Doublet Group distance statistics: 54217

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, -0.001, 0.006, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.007
N3	A	0, -0.001, 0.006, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C6	A	0, -0.001, 0.006, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.006 std_dev=0.007
N1	A	0, -0.002, 0.007, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.007 std_dev=0.009
C2	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C1'	A	0, -0.002, 0.008, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N4	A	0, -0.001, 0.012, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.014
C3'	B	0, -0.014, 0.056, 0.125, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.056 std_dev=0.070
O4'	A	0, -0.025, 0.084, 0.193, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.084 std_dev=0.109
C2'	A	0, -0.039, 0.102, 0.244, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.102 std_dev=0.142
C4'	A	0, -0.047, 0.140, 0.327, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.140 std_dev=0.187
O2'	A	0, -0.054, 0.140, 0.333, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.140 std_dev=0.193
C3'	A	0, -0.058, 0.163, 0.384, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.163 std_dev=0.221
O2'	B	0, -0.056, 0.181, 0.418, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.181 std_dev=0.237
OP1	A	0, -0.076, 0.211, 0.498, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.211 std_dev=0.287
P	B	0, -0.076, 0.215, 0.507, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.215 std_dev=0.292
O3'	A	0, -0.079, 0.236, 0.551, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.236 std_dev=0.315
C5'	A	0, -0.085, 0.234, 0.554, 0.686 max_d=0.686 avg_d=0.234 std_dev=0.319
C2'	B	0, -0.110, 0.295, 0.700, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.295 std_dev=0.405
O5'	B	0, -0.110, 0.296, 0.701, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.296 std_dev=0.406
O5'	A	0, -0.136, 0.355, 0.846, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.355 std_dev=0.491
OP2	B	0, -0.133, 0.359, 0.851, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.359 std_dev=0.492
P	A	0, -0.140, 0.358, 0.857, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.358 std_dev=0.499
O3'	B	0, -0.242, 0.606, 1.455, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.606 std_dev=0.848
OP1	B	0, -0.249, 0.650, 1.550, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.650 std_dev=0.900
OP2	A	0, -0.268, 0.665, 1.598, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.665 std_dev=0.933
C4'	B	0, -0.277, 0.691, 1.659, 2.060 max_d=2.060 avg_d=0.691 std_dev=0.968
C5'	B	0, -0.338, 0.837, 2.011, 2.498 max_d=2.498 avg_d=0.837 std_dev=1.175
C1'	B	0, -0.358, 0.884, 2.126, 2.641 max_d=2.641 avg_d=0.884 std_dev=1.242
O4'	B	0, -0.439, 1.096, 2.631, 3.266 max_d=3.266 avg_d=1.096 std_dev=1.535
N1	B	0, -0.586, 1.428, 3.441, 4.275 max_d=4.275 avg_d=1.428 std_dev=2.013
C6	B	0, -0.660, 1.630, 3.920, 4.868 max_d=4.868 avg_d=1.630 std_dev=2.290
O2	B	0, -0.655, 1.646, 3.947, 4.900 max_d=4.900 avg_d=1.646 std_dev=2.301
C2	B	0, -0.740, 1.817, 4.374, 5.434 max_d=5.434 avg_d=1.817 std_dev=2.557
C5	B	0, -0.884, 2.181, 5.246, 6.515 max_d=6.515 avg_d=2.181 std_dev=3.065
N3	B	0, -0.986, 2.402, 5.790, 7.194 max_d=7.194 avg_d=2.402 std_dev=3.388
C4	B	0, -1.057, 2.581, 6.220, 7.727 max_d=7.727 avg_d=2.581 std_dev=3.639
N4	B	0, -1.298, 3.172, 7.642, 9.494 max_d=9.494 avg_d=3.172 std_dev=4.470

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.14	0.11	0.06
C2	0.02	0.00	0.07	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.00	0.04	0.10	0.21	0.04
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.11	0.00	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.07
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.01	0.05	0.09	0.02	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.06
C4	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.13	0.01	0.37	0.03
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.04
C5	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.41	0.05
C5'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.10	0.03	0.03	0.09	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.15	0.06	0.31	0.01
N1	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.11	0.20	0.04
N3	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.00	0.08	0.05	0.29	0.01
N4	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.15	0.03	0.42	0.06
O2	0.02	0.00	0.11	0.09	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.10	0.01	0.01	0.13	0.15	0.07
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.04	0.12	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.07
O3'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.10	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.14	0.06
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.20	0.09	0.06
O5'	0.02	0.04	0.04	0.07	0.13	0.02	0.18	0.00	0.15	0.06	0.08	0.15	0.01	0.05	0.10	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.14	0.10	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.06	0.06	0.11	0.05	0.03	0.13	0.07	0.09	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.21	0.01	0.04	0.37	0.00	0.41	0.03	0.31	0.20	0.29	0.42	0.15	0.01	0.14	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.04	0.07	0.06	0.03	0.04	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.49	0.01	0.03	0.52	0.21	0.43	0.22	0.35	0.36	0.56	0.58	0.52	0.03	0.25	0.26	0.13	0.26	0.06	0.08
C2	0.33	0.30	0.07	0.03	0.25	0.41	0.28	0.44	0.30	0.32	0.25	0.21	0.31	0.00	0.26	0.52	0.13	0.20	0.12	0.06
C2'	0.43	0.90	0.10	0.03	1.01	0.27	0.82	0.28	0.67	0.67	1.07	1.13	0.94	0.00	0.28	0.42	0.14	0.25	0.01	0.10
C3'	0.54	1.18	0.24	0.12	1.33	0.27	1.07	0.26	0.85	0.86	1.41	1.49	1.24	0.06	0.23	0.44	0.20	0.34	0.14	0.19
C4	0.37	0.07	0.11	0.02	0.07	0.51	0.06	0.53	0.17	0.21	0.09	0.16	0.09	0.04	0.22	0.63	0.13	0.17	0.13	0.06
C4'	0.32	0.84	0.17	0.07	0.95	0.14	0.74	0.13	0.57	0.58	1.02	1.09	0.90	0.03	0.18	0.20	0.21	0.39	0.12	0.19
C5	0.27	0.21	0.08	0.04	0.11	0.34	0.13	0.34	0.17	0.21	0.13	0.07	0.28	0.01	0.22	0.40	0.11	0.20	0.08	0.06
C5'	0.32	0.92	0.26	0.12	1.03	0.08	0.80	0.07	0.60	0.62	1.11	1.18	0.98	0.07	0.11	0.13	0.26	0.47	0.24	0.27
C6	0.22	0.37	0.04	0.04	0.32	0.23	0.27	0.24	0.24	0.28	0.37	0.33	0.44	0.03	0.24	0.27	0.11	0.23	0.06	0.06
N1	0.27	0.40	0.04	0.04	0.38	0.29	0.33	0.30	0.31	0.33	0.41	0.39	0.44	0.02	0.25	0.35	0.12	0.23	0.08	0.07
N3	0.38	0.15	0.09	0.02	0.03	0.52	0.15	0.55	0.25	0.27	0.01	0.06	0.15	0.03	0.24	0.65	0.14	0.17	0.14	0.06
N4	0.42	0.20	0.14	0.00	0.40	0.64	0.16	0.67	0.07	0.11	0.47	0.55	0.20	0.08	0.19	0.81	0.14	0.13	0.15	0.05
O2	0.35	0.32	0.06	0.03	0.29	0.43	0.32	0.47	0.34	0.34	0.29	0.27	0.32	0.00	0.27	0.54	0.14	0.20	0.14	0.07
O2'	0.37	0.81	0.08	0.02	0.95	0.24	0.78	0.25	0.62	0.60	0.99	1.09	0.82	0.01	0.27	0.37	0.13	0.25	0.04	0.08
O3'	0.62	1.39	0.31	0.16	1.62	0.28	1.31	0.26	1.03	1.02	1.70	1.85	1.41	0.07	0.24	0.50	0.21	0.34	0.18	0.21
O4'	0.13	0.44	0.00	0.04	0.49	0.09	0.37	0.10	0.27	0.28	0.54	0.57	0.49	0.04	0.22	0.08	0.14	0.32	0.01	0.11
O5'	0.43	1.02	0.33	0.17	1.07	0.16	0.84	0.14	0.67	0.72	1.17	1.18	1.11	0.14	0.09	0.24	0.32	0.51	0.31	0.33
OP1	0.15	0.83	0.31	0.15	1.01	0.17	0.75	0.19	0.52	0.52	1.06	1.18	0.85	0.02	0.01	0.17	0.23	0.50	0.34	0.27
OP2	0.72	1.28	0.72	0.46	1.28	0.34	1.06	0.30	0.90	0.99	1.38	1.36	1.36	0.48	0.14	0.46	0.60	0.76	0.68	0.63
P	0.21	0.79	0.27	0.10	0.85	0.05	0.63	0.06	0.45	0.50	0.94	0.97	0.86	0.06	0.08	0.03	0.27	0.51	0.31	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.41	0.36	0.36	0.46
C2	0.03	0.00	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.03	0.07	0.83	0.78	1.06	1.00
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.09	0.01	0.10	0.04	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.10	0.14
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.16	0.07	0.06	0.12	0.03	0.03	0.01	0.03	0.08	0.03	0.14	0.01
C4	0.02	0.00	0.04	0.11	0.00	0.15	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.06	1.26	1.33	1.67	1.54
C4'	0.01	0.06	0.03	0.00	0.15	0.00	0.19	0.01	0.18	0.09	0.10	0.16	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.13	0.22	0.03
C5	0.01	0.00	0.09	0.16	0.00	0.19	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.17	0.03	1.38	1.45	1.70	1.63
C5'	0.06	0.22	0.01	0.01	0.37	0.01	0.42	0.00	0.37	0.23	0.29	0.41	0.14	0.06	0.10	0.03	0.01	0.32	0.40	0.02
C6	0.01	0.00	0.10	0.16	0.00	0.18	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.02	1.22	1.19	1.29	1.35
N1	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.04	0.86	0.80	0.93	0.97
N3	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.07	1.04	1.05	1.40	1.28
N4	0.02	0.00	0.05	0.12	0.00	0.16	0.00	0.41	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.06	1.36	1.50	1.89	1.70
O2	0.04	0.00	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.02	0.09	0.59	0.52	0.82	0.75
O2'	0.00	0.08	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.06	0.00	0.07	0.02	0.14	0.00	0.10	0.03	0.17	0.30	0.17	0.17
O3'	0.04	0.03	0.05	0.01	0.12	0.00	0.17	0.10	0.17	0.09	0.06	0.13	0.02	0.10	0.00	0.01	0.42	0.60	0.61	0.53
O4'	0.01	0.07	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.03	0.02	0.04	0.07	0.06	0.09	0.03	0.01	0.00	0.36	0.43	0.16	0.41
O5'	0.41	0.83	0.15	0.08	1.26	0.01	1.38	0.01	1.22	0.86	1.04	1.36	0.59	0.17	0.42	0.36	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.36	0.78	0.01	0.03	1.33	0.13	1.45	0.32	1.19	0.80	1.05	1.50	0.52	0.30	0.60	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.36	1.06	0.10	0.14	1.67	0.22	1.70	0.40	1.29	0.93	1.40	1.89	0.82	0.17	0.61	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.46	1.00	0.14	0.01	1.54	0.03	1.63	0.02	1.35	0.97	1.28	1.70	0.75	0.17	0.53	0.41	0.00	0.00	0.00	0.00