Doublet Group distance statistics: 54237

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C5	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.010 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C1'	A	0, -0.001, 0.012, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.012 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.007, 0.036, 0.066, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.036 std_dev=0.030
O2'	A	0, 0.055, 0.167, 0.279, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.167 std_dev=0.112
C2'	A	0, 0.015, 0.132, 0.249, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.132 std_dev=0.117
O4'	A	0, -0.020, 0.129, 0.277, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.129 std_dev=0.149
C1'	B	0, 0.166, 0.323, 0.481, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.323 std_dev=0.158
C2'	B	0, 0.136, 0.318, 0.499, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.318 std_dev=0.181
O2'	B	0, 0.157, 0.358, 0.558, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.358 std_dev=0.200
C3'	A	0, -0.003, 0.206, 0.414, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.206 std_dev=0.208
C4'	A	0, -0.027, 0.185, 0.398, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.185 std_dev=0.213
O3'	A	0, 0.023, 0.288, 0.552, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.288 std_dev=0.264
O3'	B	0, 0.091, 0.364, 0.637, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.364 std_dev=0.273
O5'	A	0, -0.034, 0.271, 0.577, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.271 std_dev=0.305
OP2	A	0, 0.022, 0.386, 0.750, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.386 std_dev=0.364
C5'	A	0, -0.041, 0.337, 0.715, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.337 std_dev=0.378
N3	B	0, 0.037, 0.451, 0.864, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.451 std_dev=0.413
P	A	0, -0.078, 0.347, 0.771, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.347 std_dev=0.424
C3'	B	0, -0.044, 0.403, 0.849, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.403 std_dev=0.446
N9	B	0, 0.020, 0.473, 0.926, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.473 std_dev=0.453
C4	B	0, 0.004, 0.488, 0.972, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.488 std_dev=0.484
C2	B	0, -0.039, 0.506, 1.052, 1.887 max_d=1.887 avg_d=0.506 std_dev=0.545
O4'	B	0, -0.100, 0.480, 1.061, 1.986 max_d=1.986 avg_d=0.480 std_dev=0.581
OP1	A	0, -0.179, 0.499, 1.177, 2.224 max_d=2.224 avg_d=0.499 std_dev=0.678
N1	B	0, -0.218, 0.653, 1.524, 2.919 max_d=2.919 avg_d=0.653 std_dev=0.871
C4'	B	0, -0.348, 0.582, 1.511, 3.024 max_d=3.024 avg_d=0.582 std_dev=0.930
C5	B	0, -0.386, 0.770, 1.926, 3.805 max_d=3.805 avg_d=0.770 std_dev=1.156
C8	B	0, -0.398, 0.769, 1.937, 3.840 max_d=3.840 avg_d=0.769 std_dev=1.168
C6	B	0, -0.476, 0.839, 2.155, 4.297 max_d=4.297 avg_d=0.839 std_dev=1.315
C5'	B	0, -0.661, 0.865, 2.392, 4.873 max_d=4.873 avg_d=0.865 std_dev=1.527
N7	B	0, -0.653, 0.959, 2.571, 5.208 max_d=5.208 avg_d=0.959 std_dev=1.612
O5'	B	0, -0.737, 0.880, 2.498, 5.148 max_d=5.148 avg_d=0.880 std_dev=1.617
N6	B	0, -0.856, 1.117, 3.090, 6.320 max_d=6.320 avg_d=1.117 std_dev=1.973
P	B	0, -1.120, 1.198, 3.515, 7.311 max_d=7.311 avg_d=1.198 std_dev=2.318
OP1	B	0, -1.172, 1.271, 3.715, 7.718 max_d=7.718 avg_d=1.271 std_dev=2.444
OP2	B	0, -1.171, 1.309, 3.788, 7.836 max_d=7.836 avg_d=1.309 std_dev=2.480

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.06	0.07
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.08	0.01	0.11	0.11	0.14	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.04	0.06	0.08	0.03
C3'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.11	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.14	0.09
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.15	0.17	0.21	0.15
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.14	0.15	0.18	0.14
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.00	0.10	0.00	0.07	0.04	0.08	0.12	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.10	0.10	0.11	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.09	0.08	0.10	0.08
N3	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.14	0.15	0.19	0.13
N4	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.03	0.18	0.21	0.27	0.18
O2	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.13	0.02	0.11	0.11	0.14	0.10
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.03
O3'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.08	0.06	0.13	0.03	0.00	0.01	0.13	0.17	0.21	0.14
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.10	0.09	0.10
O5'	0.05	0.11	0.04	0.09	0.15	0.01	0.14	0.01	0.10	0.09	0.14	0.18	0.11	0.05	0.13	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.11	0.06	0.11	0.17	0.04	0.15	0.05	0.10	0.08	0.15	0.21	0.11	0.05	0.17	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.14	0.08	0.14	0.21	0.03	0.18	0.02	0.11	0.10	0.19	0.27	0.14	0.08	0.21	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.10	0.03	0.09	0.15	0.02	0.14	0.01	0.10	0.08	0.13	0.18	0.10	0.03	0.14	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.33	0.09	0.17	0.11	0.21	0.37	0.16	0.29	0.60	0.10	0.31	0.49	0.67	0.24	0.06	0.24	0.16	0.62	0.63	1.53	0.95
C2	0.07	0.22	0.12	0.17	0.21	0.43	0.59	0.32	0.52	0.81	0.14	0.25	0.79	0.94	0.34	0.10	0.25	0.30	0.28	0.18	1.05	0.49
C2'	0.13	0.44	0.08	0.14	0.13	0.21	0.37	0.13	0.30	0.59	0.19	0.42	0.53	0.69	0.21	0.05	0.24	0.21	0.65	0.67	1.53	0.98
C3'	0.13	0.43	0.08	0.16	0.13	0.10	0.30	0.28	0.23	0.50	0.20	0.40	0.41	0.57	0.19	0.06	0.22	0.13	0.81	0.88	1.69	1.18
C4	0.07	0.13	0.15	0.21	0.25	0.52	0.62	0.46	0.55	0.84	0.20	0.17	0.78	0.95	0.38	0.14	0.25	0.34	0.14	0.13	0.73	0.24
C4'	0.11	0.35	0.13	0.25	0.13	0.11	0.25	0.42	0.17	0.44	0.18	0.30	0.28	0.47	0.21	0.13	0.23	0.08	0.94	1.05	1.90	1.36
C5	0.06	0.20	0.11	0.16	0.15	0.38	0.42	0.27	0.34	0.64	0.07	0.21	0.52	0.70	0.28	0.07	0.25	0.25	0.28	0.20	0.98	0.48
C5'	0.18	0.33	0.20	0.34	0.18	0.24	0.23	0.60	0.18	0.37	0.24	0.27	0.20	0.36	0.24	0.22	0.22	0.19	1.11	1.25	2.07	1.56
C6	0.06	0.28	0.08	0.15	0.09	0.27	0.34	0.16	0.26	0.56	0.07	0.27	0.43	0.61	0.22	0.04	0.25	0.19	0.46	0.43	1.27	0.73
N1	0.07	0.28	0.09	0.15	0.14	0.31	0.44	0.18	0.36	0.66	0.07	0.28	0.58	0.75	0.27	0.05	0.24	0.22	0.45	0.40	1.28	0.72
N3	0.08	0.15	0.15	0.21	0.27	0.53	0.67	0.46	0.61	0.90	0.22	0.20	0.89	1.04	0.39	0.14	0.25	0.35	0.15	0.13	0.79	0.27
N4	0.10	0.08	0.18	0.26	0.34	0.63	0.72	0.64	0.65	0.94	0.31	0.11	0.90	1.07	0.45	0.19	0.25	0.39	0.22	0.37	0.44	0.18
O2	0.08	0.23	0.13	0.17	0.22	0.44	0.63	0.32	0.57	0.86	0.16	0.26	0.87	1.01	0.36	0.11	0.25	0.31	0.29	0.18	1.08	0.51
O2'	0.13	0.46	0.08	0.15	0.14	0.19	0.37	0.17	0.29	0.58	0.22	0.42	0.51	0.67	0.21	0.05	0.23	0.19	0.71	0.76	1.65	1.08
O3'	0.18	0.51	0.09	0.16	0.18	0.07	0.29	0.36	0.23	0.46	0.28	0.47	0.39	0.53	0.19	0.07	0.22	0.14	0.89	1.00	1.76	1.28
O4'	0.10	0.30	0.13	0.24	0.12	0.13	0.29	0.29	0.20	0.50	0.13	0.26	0.34	0.53	0.24	0.12	0.25	0.08	0.80	0.85	1.76	1.18
O5'	0.17	0.28	0.19	0.32	0.14	0.22	0.19	0.55	0.12	0.36	0.18	0.24	0.17	0.35	0.22	0.22	0.25	0.18	1.03	1.12	1.89	1.41
OP1	0.33	0.20	0.37	0.51	0.24	0.58	0.20	1.02	0.18	0.25	0.19	0.24	0.18	0.21	0.28	0.41	0.30	0.48	1.46	1.61	2.31	1.92
OP2	0.25	0.19	0.27	0.39	0.17	0.35	0.16	0.66	0.13	0.27	0.17	0.17	0.12	0.22	0.23	0.38	0.33	0.30	1.04	1.06	1.67	1.32
P	0.25	0.17	0.27	0.41	0.17	0.38	0.17	0.74	0.13	0.27	0.15	0.16	0.12	0.22	0.24	0.34	0.25	0.32	1.20	1.29	2.04	1.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.27	0.00	0.06	0.07	0.10	0.10
C2	0.03	0.00	0.16	0.23	0.00	0.51	0.01	0.95	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.24	0.45	0.81	0.93	0.52	0.81
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.16	0.07	0.07	0.12	0.16	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.30	0.30	0.47	0.35
C3'	0.02	0.23	0.00	0.00	0.07	0.00	0.18	0.02	0.12	0.40	0.12	0.25	0.19	0.37	0.16	0.02	0.01	0.00	0.13	0.23	0.38	0.23
C4	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.19	0.00	0.36	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.14	0.24	0.15	0.20	0.25	0.12
C4'	0.01	0.51	0.01	0.00	0.19	0.00	0.02	0.01	0.15	0.37	0.36	0.50	0.06	0.26	0.08	0.23	0.03	0.00	0.02	0.15	0.14	0.06
C5	0.02	0.01	0.04	0.18	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.25	0.07	0.12	0.26	0.28	0.76	0.44
C5'	0.04	0.95	0.16	0.02	0.36	0.01	0.09	0.00	0.31	0.56	0.69	0.89	0.15	0.41	0.07	0.06	0.14	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01
C6	0.03	0.00	0.07	0.12	0.01	0.15	0.01	0.31	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.22	0.10	0.21	0.08	0.11	0.57	0.20
C8	0.02	0.02	0.07	0.40	0.01	0.37	0.01	0.56	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.32	0.06	0.22	0.94	0.92	1.31	1.12
N1	0.03	0.00	0.12	0.12	0.00	0.36	0.01	0.69	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.17	0.35	0.47	0.56	0.16	0.41
N3	0.03	0.00	0.16	0.25	0.00	0.50	0.01	0.89	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.27	0.45	0.77	0.85	0.52	0.74
N6	0.02	0.00	0.05	0.19	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.27	0.10	0.15	0.23	0.30	0.91	0.47
N7	0.02	0.02	0.04	0.37	0.01	0.26	0.01	0.41	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.33	0.09	0.11	0.83	0.89	1.42	1.09
N9	0.01	0.01	0.01	0.16	0.01	0.08	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.18	0.10	0.01	0.30	0.25	0.53	0.40
O2'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.14	0.23	0.25	0.06	0.22	0.32	0.14	0.09	0.27	0.33	0.18	0.00	0.02	0.16	0.26	0.23	0.65	0.37
O3'	0.27	0.24	0.02	0.01	0.14	0.03	0.07	0.14	0.10	0.06	0.17	0.27	0.10	0.09	0.10	0.02	0.00	0.18	0.08	0.19	0.34	0.15
O4'	0.00	0.45	0.02	0.00	0.24	0.00	0.12	0.01	0.21	0.22	0.35	0.45	0.15	0.11	0.01	0.16	0.18	0.00	0.16	0.07	0.20	0.20
O5'	0.06	0.81	0.30	0.13	0.15	0.02	0.26	0.01	0.08	0.94	0.47	0.77	0.23	0.83	0.30	0.26	0.08	0.16	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.93	0.30	0.23	0.20	0.15	0.28	0.05	0.11	0.92	0.56	0.85	0.30	0.89	0.25	0.23	0.19	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.52	0.47	0.38	0.25	0.14	0.76	0.04	0.57	1.31	0.16	0.52	0.91	1.42	0.53	0.65	0.34	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.81	0.35	0.23	0.12	0.06	0.44	0.01	0.20	1.12	0.41	0.74	0.47	1.09	0.40	0.37	0.15	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00