Doublet Group distance statistics: 54215

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, -0.003, 0.009, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.009 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.002, 0.019, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.022
N3	A	0, -0.002, 0.021, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.023
N1	A	0, -0.002, 0.022, 0.047, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.001, 0.029, 0.057, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.029 std_dev=0.028
C1'	A	0, -0.002, 0.030, 0.061, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.030 std_dev=0.031
O2	A	0, 0.002, 0.064, 0.126, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.064 std_dev=0.062
N4	A	0, 0.001, 0.071, 0.140, 0.165 max_d=0.165 avg_d=0.071 std_dev=0.069
O4'	A	0, 0.019, 0.141, 0.263, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.141 std_dev=0.122
O3'	B	0, 0.053, 0.184, 0.314, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.184 std_dev=0.130
C2'	A	0, 0.025, 0.183, 0.342, 0.387 max_d=0.387 avg_d=0.183 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.053, 0.236, 0.418, 0.444 max_d=0.444 avg_d=0.236 std_dev=0.182
O2'	A	0, 0.060, 0.250, 0.440, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.250 std_dev=0.190
C4'	B	0, 0.084, 0.288, 0.492, 0.446 max_d=0.446 avg_d=0.288 std_dev=0.204
P	A	0, 0.076, 0.288, 0.501, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.288 std_dev=0.212
C3'	A	0, 0.063, 0.303, 0.542, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.303 std_dev=0.239
C3'	B	0, 0.084, 0.328, 0.572, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.328 std_dev=0.244
O4'	B	0, 0.099, 0.364, 0.630, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.364 std_dev=0.266
O3'	A	0, 0.117, 0.466, 0.815, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.466 std_dev=0.349
C5'	A	0, 0.022, 0.385, 0.747, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.385 std_dev=0.363
O2'	B	0, 0.097, 0.460, 0.823, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.460 std_dev=0.363
C2'	B	0, 0.112, 0.484, 0.856, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.484 std_dev=0.372
O5'	A	0, 0.094, 0.503, 0.912, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.503 std_dev=0.409
OP1	A	0, 0.148, 0.559, 0.969, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.559 std_dev=0.410
C5'	B	0, 0.168, 0.610, 1.052, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.610 std_dev=0.442
C1'	B	0, 0.131, 0.582, 1.033, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.582 std_dev=0.451
OP2	A	0, 0.041, 0.608, 1.175, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.608 std_dev=0.567
O5'	B	0, 0.240, 0.880, 1.520, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.880 std_dev=0.640
N1	B	0, 0.248, 1.023, 1.797, 1.873 max_d=1.873 avg_d=1.023 std_dev=0.774
P	B	0, 0.354, 1.288, 2.222, 2.183 max_d=2.183 avg_d=1.288 std_dev=0.934
C6	B	0, 0.316, 1.297, 2.278, 2.373 max_d=2.373 avg_d=1.297 std_dev=0.981
C2	B	0, 0.307, 1.310, 2.314, 2.437 max_d=2.437 avg_d=1.310 std_dev=1.003
O2	B	0, 0.288, 1.327, 2.366, 2.536 max_d=2.536 avg_d=1.327 std_dev=1.039
OP1	B	0, 0.430, 1.555, 2.680, 2.625 max_d=2.625 avg_d=1.555 std_dev=1.125
OP2	B	0, 0.450, 1.622, 2.793, 2.725 max_d=2.725 avg_d=1.622 std_dev=1.171
N3	B	0, 0.399, 1.690, 2.981, 3.134 max_d=3.134 avg_d=1.690 std_dev=1.291
C5	B	0, 0.411, 1.714, 3.017, 3.156 max_d=3.156 avg_d=1.714 std_dev=1.303
C4	B	0, 0.446, 1.861, 3.275, 3.428 max_d=3.428 avg_d=1.861 std_dev=1.415
N4	B	0, 0.533, 2.271, 4.009, 4.220 max_d=4.220 avg_d=2.271 std_dev=1.738

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.34	0.40	0.04
C2	0.04	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.04	0.09	0.24	0.42	0.05
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.05	0.23	0.52	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.05	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.55	0.13
C4	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.17	0.18	0.30	0.03
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.33	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.08	0.04	0.17	0.16	0.29	0.02
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.08	0.00	0.04	0.03	0.07	0.12	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.21	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.04	0.10	0.20	0.37	0.04
N1	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.25	0.42	0.05
N3	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.06	0.03	0.14	0.21	0.37	0.04
N4	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.02	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.08	0.02	0.22	0.17	0.22	0.06
O2	0.08	0.00	0.08	0.08	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.08	0.09	0.09	0.07	0.24	0.46	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.32	0.47	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.06	0.08	0.09	0.02	0.00	0.01	0.14	0.07	0.57	0.16
O4'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.09	0.01	0.01	0.00	0.09	0.40	0.28	0.08
O5'	0.04	0.09	0.05	0.11	0.17	0.01	0.17	0.00	0.10	0.07	0.14	0.22	0.07	0.01	0.14	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.34	0.24	0.23	0.13	0.18	0.29	0.16	0.18	0.20	0.25	0.21	0.17	0.24	0.32	0.07	0.40	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.42	0.52	0.55	0.30	0.33	0.29	0.21	0.37	0.42	0.37	0.22	0.46	0.47	0.57	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.05	0.08	0.13	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.07	0.04	0.16	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.07	0.03	0.08	0.13	0.10	0.21	0.25	0.18	0.07	0.06	0.16	0.15	0.12	0.09	0.08	0.29	0.46	0.35	0.37
C2	0.15	0.21	0.12	0.02	0.12	0.08	0.08	0.21	0.08	0.13	0.19	0.12	0.31	0.20	0.05	0.10	0.20	0.39	0.23	0.28
C2'	0.09	0.12	0.09	0.03	0.12	0.09	0.20	0.21	0.17	0.08	0.08	0.15	0.23	0.19	0.03	0.09	0.25	0.45	0.34	0.35
C3'	0.15	0.18	0.14	0.08	0.13	0.13	0.19	0.16	0.16	0.12	0.14	0.15	0.30	0.22	0.09	0.15	0.15	0.38	0.28	0.26
C4	0.19	0.32	0.17	0.03	0.23	0.04	0.12	0.14	0.10	0.20	0.31	0.24	0.42	0.23	0.07	0.09	0.09	0.24	0.08	0.15
C4'	0.09	0.11	0.04	0.04	0.20	0.11	0.27	0.18	0.23	0.12	0.12	0.24	0.18	0.11	0.05	0.13	0.19	0.40	0.32	0.29
C5	0.16	0.27	0.15	0.02	0.16	0.05	0.06	0.13	0.05	0.16	0.25	0.17	0.38	0.22	0.06	0.08	0.09	0.20	0.07	0.12
C5'	0.14	0.16	0.06	0.06	0.21	0.19	0.26	0.25	0.22	0.15	0.16	0.24	0.23	0.09	0.03	0.20	0.11	0.42	0.33	0.29
C6	0.11	0.18	0.10	0.02	0.09	0.08	0.08	0.17	0.08	0.10	0.15	0.09	0.28	0.18	0.05	0.08	0.15	0.27	0.15	0.19
N1	0.11	0.16	0.09	0.04	0.08	0.09	0.11	0.21	0.10	0.09	0.13	0.09	0.25	0.18	0.05	0.09	0.21	0.37	0.24	0.28
N3	0.18	0.29	0.15	0.01	0.20	0.06	0.11	0.17	0.10	0.19	0.28	0.21	0.38	0.22	0.06	0.09	0.14	0.32	0.15	0.21
N4	0.21	0.39	0.19	0.06	0.31	0.02	0.20	0.11	0.16	0.26	0.40	0.34	0.49	0.23	0.10	0.09	0.06	0.19	0.04	0.10
O2	0.14	0.20	0.12	0.04	0.12	0.10	0.10	0.23	0.10	0.13	0.17	0.12	0.28	0.20	0.04	0.11	0.23	0.46	0.29	0.33
O2'	0.04	0.06	0.02	0.08	0.22	0.11	0.30	0.27	0.25	0.11	0.10	0.26	0.12	0.14	0.05	0.10	0.35	0.57	0.47	0.46
O3'	0.16	0.19	0.16	0.10	0.15	0.15	0.22	0.17	0.18	0.13	0.15	0.18	0.32	0.24	0.12	0.16	0.15	0.41	0.33	0.29
O4'	0.06	0.08	0.01	0.10	0.18	0.09	0.25	0.21	0.21	0.10	0.10	0.21	0.13	0.08	0.12	0.10	0.26	0.41	0.32	0.32
O5'	0.29	0.33	0.15	0.21	0.36	0.40	0.39	0.53	0.38	0.33	0.33	0.37	0.35	0.09	0.00	0.40	0.38	0.66	0.55	0.54
OP1	0.09	0.11	0.06	0.08	0.25	0.18	0.34	0.27	0.31	0.14	0.17	0.28	0.13	0.03	0.02	0.16	0.38	0.20	0.05	0.22
OP2	0.11	0.16	0.16	0.10	0.35	0.07	0.44	0.10	0.39	0.22	0.23	0.39	0.12	0.04	0.01	0.01	0.22	0.22	0.11	0.11
P	0.01	0.06	0.03	0.01	0.16	0.07	0.25	0.09	0.22	0.08	0.07	0.18	0.16	0.00	0.00	0.05	0.11	0.21	0.11	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.07	0.03
C2	0.03	0.00	0.11	0.09	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.11	0.11	0.03	0.08	0.06	0.11	0.07
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.09	0.03	0.09	0.07	0.20	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.05	0.03
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.14	0.05	0.08	0.09	0.16	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.05	0.03
C4	0.04	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.14	0.12	0.16	0.12
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.04	0.04	0.07	0.06	0.03	0.01	0.00	0.00	0.11	0.02	0.01
C5	0.03	0.00	0.07	0.13	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.16	0.05	0.17	0.14	0.17	0.13
C5'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.14	0.00	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.16	0.05	0.15	0.11	0.11	0.09
N1	0.02	0.00	0.03	0.05	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.02	0.09	0.07	0.08	0.06
N3	0.04	0.01	0.09	0.08	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.10	0.03	0.10	0.08	0.14	0.10
N4	0.06	0.03	0.07	0.09	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.06	0.11	0.04	0.15	0.15	0.19	0.15
O2	0.04	0.00	0.20	0.16	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.20	0.21	0.05	0.07	0.06	0.09	0.06
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.03	0.04	0.02	0.06	0.02	0.10	0.06	0.20	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.04	0.01
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.16	0.05	0.10	0.11	0.21	0.01	0.00	0.01	0.10	0.12	0.06	0.02
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.07	0.08	0.06	0.03
O5'	0.05	0.08	0.03	0.07	0.14	0.00	0.17	0.00	0.15	0.09	0.10	0.15	0.07	0.01	0.10	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.06	0.08	0.10	0.12	0.11	0.14	0.11	0.11	0.07	0.08	0.15	0.06	0.11	0.12	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.05	0.05	0.16	0.02	0.17	0.02	0.11	0.08	0.14	0.19	0.09	0.04	0.06	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.07	0.03	0.03	0.12	0.01	0.13	0.01	0.09	0.06	0.10	0.15	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00