0.52	0.90	0.25	0.91	0.28	0.83	0.73	0.85	0.92	0.70	0.69	0.46	0.51	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.10	0.21	0.18	0.12	0.08	0.13	0.01	0.13	0.11	0.11	0.12	0.09	0.27	0.11	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00