Doublet Group distance statistics: 54208

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.012, 0.022, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.020 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.007, 0.032, 0.056, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.006, 0.032, 0.059, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.032 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.012, 0.042, 0.072, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.042 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.054, 0.155, 0.255, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.155 std_dev=0.100
C2'	A	0, 0.041, 0.147, 0.254, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.147 std_dev=0.107
O2'	A	0, 0.034, 0.174, 0.313, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.174 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.073, 0.215, 0.358, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.215 std_dev=0.143
C3'	A	0, 0.074, 0.224, 0.373, 0.447 max_d=0.447 avg_d=0.224 std_dev=0.149
O5'	A	0, 0.085, 0.258, 0.430, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.258 std_dev=0.173
O3'	A	0, 0.098, 0.321, 0.543, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.321 std_dev=0.222
O3'	B	0, 0.131, 0.355, 0.580, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.355 std_dev=0.225
C5'	A	0, 0.125, 0.361, 0.598, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.361 std_dev=0.236
C4'	B	0, 0.151, 0.391, 0.630, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.391 std_dev=0.240
O4'	B	0, 0.158, 0.403, 0.649, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.403 std_dev=0.246
C3'	B	0, 0.159, 0.411, 0.663, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.411 std_dev=0.252
O2'	B	0, 0.069, 0.338, 0.606, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.338 std_dev=0.269
C2'	B	0, 0.121, 0.407, 0.692, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.407 std_dev=0.286
C1'	B	0, 0.129, 0.431, 0.733, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.431 std_dev=0.302
P	A	0, 0.223, 0.540, 0.858, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.540 std_dev=0.317
C5'	B	0, 0.176, 0.497, 0.817, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.497 std_dev=0.320
OP1	A	0, 0.271, 0.664, 1.057, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.664 std_dev=0.393
N1	B	0, 0.144, 0.566, 0.989, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.566 std_dev=0.423
OP2	A	0, 0.295, 0.724, 1.152, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.724 std_dev=0.428
O5'	B	0, 0.205, 0.648, 1.092, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.648 std_dev=0.443
C6	B	0, 0.164, 0.614, 1.065, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.614 std_dev=0.451
OP2	B	0, 0.265, 0.757, 1.249, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.757 std_dev=0.492
C2	B	0, 0.140, 0.636, 1.132, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.636 std_dev=0.496
O2	B	0, 0.124, 0.628, 1.132, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.628 std_dev=0.504
P	B	0, 0.268, 0.773, 1.277, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.773 std_dev=0.504
C5	B	0, 0.176, 0.704, 1.231, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.704 std_dev=0.528
OP1	B	0, 0.299, 0.860, 1.421, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.860 std_dev=0.561
N3	B	0, 0.156, 0.724, 1.292, 1.819 max_d=1.819 avg_d=0.724 std_dev=0.568
C4	B	0, 0.177, 0.753, 1.330, 1.826 max_d=1.826 avg_d=0.753 std_dev=0.576
N4	B	0, 0.209, 0.836, 1.464, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.836 std_dev=0.628

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.23	0.09
C2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.02	0.04	0.08	0.19	0.06
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.06	0.11	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.22	0.06
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.09	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.20	0.04
C4	0.04	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.03	0.03	0.09	0.03	0.13	0.03
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.08	0.02	0.00	0.01	0.02	0.09	0.17	0.05
C5	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.10	0.02	0.14	0.05
C5'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.07	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01
C6	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.05	0.20	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.21	0.08
N3	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.06	0.02	0.08	0.05	0.14	0.03
N4	0.04	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.04	0.04	0.10	0.03	0.11	0.03
O2	0.05	0.01	0.11	0.09	0.02	0.08	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.14	0.12	0.05	0.03	0.12	0.22	0.09
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.08	0.14	0.00	0.02	0.02	0.02	0.10	0.21	0.05
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.12	0.02	0.00	0.01	0.13	0.09	0.17	0.03
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.12	0.13	0.23	0.12
O5'	0.03	0.04	0.04	0.10	0.09	0.02	0.10	0.01	0.05	0.02	0.08	0.10	0.03	0.02	0.13	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.08	0.09	0.08	0.03	0.09	0.02	0.09	0.05	0.07	0.05	0.03	0.12	0.10	0.09	0.13	0.02	0.00	0.04	0.02
OP2	0.23	0.19	0.22	0.20	0.13	0.17	0.14	0.10	0.20	0.21	0.14	0.11	0.22	0.21	0.17	0.23	0.02	0.04	0.00	0.02
P	0.09	0.06	0.06	0.04	0.03	0.05	0.05	0.01	0.07	0.08	0.03	0.03	0.09	0.05	0.03	0.12	0.01	0.02	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.07	0.06	0.06	0.09	0.07	0.12	0.09	0.12	0.09	0.07	0.09	0.07	0.06	0.06	0.07	0.23	0.23	0.24	0.23
C2	0.10	0.10	0.10	0.04	0.06	0.04	0.06	0.06	0.07	0.09	0.08	0.05	0.13	0.13	0.02	0.06	0.14	0.15	0.18	0.15
C2'	0.07	0.07	0.05	0.07	0.09	0.08	0.12	0.11	0.12	0.09	0.07	0.09	0.07	0.06	0.07	0.07	0.24	0.24	0.25	0.24
C3'	0.07	0.07	0.06	0.06	0.10	0.06	0.12	0.09	0.12	0.09	0.08	0.09	0.07	0.07	0.05	0.07	0.23	0.24	0.25	0.24
C4	0.13	0.13	0.11	0.05	0.11	0.03	0.11	0.02	0.11	0.13	0.12	0.11	0.14	0.13	0.02	0.09	0.08	0.09	0.10	0.08
C4'	0.07	0.07	0.06	0.06	0.10	0.06	0.12	0.07	0.12	0.09	0.07	0.09	0.06	0.07	0.04	0.06	0.22	0.24	0.24	0.23
C5	0.08	0.08	0.06	0.04	0.07	0.04	0.07	0.05	0.07	0.08	0.08	0.07	0.10	0.06	0.06	0.04	0.15	0.12	0.13	0.13
C5'	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.10	0.05	0.10	0.07	0.05	0.07	0.05	0.08	0.05	0.05	0.19	0.22	0.22	0.20
C6	0.07	0.08	0.06	0.06	0.08	0.06	0.09	0.07	0.10	0.09	0.08	0.07	0.09	0.06	0.07	0.06	0.21	0.18	0.19	0.19
N1	0.06	0.06	0.05	0.05	0.06	0.05	0.08	0.07	0.08	0.07	0.05	0.06	0.07	0.07	0.05	0.05	0.20	0.19	0.21	0.20
N3	0.15	0.15	0.14	0.06	0.12	0.05	0.11	0.04	0.11	0.14	0.14	0.11	0.17	0.16	0.02	0.10	0.09	0.10	0.13	0.10
N4	0.17	0.17	0.15	0.06	0.15	0.04	0.15	0.02	0.15	0.17	0.16	0.15	0.18	0.16	0.02	0.12	0.04	0.07	0.07	0.04
O2	0.12	0.12	0.13	0.06	0.07	0.05	0.06	0.07	0.07	0.10	0.10	0.06	0.15	0.17	0.04	0.08	0.14	0.17	0.20	0.17
O2'	0.07	0.07	0.05	0.07	0.10	0.08	0.12	0.11	0.12	0.09	0.07	0.09	0.07	0.06	0.08	0.07	0.24	0.24	0.26	0.24
O3'	0.07	0.07	0.06	0.06	0.10	0.06	0.12	0.09	0.12	0.09	0.08	0.09	0.07	0.08	0.05	0.07	0.22	0.24	0.25	0.24
O4'	0.09	0.09	0.08	0.09	0.12	0.09	0.15	0.10	0.15	0.12	0.09	0.11	0.08	0.07	0.08	0.09	0.26	0.26	0.27	0.26
O5'	0.08	0.13	0.07	0.08	0.17	0.09	0.17	0.11	0.15	0.12	0.15	0.17	0.11	0.08	0.10	0.07	0.12	0.17	0.15	0.13
OP1	0.15	0.20	0.13	0.10	0.24	0.08	0.25	0.07	0.24	0.21	0.22	0.23	0.18	0.09	0.07	0.12	0.24	0.29	0.23	0.25
OP2	0.13	0.14	0.11	0.09	0.11	0.09	0.11	0.07	0.14	0.14	0.13	0.09	0.14	0.10	0.07	0.12	0.17	0.15	0.15	0.15
P	0.13	0.17	0.11	0.08	0.18	0.06	0.19	0.05	0.19	0.17	0.18	0.17	0.15	0.08	0.05	0.10	0.21	0.22	0.18	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.10	0.08	0.10
C2	0.04	0.00	0.07	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.05	0.03	0.12	0.11	0.10	0.12
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.04	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05
C3'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.04	0.05	0.09	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.04	0.03
C4	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.06	0.01	0.11	0.07	0.06	0.08
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.00	0.02	0.04	0.07	0.03	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.10	0.02	0.12	0.07	0.05	0.08
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.05	0.02	0.02	0.06	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.14	0.10	0.08	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.14	0.11	0.10	0.12
N3	0.04	0.01	0.06	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.05	0.02	0.11	0.09	0.09	0.10
N4	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.08	0.07	0.01	0.09	0.04	0.03	0.05
O2	0.05	0.01	0.11	0.09	0.02	0.07	0.03	0.06	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.15	0.11	0.04	0.12	0.12	0.12	0.12
O2'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.09	0.08	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03
O3'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.08	0.02	0.05	0.07	0.11	0.02	0.00	0.00	0.15	0.12	0.09	0.10
O4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.08	0.10
O5'	0.11	0.12	0.02	0.06	0.11	0.01	0.12	0.01	0.14	0.14	0.11	0.09	0.12	0.02	0.15	0.12	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.10	0.11	0.05	0.06	0.07	0.05	0.07	0.05	0.10	0.11	0.09	0.04	0.12	0.06	0.12	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.10	0.04	0.04	0.06	0.03	0.05	0.02	0.08	0.10	0.09	0.03	0.12	0.04	0.09	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.12	0.05	0.03	0.08	0.02	0.08	0.02	0.10	0.12	0.10	0.05	0.12	0.03	0.10	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00