Doublet Group distance statistics: 54270

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.004, 0.008, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.016, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.002, 0.016, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.010, 0.038, 0.066, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.038 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.004, 0.048, 0.092, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.048 std_dev=0.044
P	B	0, 0.119, 0.267, 0.414, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.267 std_dev=0.147
O4'	B	0, 0.112, 0.301, 0.491, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.301 std_dev=0.190
C1'	B	0, 0.089, 0.281, 0.474, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.281 std_dev=0.193
OP2	B	0, 0.202, 0.410, 0.619, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.410 std_dev=0.209
C3'	B	0, 0.163, 0.396, 0.630, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.396 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.126, 0.376, 0.626, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.376 std_dev=0.250
N9	B	0, 0.088, 0.339, 0.590, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.339 std_dev=0.251
N3	B	0, 0.154, 0.414, 0.673, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.414 std_dev=0.259
C4'	B	0, 0.134, 0.400, 0.666, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.400 std_dev=0.266
N1	B	0, 0.221, 0.495, 0.770, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.495 std_dev=0.275
C2	B	0, 0.204, 0.478, 0.753, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.478 std_dev=0.275
C2'	B	0, 0.171, 0.449, 0.728, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.449 std_dev=0.278
C5	B	0, 0.145, 0.478, 0.811, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.478 std_dev=0.333
C6	B	0, 0.193, 0.530, 0.867, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.530 std_dev=0.337
O4'	A	0, -0.028, 0.309, 0.646, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.309 std_dev=0.337
O3'	B	0, 0.129, 0.467, 0.805, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.467 std_dev=0.338
OP1	B	0, 0.187, 0.528, 0.870, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.528 std_dev=0.341
N2	B	0, 0.243, 0.595, 0.947, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.595 std_dev=0.352
C8	B	0, 0.093, 0.465, 0.837, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.465 std_dev=0.372
O5'	B	0, 0.210, 0.616, 1.023, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.616 std_dev=0.407
O5'	A	0, 0.132, 0.548, 0.964, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.548 std_dev=0.416
O6	B	0, 0.214, 0.638, 1.063, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.638 std_dev=0.425
C5'	B	0, 0.149, 0.578, 1.006, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.578 std_dev=0.428
N7	B	0, 0.122, 0.558, 0.993, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.558 std_dev=0.435
C2'	A	0, -0.080, 0.361, 0.803, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.361 std_dev=0.442
O2'	B	0, 0.194, 0.646, 1.098, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.646 std_dev=0.452
P	A	0, 0.153, 0.615, 1.077, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.615 std_dev=0.462
C4'	A	0, 0.009, 0.501, 0.993, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.501 std_dev=0.492
C3'	A	0, -0.015, 0.506, 1.026, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.506 std_dev=0.521
OP2	A	0, 0.177, 0.701, 1.225, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.701 std_dev=0.524
O3'	A	0, 0.013, 0.580, 1.146, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.580 std_dev=0.566
O2'	A	0, -0.115, 0.540, 1.195, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.540 std_dev=0.655
OP1	A	0, 0.141, 0.812, 1.483, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.812 std_dev=0.671
C5'	A	0, -0.019, 0.839, 1.698, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.839 std_dev=0.859

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.26	0.33	0.12	0.17
C2	0.01	0.00	0.11	0.19	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.16	0.05	0.32	0.34	0.10	0.19
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.03	0.14	0.03	0.16	0.03	0.06	0.05	0.25	0.00	0.05	0.00	0.08	0.09	0.39	0.11
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.08	0.07	0.17	0.09	0.30	0.01	0.01	0.01	0.30	0.04	0.47	0.25
C4	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.05	0.37	0.26	0.10	0.18
C4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.04	0.05	0.10	0.18	0.01	0.00	0.01	0.31	0.27	0.02
C5	0.01	0.00	0.14	0.06	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.06	0.05	0.36	0.21	0.11	0.16
C5'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.12	0.00	0.19	0.00	0.17	0.06	0.07	0.14	0.09	0.15	0.07	0.01	0.01	0.40	0.37	0.02
C6	0.01	0.01	0.16	0.08	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.04	0.36	0.25	0.12	0.17
N1	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.03	0.33	0.32	0.10	0.19
N3	0.00	0.00	0.06	0.17	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.15	0.05	0.35	0.31	0.10	0.19
N4	0.00	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.08	0.05	0.37	0.23	0.10	0.17
O2	0.01	0.00	0.25	0.30	0.00	0.10	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.26	0.05	0.29	0.37	0.09	0.20
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.12	0.18	0.14	0.15	0.12	0.07	0.09	0.13	0.03	0.00	0.05	0.13	0.09	0.27	0.18	0.12
O3'	0.03	0.16	0.05	0.01	0.07	0.01	0.06	0.07	0.09	0.03	0.15	0.08	0.26	0.05	0.00	0.02	0.45	0.08	0.47	0.31
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.13	0.02	0.00	0.40	0.47	0.06	0.28
O5'	0.26	0.32	0.08	0.30	0.37	0.01	0.36	0.01	0.36	0.33	0.35	0.37	0.29	0.09	0.45	0.40	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.33	0.34	0.09	0.04	0.26	0.31	0.21	0.40	0.25	0.32	0.31	0.23	0.37	0.27	0.08	0.47	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.10	0.39	0.47	0.10	0.27	0.11	0.37	0.12	0.10	0.10	0.10	0.09	0.18	0.47	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.19	0.11	0.25	0.18	0.02	0.16	0.02	0.17	0.19	0.19	0.17	0.20	0.12	0.31	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.09	0.13	0.10	0.14	0.13	0.26	0.19	0.28	0.23	0.18	0.08	0.08	0.32	0.14	0.16	0.18	0.11	0.27	0.38	0.12	0.18	0.05
C2	0.09	0.07	0.12	0.15	0.09	0.19	0.21	0.29	0.22	0.22	0.12	0.13	0.07	0.28	0.11	0.09	0.16	0.14	0.29	0.30	0.16	0.18	0.09
C2'	0.14	0.12	0.13	0.23	0.08	0.28	0.16	0.36	0.26	0.08	0.21	0.11	0.07	0.16	0.08	0.08	0.12	0.24	0.25	0.38	0.27	0.42	0.28
C3'	0.23	0.16	0.20	0.29	0.17	0.29	0.11	0.32	0.09	0.14	0.12	0.18	0.19	0.09	0.19	0.14	0.17	0.28	0.24	0.09	0.18	0.32	0.18
C4	0.08	0.05	0.13	0.16	0.09	0.20	0.19	0.33	0.19	0.20	0.11	0.08	0.04	0.25	0.10	0.10	0.14	0.14	0.28	0.25	0.18	0.19	0.10
C4'	0.27	0.32	0.20	0.28	0.28	0.29	0.21	0.26	0.21	0.16	0.28	0.34	0.32	0.12	0.24	0.14	0.17	0.31	0.24	0.15	0.10	0.22	0.11
C5	0.10	0.06	0.15	0.16	0.12	0.18	0.20	0.28	0.19	0.23	0.12	0.05	0.05	0.26	0.14	0.11	0.15	0.13	0.28	0.23	0.16	0.18	0.08
C5'	0.52	0.57	0.45	0.52	0.56	0.49	0.53	0.40	0.50	0.47	0.53	0.57	0.58	0.47	0.52	0.38	0.42	0.54	0.31	0.41	0.20	0.26	0.20
C6	0.11	0.08	0.16	0.13	0.14	0.15	0.23	0.22	0.22	0.26	0.14	0.06	0.07	0.31	0.16	0.15	0.16	0.13	0.28	0.27	0.15	0.17	0.06
N1	0.10	0.08	0.13	0.13	0.13	0.16	0.24	0.24	0.25	0.25	0.15	0.08	0.07	0.32	0.14	0.12	0.17	0.13	0.28	0.32	0.14	0.18	0.07
N3	0.08	0.06	0.12	0.16	0.08	0.20	0.19	0.32	0.20	0.20	0.11	0.12	0.06	0.26	0.10	0.10	0.14	0.14	0.29	0.27	0.18	0.19	0.11
N4	0.06	0.04	0.12	0.17	0.08	0.21	0.17	0.36	0.18	0.18	0.11	0.07	0.03	0.23	0.09	0.13	0.13	0.12	0.27	0.23	0.20	0.20	0.12
O2	0.09	0.09	0.11	0.15	0.08	0.19	0.19	0.29	0.21	0.20	0.11	0.17	0.09	0.27	0.10	0.09	0.16	0.15	0.29	0.31	0.16	0.18	0.09
O2'	0.13	0.40	0.16	0.10	0.32	0.17	0.46	0.28	0.61	0.28	0.55	0.38	0.30	0.42	0.23	0.26	0.19	0.12	0.24	0.76	0.25	0.41	0.27
O3'	0.23	0.20	0.20	0.28	0.19	0.29	0.14	0.31	0.13	0.16	0.17	0.21	0.21	0.12	0.20	0.13	0.16	0.28	0.24	0.10	0.17	0.32	0.18
O4'	0.12	0.24	0.07	0.12	0.12	0.15	0.06	0.14	0.08	0.12	0.17	0.29	0.22	0.19	0.08	0.08	0.08	0.17	0.26	0.14	0.13	0.16	0.07
O5'	0.35	0.26	0.42	0.29	0.32	0.27	0.32	0.27	0.26	0.39	0.24	0.25	0.29	0.38	0.35	0.55	0.41	0.26	0.39	0.23	0.32	0.32	0.29
OP1	0.08	0.18	0.12	0.08	0.14	0.06	0.17	0.09	0.20	0.11	0.20	0.19	0.15	0.15	0.11	0.30	0.05	0.05	0.24	0.23	0.07	0.13	0.06
OP2	0.12	0.20	0.07	0.15	0.18	0.20	0.21	0.20	0.23	0.16	0.22	0.20	0.18	0.20	0.15	0.25	0.09	0.25	0.27	0.24	0.05	0.10	0.09
P	0.10	0.13	0.17	0.02	0.11	0.03	0.12	0.06	0.13	0.11	0.13	0.13	0.12	0.12	0.11	0.36	0.12	0.04	0.23	0.14	0.07	0.13	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.00	0.09	0.01	0.25	0.19	0.08
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.33	0.10	0.16	0.01	0.27	0.20	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.11	0.06	0.03	0.08	0.10	0.08	0.02	0.02	0.00	0.04	0.01	0.11	0.06	0.23	0.34	0.19
C3'	0.03	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.12	0.09	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.23	0.03	0.14	0.23	0.13
C4	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.24	0.06	0.17	0.01	0.25	0.20	0.11
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.07	0.10	0.07	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.27	0.10	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.20	0.04	0.21	0.01	0.23	0.20	0.12
C5'	0.05	0.11	0.11	0.02	0.07	0.01	0.07	0.00	0.08	0.07	0.10	0.12	0.09	0.06	0.06	0.07	0.08	0.01	0.01	0.07	0.23	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.23	0.06	0.21	0.00	0.23	0.20	0.12
C8	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.04	0.21	0.01	0.21	0.21	0.13
N1	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.29	0.09	0.19	0.01	0.25	0.20	0.11
N2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.10	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.37	0.12	0.15	0.01	0.28	0.19	0.09
N3	0.01	0.00	0.08	0.09	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.32	0.10	0.15	0.01	0.27	0.19	0.09
N7	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01	0.23	0.01	0.21	0.21	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.17	0.01	0.16	0.01	0.24	0.20	0.11
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.08	0.03	0.07	0.07	0.09	0.10	0.13	0.19	0.14	0.08	0.04	0.00	0.03	0.03	0.16	0.09	0.21	0.37	0.19
O3'	0.17	0.33	0.04	0.01	0.24	0.01	0.20	0.08	0.23	0.09	0.29	0.37	0.32	0.12	0.17	0.03	0.00	0.12	0.33	0.21	0.15	0.21	0.20
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.09	0.12	0.10	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.19	0.05	0.30	0.06	0.11
O5'	0.09	0.16	0.11	0.23	0.17	0.01	0.21	0.01	0.21	0.21	0.19	0.15	0.15	0.23	0.16	0.16	0.33	0.19	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.21	0.05	0.23	0.00	0.21	0.20	0.12
OP1	0.25	0.27	0.23	0.14	0.25	0.27	0.23	0.23	0.23	0.21	0.25	0.28	0.27	0.21	0.24	0.21	0.15	0.30	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.20	0.34	0.23	0.20	0.10	0.20	0.09	0.20	0.21	0.20	0.19	0.19	0.21	0.20	0.37	0.21	0.06	0.01	0.20	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.10	0.19	0.13	0.11	0.04	0.12	0.01	0.12	0.13	0.11	0.09	0.09	0.13	0.11	0.19	0.20	0.11	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00