Doublet Group distance statistics: 54253

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
O2	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	B	0, 0.000, 0.144, 0.288, 0.288 max_d=0.288 avg_d=0.144 std_dev=0.144
N9	B	0, 0.000, 0.208, 0.416, 0.416 max_d=0.416 avg_d=0.208 std_dev=0.208
O4'	B	0, 0.000, 0.275, 0.550, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.275 std_dev=0.275
C4	B	0, 0.000, 0.404, 0.808, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.404 std_dev=0.404
C2'	B	0, 0.000, 0.454, 0.909, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.454 std_dev=0.454
O2'	B	0, 0.000, 0.510, 1.020, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.510 std_dev=0.510
C4'	B	0, 0.000, 0.518, 1.035, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.518 std_dev=0.518
C8	B	0, 0.000, 0.524, 1.048, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.524 std_dev=0.524
C3'	B	0, 0.000, 0.552, 1.104, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.552 std_dev=0.552
C5	B	0, 0.000, 0.589, 1.178, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.589 std_dev=0.589
N3	B	0, 0.000, 0.659, 1.318, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.659 std_dev=0.659
N7	B	0, 0.000, 0.681, 1.361, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.681 std_dev=0.681
C5'	B	0, 0.000, 0.700, 1.399, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.700 std_dev=0.700
C6	B	0, 0.000, 0.849, 1.697, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.849 std_dev=0.849
O3'	B	0, 0.000, 0.890, 1.780, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.890 std_dev=0.890
C2	B	0, 0.000, 0.931, 1.862, 1.862 max_d=1.862 avg_d=0.931 std_dev=0.931
N1	B	0, 0.000, 0.997, 1.994, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.997 std_dev=0.997
N6	B	0, 0.000, 1.067, 2.134, 2.134 max_d=2.134 avg_d=1.067 std_dev=1.067
O3'	A	0, 0.000, 1.125, 2.249, 2.249 max_d=2.249 avg_d=1.125 std_dev=1.125
O4'	A	0, 0.000, 1.135, 2.270, 2.270 max_d=2.270 avg_d=1.135 std_dev=1.135
C2'	A	0, 0.000, 1.202, 2.404, 2.404 max_d=2.404 avg_d=1.202 std_dev=1.202
C3'	A	0, 0.000, 1.363, 2.726, 2.726 max_d=2.726 avg_d=1.363 std_dev=1.363
O5'	B	0, 0.000, 1.489, 2.978, 2.978 max_d=2.978 avg_d=1.489 std_dev=1.489
C4'	A	0, 0.000, 1.490, 2.979, 2.979 max_d=2.979 avg_d=1.490 std_dev=1.490
OP2	B	0, 0.000, 1.743, 3.486, 3.486 max_d=3.486 avg_d=1.743 std_dev=1.743
O2'	A	0, 0.000, 1.871, 3.741, 3.741 max_d=3.741 avg_d=1.871 std_dev=1.871
P	B	0, 0.000, 1.887, 3.774, 3.774 max_d=3.774 avg_d=1.887 std_dev=1.887
OP1	B	0, 0.000, 2.044, 4.087, 4.087 max_d=4.087 avg_d=2.044 std_dev=2.044
C5'	A	0, 0.000, 2.588, 5.175, 5.175 max_d=5.175 avg_d=2.588 std_dev=2.588
O5'	A	0, 0.000, 3.203, 6.406, 6.406 max_d=6.406 avg_d=3.203 std_dev=3.203
P	A	0, 0.000, 4.323, 8.647, 8.647 max_d=8.647 avg_d=4.323 std_dev=4.323
OP2	A	0, 0.000, 4.994, 9.988, 9.988 max_d=9.988 avg_d=4.994 std_dev=4.994
OP1	A	0, 0.000, 5.351, 10.701, 10.701 max_d=10.701 avg_d=5.351 std_dev=5.351

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.00	0.20	0.23	0.64	0.31
C2	0.00	0.00	0.27	0.29	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.01	0.16	0.20	0.26	1.09	0.49
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.03	0.00	0.26	0.16	0.33	0.03	0.18	0.03	0.54	0.00	0.01	0.02	0.00	0.09	0.31	0.02
C3'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.19	0.00	0.05	0.01	0.02	0.11	0.29	0.21	0.39	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.15	0.01
C4	0.01	0.01	0.03	0.19	0.00	0.07	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.30	0.02	0.01	0.46	0.51	1.64	0.86
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.04	0.03	0.08	0.03	0.21	0.00	0.00	0.00	0.14	0.09	0.01
C5	0.01	0.00	0.26	0.05	0.00	0.10	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.51	0.12	0.15	0.61	0.63	1.72	0.98
C5'	0.05	0.03	0.16	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.00	0.04	0.06	0.04	0.18	0.00	0.01	0.20	0.13	0.00
C6	0.01	0.00	0.33	0.02	0.00	0.10	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.51	0.18	0.20	0.59	0.57	1.47	0.86
N1	0.00	0.00	0.03	0.11	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.12	0.00	0.34	0.35	1.10	0.57
N3	0.00	0.00	0.18	0.29	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.11	0.29	0.35	1.37	0.65
N4	0.01	0.01	0.03	0.21	0.00	0.08	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.00	0.01	0.48	0.55	1.78	0.94
O2	0.00	0.00	0.54	0.39	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.42	0.09	0.29	0.02	0.10	0.80	0.28
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.30	0.21	0.51	0.04	0.51	0.17	0.05	0.32	0.42	0.00	0.02	0.14	0.19	0.25	0.30	0.12
O3'	0.24	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.12	0.18	0.18	0.12	0.04	0.00	0.09	0.02	0.00	0.16	0.01	0.35	0.04	0.02
O4'	0.00	0.16	0.02	0.01	0.01	0.00	0.15	0.00	0.20	0.00	0.11	0.01	0.29	0.14	0.16	0.00	0.24	0.23	0.57	0.32
O5'	0.20	0.20	0.00	0.00	0.46	0.00	0.61	0.01	0.59	0.34	0.29	0.48	0.02	0.19	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.23	0.26	0.09	0.22	0.51	0.14	0.63	0.20	0.57	0.35	0.35	0.55	0.10	0.25	0.35	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.64	1.09	0.31	0.15	1.64	0.09	1.72	0.13	1.47	1.10	1.37	1.78	0.80	0.30	0.04	0.57	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.31	0.49	0.02	0.01	0.86	0.01	0.98	0.00	0.86	0.57	0.65	0.94	0.28	0.12	0.02	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.57	0.09	0.14	0.23	0.17	0.19	0.20	0.34	0.09	0.52	0.45	0.30	0.00	0.03	0.11	0.18	0.12	0.29	0.64	0.72	0.68
C2	0.05	0.54	0.09	0.10	0.21	0.10	0.14	0.11	0.28	0.14	0.47	0.44	0.23	0.06	0.00	0.10	0.12	0.09	0.08	0.44	0.65	0.50
C2'	0.26	0.46	0.44	0.54	0.10	0.50	0.10	0.51	0.27	0.21	0.45	0.29	0.27	0.08	0.13	0.52	0.70	0.33	0.56	0.83	0.83	0.84
C3'	0.18	1.10	0.03	0.13	0.64	0.17	0.64	0.24	0.86	0.24	1.08	0.88	0.87	0.41	0.35	0.05	0.30	0.01	0.36	0.72	0.58	0.67
C4	0.05	0.45	0.07	0.09	0.18	0.10	0.10	0.12	0.21	0.15	0.37	0.38	0.16	0.07	0.01	0.07	0.09	0.10	0.09	0.41	0.64	0.49
C4'	0.23	1.18	0.22	0.05	0.68	0.11	0.65	0.22	0.88	0.22	1.13	0.97	0.86	0.38	0.37	0.17	0.03	0.01	0.46	0.92	0.76	0.86
C5	0.04	0.46	0.05	0.12	0.19	0.18	0.14	0.21	0.25	0.09	0.39	0.39	0.21	0.02	0.02	0.06	0.14	0.14	0.30	0.58	0.69	0.65
C5'	0.33	1.51	0.34	0.08	0.90	0.18	0.88	0.35	1.17	0.35	1.47	1.24	1.16	0.56	0.52	0.28	0.03	0.02	0.69	1.20	0.88	1.08
C6	0.04	0.51	0.07	0.14	0.22	0.19	0.17	0.23	0.29	0.08	0.45	0.41	0.25	0.00	0.03	0.08	0.17	0.15	0.35	0.65	0.72	0.70
N1	0.04	0.55	0.08	0.13	0.23	0.15	0.17	0.18	0.31	0.10	0.49	0.44	0.27	0.01	0.02	0.10	0.16	0.12	0.24	0.58	0.70	0.64
N3	0.06	0.49	0.09	0.08	0.18	0.07	0.11	0.07	0.23	0.17	0.41	0.41	0.17	0.09	0.01	0.09	0.09	0.08	0.00	0.35	0.61	0.42
N4	0.06	0.36	0.06	0.06	0.13	0.06	0.05	0.07	0.14	0.18	0.28	0.33	0.08	0.12	0.04	0.04	0.05	0.09	0.03	0.28	0.58	0.37
O2	0.06	0.56	0.10	0.10	0.20	0.08	0.13	0.08	0.28	0.16	0.48	0.44	0.23	0.08	0.01	0.11	0.12	0.08	0.02	0.40	0.64	0.45
O2'	0.73	0.24	0.94	0.96	0.50	0.82	0.50	0.78	0.37	0.69	0.25	0.37	0.37	0.61	0.65	0.98	1.09	0.69	0.75	0.94	1.06	1.00
O3'	0.01	0.91	0.15	0.27	0.44	0.30	0.45	0.35	0.68	0.05	0.90	0.68	0.69	0.22	0.15	0.22	0.42	0.15	0.44	0.78	0.69	0.75
O4'	0.19	0.97	0.24	0.13	0.54	0.03	0.48	0.13	0.67	0.11	0.90	0.82	0.62	0.23	0.28	0.24	0.12	0.01	0.35	0.81	0.77	0.80
O5'	0.94	2.06	1.05	0.80	1.48	0.46	1.44	0.25	1.71	0.91	2.00	1.82	1.68	1.11	1.11	1.01	0.75	0.56	0.17	0.77	0.41	0.63
OP1	1.24	2.78	1.39	1.01	2.01	0.53	2.00	0.22	2.38	1.29	2.75	2.42	2.37	1.57	1.51	1.29	0.91	0.69	0.33	1.06	0.41	0.79
OP2	2.47	3.71	2.53	2.21	3.12	1.84	3.11	1.61	3.40	2.53	3.68	3.46	3.39	2.77	2.71	2.42	2.04	2.02	1.15	0.53	1.08	0.75
P	1.57	2.83	1.69	1.37	2.21	0.97	2.19	0.72	2.49	1.60	2.79	2.55	2.48	1.84	1.79	1.61	1.27	1.11	0.23	0.41	0.12	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.19	0.14	0.02	0.09
C2	0.03	0.00	0.17	0.31	0.01	0.13	0.02	0.18	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.41	0.03	0.18	0.26	0.33	0.30
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.05	0.09	0.11	0.18	0.03	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.10	0.07	0.01
C3'	0.02	0.31	0.01	0.00	0.17	0.00	0.10	0.01	0.17	0.11	0.25	0.29	0.13	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.14	0.12	0.03
C4	0.02	0.01	0.08	0.17	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.21	0.02	0.23	0.29	0.32	0.31
C4'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.04	0.12	0.12	0.08	0.00	0.02	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.09
C5	0.02	0.02	0.02	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.28	0.37	0.45	0.42
C5'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.11	0.00	0.09	0.00	0.14	0.04	0.17	0.15	0.13	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.13	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.17	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.22	0.01	0.25	0.37	0.47	0.43
C8	0.00	0.02	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.02	0.35	0.39	0.40	0.41
N1	0.03	0.00	0.11	0.25	0.00	0.12	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.34	0.03	0.21	0.32	0.42	0.38
N3	0.04	0.00	0.18	0.29	0.01	0.12	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.37	0.04	0.18	0.23	0.27	0.25
N6	0.01	0.02	0.03	0.13	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.18	0.00	0.26	0.41	0.53	0.48
N7	0.01	0.02	0.06	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.34	0.43	0.51	0.48
N9	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.27	0.28	0.25	0.28
O2'	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.06	0.02	0.01	0.04	0.06	0.03	0.00	0.05	0.03	0.09	0.09	0.15	0.20
O3'	0.03	0.41	0.03	0.01	0.21	0.00	0.13	0.01	0.22	0.11	0.34	0.37	0.18	0.04	0.05	0.05	0.00	0.01	0.16	0.06	0.08	0.07
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.22	0.10	0.11	0.03
O5'	0.19	0.18	0.05	0.02	0.23	0.00	0.28	0.01	0.25	0.35	0.21	0.18	0.26	0.34	0.27	0.09	0.16	0.22	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.14	0.26	0.10	0.14	0.29	0.04	0.37	0.13	0.37	0.39	0.32	0.23	0.41	0.43	0.28	0.09	0.06	0.10	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.33	0.07	0.12	0.32	0.10	0.45	0.05	0.47	0.40	0.42	0.27	0.53	0.51	0.25	0.15	0.08	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.30	0.01	0.03	0.31	0.09	0.42	0.01	0.43	0.41	0.38	0.25	0.48	0.48	0.28	0.20	0.07	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00