Doublet Group distance statistics: 54252

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.000, 0.042, 0.084, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.042
O2	A	0, 0.000, 0.049, 0.098, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.049 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.000, 0.243, 0.486, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.243 std_dev=0.243
O4'	A	0, 0.000, 0.276, 0.553, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.276 std_dev=0.276
O2'	A	0, 0.000, 0.282, 0.563, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.282 std_dev=0.282
O2'	B	0, 0.000, 0.315, 0.630, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.315 std_dev=0.315
O3'	B	0, 0.000, 0.391, 0.783, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.391 std_dev=0.391
C2'	B	0, 0.000, 0.443, 0.886, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.443 std_dev=0.443
C3'	A	0, 0.000, 0.492, 0.984, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.492 std_dev=0.492
C3'	B	0, 0.000, 0.499, 0.998, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.499 std_dev=0.499
C4'	A	0, 0.000, 0.504, 1.008, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.504 std_dev=0.504
P	A	0, 0.000, 0.555, 1.109, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.555 std_dev=0.555
OP1	A	0, 0.000, 0.630, 1.261, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.630 std_dev=0.630
O5'	A	0, 0.000, 0.635, 1.270, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.635 std_dev=0.635
C4'	B	0, 0.000, 0.657, 1.315, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.657 std_dev=0.657
O3'	A	0, 0.000, 0.672, 1.344, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.672 std_dev=0.672
OP2	A	0, 0.000, 0.688, 1.376, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.688 std_dev=0.688
C1'	B	0, 0.000, 0.739, 1.478, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.739 std_dev=0.739
O4'	B	0, 0.000, 0.751, 1.502, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.751 std_dev=0.751
C5'	A	0, 0.000, 0.788, 1.575, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.788 std_dev=0.788
C5'	B	0, 0.000, 0.862, 1.725, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.862 std_dev=0.862
N9	B	0, 0.000, 1.231, 2.461, 2.461 max_d=2.461 avg_d=1.231 std_dev=1.231
C8	B	0, 0.000, 1.564, 3.128, 3.128 max_d=3.128 avg_d=1.564 std_dev=1.564
C4	B	0, 0.000, 1.676, 3.351, 3.351 max_d=3.351 avg_d=1.676 std_dev=1.676
N7	B	0, 0.000, 1.962, 3.925, 3.925 max_d=3.925 avg_d=1.962 std_dev=1.962
N3	B	0, 0.000, 1.989, 3.978, 3.978 max_d=3.978 avg_d=1.989 std_dev=1.989
C5	B	0, 0.000, 2.000, 3.999, 3.999 max_d=3.999 avg_d=2.000 std_dev=2.000
O5'	B	0, 0.000, 2.039, 4.077, 4.077 max_d=4.077 avg_d=2.039 std_dev=2.039
C6	B	0, 0.000, 2.489, 4.978, 4.978 max_d=4.978 avg_d=2.489 std_dev=2.489
C2	B	0, 0.000, 2.531, 5.061, 5.061 max_d=5.061 avg_d=2.531 std_dev=2.531
OP2	B	0, 0.000, 2.560, 5.121, 5.121 max_d=5.121 avg_d=2.560 std_dev=2.560
P	B	0, 0.000, 2.718, 5.436, 5.436 max_d=5.436 avg_d=2.718 std_dev=2.718
N1	B	0, 0.000, 2.733, 5.466, 5.466 max_d=5.466 avg_d=2.733 std_dev=2.733
N6	B	0, 0.000, 2.845, 5.690, 5.690 max_d=5.690 avg_d=2.845 std_dev=2.845
OP1	B	0, 0.000, 4.109, 8.218, 8.218 max_d=8.218 avg_d=4.109 std_dev=4.109

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.09	0.20	0.11	0.17
C2	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.18	0.03	0.22	0.27	0.28	0.28
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.06	0.00	0.06	0.02	0.12	0.00	0.06	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.14	0.00	0.08	0.02	0.04	0.08	0.17	0.16	0.16	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.01
C4	0.01	0.00	0.01	0.14	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.17	0.04	0.27	0.30	0.39	0.32
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.06	0.05	0.05	0.11	0.04	0.00	0.01	0.11	0.01	0.06
C5	0.02	0.00	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.03	0.24	0.30	0.38	0.32
C5'	0.01	0.09	0.02	0.02	0.11	0.01	0.09	0.00	0.07	0.07	0.11	0.11	0.09	0.11	0.02	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.02	0.20	0.28	0.28	0.29
N1	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.10	0.02	0.19	0.26	0.23	0.26
N3	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.21	0.04	0.26	0.29	0.35	0.31
N4	0.01	0.01	0.02	0.16	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.19	0.04	0.28	0.30	0.42	0.33
O2	0.01	0.01	0.12	0.16	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.21	0.02	0.20	0.26	0.24	0.26
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.11	0.11	0.10	0.11	0.09	0.08	0.11	0.11	0.09	0.00	0.10	0.08	0.04	0.18	0.02	0.10
O3'	0.04	0.18	0.06	0.01	0.17	0.04	0.09	0.02	0.05	0.10	0.21	0.19	0.21	0.10	0.00	0.04	0.10	0.08	0.19	0.11
O4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.08	0.04	0.00	0.09	0.23	0.12	0.18
O5'	0.09	0.22	0.01	0.03	0.27	0.01	0.24	0.00	0.20	0.19	0.26	0.28	0.20	0.04	0.10	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.20	0.27	0.07	0.02	0.30	0.11	0.30	0.06	0.28	0.26	0.29	0.30	0.26	0.18	0.08	0.23	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.28	0.07	0.08	0.39	0.01	0.38	0.01	0.28	0.23	0.35	0.42	0.24	0.02	0.19	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.28	0.03	0.01	0.32	0.06	0.32	0.01	0.29	0.26	0.31	0.33	0.26	0.10	0.11	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.26	0.06	0.28	0.07	0.34	0.26	0.43	0.15	0.55	0.09	0.22	0.27	0.53	0.25	0.17	0.25	0.29	1.13	1.96	1.06	1.30
C2	0.04	0.46	0.02	0.25	0.11	0.32	0.04	0.38	0.09	0.35	0.32	0.39	0.00	0.30	0.09	0.15	0.28	0.25	0.97	1.74	0.80	1.14
C2'	0.01	0.48	0.08	0.13	0.11	0.22	0.09	0.31	0.04	0.43	0.31	0.42	0.09	0.41	0.10	0.27	0.11	0.17	0.99	1.87	1.06	1.20
C3'	0.04	0.44	0.09	0.06	0.11	0.09	0.09	0.13	0.03	0.39	0.28	0.40	0.10	0.38	0.08	0.24	0.05	0.06	0.74	1.46	0.88	0.88
C4	0.10	0.65	0.06	0.16	0.32	0.18	0.21	0.21	0.34	0.10	0.54	0.57	0.28	0.02	0.11	0.16	0.24	0.10	0.62	1.13	0.39	0.72
C4'	0.04	0.20	0.00	0.14	0.07	0.11	0.28	0.15	0.20	0.53	0.02	0.20	0.34	0.55	0.21	0.20	0.10	0.09	0.81	1.51	0.93	0.93
C5	0.08	0.57	0.05	0.16	0.26	0.17	0.15	0.18	0.27	0.14	0.46	0.51	0.20	0.08	0.07	0.17	0.24	0.10	0.56	0.97	0.37	0.62
C5'	0.03	0.18	0.03	0.01	0.04	0.09	0.23	0.12	0.18	0.43	0.02	0.19	0.30	0.46	0.14	0.19	0.03	0.08	0.40	0.84	0.57	0.43
C6	0.02	0.42	0.01	0.23	0.11	0.25	0.03	0.28	0.08	0.33	0.29	0.37	0.01	0.28	0.08	0.17	0.28	0.19	0.76	1.24	0.60	0.82
N1	0.07	0.37	0.04	0.26	0.05	0.32	0.11	0.37	0.01	0.42	0.23	0.33	0.10	0.38	0.15	0.16	0.28	0.25	0.97	1.66	0.82	1.10
N3	0.04	0.58	0.02	0.21	0.23	0.25	0.11	0.30	0.25	0.21	0.47	0.50	0.17	0.14	0.02	0.15	0.26	0.18	0.81	1.48	0.60	0.95
N4	0.18	0.78	0.11	0.10	0.45	0.11	0.37	0.13	0.51	0.06	0.70	0.68	0.46	0.15	0.23	0.15	0.20	0.02	0.47	0.91	0.21	0.56
O2	0.08	0.42	0.04	0.28	0.06	0.36	0.11	0.44	0.02	0.43	0.27	0.35	0.08	0.39	0.15	0.14	0.29	0.30	1.10	2.01	0.97	1.32
O2'	0.12	0.34	0.02	0.26	0.05	0.37	0.28	0.52	0.15	0.63	0.14	0.29	0.31	0.62	0.26	0.22	0.21	0.31	1.27	2.34	1.41	1.56
O3'	0.06	0.48	0.12	0.01	0.14	0.05	0.06	0.08	0.05	0.38	0.32	0.44	0.08	0.37	0.05	0.25	0.01	0.03	0.68	1.42	0.92	0.83
O4'	0.12	0.13	0.08	0.27	0.14	0.27	0.34	0.34	0.26	0.59	0.03	0.13	0.38	0.60	0.29	0.17	0.24	0.22	1.05	1.76	0.99	1.17
O5'	0.03	0.31	0.03	0.01	0.08	0.06	0.08	0.12	0.01	0.31	0.19	0.29	0.08	0.30	0.07	0.09	0.01	0.04	0.24	0.49	0.38	0.22
OP1	0.14	0.06	0.18	0.05	0.20	0.08	0.33	0.23	0.29	0.46	0.16	0.05	0.35	0.48	0.26	0.13	0.02	0.02	0.21	0.32	0.09	0.32
OP2	0.00	0.43	0.03	0.09	0.21	0.08	0.15	0.19	0.25	0.10	0.37	0.37	0.21	0.03	0.04	0.16	0.04	0.04	0.22	0.33	0.03	0.30
P	0.04	0.22	0.07	0.01	0.03	0.07	0.08	0.17	0.01	0.29	0.13	0.20	0.07	0.26	0.10	0.07	0.01	0.03	0.05	0.04	0.12	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.30	0.52	0.31	0.29
C2	0.01	0.00	0.20	0.15	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.25	0.08	0.42	1.01	0.17	0.42
C2'	0.00	0.20	0.00	0.01	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.12	0.15	0.21	0.05	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.20	0.34	0.14	0.20
C3'	0.00	0.15	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.22	0.09	0.16	0.03	0.17	0.06	0.03	0.01	0.01	0.11	0.18	0.02	0.12
C4	0.00	0.00	0.10	0.04	0.00	0.05	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.05	0.39	0.94	0.19	0.40
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.09	0.17	0.04	0.01	0.11	0.16	0.08	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.15	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.10	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.02	0.39	1.11	0.11	0.43
C5'	0.06	0.18	0.01	0.01	0.21	0.00	0.29	0.00	0.29	0.32	0.24	0.15	0.32	0.34	0.20	0.06	0.07	0.02	0.01	0.01	0.12	0.00
C6	0.00	0.00	0.08	0.01	0.00	0.09	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.03	0.04	0.40	1.19	0.08	0.45
C8	0.01	0.00	0.12	0.22	0.00	0.17	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.24	0.05	0.32	0.94	0.17	0.39
N1	0.00	0.00	0.15	0.09	0.00	0.04	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.16	0.07	0.42	1.14	0.11	0.44
N3	0.00	0.00	0.21	0.16	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.24	0.08	0.40	0.89	0.21	0.39
N6	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.11	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.03	0.03	0.39	1.29	0.02	0.46
N7	0.01	0.00	0.07	0.17	0.00	0.16	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.20	0.02	0.34	1.13	0.08	0.42
N9	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.36	0.80	0.23	0.36
O2'	0.01	0.21	0.00	0.03	0.11	0.06	0.05	0.06	0.09	0.07	0.16	0.21	0.07	0.04	0.02	0.00	0.07	0.01	0.11	0.11	0.18	0.10
O3'	0.03	0.25	0.03	0.01	0.08	0.03	0.03	0.07	0.03	0.24	0.16	0.24	0.03	0.20	0.04	0.07	0.00	0.02	0.12	0.20	0.14	0.08
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.04	0.05	0.07	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.27	0.36	0.42	0.24
O5'	0.30	0.42	0.20	0.11	0.39	0.02	0.39	0.01	0.40	0.32	0.42	0.40	0.39	0.34	0.36	0.11	0.12	0.27	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.52	1.01	0.34	0.18	0.94	0.01	1.11	0.01	1.19	0.94	1.14	0.89	1.29	1.13	0.80	0.11	0.20	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.31	0.17	0.14	0.02	0.19	0.15	0.11	0.12	0.08	0.17	0.11	0.21	0.02	0.08	0.23	0.18	0.14	0.42	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.29	0.42	0.20	0.12	0.40	0.01	0.43	0.00	0.45	0.39	0.44	0.39	0.46	0.42	0.36	0.10	0.08	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00