Doublet Group distance statistics: 54275

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N3	A	0, -0.001, 0.009, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.018, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.006, 0.033, 0.060, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.033 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.001, 0.035, 0.069, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.035 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.049, 0.162, 0.275, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.162 std_dev=0.113
O4'	A	0, 0.026, 0.169, 0.311, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.169 std_dev=0.142
C3'	A	0, 0.095, 0.265, 0.435, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.265 std_dev=0.170
C2'	B	0, -0.007, 0.163, 0.334, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.163 std_dev=0.170
C4	B	0, 0.144, 0.343, 0.541, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.343 std_dev=0.198
C5	B	0, 0.151, 0.378, 0.606, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.378 std_dev=0.228
O3'	A	0, 0.142, 0.375, 0.608, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.375 std_dev=0.233
C6	B	0, 0.143, 0.392, 0.642, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.392 std_dev=0.249
C4'	A	0, 0.099, 0.353, 0.606, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.353 std_dev=0.253
C3'	B	0, 0.145, 0.404, 0.663, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.404 std_dev=0.259
O6	B	0, 0.146, 0.405, 0.664, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.405 std_dev=0.259
N9	B	0, 0.192, 0.456, 0.721, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.456 std_dev=0.264
O2'	A	0, 0.016, 0.285, 0.554, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.285 std_dev=0.269
C1'	B	0, 0.188, 0.465, 0.742, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.465 std_dev=0.277
N3	B	0, 0.136, 0.421, 0.706, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.421 std_dev=0.285
O3'	B	0, 0.171, 0.480, 0.789, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.480 std_dev=0.309
O5'	A	0, 0.149, 0.505, 0.861, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.505 std_dev=0.356
N7	B	0, 0.220, 0.584, 0.948, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.584 std_dev=0.364
N1	B	0, 0.174, 0.559, 0.945, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.559 std_dev=0.385
C5'	A	0, 0.145, 0.531, 0.917, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.531 std_dev=0.386
C8	B	0, 0.255, 0.666, 1.076, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.666 std_dev=0.410
C2	B	0, 0.163, 0.589, 1.015, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.589 std_dev=0.426
OP1	B	0, 0.030, 0.460, 0.891, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.460 std_dev=0.430
O2'	B	0, 0.137, 0.571, 1.005, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.571 std_dev=0.434
P	B	0, 0.203, 0.646, 1.090, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.646 std_dev=0.443
O4'	B	0, 0.269, 0.735, 1.201, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.735 std_dev=0.466
P	A	0, 0.125, 0.594, 1.063, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.594 std_dev=0.469
C4'	B	0, 0.273, 0.748, 1.223, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.748 std_dev=0.475
OP2	A	0, 0.106, 0.673, 1.240, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.673 std_dev=0.567
OP2	B	0, 0.328, 0.897, 1.467, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.897 std_dev=0.569
O5'	B	0, 0.468, 1.052, 1.637, 1.623 max_d=1.623 avg_d=1.052 std_dev=0.584
N2	B	0, 0.200, 0.837, 1.474, 1.839 max_d=1.839 avg_d=0.837 std_dev=0.637
C5'	B	0, 0.374, 1.034, 1.695, 1.871 max_d=1.871 avg_d=1.034 std_dev=0.660
OP1	A	0, 0.109, 0.820, 1.532, 2.031 max_d=2.031 avg_d=0.820 std_dev=0.711

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.05	0.00	0.06	0.15	0.17	0.03
C2	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.04	0.08	0.10	0.16	0.03
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.03	0.07	0.02	0.02	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.20	0.36	0.30	0.23
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.15	0.30	0.22	0.18
C4	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.16	0.05	0.18	0.12
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.02	0.03	0.08	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04
C5	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.06	0.04	0.18	0.08	0.19	0.14
C5'	0.02	0.05	0.03	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.06	0.09	0.16	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.12	0.06	0.05	0.14	0.04	0.17	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.05	0.01	0.08	0.10	0.17	0.04
N3	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03	0.11	0.06	0.16	0.07
N4	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.08	0.02	0.16	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.03	0.19	0.08	0.18	0.15
O2	0.05	0.00	0.04	0.05	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.08	0.13	0.09	0.10	0.16	0.15	0.02
O2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.01	0.13	0.02	0.12	0.06	0.07	0.11	0.08	0.00	0.02	0.01	0.22	0.45	0.34	0.27
O3'	0.05	0.08	0.01	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.05	0.07	0.07	0.13	0.02	0.00	0.05	0.07	0.25	0.16	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.09	0.01	0.05	0.00	0.05	0.05	0.20	0.12
O5'	0.06	0.08	0.20	0.15	0.16	0.01	0.18	0.01	0.14	0.08	0.11	0.19	0.10	0.22	0.07	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.15	0.10	0.36	0.30	0.05	0.04	0.08	0.03	0.04	0.10	0.06	0.08	0.16	0.45	0.25	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.16	0.30	0.22	0.18	0.11	0.19	0.09	0.17	0.17	0.16	0.18	0.15	0.34	0.16	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.03	0.23	0.18	0.12	0.04	0.14	0.02	0.09	0.04	0.07	0.15	0.02	0.27	0.10	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.11	0.08	0.14	0.10	0.20	0.11	0.14	0.06	0.26	0.12	0.17	0.06	0.22	0.19	0.07	0.22	0.24	0.18	0.05	0.09	0.19	0.06
C2	0.19	0.24	0.05	0.11	0.05	0.13	0.05	0.14	0.11	0.22	0.23	0.35	0.13	0.16	0.14	0.11	0.23	0.17	0.14	0.10	0.06	0.16	0.03
C2'	0.27	0.04	0.16	0.21	0.15	0.28	0.19	0.23	0.08	0.36	0.04	0.12	0.05	0.33	0.26	0.16	0.27	0.32	0.26	0.08	0.16	0.22	0.15
C3'	0.19	0.04	0.10	0.12	0.14	0.21	0.18	0.18	0.13	0.27	0.05	0.03	0.07	0.27	0.19	0.14	0.18	0.24	0.15	0.15	0.15	0.22	0.09
C4	0.15	0.31	0.02	0.08	0.11	0.10	0.09	0.20	0.18	0.16	0.29	0.40	0.22	0.10	0.10	0.10	0.23	0.12	0.10	0.16	0.07	0.19	0.05
C4'	0.15	0.09	0.07	0.08	0.13	0.15	0.17	0.13	0.16	0.19	0.10	0.06	0.10	0.21	0.15	0.12	0.13	0.18	0.08	0.18	0.18	0.29	0.14
C5	0.20	0.25	0.02	0.12	0.11	0.17	0.10	0.13	0.16	0.19	0.24	0.30	0.18	0.12	0.14	0.07	0.24	0.22	0.13	0.15	0.05	0.22	0.03
C5'	0.15	0.17	0.10	0.08	0.19	0.13	0.25	0.12	0.27	0.22	0.21	0.14	0.15	0.30	0.17	0.19	0.13	0.17	0.08	0.32	0.28	0.38	0.24
C6	0.23	0.18	0.06	0.15	0.10	0.21	0.10	0.14	0.12	0.26	0.18	0.23	0.12	0.18	0.19	0.07	0.25	0.27	0.17	0.11	0.08	0.20	0.04
N1	0.22	0.18	0.07	0.14	0.08	0.18	0.08	0.12	0.09	0.26	0.18	0.25	0.09	0.20	0.18	0.09	0.24	0.23	0.17	0.08	0.06	0.17	0.03
N3	0.16	0.30	0.02	0.08	0.08	0.10	0.06	0.19	0.15	0.18	0.28	0.42	0.19	0.12	0.11	0.12	0.23	0.12	0.11	0.14	0.08	0.17	0.06
N4	0.10	0.35	0.06	0.05	0.15	0.08	0.13	0.31	0.21	0.11	0.31	0.45	0.27	0.07	0.07	0.09	0.21	0.04	0.06	0.19	0.10	0.21	0.09
O2	0.18	0.23	0.05	0.10	0.04	0.12	0.04	0.14	0.08	0.22	0.22	0.35	0.12	0.17	0.14	0.12	0.23	0.15	0.14	0.08	0.06	0.15	0.04
O2'	0.31	0.10	0.20	0.26	0.15	0.34	0.17	0.30	0.06	0.38	0.11	0.20	0.04	0.32	0.27	0.19	0.33	0.36	0.38	0.05	0.27	0.29	0.27
O3'	0.17	0.03	0.08	0.11	0.11	0.20	0.13	0.18	0.09	0.21	0.03	0.03	0.06	0.20	0.16	0.13	0.17	0.23	0.18	0.10	0.14	0.21	0.09
O4'	0.19	0.04	0.07	0.12	0.12	0.17	0.13	0.13	0.07	0.21	0.03	0.04	0.08	0.19	0.17	0.04	0.18	0.21	0.11	0.05	0.09	0.23	0.06
O5'	0.08	0.04	0.18	0.11	0.03	0.11	0.06	0.16	0.10	0.07	0.08	0.04	0.02	0.08	0.06	0.34	0.14	0.10	0.15	0.16	0.40	0.44	0.31
OP1	0.23	0.18	0.35	0.22	0.21	0.12	0.19	0.19	0.16	0.23	0.16	0.18	0.21	0.20	0.23	0.67	0.30	0.13	0.10	0.13	0.24	0.19	0.12
OP2	0.23	0.29	0.31	0.16	0.29	0.13	0.28	0.21	0.26	0.25	0.28	0.29	0.29	0.26	0.27	0.59	0.24	0.16	0.08	0.24	0.25	0.22	0.12
P	0.17	0.19	0.25	0.13	0.19	0.08	0.18	0.16	0.17	0.17	0.18	0.19	0.19	0.17	0.18	0.51	0.20	0.09	0.06	0.16	0.28	0.27	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.09	0.02	0.21	0.27	0.15
C2	0.02	0.00	0.14	0.01	0.01	0.19	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.38	0.09	0.23	0.21	0.01	0.25	0.38	0.28
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.05	0.08	0.08	0.06	0.12	0.17	0.13	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.23	0.07	0.37	0.47	0.35
C3'	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.18	0.03	0.22	0.27	0.20
C4	0.01	0.01	0.08	0.02	0.00	0.07	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.06	0.11	0.13	0.01	0.22	0.32	0.19
C4'	0.00	0.19	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.05	0.13	0.13	0.25	0.18	0.09	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.15	0.08	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.11	0.01	0.22	0.29	0.16
C5'	0.02	0.27	0.08	0.02	0.11	0.00	0.03	0.00	0.08	0.19	0.20	0.36	0.25	0.14	0.03	0.07	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.03	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.08	0.13	0.00	0.22	0.31	0.19
C8	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.13	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.06	0.14	0.13	0.01	0.25	0.25	0.15
N1	0.02	0.00	0.12	0.02	0.01	0.13	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.08	0.17	0.18	0.01	0.23	0.36	0.24
N2	0.02	0.00	0.17	0.01	0.01	0.25	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.48	0.10	0.29	0.27	0.01	0.28	0.42	0.33
N3	0.02	0.00	0.13	0.01	0.00	0.18	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.36	0.08	0.23	0.20	0.01	0.24	0.37	0.26
N7	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.07	0.08	0.13	0.01	0.24	0.25	0.15
N9	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.23	0.29	0.16
O2'	0.03	0.38	0.00	0.02	0.17	0.03	0.06	0.07	0.14	0.24	0.28	0.48	0.36	0.16	0.02	0.00	0.09	0.03	0.25	0.09	0.47	0.59	0.42
O3'	0.05	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.07	0.06	0.08	0.10	0.08	0.07	0.05	0.09	0.00	0.04	0.13	0.06	0.13	0.17	0.09
O4'	0.00	0.23	0.01	0.00	0.11	0.00	0.03	0.00	0.08	0.14	0.17	0.29	0.23	0.08	0.01	0.03	0.04	0.00	0.10	0.05	0.16	0.10	0.06
O5'	0.09	0.21	0.23	0.18	0.13	0.01	0.11	0.01	0.13	0.13	0.18	0.27	0.20	0.13	0.10	0.25	0.13	0.10	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.06	0.05	0.12	0.00	0.22	0.29	0.17
OP1	0.21	0.25	0.37	0.22	0.22	0.15	0.22	0.12	0.22	0.25	0.23	0.28	0.24	0.24	0.23	0.47	0.13	0.16	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00
OP2	0.27	0.38	0.47	0.27	0.32	0.08	0.29	0.09	0.31	0.25	0.36	0.42	0.37	0.25	0.29	0.59	0.17	0.10	0.00	0.29	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.28	0.35	0.20	0.19	0.02	0.16	0.01	0.19	0.15	0.24	0.33	0.26	0.15	0.16	0.42	0.09	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00