Doublet Group distance statistics: 54232

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 5, 7, 8, 6, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.005, 0.008, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, -0.001, 0.012, 0.024, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.012 std_dev=0.012
O2	A	0, -0.001, 0.026, 0.052, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.000, 0.032, 0.063, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.032 std_dev=0.032
O4'	A	0, -0.023, 0.130, 0.283, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.130 std_dev=0.153
C2'	A	0, 0.021, 0.175, 0.329, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.175 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.274, 0.456, 0.638, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.456 std_dev=0.182
O2'	A	0, 0.185, 0.367, 0.549, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.367 std_dev=0.182
C2'	B	0, 0.214, 0.398, 0.582, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.398 std_dev=0.184
O2'	B	0, 0.280, 0.464, 0.649, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.464 std_dev=0.185
C3'	B	0, 0.194, 0.379, 0.564, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.379 std_dev=0.185
C1'	B	0, 0.155, 0.355, 0.554, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.355 std_dev=0.200
O3'	B	0, 0.107, 0.308, 0.508, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.308 std_dev=0.201
C4'	B	0, 0.176, 0.389, 0.602, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.389 std_dev=0.213
C3'	A	0, 0.115, 0.330, 0.545, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.330 std_dev=0.215
O5'	A	0, 0.833, 1.050, 1.268, 1.463 max_d=1.463 avg_d=1.050 std_dev=0.218
O4'	B	0, 0.138, 0.363, 0.588, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.363 std_dev=0.225
C5'	A	0, 0.618, 0.913, 1.208, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.913 std_dev=0.295
C5'	B	0, 0.189, 0.526, 0.863, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.526 std_dev=0.337
O3'	A	0, 0.081, 0.427, 0.773, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.427 std_dev=0.346
C4	B	0, 0.125, 0.483, 0.842, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.483 std_dev=0.358
N9	B	0, 0.085, 0.460, 0.835, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.460 std_dev=0.375
P	A	0, 0.350, 0.734, 1.117, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.734 std_dev=0.384
C5	B	0, 0.068, 0.518, 0.969, 2.013 max_d=2.013 avg_d=0.518 std_dev=0.450
C6	B	0, 0.063, 0.589, 1.116, 2.099 max_d=2.099 avg_d=0.589 std_dev=0.526
N6	B	0, 0.001, 0.619, 1.236, 2.678 max_d=2.678 avg_d=0.619 std_dev=0.618
OP2	A	0, 0.557, 1.212, 1.867, 3.266 max_d=3.266 avg_d=1.212 std_dev=0.655
OP1	A	0, 0.049, 0.774, 1.500, 3.008 max_d=3.008 avg_d=0.774 std_dev=0.725
O5'	B	0, -0.082, 0.741, 1.564, 3.276 max_d=3.276 avg_d=0.741 std_dev=0.823
P	B	0, 0.005, 0.952, 1.898, 3.511 max_d=3.511 avg_d=0.952 std_dev=0.947
OP2	B	0, 0.084, 1.102, 2.120, 3.923 max_d=3.923 avg_d=1.102 std_dev=1.018
OP1	B	0, -0.020, 1.010, 2.041, 3.698 max_d=3.698 avg_d=1.010 std_dev=1.030
N3	B	0, -0.271, 0.822, 1.914, 3.697 max_d=3.697 avg_d=0.822 std_dev=1.093
C8	B	0, -0.375, 0.771, 1.917, 4.010 max_d=4.010 avg_d=0.771 std_dev=1.146
N1	B	0, -0.268, 0.882, 2.033, 3.918 max_d=3.918 avg_d=0.882 std_dev=1.151
N7	B	0, -0.361, 0.792, 1.945, 4.256 max_d=4.256 avg_d=0.792 std_dev=1.153
C2	B	0, -0.455, 1.016, 2.487, 4.845 max_d=4.845 avg_d=1.016 std_dev=1.471

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.18	0.21	0.18	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.03	0.22	0.26	0.26	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.05	0.05	0.09	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.30	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.07	0.08	0.10	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.30	0.14
C4	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.26	0.34	0.23	0.10
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.05	0.08	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.10	0.17	0.06
C5	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.29	0.36	0.15	0.13
C5'	0.04	0.12	0.02	0.01	0.18	0.01	0.20	0.00	0.18	0.12	0.15	0.20	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.11	0.17	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.28	0.31	0.12	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.23	0.25	0.19	0.08
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.03	0.24	0.30	0.28	0.07
N4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.03	0.26	0.37	0.25	0.10
O2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.12	0.04	0.18	0.22	0.29	0.07
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.00	0.04	0.03	0.04	0.10	0.30	0.11
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.01	0.10	0.04	0.10	0.04	0.08	0.09	0.12	0.04	0.00	0.01	0.14	0.22	0.38	0.23
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.18	0.27	0.14	0.12
O5'	0.18	0.22	0.08	0.03	0.26	0.01	0.29	0.01	0.28	0.23	0.24	0.26	0.18	0.04	0.14	0.18	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.21	0.26	0.09	0.09	0.34	0.10	0.36	0.11	0.31	0.25	0.30	0.37	0.22	0.10	0.22	0.27	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.26	0.30	0.30	0.23	0.17	0.15	0.17	0.12	0.19	0.28	0.25	0.29	0.30	0.38	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.07	0.11	0.14	0.10	0.06	0.13	0.01	0.12	0.08	0.07	0.10	0.07	0.11	0.23	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.84	0.05	0.10	0.23	0.09	0.06	0.11	0.22	0.58	0.62	0.72	0.09	0.47	0.15	0.08	0.13	0.13	0.25	0.46	0.28	0.36
C2	0.11	1.14	0.08	0.09	0.31	0.10	0.08	0.14	0.31	0.74	0.83	0.96	0.13	0.62	0.19	0.12	0.15	0.15	0.41	0.47	0.30	0.40
C2'	0.19	0.81	0.11	0.11	0.16	0.15	0.14	0.15	0.14	0.72	0.56	0.67	0.08	0.62	0.26	0.11	0.11	0.21	0.18	0.36	0.17	0.26
C3'	0.21	0.63	0.14	0.16	0.13	0.20	0.13	0.20	0.12	0.60	0.44	0.53	0.08	0.50	0.24	0.12	0.15	0.25	0.11	0.27	0.10	0.17
C4	0.12	1.16	0.10	0.10	0.35	0.15	0.09	0.21	0.34	0.70	0.84	1.00	0.15	0.56	0.18	0.14	0.14	0.19	0.52	0.48	0.37	0.44
C4'	0.13	0.58	0.14	0.18	0.20	0.20	0.10	0.21	0.19	0.36	0.43	0.50	0.11	0.29	0.13	0.13	0.17	0.21	0.14	0.34	0.21	0.26
C5	0.10	0.87	0.09	0.10	0.29	0.13	0.07	0.17	0.27	0.54	0.63	0.79	0.13	0.41	0.13	0.12	0.14	0.16	0.41	0.41	0.26	0.34
C5'	0.22	0.45	0.23	0.27	0.27	0.30	0.22	0.30	0.27	0.24	0.38	0.41	0.23	0.21	0.21	0.21	0.24	0.31	0.19	0.24	0.20	0.21
C6	0.08	0.79	0.06	0.08	0.25	0.09	0.06	0.11	0.23	0.51	0.57	0.70	0.11	0.39	0.13	0.10	0.14	0.13	0.30	0.38	0.22	0.30
N1	0.09	0.93	0.06	0.09	0.27	0.08	0.06	0.11	0.25	0.62	0.68	0.80	0.10	0.50	0.16	0.10	0.14	0.13	0.31	0.43	0.25	0.35
N3	0.12	1.24	0.09	0.09	0.35	0.13	0.10	0.19	0.35	0.78	0.91	1.04	0.15	0.65	0.20	0.14	0.15	0.18	0.50	0.49	0.36	0.44
N4	0.13	1.30	0.12	0.12	0.40	0.19	0.12	0.28	0.39	0.72	0.95	1.10	0.19	0.59	0.19	0.16	0.14	0.22	0.62	0.54	0.47	0.52
O2	0.12	1.20	0.08	0.10	0.32	0.09	0.10	0.13	0.32	0.79	0.88	0.99	0.13	0.67	0.21	0.13	0.16	0.15	0.40	0.49	0.32	0.42
O2'	0.18	0.83	0.11	0.11	0.16	0.14	0.14	0.14	0.14	0.72	0.58	0.68	0.09	0.63	0.25	0.11	0.12	0.19	0.18	0.41	0.23	0.32
O3'	0.27	0.56	0.21	0.21	0.12	0.24	0.20	0.23	0.10	0.64	0.37	0.45	0.14	0.56	0.30	0.19	0.21	0.29	0.09	0.21	0.11	0.13
O4'	0.05	0.67	0.10	0.14	0.23	0.12	0.07	0.15	0.22	0.37	0.51	0.58	0.12	0.29	0.07	0.13	0.16	0.12	0.25	0.49	0.32	0.40
O5'	0.18	0.21	0.04	0.06	0.14	0.21	0.17	0.21	0.15	0.29	0.17	0.18	0.16	0.26	0.19	0.10	0.02	0.24	0.19	0.34	0.19	0.26
OP1	0.14	0.40	0.11	0.06	0.23	0.31	0.16	0.33	0.22	0.13	0.33	0.38	0.18	0.11	0.13	0.24	0.01	0.28	0.31	0.47	0.29	0.39
OP2	0.14	0.20	0.21	0.08	0.20	0.09	0.22	0.15	0.22	0.20	0.22	0.19	0.24	0.22	0.18	0.34	0.01	0.04	0.24	0.34	0.17	0.23
P	0.05	0.07	0.07	0.01	0.05	0.16	0.04	0.16	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.04	0.04	0.18	0.00	0.13	0.19	0.32	0.15	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.30	0.27	0.41	0.32
C2	0.02	0.00	0.41	0.38	0.00	0.36	0.00	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.06	0.13	0.79	0.93	1.03	0.82
C2'	0.00	0.41	0.00	0.00	0.21	0.01	0.08	0.04	0.17	0.22	0.31	0.41	0.11	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.40	0.33	0.46	0.40
C3'	0.01	0.38	0.00	0.00	0.17	0.00	0.07	0.01	0.15	0.19	0.29	0.37	0.10	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01	0.25	0.11	0.21	0.20
C4	0.01	0.00	0.21	0.17	0.00	0.15	0.00	0.30	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.04	0.07	0.46	0.48	0.58	0.46
C4'	0.01	0.36	0.01	0.00	0.15	0.00	0.06	0.00	0.13	0.20	0.27	0.35	0.08	0.14	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.10	0.06
C5	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.03	0.51	0.60	0.79	0.64
C5'	0.04	0.77	0.04	0.01	0.30	0.00	0.13	0.00	0.28	0.45	0.57	0.71	0.18	0.33	0.10	0.03	0.02	0.01	0.01	0.20	0.16	0.01
C6	0.01	0.00	0.17	0.15	0.00	0.13	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.04	0.05	0.54	0.61	0.76	0.61
C8	0.01	0.00	0.22	0.19	0.00	0.20	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.05	0.08	0.81	0.94	1.25	1.04
N1	0.02	0.00	0.31	0.29	0.01	0.27	0.00	0.57	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.05	0.10	0.68	0.76	0.88	0.69
N3	0.02	0.00	0.41	0.37	0.00	0.35	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.06	0.14	0.70	0.80	0.84	0.68
N6	0.01	0.00	0.11	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.04	0.55	0.68	0.85	0.69
N7	0.01	0.00	0.12	0.12	0.00	0.14	0.00	0.33	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.05	0.73	0.93	1.24	1.01
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.47	0.49	0.67	0.55
O2'	0.01	0.23	0.00	0.02	0.12	0.01	0.08	0.03	0.13	0.09	0.19	0.21	0.10	0.06	0.04	0.00	0.05	0.01	0.41	0.35	0.54	0.43
O3'	0.03	0.06	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.04	0.04	0.05	0.00	0.03	0.20	0.12	0.20	0.19
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.10	0.14	0.04	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.19	0.18	0.13	0.11
O5'	0.30	0.79	0.40	0.25	0.46	0.01	0.51	0.01	0.54	0.81	0.68	0.70	0.55	0.73	0.47	0.41	0.20	0.19	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.27	0.93	0.33	0.11	0.48	0.14	0.60	0.20	0.61	0.94	0.76	0.80	0.68	0.93	0.49	0.35	0.12	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.41	1.03	0.46	0.21	0.58	0.10	0.79	0.16	0.76	1.25	0.88	0.84	0.85	1.24	0.67	0.54	0.20	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.32	0.82	0.40	0.20	0.46	0.06	0.64	0.01	0.61	1.04	0.69	0.68	0.69	1.01	0.55	0.43	0.19	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00