Doublet Group distance statistics: 54244

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.009, 0.031, 0.054, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.031 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.011, 0.037, 0.063, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.037 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.104, 0.430, 0.757, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.430 std_dev=0.327
O4'	A	0, 0.145, 0.497, 0.848, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.497 std_dev=0.351
C3'	B	0, 0.135, 0.498, 0.860, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.498 std_dev=0.363
O4'	B	0, 0.135, 0.519, 0.903, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.519 std_dev=0.384
C2'	B	0, 0.160, 0.549, 0.939, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.549 std_dev=0.389
O3'	B	0, 0.107, 0.499, 0.892, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.499 std_dev=0.393
C1'	B	0, 0.172, 0.586, 1.000, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.586 std_dev=0.414
O5'	A	0, 0.181, 0.636, 1.092, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.636 std_dev=0.455
C4'	B	0, 0.191, 0.745, 1.299, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.745 std_dev=0.554
P	A	0, 0.223, 0.796, 1.369, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.796 std_dev=0.573
O2'	B	0, 0.252, 0.862, 1.473, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.862 std_dev=0.610
C5'	A	0, 0.253, 0.867, 1.481, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.867 std_dev=0.614
C4'	A	0, 0.253, 0.869, 1.485, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.869 std_dev=0.616
O2'	A	0, 0.268, 0.953, 1.638, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.953 std_dev=0.685
C3'	A	0, 0.309, 1.066, 1.822, 1.684 max_d=1.684 avg_d=1.066 std_dev=0.757
OP1	A	0, 0.315, 1.081, 1.847, 1.681 max_d=1.681 avg_d=1.081 std_dev=0.766
N9	B	0, 0.322, 1.112, 1.901, 1.753 max_d=1.753 avg_d=1.112 std_dev=0.789
C5'	B	0, 0.373, 1.355, 2.336, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.355 std_dev=0.982
OP2	A	0, 0.374, 1.389, 2.405, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.389 std_dev=1.016
C8	B	0, 0.401, 1.428, 2.455, 2.370 max_d=2.370 avg_d=1.428 std_dev=1.027
O5'	B	0, 0.444, 1.589, 2.733, 2.649 max_d=2.649 avg_d=1.589 std_dev=1.144
C4	B	0, 0.466, 1.617, 2.769, 2.587 max_d=2.587 avg_d=1.617 std_dev=1.151
N3	B	0, 0.536, 1.859, 3.182, 2.972 max_d=2.972 avg_d=1.859 std_dev=1.323
O3'	A	0, 0.545, 1.876, 3.208, 2.949 max_d=2.949 avg_d=1.876 std_dev=1.331
N7	B	0, 0.546, 1.953, 3.360, 3.261 max_d=3.261 avg_d=1.953 std_dev=1.407
C5	B	0, 0.574, 2.027, 3.481, 3.336 max_d=3.336 avg_d=2.027 std_dev=1.454
P	B	0, 0.651, 2.292, 3.933, 3.755 max_d=3.755 avg_d=2.292 std_dev=1.641
C2	B	0, 0.686, 2.407, 4.128, 3.926 max_d=3.926 avg_d=2.407 std_dev=1.721
C6	B	0, 0.723, 2.575, 4.427, 4.277 max_d=4.277 avg_d=2.575 std_dev=1.852
OP2	B	0, 0.790, 2.730, 4.669, 4.327 max_d=4.327 avg_d=2.730 std_dev=1.939
N1	B	0, 0.767, 2.721, 4.675, 4.497 max_d=4.497 avg_d=2.721 std_dev=1.954
OP1	B	0, 0.840, 2.940, 5.040, 4.774 max_d=4.774 avg_d=2.940 std_dev=2.100
N6	B	0, 0.845, 3.049, 5.253, 5.135 max_d=5.135 avg_d=3.049 std_dev=2.204

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.17	0.00	0.14	0.17	0.35	0.20
C2	0.01	0.00	0.07	0.16	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.05	0.03	0.08	0.12	0.30	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.03	0.07	0.11	0.08	0.02	0.05	0.03	0.14	0.00	0.04	0.01	0.24	0.28	0.50	0.33
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.21	0.00	0.20	0.02	0.17	0.14	0.20	0.23	0.14	0.01	0.00	0.02	0.05	0.08	0.22	0.07
C4	0.01	0.00	0.04	0.21	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.13	0.02	0.08	0.11	0.27	0.13
C4'	0.01	0.04	0.03	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.06	0.08	0.03	0.19	0.01	0.00	0.01	0.03	0.15	0.03
C5	0.01	0.00	0.07	0.20	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.15	0.03	0.08	0.09	0.25	0.12
C5'	0.06	0.01	0.11	0.02	0.08	0.00	0.10	0.00	0.08	0.03	0.04	0.09	0.02	0.08	0.14	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.04	0.06	0.06	0.19	0.09
N1	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.01	0.09	0.11	0.27	0.14
N3	0.01	0.00	0.05	0.20	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.07	0.02	0.08	0.11	0.27	0.13
N4	0.01	0.00	0.03	0.23	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.20	0.15	0.02	0.10	0.14	0.31	0.15
O2	0.00	0.01	0.14	0.14	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.09	0.04	0.09	0.15	0.36	0.18
O2'	0.03	0.17	0.00	0.01	0.19	0.19	0.15	0.08	0.11	0.11	0.20	0.20	0.20	0.00	0.06	0.14	0.15	0.16	0.51	0.26
O3'	0.17	0.05	0.04	0.00	0.13	0.01	0.15	0.14	0.12	0.08	0.07	0.15	0.09	0.06	0.00	0.12	0.16	0.18	0.24	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.14	0.12	0.00	0.10	0.07	0.22	0.10
O5'	0.14	0.08	0.24	0.05	0.08	0.01	0.08	0.01	0.06	0.09	0.08	0.10	0.09	0.15	0.16	0.10	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.17	0.12	0.28	0.08	0.11	0.03	0.09	0.03	0.06	0.11	0.11	0.14	0.15	0.16	0.18	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.35	0.30	0.50	0.22	0.27	0.15	0.25	0.09	0.19	0.27	0.27	0.31	0.36	0.51	0.24	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.15	0.33	0.07	0.13	0.03	0.12	0.01	0.09	0.14	0.13	0.15	0.18	0.26	0.16	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.68	0.06	0.12	0.56	0.08	0.74	0.17	0.88	0.54	0.86	0.50	0.96	0.70	0.42	0.20	0.13	0.16	0.35	0.30	0.52	0.40
C2	0.14	0.27	0.07	0.14	0.36	0.17	0.57	0.30	0.60	0.52	0.44	0.19	0.69	0.65	0.34	0.25	0.04	0.21	0.48	0.52	0.66	0.55
C2'	0.20	0.57	0.13	0.17	0.49	0.14	0.65	0.22	0.76	0.51	0.73	0.43	0.85	0.64	0.40	0.18	0.06	0.20	0.39	0.38	0.53	0.43
C3'	0.19	0.80	0.06	0.02	0.56	0.01	0.68	0.04	0.85	0.45	0.91	0.59	0.92	0.60	0.39	0.17	0.17	0.13	0.20	0.12	0.29	0.20
C4	0.14	0.15	0.13	0.17	0.16	0.22	0.26	0.34	0.22	0.35	0.17	0.09	0.25	0.36	0.21	0.23	0.05	0.22	0.48	0.51	0.53	0.51
C4'	0.34	1.02	0.20	0.13	0.75	0.10	0.85	0.13	1.01	0.59	1.10	0.81	1.06	0.75	0.56	0.09	0.10	0.26	0.29	0.14	0.38	0.29
C5	0.18	0.24	0.14	0.16	0.31	0.16	0.36	0.24	0.34	0.34	0.29	0.23	0.34	0.38	0.29	0.20	0.06	0.20	0.36	0.30	0.35	0.34
C5'	0.40	1.03	0.28	0.16	0.76	0.13	0.82	0.12	0.96	0.57	1.06	0.86	0.98	0.70	0.58	0.22	0.04	0.29	0.26	0.14	0.30	0.23
C6	0.20	0.47	0.11	0.14	0.46	0.12	0.54	0.19	0.57	0.43	0.53	0.41	0.58	0.51	0.37	0.18	0.10	0.19	0.33	0.25	0.37	0.33
N1	0.18	0.49	0.07	0.13	0.49	0.12	0.64	0.22	0.70	0.51	0.63	0.39	0.76	0.64	0.39	0.21	0.09	0.19	0.39	0.36	0.52	0.43
N3	0.12	0.22	0.11	0.15	0.19	0.21	0.37	0.36	0.33	0.45	0.23	0.14	0.40	0.51	0.25	0.25	0.04	0.22	0.52	0.60	0.68	0.60
N4	0.12	0.28	0.17	0.19	0.09	0.27	0.12	0.42	0.22	0.19	0.28	0.19	0.23	0.16	0.07	0.22	0.11	0.23	0.54	0.61	0.53	0.56
O2	0.13	0.27	0.07	0.13	0.35	0.16	0.62	0.31	0.69	0.56	0.49	0.16	0.86	0.72	0.34	0.27	0.03	0.21	0.50	0.58	0.75	0.61
O2'	0.16	0.58	0.09	0.20	0.52	0.14	0.75	0.28	0.89	0.60	0.82	0.41	1.06	0.78	0.42	0.21	0.09	0.18	0.50	0.53	0.74	0.59
O3'	0.37	1.08	0.18	0.11	0.80	0.13	0.96	0.17	1.17	0.68	1.25	0.83	1.28	0.87	0.61	0.12	0.12	0.31	0.35	0.23	0.48	0.36
O4'	0.31	1.00	0.16	0.14	0.75	0.10	0.87	0.15	1.03	0.62	1.09	0.79	1.07	0.78	0.56	0.10	0.14	0.24	0.32	0.19	0.45	0.34
O5'	0.25	0.82	0.17	0.12	0.59	0.09	0.62	0.09	0.75	0.39	0.85	0.68	0.76	0.51	0.41	0.07	0.19	0.16	0.15	0.08	0.12	0.08
OP1	0.27	0.89	0.18	0.04	0.59	0.04	0.60	0.11	0.75	0.34	0.89	0.74	0.76	0.45	0.40	0.21	0.18	0.13	0.02	0.29	0.09	0.10
OP2	0.06	0.57	0.12	0.23	0.29	0.29	0.32	0.33	0.47	0.06	0.59	0.42	0.48	0.18	0.10	0.27	0.40	0.16	0.20	0.46	0.33	0.32
P	0.17	0.74	0.10	0.05	0.47	0.12	0.49	0.16	0.63	0.25	0.75	0.60	0.63	0.36	0.29	0.20	0.22	0.06	0.03	0.30	0.13	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.03	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.03	0.13	0.15	0.23	0.18
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.04	0.02
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.08	0.09	0.08	0.10	0.09	0.06	0.02	0.00	0.01	0.05	0.14	0.10	0.07
C4	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.01	0.13	0.15	0.22	0.17
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.07	0.04	0.02	0.07	0.07	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.02
C5	0.01	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.18	0.22	0.28	0.23
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.10	0.08	0.04	0.13	0.12	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.13	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.10	0.01	0.18	0.24	0.30	0.24
C8	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.04	0.17	0.19	0.23	0.21
N1	0.02	0.00	0.02	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.10	0.02	0.16	0.20	0.27	0.21
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.09	0.03	0.11	0.12	0.20	0.15
N6	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.20	0.29	0.33	0.27
N7	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.20	0.25	0.30	0.25
N9	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.12	0.13	0.18	0.15
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.07	0.06	0.07	0.08	0.02	0.11	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.03	0.07	0.03	0.13	0.03	0.05
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.10	0.09	0.10	0.09	0.12	0.11	0.06	0.03	0.00	0.01	0.08	0.23	0.21	0.14
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.07	0.11	0.12	0.10
O5'	0.06	0.13	0.02	0.05	0.13	0.01	0.18	0.01	0.18	0.17	0.16	0.11	0.20	0.20	0.12	0.03	0.08	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.15	0.10	0.14	0.15	0.12	0.22	0.13	0.24	0.19	0.20	0.12	0.29	0.25	0.13	0.13	0.23	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.23	0.04	0.10	0.22	0.00	0.28	0.01	0.30	0.23	0.27	0.20	0.33	0.30	0.18	0.03	0.21	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.18	0.02	0.07	0.17	0.02	0.23	0.01	0.24	0.21	0.21	0.15	0.27	0.25	0.15	0.05	0.14	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00