Doublet Group distance statistics: 54258

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 12, 8, 2, 2, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N4	A	0, 0.019, 0.039, 0.058, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.039 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.010, 0.033, 0.055, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.033 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.031, 0.087, 0.143, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.087 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.027, 0.084, 0.140, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.084 std_dev=0.057
O2'	A	0, 0.050, 0.114, 0.179, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.114 std_dev=0.065
C3'	A	0, 0.060, 0.145, 0.230, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.145 std_dev=0.085
C4'	A	0, 0.034, 0.123, 0.212, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.123 std_dev=0.089
O3'	A	0, 0.096, 0.223, 0.349, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.223 std_dev=0.127
C5'	A	0, 0.077, 0.221, 0.365, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.221 std_dev=0.144
O2'	B	0, 0.262, 0.476, 0.690, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.476 std_dev=0.214
C2'	B	0, 0.151, 0.510, 0.869, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.510 std_dev=0.359
C1'	B	0, 0.041, 0.483, 0.925, 2.259 max_d=2.259 avg_d=0.483 std_dev=0.442
O5'	A	0, -0.094, 0.366, 0.827, 2.266 max_d=2.266 avg_d=0.366 std_dev=0.461
N9	B	0, 0.048, 0.557, 1.066, 2.584 max_d=2.584 avg_d=0.557 std_dev=0.509
C4	B	0, 0.055, 0.645, 1.235, 2.955 max_d=2.955 avg_d=0.645 std_dev=0.590
O4'	B	0, -0.103, 0.500, 1.102, 3.040 max_d=3.040 avg_d=0.500 std_dev=0.603
C3'	B	0, -0.066, 0.571, 1.207, 3.211 max_d=3.211 avg_d=0.571 std_dev=0.636
C5	B	0, 0.062, 0.709, 1.356, 3.125 max_d=3.125 avg_d=0.709 std_dev=0.647
C4'	B	0, -0.134, 0.525, 1.184, 3.306 max_d=3.306 avg_d=0.525 std_dev=0.659
O3'	B	0, -0.105, 0.611, 1.327, 3.609 max_d=3.609 avg_d=0.611 std_dev=0.716
C5'	B	0, -0.198, 0.576, 1.350, 3.860 max_d=3.860 avg_d=0.576 std_dev=0.774
O5'	B	0, -0.249, 0.538, 1.325, 3.859 max_d=3.859 avg_d=0.538 std_dev=0.787
C6	B	0, 0.035, 0.823, 1.611, 3.743 max_d=3.743 avg_d=0.823 std_dev=0.788
C8	B	0, -0.176, 0.658, 1.491, 4.107 max_d=4.107 avg_d=0.658 std_dev=0.834
P	B	0, -0.294, 0.573, 1.441, 4.078 max_d=4.078 avg_d=0.573 std_dev=0.867
O6	B	0, 0.041, 0.910, 1.778, 4.003 max_d=4.003 avg_d=0.910 std_dev=0.868
OP2	B	0, -0.266, 0.603, 1.472, 4.012 max_d=4.012 avg_d=0.603 std_dev=0.869
N7	B	0, -0.128, 0.742, 1.612, 4.247 max_d=4.247 avg_d=0.742 std_dev=0.870
OP1	B	0, -0.251, 0.655, 1.560, 4.168 max_d=4.168 avg_d=0.655 std_dev=0.906
P	A	0, -0.391, 0.523, 1.437, 4.409 max_d=4.409 avg_d=0.523 std_dev=0.914
N3	B	0, -0.170, 0.758, 1.687, 4.622 max_d=4.622 avg_d=0.758 std_dev=0.929
N1	B	0, -0.165, 0.904, 1.974, 5.203 max_d=5.203 avg_d=0.904 std_dev=1.070
OP1	A	0, -0.532, 0.611, 1.754, 5.478 max_d=5.478 avg_d=0.611 std_dev=1.143
C2	B	0, -0.310, 0.894, 2.097, 5.902 max_d=5.902 avg_d=0.894 std_dev=1.203
OP2	A	0, -0.645, 0.654, 1.953, 6.197 max_d=6.197 avg_d=0.654 std_dev=1.299
N2	B	0, -0.644, 1.062, 2.768, 8.272 max_d=8.272 avg_d=1.062 std_dev=1.706

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.15	0.25	0.13	0.06
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.29	0.07	0.48	0.28
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.08	0.00	0.01	0.01	0.17	0.23	0.06	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.01	0.01	0.01	0.20	0.12	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.02	0.40	0.29	0.85	0.54
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.25	0.22	0.13
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.42	0.37	0.89	0.59
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.09	0.17	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.37	0.23	0.67	0.46
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.28	0.06	0.44	0.27
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.06	0.02	0.35	0.14	0.67	0.41
N4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.02	0.42	0.39	0.97	0.62
O2	0.03	0.01	0.08	0.08	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.08	0.09	0.02	0.22	0.20	0.32	0.15
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.03	0.03	0.06	0.46	0.25	0.20
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.06	0.07	0.09	0.03	0.00	0.01	0.13	0.17	0.31	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.07	0.29	0.09	0.09
O5'	0.15	0.29	0.17	0.20	0.40	0.02	0.42	0.01	0.37	0.28	0.35	0.42	0.22	0.06	0.13	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.25	0.07	0.23	0.12	0.29	0.25	0.37	0.09	0.23	0.06	0.14	0.39	0.20	0.46	0.17	0.29	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.48	0.06	0.08	0.85	0.22	0.89	0.17	0.67	0.44	0.67	0.97	0.32	0.25	0.31	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.28	0.03	0.06	0.54	0.13	0.59	0.02	0.46	0.27	0.41	0.62	0.15	0.20	0.11	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	1.01	0.12	0.19	0.64	0.17	0.61	0.15	0.79	0.23	0.97	1.17	0.85	0.38	0.37	0.21	0.22	0.29	0.26	0.78	0.22	0.32	0.21
C2	0.11	1.02	0.07	0.09	0.62	0.11	0.64	0.15	0.86	0.21	1.03	1.16	0.81	0.39	0.30	0.21	0.11	0.09	0.12	0.87	0.09	0.23	0.13
C2'	0.19	1.12	0.10	0.17	0.63	0.15	0.56	0.12	0.78	0.15	1.04	1.36	0.93	0.26	0.31	0.23	0.25	0.25	0.22	0.74	0.23	0.30	0.19
C3'	0.24	1.10	0.12	0.23	0.63	0.22	0.54	0.19	0.74	0.15	1.00	1.35	0.94	0.25	0.33	0.21	0.32	0.32	0.27	0.69	0.30	0.35	0.26
C4	0.07	0.87	0.09	0.20	0.58	0.28	0.66	0.33	0.86	0.25	0.95	0.92	0.68	0.46	0.28	0.21	0.19	0.14	0.19	0.88	0.16	0.22	0.19
C4'	0.32	0.98	0.18	0.32	0.64	0.33	0.58	0.30	0.72	0.24	0.91	1.15	0.86	0.35	0.41	0.18	0.37	0.43	0.37	0.69	0.36	0.42	0.34
C5	0.12	0.83	0.07	0.13	0.62	0.18	0.66	0.19	0.79	0.32	0.86	0.85	0.70	0.49	0.37	0.21	0.14	0.07	0.11	0.80	0.11	0.24	0.11
C5'	0.38	0.88	0.21	0.39	0.62	0.41	0.55	0.38	0.66	0.28	0.81	1.01	0.80	0.37	0.43	0.14	0.44	0.50	0.43	0.63	0.43	0.47	0.40
C6	0.20	0.89	0.09	0.10	0.64	0.08	0.64	0.07	0.78	0.30	0.89	0.96	0.77	0.45	0.39	0.21	0.13	0.22	0.19	0.77	0.17	0.30	0.17
N1	0.18	0.99	0.09	0.11	0.64	0.08	0.64	0.07	0.82	0.24	0.97	1.11	0.83	0.40	0.36	0.21	0.14	0.20	0.18	0.81	0.14	0.27	0.14
N3	0.07	0.96	0.08	0.16	0.58	0.23	0.64	0.28	0.87	0.21	1.02	1.07	0.74	0.41	0.26	0.21	0.15	0.10	0.17	0.91	0.15	0.23	0.19
N4	0.13	0.74	0.15	0.32	0.49	0.43	0.65	0.50	0.86	0.24	0.89	0.75	0.54	0.47	0.21	0.20	0.29	0.31	0.35	0.93	0.29	0.27	0.32
O2	0.11	1.06	0.07	0.08	0.61	0.09	0.62	0.13	0.86	0.19	1.07	1.24	0.83	0.36	0.29	0.21	0.12	0.10	0.13	0.88	0.09	0.24	0.14
O2'	0.20	1.13	0.10	0.20	0.63	0.19	0.56	0.16	0.78	0.16	1.05	1.39	0.93	0.26	0.31	0.22	0.28	0.27	0.24	0.75	0.24	0.30	0.20
O3'	0.25	1.15	0.14	0.27	0.62	0.25	0.51	0.22	0.71	0.18	1.02	1.45	0.97	0.22	0.31	0.21	0.39	0.33	0.28	0.65	0.35	0.36	0.28
O4'	0.32	0.93	0.19	0.28	0.65	0.29	0.62	0.27	0.76	0.31	0.89	1.05	0.81	0.43	0.44	0.19	0.29	0.42	0.36	0.74	0.31	0.39	0.30
O5'	0.09	0.31	0.18	0.10	0.13	0.14	0.12	0.18	0.17	0.20	0.26	0.42	0.26	0.16	0.10	0.51	0.18	0.15	0.19	0.15	0.23	0.20	0.17
OP1	0.53	0.18	0.77	0.46	0.36	0.28	0.38	0.15	0.30	0.57	0.21	0.14	0.24	0.50	0.48	1.19	0.46	0.26	0.17	0.31	0.31	0.19	0.21
OP2	0.91	0.52	1.06	0.80	0.74	0.76	0.78	0.70	0.70	0.96	0.58	0.38	0.59	0.90	0.87	1.32	0.65	0.75	0.74	0.72	0.70	0.72	0.73
P	0.51	0.18	0.68	0.41	0.36	0.33	0.39	0.26	0.32	0.55	0.22	0.10	0.24	0.50	0.47	1.03	0.36	0.32	0.28	0.33	0.31	0.27	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.00	0.08	0.01	0.26	0.24	0.18
C2	0.02	0.00	0.26	0.52	0.01	0.35	0.01	0.51	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.36	0.14	0.67	0.01	0.91	0.82	0.82
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.12	0.01	0.05	0.09	0.10	0.16	0.19	0.33	0.26	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.07	0.40	0.39	0.32
C3'	0.01	0.52	0.00	0.00	0.26	0.00	0.17	0.01	0.27	0.13	0.42	0.63	0.49	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.22	0.22	0.11	0.11
C4	0.01	0.01	0.12	0.26	0.00	0.16	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.13	0.07	0.23	0.01	0.29	0.15	0.22
C4'	0.01	0.35	0.01	0.00	0.16	0.00	0.08	0.00	0.15	0.15	0.27	0.44	0.33	0.09	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.12	0.13	0.06	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.17	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.07	0.04	0.10	0.01	0.18	0.12	0.09
C5'	0.03	0.51	0.09	0.01	0.19	0.00	0.08	0.00	0.19	0.30	0.39	0.68	0.45	0.21	0.06	0.04	0.10	0.02	0.01	0.14	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.27	0.01	0.15	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.16	0.07	0.25	0.00	0.35	0.24	0.27
C8	0.01	0.01	0.16	0.13	0.00	0.15	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.15	0.07	0.44	0.01	0.58	0.72	0.60
N1	0.01	0.01	0.19	0.42	0.01	0.27	0.00	0.39	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.28	0.11	0.51	0.00	0.71	0.63	0.63
N2	0.02	0.00	0.33	0.63	0.01	0.44	0.01	0.68	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.48	0.17	0.87	0.01	1.27	1.16	1.14
N3	0.02	0.01	0.26	0.49	0.00	0.33	0.00	0.45	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.30	0.13	0.58	0.01	0.72	0.59	0.65
N7	0.01	0.01	0.11	0.04	0.00	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.04	0.31	0.01	0.43	0.59	0.46
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.04	0.01	0.10	0.01	0.25	0.28	0.20
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.08	0.11	0.13	0.04	0.13	0.13	0.10	0.08	0.06	0.15	0.08	0.00	0.03	0.07	0.11	0.15	0.42	0.45	0.32
O3'	0.10	0.36	0.02	0.01	0.13	0.02	0.07	0.10	0.16	0.15	0.28	0.48	0.30	0.08	0.04	0.03	0.00	0.07	0.12	0.14	0.21	0.11	0.14
O4'	0.00	0.14	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.02	0.07	0.07	0.11	0.17	0.13	0.04	0.01	0.07	0.07	0.00	0.05	0.06	0.15	0.10	0.08
O5'	0.08	0.67	0.16	0.04	0.23	0.01	0.10	0.01	0.25	0.44	0.51	0.87	0.58	0.31	0.10	0.11	0.12	0.05	0.00	0.18	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.22	0.01	0.12	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.06	0.18	0.00	0.28	0.17	0.19
OP1	0.26	0.91	0.40	0.22	0.29	0.13	0.18	0.05	0.35	0.58	0.71	1.27	0.72	0.43	0.25	0.42	0.21	0.15	0.02	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.82	0.39	0.11	0.15	0.06	0.12	0.02	0.24	0.72	0.63	1.16	0.59	0.59	0.28	0.45	0.11	0.10	0.02	0.17	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.82	0.32	0.11	0.22	0.06	0.09	0.01	0.27	0.60	0.63	1.14	0.65	0.46	0.20	0.32	0.14	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00