Doublet Group distance statistics: 54274

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.013, 0.036, 0.058, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N4	A	0, 0.029, 0.073, 0.118, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.073 std_dev=0.044
O2'	A	0, 0.036, 0.118, 0.200, 0.252 max_d=0.252 avg_d=0.118 std_dev=0.082
C2'	A	0, -0.022, 0.101, 0.223, 0.340 max_d=0.340 avg_d=0.101 std_dev=0.122
O4'	A	0, -0.053, 0.107, 0.267, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.107 std_dev=0.160
O2'	B	0, 0.095, 0.310, 0.525, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.310 std_dev=0.215
C1'	B	0, 0.184, 0.423, 0.662, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.423 std_dev=0.239
C3'	A	0, -0.076, 0.167, 0.410, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.167 std_dev=0.243
C4'	A	0, -0.100, 0.157, 0.414, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.157 std_dev=0.257
P	A	0, -0.068, 0.213, 0.494, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.213 std_dev=0.281
N9	B	0, 0.152, 0.458, 0.763, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.458 std_dev=0.305
O3'	A	0, -0.047, 0.262, 0.571, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.262 std_dev=0.309
C5'	A	0, -0.155, 0.245, 0.644, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.245 std_dev=0.399
O5'	A	0, -0.145, 0.275, 0.695, 1.110 max_d=1.110 avg_d=0.275 std_dev=0.420
C2'	B	0, 0.086, 0.541, 0.996, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.541 std_dev=0.455
OP2	A	0, -0.129, 0.366, 0.862, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.366 std_dev=0.495
O4'	B	0, 0.123, 0.653, 1.184, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.653 std_dev=0.530
OP1	A	0, -0.170, 0.432, 1.034, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.432 std_dev=0.602
C4	B	0, -0.040, 0.592, 1.225, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.592 std_dev=0.632
OP2	B	0, 0.319, 1.030, 1.740, 2.211 max_d=2.211 avg_d=1.030 std_dev=0.711
C8	B	0, 0.014, 0.748, 1.483, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.748 std_dev=0.734
N3	B	0, -0.181, 0.664, 1.509, 2.333 max_d=2.333 avg_d=0.664 std_dev=0.845
C3'	B	0, -0.158, 0.826, 1.810, 2.756 max_d=2.756 avg_d=0.826 std_dev=0.984
C5	B	0, -0.216, 0.829, 1.873, 2.892 max_d=2.892 avg_d=0.829 std_dev=1.044
N7	B	0, -0.161, 0.929, 2.020, 3.071 max_d=3.071 avg_d=0.929 std_dev=1.091
C4'	B	0, -0.159, 0.944, 2.047, 3.102 max_d=3.102 avg_d=0.944 std_dev=1.103
P	B	0, 0.037, 1.165, 2.294, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.165 std_dev=1.128
O5'	B	0, -0.117, 1.057, 2.231, 3.338 max_d=3.338 avg_d=1.057 std_dev=1.174
O3'	B	0, -0.369, 0.848, 2.064, 3.261 max_d=3.261 avg_d=0.848 std_dev=1.217
C2	B	0, -0.402, 0.912, 2.227, 3.526 max_d=3.526 avg_d=0.912 std_dev=1.314
C6	B	0, -0.475, 1.039, 2.554, 4.053 max_d=4.053 avg_d=1.039 std_dev=1.514
C5'	B	0, -0.264, 1.257, 2.777, 4.245 max_d=4.245 avg_d=1.257 std_dev=1.521
N1	B	0, -0.527, 1.052, 2.631, 4.198 max_d=4.198 avg_d=1.052 std_dev=1.579
N2	B	0, -0.598, 1.104, 2.806, 4.498 max_d=4.498 avg_d=1.104 std_dev=1.702
O6	B	0, -0.677, 1.259, 3.196, 5.119 max_d=5.119 avg_d=1.259 std_dev=1.936
OP1	B	0, -0.467, 1.563, 3.594, 5.577 max_d=5.577 avg_d=1.563 std_dev=2.030

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.02	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.03	0.05	0.07	0.07	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.42	0.22	0.11
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.04	0.01	0.02	0.05	0.12	0.12	0.12	0.01	0.01	0.00	0.04	0.52	0.29	0.20
C4	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.02	0.07	0.07	0.16	0.18
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.25	0.07	0.02
C5	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.05	0.10	0.19	0.19
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.06	0.00	0.04	0.04	0.06	0.09	0.05	0.02	0.04	0.01	0.01	0.13	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.12	0.17
N1	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.07	0.07	0.13
N3	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.06	0.03	0.11	0.15
N4	0.02	0.01	0.04	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.03	0.09	0.13	0.20	0.19
O2	0.03	0.01	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.12	0.04	0.05	0.13	0.05	0.12
O2'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.00	0.04	0.02	0.01	0.41	0.19	0.08
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.11	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.12	0.14	0.12	0.04	0.00	0.02	0.09	0.67	0.38	0.28
O4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.04	0.05	0.10	0.17
O5'	0.02	0.05	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.06	0.09	0.05	0.01	0.09	0.04	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.16	0.07	0.42	0.52	0.07	0.25	0.10	0.13	0.03	0.07	0.03	0.13	0.13	0.41	0.67	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02
OP2	0.02	0.07	0.22	0.29	0.16	0.07	0.19	0.03	0.12	0.07	0.11	0.20	0.05	0.19	0.38	0.10	0.02	0.03	0.00	0.02
P	0.09	0.13	0.11	0.20	0.18	0.02	0.19	0.01	0.17	0.13	0.15	0.19	0.12	0.08	0.28	0.17	0.01	0.02	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.66	0.06	0.31	0.56	0.24	0.94	0.05	1.25	0.62	1.14	0.44	0.36	0.92	0.37	0.17	0.77	0.07	0.38	1.53	0.11	0.70	0.39
C2	0.06	0.08	0.12	0.06	0.36	0.05	0.76	0.39	0.91	0.67	0.53	0.42	0.07	0.91	0.35	0.10	0.51	0.10	0.13	1.22	0.27	0.62	0.15
C2'	0.05	0.60	0.05	0.23	0.51	0.17	0.82	0.10	1.08	0.55	0.98	0.44	0.36	0.81	0.35	0.11	0.66	0.04	0.32	1.32	0.15	0.72	0.37
C3'	0.03	0.79	0.08	0.32	0.53	0.25	0.76	0.07	1.04	0.43	1.06	0.78	0.50	0.67	0.31	0.14	0.68	0.06	0.45	1.21	0.40	0.82	0.53
C4	0.09	0.31	0.21	0.13	0.19	0.21	0.47	0.55	0.42	0.56	0.05	0.66	0.23	0.69	0.28	0.06	0.27	0.18	0.04	0.58	0.35	0.61	0.09
C4'	0.03	1.06	0.16	0.49	0.66	0.40	0.93	0.24	1.29	0.49	1.37	1.13	0.66	0.79	0.36	0.21	0.87	0.13	0.58	1.49	0.50	0.81	0.62
C5	0.05	0.16	0.10	0.06	0.33	0.04	0.58	0.29	0.65	0.47	0.45	0.11	0.10	0.62	0.28	0.11	0.42	0.07	0.23	0.75	0.05	0.68	0.28
C5'	0.04	1.25	0.24	0.59	0.70	0.49	0.90	0.41	1.26	0.39	1.44	1.47	0.82	0.69	0.34	0.24	0.91	0.16	0.71	1.40	0.72	0.86	0.75
C6	0.04	0.52	0.05	0.22	0.47	0.16	0.76	0.11	0.96	0.50	0.87	0.29	0.29	0.73	0.31	0.15	0.63	0.05	0.35	1.11	0.11	0.71	0.38
N1	0.04	0.42	0.05	0.20	0.47	0.13	0.84	0.18	1.08	0.60	0.89	0.11	0.22	0.87	0.35	0.14	0.64	0.04	0.29	1.33	0.03	0.68	0.31
N3	0.09	0.31	0.20	0.10	0.22	0.19	0.58	0.57	0.58	0.65	0.11	0.77	0.23	0.82	0.31	0.07	0.34	0.17	0.03	0.85	0.43	0.58	0.05
N4	0.15	0.65	0.32	0.33	0.11	0.41	0.16	0.79	0.13	0.51	0.52	0.90	0.43	0.51	0.23	0.04	0.06	0.30	0.17	0.04	0.55	0.55	0.08
O2	0.07	0.08	0.13	0.07	0.37	0.05	0.79	0.42	0.96	0.72	0.54	0.47	0.08	0.97	0.37	0.11	0.54	0.11	0.10	1.33	0.33	0.59	0.11
O2'	0.03	0.64	0.04	0.29	0.55	0.22	0.90	0.06	1.19	0.61	1.07	0.46	0.37	0.90	0.37	0.13	0.74	0.05	0.35	1.49	0.15	0.72	0.39
O3'	0.03	0.80	0.10	0.34	0.51	0.27	0.71	0.12	0.99	0.37	1.03	0.83	0.51	0.60	0.28	0.15	0.67	0.08	0.48	1.16	0.52	0.88	0.59
O4'	0.05	1.02	0.14	0.46	0.69	0.38	1.03	0.17	1.41	0.60	1.44	0.98	0.60	0.93	0.40	0.21	0.90	0.12	0.53	1.64	0.31	0.73	0.52
O5'	0.02	1.24	0.20	0.50	0.69	0.39	0.83	0.33	1.13	0.35	1.33	1.47	0.86	0.60	0.35	0.20	0.78	0.09	0.66	1.21	0.68	0.85	0.72
OP1	0.59	0.80	0.77	1.18	0.16	1.15	0.28	1.17	0.64	0.28	0.88	1.11	0.40	0.03	0.25	0.58	1.42	0.80	1.32	0.73	1.59	1.38	1.40
OP2	0.55	0.43	0.63	0.86	0.03	0.83	0.06	0.77	0.29	0.33	0.47	0.63	0.18	0.14	0.31	0.55	1.07	0.66	1.02	0.34	1.14	1.19	1.09
P	0.37	0.78	0.52	0.84	0.26	0.80	0.35	0.76	0.63	0.10	0.84	1.03	0.46	0.13	0.08	0.41	1.09	0.53	0.97	0.70	1.10	1.05	1.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.46	0.02	0.03	0.45	0.37
C2	0.02	0.00	0.10	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.04	0.08	0.54	0.02	0.03	0.80	0.54
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.04	0.05	0.05	0.08	0.13	0.11	0.03	0.02	0.00	0.05	0.01	0.41	0.04	0.27	0.57	0.42
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.02	0.18	0.03	0.09
C4	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.05	0.59	0.01	0.04	0.90	0.60
C4'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.08	0.07	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.18	0.29	0.11
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.03	0.66	0.01	0.05	1.19	0.73
C5'	0.02	0.02	0.04	0.03	0.06	0.00	0.11	0.00	0.10	0.15	0.06	0.03	0.01	0.15	0.08	0.03	0.03	0.01	0.01	0.12	0.08	0.11	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.05	0.66	0.01	0.06	1.24	0.75
C8	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.09	0.03	0.04	0.69	0.01	0.06	1.22	0.75
N1	0.01	0.01	0.08	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.07	0.61	0.01	0.04	1.04	0.66
N2	0.04	0.02	0.13	0.06	0.03	0.08	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.23	0.04	0.09	0.48	0.03	0.03	0.65	0.46
N3	0.02	0.01	0.11	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.18	0.04	0.08	0.52	0.01	0.03	0.69	0.49
N7	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02	0.71	0.01	0.07	1.38	0.82
N9	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.60	0.01	0.04	0.86	0.58
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.08	0.01	0.03	0.03	0.06	0.09	0.12	0.23	0.18	0.07	0.01	0.00	0.08	0.01	0.38	0.05	0.35	0.63	0.45
O3'	0.02	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.04	0.04	0.03	0.08	0.00	0.04	0.08	0.05	0.04	0.43	0.16
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.09	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.36	0.04	0.19	0.14	0.19
O5'	0.46	0.54	0.41	0.10	0.59	0.02	0.66	0.01	0.66	0.69	0.61	0.48	0.52	0.71	0.60	0.38	0.08	0.36	0.00	0.69	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.69	0.00	0.07	1.40	0.82
OP1	0.03	0.03	0.27	0.18	0.04	0.18	0.05	0.08	0.06	0.06	0.04	0.03	0.03	0.07	0.04	0.35	0.04	0.19	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01
OP2	0.45	0.80	0.57	0.03	0.90	0.29	1.19	0.11	1.24	1.22	1.04	0.65	0.69	1.38	0.86	0.63	0.43	0.14	0.01	1.40	0.01	0.00	0.01
P	0.37	0.54	0.42	0.09	0.60	0.11	0.73	0.01	0.75	0.75	0.66	0.46	0.49	0.82	0.58	0.45	0.16	0.19	0.00	0.82	0.01	0.01	0.00