Doublet Group distance statistics: 54210

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.005, 0.031, 0.056, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.012, 0.041, 0.070, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.041 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.015, 0.048, 0.081, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.048 std_dev=0.033
O2	A	0, 0.025, 0.103, 0.181, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.103 std_dev=0.078
O4'	A	0, -0.001, 0.080, 0.162, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.080 std_dev=0.081
C3'	A	0, 0.020, 0.120, 0.219, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.120 std_dev=0.099
C2'	A	0, 0.016, 0.118, 0.220, 0.277 max_d=0.277 avg_d=0.118 std_dev=0.102
C4'	A	0, 0.042, 0.182, 0.322, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.182 std_dev=0.140
O3'	A	0, 0.009, 0.153, 0.298, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.153 std_dev=0.145
O4'	B	0, 0.098, 0.304, 0.510, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.304 std_dev=0.206
O2'	B	0, 0.073, 0.283, 0.493, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.283 std_dev=0.210
C1'	B	0, 0.088, 0.303, 0.519, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.303 std_dev=0.216
C4'	B	0, 0.080, 0.304, 0.528, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.304 std_dev=0.224
C2'	B	0, 0.083, 0.318, 0.552, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.318 std_dev=0.234
C5'	A	0, 0.084, 0.322, 0.559, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.322 std_dev=0.237
C5'	B	0, 0.115, 0.356, 0.597, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.356 std_dev=0.241
P	A	0, 0.059, 0.300, 0.541, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.300 std_dev=0.241
O2	B	0, 0.084, 0.331, 0.579, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.331 std_dev=0.247
O2'	A	0, -0.017, 0.238, 0.493, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.238 std_dev=0.255
C3'	B	0, 0.076, 0.335, 0.595, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.335 std_dev=0.259
O5'	A	0, 0.093, 0.362, 0.632, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.362 std_dev=0.270
N1	B	0, 0.075, 0.347, 0.619, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.347 std_dev=0.272
OP2	A	0, 0.074, 0.352, 0.630, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.352 std_dev=0.278
C2	B	0, 0.071, 0.352, 0.633, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.352 std_dev=0.281
O3'	B	0, 0.051, 0.333, 0.615, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.333 std_dev=0.282
OP1	A	0, 0.087, 0.402, 0.718, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.402 std_dev=0.316
O5'	B	0, 0.139, 0.458, 0.776, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.458 std_dev=0.318
C6	B	0, 0.077, 0.397, 0.716, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.397 std_dev=0.319
N3	B	0, 0.055, 0.388, 0.722, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.388 std_dev=0.333
C5	B	0, 0.068, 0.434, 0.800, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.434 std_dev=0.366
C4	B	0, 0.056, 0.429, 0.803, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.429 std_dev=0.374
P	B	0, 0.098, 0.492, 0.887, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.492 std_dev=0.395
N4	B	0, 0.054, 0.485, 0.916, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.485 std_dev=0.431
OP1	B	0, 0.068, 0.525, 0.983, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.525 std_dev=0.457
OP2	B	0, 0.070, 0.587, 1.105, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.587 std_dev=0.517

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.02	0.09	0.01	0.07	0.01	0.04	0.38	0.11	0.16
C2	0.04	0.00	0.04	0.04	0.02	0.07	0.03	0.16	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.15	0.36	0.19	0.18
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.02	0.02	0.14	0.49	0.16	0.26
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.07	0.02	0.00	0.01	0.12	0.33	0.05	0.16
C4	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.08	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.10	0.05	0.04	0.19	0.32	0.19	0.16
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.05	0.07	0.09	0.09	0.02	0.01	0.01	0.02	0.19	0.09	0.07
C5	0.01	0.03	0.04	0.05	0.01	0.10	0.00	0.25	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.16	0.05	0.03	0.17	0.32	0.17	0.14
C5'	0.07	0.16	0.05	0.01	0.22	0.01	0.25	0.00	0.23	0.16	0.18	0.23	0.14	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.04	0.02
C6	0.02	0.02	0.04	0.05	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.15	0.05	0.03	0.13	0.35	0.15	0.14
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.06	0.01	0.11	0.37	0.16	0.17
N3	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.02	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.06	0.05	0.18	0.34	0.20	0.18
N4	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.09	0.01	0.23	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.12	0.05	0.04	0.21	0.28	0.20	0.16
O2	0.09	0.01	0.09	0.07	0.03	0.09	0.03	0.14	0.03	0.03	0.03	0.05	0.00	0.12	0.04	0.09	0.15	0.34	0.19	0.18
O2'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.10	0.02	0.16	0.04	0.15	0.06	0.05	0.12	0.12	0.00	0.05	0.03	0.17	0.55	0.19	0.31
O3'	0.07	0.06	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.06	0.06	0.05	0.04	0.05	0.00	0.04	0.08	0.27	0.10	0.10
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.05	0.04	0.09	0.03	0.04	0.00	0.05	0.27	0.08	0.09
O5'	0.04	0.15	0.14	0.12	0.19	0.02	0.17	0.01	0.13	0.11	0.18	0.21	0.15	0.17	0.08	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.38	0.36	0.49	0.33	0.32	0.19	0.32	0.09	0.35	0.37	0.34	0.28	0.34	0.55	0.27	0.27	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.19	0.16	0.05	0.19	0.09	0.17	0.04	0.15	0.16	0.20	0.20	0.19	0.19	0.10	0.08	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.18	0.26	0.16	0.16	0.07	0.14	0.02	0.14	0.17	0.18	0.16	0.18	0.31	0.10	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.14	0.14	0.06	0.15	0.05	0.16	0.05	0.15	0.13	0.15	0.15	0.13	0.20	0.02	0.12	0.05	0.14	0.11	0.03
C2	0.06	0.07	0.09	0.04	0.09	0.04	0.11	0.06	0.10	0.06	0.08	0.09	0.08	0.17	0.07	0.06	0.08	0.17	0.05	0.05
C2'	0.16	0.17	0.21	0.14	0.17	0.11	0.19	0.09	0.19	0.17	0.17	0.17	0.15	0.26	0.12	0.16	0.08	0.11	0.16	0.09
C3'	0.09	0.11	0.08	0.03	0.11	0.05	0.12	0.05	0.12	0.10	0.11	0.11	0.10	0.10	0.03	0.14	0.05	0.16	0.09	0.01
C4	0.03	0.04	0.05	0.09	0.10	0.09	0.12	0.11	0.09	0.05	0.05	0.11	0.08	0.12	0.12	0.07	0.13	0.20	0.07	0.11
C4'	0.10	0.07	0.05	0.10	0.07	0.12	0.10	0.12	0.11	0.08	0.06	0.07	0.08	0.04	0.14	0.17	0.11	0.25	0.05	0.10
C5	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.08	0.13	0.09	0.10	0.06	0.06	0.12	0.08	0.13	0.12	0.08	0.10	0.15	0.03	0.05
C5'	0.22	0.17	0.19	0.25	0.17	0.26	0.20	0.26	0.21	0.20	0.15	0.17	0.17	0.17	0.27	0.27	0.24	0.37	0.21	0.25
C6	0.04	0.05	0.08	0.05	0.09	0.04	0.12	0.05	0.11	0.06	0.07	0.10	0.06	0.16	0.09	0.08	0.07	0.13	0.08	0.02
N1	0.07	0.08	0.11	0.05	0.10	0.03	0.12	0.05	0.11	0.08	0.09	0.11	0.09	0.18	0.06	0.08	0.06	0.15	0.07	0.02
N3	0.04	0.03	0.06	0.06	0.07	0.06	0.10	0.09	0.08	0.03	0.04	0.09	0.07	0.15	0.09	0.05	0.11	0.21	0.06	0.10
N4	0.07	0.09	0.07	0.13	0.14	0.13	0.16	0.17	0.12	0.09	0.10	0.16	0.12	0.09	0.16	0.10	0.19	0.26	0.16	0.19
O2	0.06	0.08	0.10	0.05	0.09	0.04	0.11	0.06	0.10	0.07	0.09	0.10	0.09	0.17	0.06	0.07	0.07	0.18	0.05	0.05
O2'	0.35	0.37	0.39	0.32	0.37	0.26	0.38	0.23	0.38	0.37	0.37	0.37	0.35	0.41	0.28	0.30	0.22	0.19	0.34	0.26
O3'	0.14	0.19	0.14	0.08	0.20	0.06	0.19	0.06	0.18	0.17	0.21	0.21	0.18	0.15	0.04	0.14	0.05	0.10	0.17	0.07
O4'	0.10	0.10	0.09	0.08	0.12	0.10	0.15	0.09	0.15	0.11	0.11	0.12	0.08	0.12	0.08	0.16	0.09	0.22	0.04	0.07
O5'	0.15	0.16	0.10	0.11	0.15	0.12	0.15	0.13	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.11	0.15	0.17	0.10	0.29	0.07	0.12
OP1	0.27	0.32	0.25	0.19	0.28	0.23	0.26	0.23	0.26	0.28	0.31	0.28	0.34	0.26	0.13	0.24	0.23	0.03	0.23	0.18
OP2	0.20	0.26	0.22	0.18	0.26	0.15	0.24	0.17	0.23	0.23	0.27	0.26	0.26	0.18	0.17	0.17	0.21	0.09	0.25	0.18
P	0.17	0.22	0.15	0.08	0.21	0.07	0.19	0.06	0.18	0.19	0.22	0.21	0.23	0.15	0.04	0.14	0.08	0.14	0.12	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.07	0.07	0.18	0.09
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.13	0.09	0.17	0.08
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.12	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.10	0.05
C4	0.03	0.01	0.02	0.06	0.00	0.07	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.04	0.18	0.12	0.16	0.11
C4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.03	0.05	0.07	0.03	0.05	0.01	0.01	0.03	0.10	0.11	0.05
C5	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.06	0.20	0.11	0.15	0.11
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.13	0.01	0.16	0.00	0.13	0.08	0.10	0.14	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.09	0.04	0.01
C6	0.03	0.02	0.03	0.07	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.06	0.06	0.17	0.08	0.15	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.13	0.08	0.16	0.07
N3	0.03	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.02	0.10	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.03	0.15	0.11	0.17	0.10
N4	0.03	0.02	0.02	0.06	0.00	0.07	0.02	0.14	0.03	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.04	0.19	0.12	0.15	0.12
O2	0.04	0.01	0.05	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.04	0.00	0.06	0.06	0.05	0.11	0.09	0.17	0.08
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.00	0.04	0.04	0.04	0.10	0.13	0.07
O3'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.06	0.02	0.06	0.06	0.06	0.04	0.00	0.01	0.08	0.17	0.08	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.07	0.06	0.22	0.13
O5'	0.07	0.13	0.04	0.03	0.18	0.03	0.20	0.01	0.17	0.13	0.15	0.19	0.11	0.04	0.08	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.07	0.09	0.12	0.14	0.12	0.10	0.11	0.09	0.08	0.08	0.11	0.12	0.09	0.10	0.17	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.17	0.12	0.10	0.16	0.11	0.15	0.04	0.15	0.16	0.17	0.15	0.17	0.13	0.08	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.08	0.06	0.05	0.11	0.05	0.11	0.01	0.07	0.07	0.10	0.12	0.08	0.07	0.05	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00