Doublet Group distance statistics: 54206

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.012, 0.021, 0.029, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.021 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.013, 0.023, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.026 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.036, 0.061, 0.086, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.061 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.017, 0.051, 0.085, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.051 std_dev=0.034
N4	A	0, 0.035, 0.069, 0.103, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.069 std_dev=0.034
O2'	A	0, 0.062, 0.145, 0.228, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.145 std_dev=0.083
C2'	A	0, 0.100, 0.250, 0.400, 0.400 max_d=0.400 avg_d=0.250 std_dev=0.150
O4'	A	0, 0.131, 0.298, 0.465, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.298 std_dev=0.167
C4'	A	0, 0.242, 0.519, 0.796, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.519 std_dev=0.277
C3'	A	0, 0.260, 0.538, 0.816, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.538 std_dev=0.278
O5'	A	0, 0.337, 0.661, 0.984, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.661 std_dev=0.324
O2'	B	0, 0.570, 0.929, 1.288, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.929 std_dev=0.359
P	A	0, 0.496, 0.861, 1.227, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.861 std_dev=0.365
C2'	B	0, 0.551, 0.917, 1.282, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.917 std_dev=0.366
O3'	A	0, 0.382, 0.790, 1.198, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.790 std_dev=0.408
C5'	A	0, 0.348, 0.757, 1.166, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.757 std_dev=0.409
OP2	A	0, 0.575, 1.006, 1.437, 1.491 max_d=1.491 avg_d=1.006 std_dev=0.431
OP1	A	0, 0.557, 1.065, 1.573, 1.646 max_d=1.646 avg_d=1.065 std_dev=0.508
C3'	B	0, 1.011, 1.643, 2.274, 2.057 max_d=2.057 avg_d=1.643 std_dev=0.631
O3'	B	0, 1.127, 1.853, 2.578, 2.391 max_d=2.391 avg_d=1.853 std_dev=0.725
O4'	B	0, 1.256, 2.031, 2.806, 2.456 max_d=2.456 avg_d=2.031 std_dev=0.775
C1'	B	0, 1.288, 2.097, 2.906, 2.663 max_d=2.663 avg_d=2.097 std_dev=0.809
C4'	B	0, 1.337, 2.165, 2.992, 2.684 max_d=2.684 avg_d=2.165 std_dev=0.828
C6	B	0, 1.595, 2.589, 3.583, 3.178 max_d=3.178 avg_d=2.589 std_dev=0.994
N1	B	0, 2.008, 3.248, 4.488, 3.964 max_d=3.964 avg_d=3.248 std_dev=1.240
C5'	B	0, 2.131, 3.441, 4.752, 4.125 max_d=4.125 avg_d=3.441 std_dev=1.310
O5'	B	0, 2.555, 4.123, 5.691, 5.070 max_d=5.070 avg_d=4.123 std_dev=1.568
C5	B	0, 2.553, 4.124, 5.695, 4.926 max_d=4.926 avg_d=4.124 std_dev=1.571
C2	B	0, 3.419, 5.507, 7.595, 6.535 max_d=6.535 avg_d=5.507 std_dev=2.088
P	B	0, 3.807, 6.135, 8.464, 7.300 max_d=7.300 avg_d=6.135 std_dev=2.328
O2	B	0, 3.862, 6.216, 8.570, 7.353 max_d=7.353 avg_d=6.216 std_dev=2.354
C4	B	0, 3.916, 6.310, 8.704, 7.434 max_d=7.434 avg_d=6.310 std_dev=2.394
N3	B	0, 4.338, 6.983, 9.629, 8.205 max_d=8.205 avg_d=6.983 std_dev=2.646
OP2	B	0, 4.438, 7.152, 9.865, 8.507 max_d=8.507 avg_d=7.152 std_dev=2.713
N4	B	0, 4.887, 7.875, 10.863, 9.241 max_d=9.241 avg_d=7.875 std_dev=2.988
OP1	B	0, 4.968, 7.998, 11.028, 9.459 max_d=9.459 avg_d=7.998 std_dev=3.030

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.06	0.08	0.12	0.08
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.03	0.08	0.12	0.20	0.12
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.05	0.03	0.07	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.15	0.07
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.03	0.04	0.08	0.06	0.07	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.14	0.08
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.04	0.08	0.14	0.23	0.14
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.06	0.06	0.03
C5	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.09	0.14	0.23	0.14
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.09	0.13	0.20	0.13
N1	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.12	0.18	0.12
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.09	0.04	0.08	0.13	0.21	0.13
N4	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.08	0.04	0.08	0.15	0.24	0.14
O2	0.04	0.01	0.07	0.07	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.08	0.06	0.08	0.11	0.18	0.11
O2'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.06	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.00	0.03	0.04	0.03	0.08	0.13	0.05
O3'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.08	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.09	0.08	0.08	0.03	0.00	0.02	0.09	0.10	0.16	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.04	0.02	0.00	0.09	0.07	0.13	0.09
O5'	0.06	0.08	0.04	0.06	0.08	0.02	0.09	0.01	0.09	0.08	0.08	0.08	0.08	0.03	0.09	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.12	0.09	0.09	0.14	0.06	0.14	0.04	0.13	0.12	0.13	0.15	0.11	0.08	0.10	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.20	0.15	0.14	0.23	0.06	0.23	0.02	0.20	0.18	0.21	0.24	0.18	0.13	0.16	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.07	0.08	0.14	0.03	0.14	0.02	0.13	0.12	0.13	0.14	0.11	0.05	0.09	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.11	0.22	0.08	0.11	0.14	0.16	0.12	0.07	0.05	0.09	0.19	0.11	0.29	0.10	0.20	0.30	0.34	0.26
C2	0.16	0.27	0.12	0.25	0.13	0.16	0.11	0.24	0.11	0.14	0.25	0.14	0.41	0.12	0.32	0.15	0.31	0.47	0.52	0.41
C2'	0.04	0.08	0.08	0.21	0.07	0.10	0.13	0.18	0.12	0.06	0.07	0.08	0.17	0.09	0.28	0.04	0.23	0.35	0.32	0.28
C3'	0.07	0.06	0.09	0.19	0.12	0.11	0.15	0.14	0.13	0.09	0.08	0.13	0.09	0.09	0.26	0.07	0.15	0.25	0.21	0.18
C4	0.20	0.35	0.13	0.23	0.20	0.15	0.13	0.24	0.12	0.19	0.33	0.20	0.52	0.14	0.29	0.16	0.33	0.51	0.59	0.46
C4'	0.09	0.13	0.12	0.19	0.22	0.11	0.22	0.11	0.18	0.13	0.17	0.25	0.11	0.12	0.25	0.10	0.10	0.17	0.18	0.13
C5	0.16	0.21	0.12	0.21	0.08	0.12	0.11	0.18	0.11	0.12	0.17	0.08	0.36	0.13	0.28	0.14	0.26	0.38	0.46	0.35
C5'	0.11	0.23	0.12	0.15	0.31	0.12	0.28	0.10	0.21	0.19	0.29	0.35	0.20	0.12	0.21	0.09	0.07	0.13	0.15	0.09
C6	0.11	0.12	0.11	0.21	0.07	0.11	0.13	0.16	0.12	0.07	0.08	0.08	0.24	0.11	0.29	0.12	0.22	0.31	0.37	0.28
N1	0.12	0.16	0.11	0.23	0.05	0.13	0.11	0.19	0.11	0.08	0.12	0.06	0.28	0.11	0.31	0.12	0.24	0.36	0.41	0.32
N3	0.19	0.36	0.13	0.24	0.21	0.16	0.13	0.26	0.13	0.19	0.35	0.23	0.52	0.14	0.31	0.16	0.34	0.54	0.61	0.48
N4	0.24	0.47	0.13	0.22	0.30	0.15	0.18	0.27	0.15	0.26	0.46	0.31	0.64	0.15	0.26	0.16	0.39	0.60	0.70	0.55
O2	0.16	0.27	0.12	0.25	0.15	0.17	0.11	0.25	0.11	0.14	0.26	0.16	0.41	0.12	0.33	0.15	0.32	0.49	0.53	0.43
O2'	0.05	0.08	0.08	0.21	0.06	0.09	0.13	0.17	0.12	0.06	0.06	0.07	0.17	0.09	0.27	0.04	0.22	0.35	0.32	0.28
O3'	0.09	0.08	0.09	0.19	0.12	0.13	0.15	0.15	0.13	0.10	0.10	0.13	0.09	0.09	0.26	0.09	0.13	0.24	0.17	0.16
O4'	0.12	0.12	0.16	0.22	0.19	0.15	0.21	0.15	0.17	0.13	0.14	0.22	0.14	0.15	0.29	0.14	0.15	0.19	0.24	0.17
O5'	0.11	0.20	0.11	0.15	0.26	0.12	0.23	0.10	0.19	0.17	0.24	0.29	0.18	0.10	0.20	0.10	0.05	0.12	0.13	0.07
OP1	0.18	0.29	0.17	0.21	0.29	0.28	0.21	0.28	0.16	0.20	0.33	0.33	0.34	0.15	0.26	0.20	0.23	0.26	0.30	0.25
OP2	0.22	0.30	0.20	0.16	0.29	0.20	0.25	0.20	0.23	0.25	0.31	0.30	0.32	0.21	0.14	0.20	0.18	0.18	0.22	0.18
P	0.13	0.27	0.11	0.12	0.29	0.18	0.22	0.17	0.17	0.19	0.31	0.32	0.30	0.11	0.15	0.13	0.13	0.17	0.18	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.10	0.11	0.16	0.10
C2	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.05	0.03	0.15	0.13	0.28	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.07	0.07	0.01	0.05	0.03	0.09	0.00	0.01	0.01	0.18	0.24	0.24	0.20
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.13	0.01	0.12	0.01	0.10	0.08	0.12	0.14	0.07	0.01	0.00	0.01	0.10	0.19	0.10	0.10
C4	0.01	0.02	0.03	0.13	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.07	0.02	0.18	0.15	0.39	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.10	0.02	0.01	0.01	0.09	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.09	0.03	0.18	0.16	0.40	0.21
C5'	0.03	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.06	0.03	0.05	0.08	0.05	0.05	0.06	0.01	0.00	0.12	0.08	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.03	0.17	0.14	0.33	0.19
N1	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01	0.15	0.13	0.26	0.15
N3	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.09	0.05	0.02	0.16	0.14	0.34	0.18
N4	0.01	0.03	0.03	0.14	0.01	0.06	0.02	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.12	0.08	0.02	0.20	0.18	0.44	0.24
O2	0.03	0.01	0.09	0.07	0.04	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.04	0.06	0.00	0.06	0.09	0.07	0.14	0.13	0.24	0.14
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.11	0.10	0.13	0.05	0.11	0.06	0.09	0.12	0.06	0.00	0.04	0.07	0.08	0.18	0.19	0.13
O3'	0.10	0.05	0.01	0.00	0.07	0.02	0.09	0.06	0.07	0.05	0.05	0.08	0.09	0.04	0.00	0.08	0.05	0.12	0.14	0.05
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.07	0.07	0.08	0.00	0.06	0.08	0.04	0.03
O5'	0.10	0.15	0.18	0.10	0.18	0.01	0.18	0.00	0.17	0.15	0.16	0.20	0.14	0.08	0.05	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.13	0.24	0.19	0.15	0.09	0.16	0.12	0.14	0.13	0.14	0.18	0.13	0.18	0.12	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.28	0.24	0.10	0.39	0.06	0.40	0.08	0.33	0.26	0.34	0.44	0.24	0.19	0.14	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.16	0.20	0.10	0.21	0.02	0.21	0.01	0.19	0.15	0.18	0.24	0.14	0.13	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00