Doublet Group distance statistics: 54218

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N1	A	0, -0.004, 0.017, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.006, 0.029, 0.051, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.029 std_dev=0.023
O2	A	0, -0.001, 0.030, 0.061, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.030 std_dev=0.031
O4'	A	0, -0.055, 0.169, 0.393, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.169 std_dev=0.224
C2'	A	0, -0.064, 0.202, 0.468, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.202 std_dev=0.266
P	A	0, -0.069, 0.232, 0.532, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.232 std_dev=0.301
O5'	A	0, -0.066, 0.237, 0.541, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.237 std_dev=0.304
C2'	B	0, -0.070, 0.259, 0.588, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.259 std_dev=0.329
O2'	B	0, -0.064, 0.274, 0.612, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.274 std_dev=0.338
O5'	B	0, -0.044, 0.316, 0.677, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.316 std_dev=0.361
C6	B	0, -0.071, 0.296, 0.664, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.296 std_dev=0.368
P	B	0, -0.043, 0.354, 0.751, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.354 std_dev=0.397
OP1	B	0, -0.030, 0.370, 0.770, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.370 std_dev=0.400
N1	B	0, -0.086, 0.316, 0.718, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.316 std_dev=0.402
C3'	B	0, -0.090, 0.319, 0.728, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.319 std_dev=0.409
C3'	A	0, -0.101, 0.311, 0.723, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.311 std_dev=0.412
C5	B	0, -0.072, 0.341, 0.753, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.341 std_dev=0.413
O2'	A	0, -0.106, 0.307, 0.720, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.307 std_dev=0.413
C4'	A	0, -0.110, 0.307, 0.725, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.307 std_dev=0.418
C1'	B	0, -0.096, 0.328, 0.752, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.328 std_dev=0.424
O3'	B	0, -0.089, 0.336, 0.762, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.336 std_dev=0.426
OP1	A	0, -0.114, 0.317, 0.749, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.317 std_dev=0.432
OP2	B	0, -0.051, 0.387, 0.825, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.387 std_dev=0.438
C5'	B	0, -0.073, 0.366, 0.806, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.366 std_dev=0.440
C2	B	0, -0.094, 0.354, 0.802, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.354 std_dev=0.448
N3	B	0, -0.088, 0.374, 0.837, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.374 std_dev=0.462
C4	B	0, -0.081, 0.383, 0.846, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.383 std_dev=0.463
C4'	B	0, -0.094, 0.374, 0.842, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.374 std_dev=0.468
O4'	B	0, -0.107, 0.388, 0.883, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.388 std_dev=0.495
O2	B	0, -0.107, 0.393, 0.892, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.393 std_dev=0.500
OP2	A	0, -0.105, 0.403, 0.912, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.403 std_dev=0.508
N4	B	0, -0.087, 0.436, 0.959, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.436 std_dev=0.523
O3'	A	0, -0.139, 0.461, 1.061, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.461 std_dev=0.600
C5'	A	0, -0.212, 0.555, 1.322, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.555 std_dev=0.767

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.26	0.29	0.09	0.21
C2	0.01	0.00	0.10	0.03	0.01	0.05	0.02	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.05	0.03	0.29	0.25	0.05	0.20
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.04	0.08	0.02	0.07	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.03	0.02
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.11	0.00	0.18	0.02	0.18	0.04	0.02	0.12	0.13	0.01	0.00	0.03	0.17	0.00	0.09	0.09
C4	0.01	0.01	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.46	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.25	0.13	0.08	0.12
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.18	0.00	0.22	0.01	0.20	0.09	0.10	0.19	0.05	0.07	0.03	0.01	0.03	0.21	0.07	0.01
C5	0.01	0.02	0.06	0.18	0.00	0.22	0.00	0.51	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.16	0.02	0.24	0.11	0.10	0.11
C5'	0.07	0.25	0.04	0.02	0.46	0.01	0.51	0.00	0.44	0.27	0.36	0.50	0.13	0.06	0.04	0.01	0.00	0.43	0.17	0.03
C6	0.01	0.02	0.08	0.18	0.01	0.20	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.18	0.04	0.26	0.17	0.04	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.01	0.29	0.25	0.05	0.20
N3	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00	0.10	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.02	0.04	0.28	0.19	0.03	0.16
N4	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.50	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.24	0.10	0.11	0.10
O2	0.04	0.01	0.19	0.13	0.01	0.05	0.03	0.13	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.26	0.16	0.03	0.31	0.31	0.10	0.24
O2'	0.02	0.15	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.06	0.04	0.05	0.14	0.06	0.26	0.00	0.07	0.02	0.07	0.02	0.06	0.04
O3'	0.04	0.05	0.02	0.00	0.08	0.03	0.16	0.04	0.18	0.04	0.02	0.08	0.16	0.07	0.00	0.06	0.42	0.21	0.15	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.39	0.46	0.20	0.33
O5'	0.26	0.29	0.00	0.17	0.25	0.03	0.24	0.00	0.26	0.29	0.28	0.24	0.31	0.07	0.42	0.39	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.29	0.25	0.07	0.00	0.13	0.21	0.11	0.43	0.17	0.25	0.19	0.10	0.31	0.02	0.21	0.46	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.05	0.03	0.09	0.08	0.07	0.10	0.17	0.04	0.05	0.03	0.11	0.10	0.06	0.15	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.20	0.02	0.09	0.12	0.01	0.11	0.03	0.15	0.20	0.16	0.10	0.24	0.04	0.26	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.24	0.24	0.27	0.17	0.28	0.15	0.26	0.19	0.24	0.20	0.14	0.28	0.29	0.28	0.29	0.19	0.21	0.33	0.26
C2	0.25	0.19	0.24	0.25	0.11	0.25	0.10	0.24	0.15	0.20	0.15	0.08	0.22	0.32	0.23	0.25	0.17	0.20	0.33	0.25
C2'	0.15	0.09	0.11	0.16	0.04	0.17	0.04	0.18	0.07	0.10	0.07	0.02	0.12	0.12	0.15	0.17	0.11	0.17	0.27	0.20
C3'	0.03	0.04	0.02	0.07	0.10	0.09	0.10	0.09	0.07	0.03	0.07	0.13	0.00	0.06	0.10	0.07	0.01	0.08	0.12	0.08
C4	0.17	0.11	0.17	0.15	0.06	0.17	0.06	0.18	0.09	0.13	0.09	0.05	0.13	0.26	0.11	0.17	0.12	0.16	0.32	0.23
C4'	0.03	0.04	0.03	0.06	0.13	0.08	0.14	0.07	0.09	0.04	0.08	0.16	0.02	0.05	0.13	0.07	0.03	0.01	0.05	0.02
C5	0.20	0.15	0.19	0.17	0.11	0.19	0.11	0.20	0.14	0.17	0.13	0.10	0.16	0.28	0.12	0.20	0.15	0.17	0.33	0.24
C5'	0.22	0.26	0.33	0.20	0.38	0.16	0.42	0.20	0.38	0.30	0.31	0.40	0.15	0.38	0.06	0.17	0.32	0.31	0.30	0.30
C6	0.26	0.21	0.23	0.23	0.15	0.24	0.14	0.24	0.18	0.21	0.18	0.13	0.23	0.30	0.21	0.25	0.18	0.19	0.33	0.26
N1	0.27	0.21	0.24	0.26	0.14	0.26	0.13	0.25	0.17	0.21	0.17	0.11	0.24	0.31	0.25	0.27	0.18	0.20	0.33	0.26
N3	0.20	0.13	0.19	0.19	0.06	0.20	0.05	0.19	0.10	0.14	0.10	0.04	0.16	0.28	0.16	0.19	0.13	0.16	0.31	0.22
N4	0.13	0.07	0.13	0.09	0.04	0.11	0.03	0.13	0.06	0.09	0.06	0.02	0.08	0.22	0.04	0.11	0.09	0.13	0.32	0.20
O2	0.28	0.21	0.26	0.28	0.12	0.28	0.11	0.26	0.16	0.21	0.17	0.09	0.25	0.33	0.27	0.27	0.18	0.21	0.34	0.26
O2'	0.14	0.10	0.11	0.15	0.07	0.16	0.06	0.17	0.08	0.11	0.08	0.05	0.11	0.12	0.12	0.15	0.12	0.19	0.30	0.22
O3'	0.02	0.12	0.05	0.07	0.17	0.09	0.15	0.10	0.11	0.09	0.16	0.20	0.09	0.13	0.09	0.04	0.01	0.12	0.12	0.10
O4'	0.37	0.31	0.31	0.36	0.20	0.38	0.19	0.35	0.24	0.31	0.25	0.16	0.36	0.35	0.41	0.38	0.26	0.25	0.34	0.30
O5'	0.33	0.29	0.29	0.32	0.28	0.32	0.29	0.34	0.31	0.31	0.28	0.26	0.29	0.25	0.32	0.34	0.32	0.34	0.43	0.38
OP1	0.09	0.14	0.03	0.06	0.15	0.06	0.13	0.08	0.11	0.11	0.15	0.16	0.15	0.04	0.08	0.09	0.08	0.09	0.17	0.12
OP2	0.02	0.04	0.08	0.07	0.09	0.12	0.09	0.11	0.07	0.04	0.07	0.10	0.02	0.27	0.18	0.11	0.02	0.05	0.03	0.05
P	0.20	0.17	0.13	0.20	0.15	0.22	0.15	0.22	0.16	0.18	0.15	0.13	0.19	0.03	0.24	0.23	0.19	0.21	0.25	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03
C2	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.02	0.01	0.04	0.00
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.12	0.09
C3'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03
C4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.05	0.10	0.03
C4'	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01
C5	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.12	0.05
C5'	0.03	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.07	0.03
N1	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00
N3	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.03	0.07	0.02
N4	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.06	0.11	0.03
O2	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01
O2'	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.00	0.05	0.02	0.06	0.11	0.21	0.14
O3'	0.05	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.06	0.10	0.05	0.00	0.06	0.02	0.02	0.06	0.02
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02
O5'	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.03	0.01	0.07	0.03	0.05	0.03	0.08	0.02	0.06	0.01	0.03	0.06	0.02	0.11	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01
OP2	0.03	0.04	0.12	0.06	0.10	0.02	0.12	0.01	0.07	0.03	0.07	0.11	0.03	0.21	0.06	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.00	0.09	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.14	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00