Doublet Group distance statistics: 54220

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N4	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
C2'	B	0, 0.000, 0.309, 0.618, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.309 std_dev=0.309
O4'	A	0, 0.000, 0.361, 0.722, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.361 std_dev=0.361
C2'	A	0, 0.000, 0.363, 0.725, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.363 std_dev=0.363
O2'	B	0, 0.000, 0.367, 0.733, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.367 std_dev=0.367
O2'	A	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
C4'	A	0, 0.000, 0.497, 0.994, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.497 std_dev=0.497
C3'	A	0, 0.000, 0.571, 1.142, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.571 std_dev=0.571
C3'	B	0, 0.000, 0.733, 1.466, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.733 std_dev=0.733
O3'	A	0, 0.000, 0.832, 1.664, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.832 std_dev=0.832
C5'	A	0, 0.000, 0.882, 1.764, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.882 std_dev=0.882
O4'	B	0, 0.000, 0.951, 1.902, 1.902 max_d=1.902 avg_d=0.951 std_dev=0.951
O3'	B	0, 0.000, 0.956, 1.913, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.956 std_dev=0.956
C1'	B	0, 0.000, 1.025, 2.050, 2.050 max_d=2.050 avg_d=1.025 std_dev=1.025
C4'	B	0, 0.000, 1.175, 2.351, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.175 std_dev=1.175
O5'	A	0, 0.000, 1.236, 2.473, 2.473 max_d=2.473 avg_d=1.236 std_dev=1.236
O5'	B	0, 0.000, 1.474, 2.948, 2.948 max_d=2.948 avg_d=1.474 std_dev=1.474
C5'	B	0, 0.000, 1.615, 3.230, 3.230 max_d=3.230 avg_d=1.615 std_dev=1.615
OP1	A	0, 0.000, 1.786, 3.572, 3.572 max_d=3.572 avg_d=1.786 std_dev=1.786
P	A	0, 0.000, 1.844, 3.688, 3.688 max_d=3.688 avg_d=1.844 std_dev=1.844
C6	B	0, 0.000, 1.851, 3.701, 3.701 max_d=3.701 avg_d=1.851 std_dev=1.851
N1	B	0, 0.000, 1.857, 3.715, 3.715 max_d=3.715 avg_d=1.857 std_dev=1.857
P	B	0, 0.000, 1.938, 3.876, 3.876 max_d=3.876 avg_d=1.938 std_dev=1.938
OP2	B	0, 0.000, 2.136, 4.273, 4.273 max_d=4.273 avg_d=2.136 std_dev=2.136
OP2	A	0, 0.000, 2.466, 4.932, 4.932 max_d=4.932 avg_d=2.466 std_dev=2.466
C5	B	0, 0.000, 2.950, 5.899, 5.899 max_d=5.899 avg_d=2.950 std_dev=2.950
C2	B	0, 0.000, 3.035, 6.070, 6.070 max_d=6.070 avg_d=3.035 std_dev=3.035
OP1	B	0, 0.000, 3.140, 6.280, 6.280 max_d=6.280 avg_d=3.140 std_dev=3.140
O2	B	0, 0.000, 3.244, 6.488, 6.488 max_d=6.488 avg_d=3.244 std_dev=3.244
C4	B	0, 0.000, 4.000, 8.001, 8.001 max_d=8.001 avg_d=4.000 std_dev=4.000
N3	B	0, 0.000, 4.032, 8.064, 8.064 max_d=8.064 avg_d=4.032 std_dev=4.032
N4	B	0, 0.000, 5.092, 10.185, 10.185 max_d=10.185 avg_d=5.092 std_dev=5.092

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.00	0.00	0.00	0.11	0.07	0.24	0.14
C2	0.03	0.00	0.07	0.06	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.09	0.05	0.15	0.19	0.36	0.22
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.02	0.10	0.01	0.04	0.03	0.14	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.15	0.03	0.03	0.05	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01
C4	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.03	0.23	0.36	0.55	0.33
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.09	0.03	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03
C5	0.02	0.00	0.09	0.13	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.29	0.42	0.63	0.38
C5'	0.03	0.05	0.02	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.07	0.07	0.10	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.30	0.36	0.55	0.35
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.21	0.38	0.24
N3	0.03	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.05	0.17	0.26	0.44	0.26
N4	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.23	0.40	0.58	0.34
O2	0.04	0.00	0.14	0.13	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.18	0.08	0.10	0.11	0.28	0.17
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00
O3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.16	0.02	0.06	0.04	0.18	0.00	0.00	0.00	0.09	0.07	0.26	0.12
O4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.08	0.00	0.00	0.00	0.10	0.03	0.23	0.13
O5'	0.11	0.15	0.04	0.01	0.23	0.02	0.29	0.00	0.30	0.18	0.17	0.23	0.10	0.00	0.09	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.07	0.19	0.03	0.02	0.36	0.04	0.42	0.06	0.36	0.21	0.26	0.40	0.11	0.06	0.07	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.36	0.05	0.06	0.55	0.04	0.63	0.01	0.55	0.38	0.44	0.58	0.28	0.00	0.26	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.22	0.05	0.01	0.33	0.03	0.38	0.01	0.35	0.24	0.26	0.34	0.17	0.00	0.12	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.12	0.17	0.10	0.68	0.43	0.67	0.24	0.40	0.11	0.43	0.91	0.21	0.11	0.09	0.42	0.23	0.39	0.90	0.44
C2	0.41	0.32	0.13	0.00	0.31	0.35	0.47	0.07	0.26	0.13	0.06	0.47	0.76	0.02	0.02	0.50	0.42	0.75	1.10	0.68
C2'	0.38	0.14	0.31	0.20	0.40	0.49	0.44	0.29	0.21	0.09	0.13	0.59	0.47	0.22	0.20	0.50	0.17	0.36	0.81	0.39
C3'	0.43	0.17	0.45	0.32	0.27	0.59	0.26	0.44	0.06	0.17	0.07	0.44	0.43	0.35	0.32	0.57	0.01	0.10	0.55	0.16
C4	0.49	0.65	0.10	0.07	0.07	0.25	0.20	0.06	0.09	0.33	0.47	0.02	1.13	0.05	0.11	0.49	0.50	0.86	1.10	0.75
C4'	0.28	0.19	0.35	0.29	0.62	0.59	0.51	0.49	0.25	0.07	0.48	0.84	0.01	0.31	0.28	0.49	0.06	0.04	0.54	0.10
C5	0.38	0.35	0.15	0.01	0.15	0.30	0.30	0.04	0.17	0.16	0.15	0.25	0.76	0.01	0.05	0.42	0.37	0.59	0.92	0.57
C5'	0.32	0.20	0.47	0.42	0.53	0.71	0.36	0.67	0.12	0.01	0.47	0.73	0.09	0.44	0.41	0.56	0.27	0.35	0.26	0.16
C6	0.29	0.07	0.17	0.06	0.43	0.36	0.48	0.15	0.29	0.00	0.18	0.57	0.42	0.07	0.03	0.40	0.27	0.44	0.87	0.48
N1	0.32	0.09	0.16	0.06	0.48	0.39	0.54	0.16	0.32	0.01	0.19	0.66	0.47	0.07	0.04	0.45	0.30	0.52	0.96	0.53
N3	0.49	0.58	0.10	0.06	0.04	0.29	0.30	0.04	0.15	0.28	0.37	0.16	1.06	0.03	0.08	0.52	0.51	0.91	1.17	0.78
N4	0.57	1.00	0.05	0.16	0.44	0.15	0.04	0.21	0.07	0.53	0.89	0.39	1.52	0.13	0.20	0.49	0.63	1.07	1.18	0.88
O2	0.41	0.30	0.12	0.00	0.36	0.37	0.52	0.07	0.30	0.12	0.03	0.56	0.75	0.03	0.01	0.51	0.43	0.80	1.16	0.71
O2'	0.31	0.01	0.26	0.17	0.59	0.47	0.60	0.28	0.33	0.03	0.32	0.83	0.32	0.18	0.19	0.46	0.19	0.38	0.88	0.42
O3'	0.47	0.26	0.52	0.38	0.16	0.63	0.16	0.48	0.02	0.24	0.04	0.33	0.50	0.41	0.40	0.60	0.07	0.03	0.47	0.10
O4'	0.17	0.35	0.18	0.14	0.83	0.48	0.72	0.36	0.44	0.22	0.67	1.06	0.11	0.15	0.12	0.40	0.10	0.15	0.74	0.27
O5'	0.56	0.17	0.69	0.58	0.09	0.86	0.03	0.81	0.22	0.31	0.04	0.25	0.26	0.66	0.55	0.76	0.44	0.50	0.02	0.35
OP1	0.78	0.31	1.07	1.04	0.19	1.24	0.41	1.30	0.60	0.57	0.13	0.04	0.26	1.02	1.06	1.01	1.01	1.24	0.64	0.98
OP2	1.23	0.91	1.39	1.23	0.81	1.49	0.94	1.45	1.07	1.07	0.78	0.70	0.88	1.39	1.17	1.41	1.15	1.24	0.83	1.11
P	0.73	0.30	0.93	0.85	0.16	1.11	0.34	1.13	0.51	0.51	0.12	0.01	0.28	0.93	0.82	0.96	0.80	0.96	0.42	0.76

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.24	0.00	0.00	0.03	0.26	0.12
C2	0.01	0.00	0.12	0.18	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.15	0.04	0.22	0.12	0.05	0.05
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.14	0.11	0.00	0.08	0.01	0.23	0.00	0.00	0.02	0.31	0.29	0.59	0.42
C3'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.28	0.01	0.28	0.01	0.25	0.17	0.23	0.29	0.11	0.02	0.00	0.02	0.04	0.07	0.13	0.05
C4	0.02	0.00	0.00	0.28	0.00	0.15	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.33	0.03	0.05	0.41	0.26	0.16	0.23
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.15	0.00	0.19	0.00	0.19	0.09	0.08	0.16	0.02	0.26	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03
C5	0.02	0.00	0.09	0.28	0.00	0.19	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.35	0.11	0.10	0.44	0.26	0.15	0.25
C5'	0.02	0.06	0.14	0.01	0.19	0.00	0.24	0.00	0.20	0.08	0.12	0.22	0.00	0.09	0.18	0.01	0.00	0.13	0.05	0.01
C6	0.02	0.00	0.11	0.25	0.01	0.19	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.08	0.12	0.35	0.17	0.03	0.13
N1	0.01	0.01	0.00	0.17	0.01	0.09	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.08	0.02	0.20	0.08	0.13	0.01
N3	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.08	0.01	0.32	0.20	0.07	0.15
N4	0.02	0.00	0.01	0.29	0.00	0.16	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.36	0.05	0.05	0.45	0.31	0.26	0.30
O2	0.01	0.00	0.23	0.11	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.09	0.14	0.08	0.10	0.00
O2'	0.03	0.15	0.00	0.02	0.33	0.26	0.35	0.09	0.29	0.18	0.24	0.36	0.01	0.00	0.04	0.19	0.23	0.22	0.65	0.35
O3'	0.24	0.15	0.00	0.00	0.03	0.01	0.11	0.18	0.08	0.08	0.08	0.05	0.27	0.04	0.00	0.14	0.12	0.36	0.02	0.14
O4'	0.00	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.12	0.02	0.01	0.05	0.09	0.19	0.14	0.00	0.09	0.09	0.13	0.01
O5'	0.00	0.22	0.31	0.04	0.41	0.01	0.44	0.00	0.35	0.20	0.32	0.45	0.14	0.23	0.12	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.12	0.29	0.07	0.26	0.10	0.26	0.13	0.17	0.08	0.20	0.31	0.08	0.22	0.36	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.26	0.05	0.59	0.13	0.16	0.11	0.15	0.05	0.03	0.13	0.07	0.26	0.10	0.65	0.02	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.05	0.42	0.05	0.23	0.03	0.25	0.01	0.13	0.01	0.15	0.30	0.00	0.35	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00