Doublet Group distance statistics: 54211

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.002, 0.010, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.001, 0.013, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.001, 0.014, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.019 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.005, 0.035, 0.066, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.035 std_dev=0.030
C3'	B	0, 0.059, 0.195, 0.331, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.195 std_dev=0.136
C4'	B	0, 0.051, 0.211, 0.371, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.211 std_dev=0.160
O4'	B	0, 0.024, 0.187, 0.350, 0.466 max_d=0.466 avg_d=0.187 std_dev=0.163
O3'	B	0, 0.084, 0.265, 0.445, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.265 std_dev=0.180
C2'	B	0, 0.030, 0.249, 0.468, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.249 std_dev=0.219
C1'	B	0, 0.000, 0.236, 0.472, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.236 std_dev=0.236
O2'	B	0, 0.011, 0.277, 0.544, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.277 std_dev=0.267
OP1	A	0, 0.085, 0.384, 0.684, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.384 std_dev=0.300
C5'	B	0, 0.024, 0.328, 0.633, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.328 std_dev=0.304
N1	B	0, -0.076, 0.311, 0.699, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.311 std_dev=0.387
O5'	B	0, -0.022, 0.379, 0.780, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.379 std_dev=0.401
P	A	0, 0.043, 0.463, 0.882, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.463 std_dev=0.419
C6	B	0, -0.120, 0.340, 0.800, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.340 std_dev=0.460
C2	B	0, -0.052, 0.449, 0.951, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.449 std_dev=0.502
O2	B	0, -0.006, 0.501, 1.009, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.501 std_dev=0.508
OP2	A	0, 0.005, 0.521, 1.038, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.521 std_dev=0.516
O5'	A	0, 0.014, 0.545, 1.076, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.545 std_dev=0.531
O4'	A	0, -0.152, 0.407, 0.966, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.407 std_dev=0.559
C2'	A	0, -0.168, 0.410, 0.989, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.410 std_dev=0.579
P	B	0, -0.030, 0.550, 1.129, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.550 std_dev=0.579
C5	B	0, -0.118, 0.488, 1.094, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.488 std_dev=0.606
OP1	B	0, -0.019, 0.610, 1.239, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.610 std_dev=0.629
OP2	B	0, -0.036, 0.595, 1.226, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.595 std_dev=0.631
N3	B	0, -0.070, 0.569, 1.209, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.569 std_dev=0.639
C3'	A	0, -0.137, 0.510, 1.158, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.510 std_dev=0.648
C4'	A	0, -0.137, 0.523, 1.183, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.523 std_dev=0.660
C4	B	0, -0.096, 0.585, 1.266, 1.886 max_d=1.886 avg_d=0.585 std_dev=0.681
O3'	A	0, -0.150, 0.592, 1.334, 2.022 max_d=2.022 avg_d=0.592 std_dev=0.742
N4	B	0, -0.077, 0.741, 1.560, 2.289 max_d=2.289 avg_d=0.741 std_dev=0.819
O2'	A	0, -0.312, 0.645, 1.602, 2.538 max_d=2.538 avg_d=0.645 std_dev=0.957
C5'	A	0, -0.222, 0.772, 1.765, 2.700 max_d=2.700 avg_d=0.772 std_dev=0.994

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.24	0.00	0.15	0.05	0.12	0.04
C2	0.02	0.00	0.11	0.05	0.01	0.15	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.20	0.23	0.10	0.08	0.07	0.04
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.16	0.21	0.19	0.03	0.08	0.07	0.21	0.01	0.03	0.02	0.23	0.52	0.28	0.43
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.17	0.08	0.08	0.15	0.08	0.01	0.01	0.04	0.30	0.43	0.26	0.36
C4	0.00	0.01	0.06	0.14	0.00	0.04	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.05	0.04	0.17	0.09	0.09	0.06
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.13	0.04	0.27	0.23	0.04	0.00	0.03	0.17	0.09	0.03
C5	0.02	0.00	0.16	0.18	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.47	0.04	0.12	0.24	0.11	0.15	0.11
C5'	0.10	0.33	0.21	0.01	0.25	0.01	0.13	0.00	0.09	0.18	0.34	0.26	0.43	0.05	0.17	0.02	0.02	0.34	0.21	0.03
C6	0.02	0.00	0.19	0.17	0.00	0.12	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.48	0.03	0.18	0.25	0.09	0.16	0.11
N1	0.00	0.00	0.03	0.08	0.01	0.01	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.13	0.02	0.17	0.06	0.11	0.05
N3	0.01	0.00	0.08	0.08	0.00	0.13	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.17	0.11	0.08	0.06	0.03
N4	0.00	0.01	0.07	0.15	0.00	0.04	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.28	0.03	0.04	0.17	0.10	0.09	0.06
O2	0.03	0.00	0.21	0.08	0.01	0.27	0.01	0.43	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.37	0.31	0.39	0.08	0.10	0.07	0.09
O2'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.26	0.23	0.47	0.05	0.48	0.15	0.06	0.28	0.37	0.00	0.03	0.11	0.02	0.30	0.09	0.25
O3'	0.24	0.20	0.03	0.01	0.05	0.04	0.04	0.17	0.03	0.13	0.14	0.03	0.31	0.03	0.00	0.18	0.23	0.30	0.09	0.22
O4'	0.00	0.23	0.02	0.04	0.04	0.00	0.12	0.02	0.18	0.02	0.17	0.04	0.39	0.11	0.18	0.00	0.33	0.18	0.33	0.28
O5'	0.15	0.10	0.23	0.30	0.17	0.03	0.24	0.02	0.25	0.17	0.11	0.17	0.08	0.02	0.23	0.33	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.08	0.52	0.43	0.09	0.17	0.11	0.34	0.09	0.06	0.08	0.10	0.10	0.30	0.30	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.07	0.28	0.26	0.09	0.09	0.15	0.21	0.16	0.11	0.06	0.09	0.07	0.09	0.09	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.04	0.43	0.36	0.06	0.03	0.11	0.03	0.11	0.05	0.03	0.06	0.09	0.25	0.22	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.27	0.21	0.12	0.27	0.10	0.23	0.14	0.21	0.22	0.29	0.28	0.30	0.22	0.08	0.13	0.12	0.16	0.12	0.14
C2	0.14	0.17	0.17	0.09	0.14	0.05	0.11	0.12	0.10	0.13	0.17	0.14	0.21	0.22	0.10	0.07	0.11	0.17	0.15	0.16
C2'	0.68	0.69	0.74	0.64	0.66	0.54	0.64	0.47	0.64	0.67	0.68	0.66	0.71	0.74	0.63	0.56	0.50	0.47	0.47	0.47
C3'	0.12	0.06	0.18	0.14	0.04	0.17	0.07	0.20	0.09	0.07	0.06	0.04	0.08	0.20	0.19	0.16	0.17	0.19	0.17	0.18
C4	0.08	0.07	0.11	0.07	0.03	0.05	0.04	0.12	0.04	0.04	0.06	0.03	0.11	0.16	0.10	0.03	0.13	0.19	0.17	0.17
C4'	0.13	0.13	0.08	0.09	0.12	0.18	0.12	0.22	0.13	0.12	0.13	0.12	0.14	0.06	0.08	0.19	0.19	0.19	0.21	0.20
C5	0.09	0.09	0.12	0.09	0.07	0.08	0.07	0.12	0.07	0.07	0.08	0.07	0.11	0.15	0.10	0.06	0.12	0.17	0.13	0.14
C5'	0.18	0.24	0.14	0.13	0.22	0.21	0.19	0.25	0.18	0.20	0.25	0.24	0.29	0.13	0.16	0.20	0.22	0.28	0.22	0.23
C6	0.15	0.17	0.17	0.11	0.16	0.09	0.15	0.13	0.14	0.15	0.17	0.17	0.19	0.18	0.10	0.10	0.11	0.16	0.11	0.13
N1	0.17	0.20	0.18	0.10	0.19	0.07	0.16	0.13	0.15	0.17	0.21	0.20	0.23	0.21	0.09	0.10	0.11	0.16	0.12	0.13
N3	0.10	0.11	0.14	0.08	0.07	0.04	0.05	0.12	0.05	0.07	0.10	0.07	0.15	0.19	0.10	0.04	0.13	0.19	0.18	0.18
N4	0.04	0.05	0.08	0.05	0.06	0.04	0.08	0.11	0.07	0.03	0.06	0.07	0.08	0.13	0.10	0.01	0.15	0.21	0.22	0.20
O2	0.16	0.20	0.19	0.10	0.16	0.05	0.13	0.13	0.12	0.15	0.20	0.17	0.24	0.24	0.10	0.07	0.12	0.18	0.15	0.17
O2'	1.16	1.31	1.09	0.94	1.33	0.85	1.27	0.76	1.21	1.24	1.35	1.35	1.32	0.98	0.80	1.00	0.87	0.75	0.90	0.84
O3'	0.11	0.01	0.12	0.11	0.01	0.15	0.06	0.18	0.09	0.07	0.02	0.02	0.02	0.10	0.13	0.15	0.16	0.18	0.16	0.16
O4'	0.24	0.24	0.23	0.27	0.22	0.31	0.21	0.33	0.23	0.23	0.23	0.22	0.25	0.22	0.27	0.28	0.32	0.28	0.33	0.31
O5'	0.24	0.14	0.20	0.26	0.16	0.36	0.21	0.39	0.23	0.20	0.12	0.15	0.09	0.20	0.26	0.33	0.36	0.36	0.38	0.37
OP1	0.14	0.11	0.14	0.14	0.11	0.23	0.14	0.26	0.15	0.12	0.11	0.10	0.13	0.17	0.16	0.19	0.23	0.26	0.24	0.25
OP2	0.16	0.04	0.13	0.17	0.05	0.26	0.10	0.28	0.13	0.11	0.02	0.04	0.02	0.15	0.19	0.23	0.24	0.25	0.25	0.25
P	0.15	0.04	0.14	0.18	0.06	0.27	0.12	0.30	0.14	0.11	0.02	0.05	0.02	0.14	0.21	0.23	0.26	0.27	0.28	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02
C2	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02
C2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01
C3'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.06	0.03	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.08	0.03
C4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04
C4'	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04
C5'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.02	0.07	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02
C6	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03	0.04	0.05	0.02
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02
N3	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03
N4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03	0.05	0.04	0.04	0.04
O2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.05	0.01	0.03	0.05	0.04	0.02
O2'	0.03	0.08	0.00	0.03	0.06	0.08	0.03	0.07	0.02	0.04	0.08	0.07	0.11	0.00	0.09	0.04	0.05	0.07	0.07	0.05
O3'	0.02	0.05	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.06	0.04	0.06	0.08	0.05	0.09	0.00	0.01	0.03	0.04	0.08	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.03
O5'	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.04	0.04	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.04	0.08	0.08	0.04	0.04	0.04	0.01	0.05	0.05	0.04	0.04	0.04	0.07	0.08	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00