Doublet Group distance statistics: 54282

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N4	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C1'	A	0, -0.001, 0.014, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.005, 0.022, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.016
O4'	A	0, 0.011, 0.043, 0.075, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.043 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.022, 0.055, 0.088, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.055 std_dev=0.033
C3'	A	0, 0.014, 0.064, 0.114, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.064 std_dev=0.050
O3'	A	0, 0.017, 0.092, 0.166, 0.196 max_d=0.196 avg_d=0.092 std_dev=0.074
O2'	A	0, 0.015, 0.091, 0.167, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.091 std_dev=0.076
C4'	A	0, 0.021, 0.114, 0.207, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.114 std_dev=0.093
C2'	B	0, 0.027, 0.220, 0.412, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.220 std_dev=0.193
C5'	A	0, 0.010, 0.217, 0.423, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.217 std_dev=0.206
O5'	A	0, 0.116, 0.358, 0.601, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.358 std_dev=0.242
P	A	0, -0.060, 0.335, 0.729, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.335 std_dev=0.394
O2'	B	0, -0.059, 0.507, 1.072, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.507 std_dev=0.566
OP1	A	0, -0.108, 0.537, 1.181, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.537 std_dev=0.644
C1'	B	0, -0.163, 0.498, 1.160, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.498 std_dev=0.661
C4'	B	0, -0.197, 0.536, 1.268, 1.798 max_d=1.798 avg_d=0.536 std_dev=0.732
C3'	B	0, -0.234, 0.546, 1.326, 1.892 max_d=1.892 avg_d=0.546 std_dev=0.780
O4'	B	0, -0.233, 0.616, 1.466, 2.079 max_d=2.079 avg_d=0.616 std_dev=0.849
OP2	A	0, -0.137, 0.771, 1.679, 2.320 max_d=2.320 avg_d=0.771 std_dev=0.908
C4	B	0, -0.261, 0.678, 1.617, 2.297 max_d=2.297 avg_d=0.678 std_dev=0.939
N9	B	0, -0.325, 0.731, 1.786, 2.554 max_d=2.554 avg_d=0.731 std_dev=1.055
C5'	B	0, -0.384, 0.931, 2.245, 3.200 max_d=3.200 avg_d=0.931 std_dev=1.315
C5	B	0, -0.451, 0.881, 2.213, 3.185 max_d=3.185 avg_d=0.881 std_dev=1.332
C6	B	0, -0.463, 0.901, 2.266, 3.261 max_d=3.261 avg_d=0.901 std_dev=1.364
O3'	B	0, -0.495, 0.871, 2.236, 3.234 max_d=3.234 avg_d=0.871 std_dev=1.365
N3	B	0, -0.410, 0.967, 2.343, 3.342 max_d=3.342 avg_d=0.967 std_dev=1.377
O5'	B	0, -0.523, 1.084, 2.692, 3.862 max_d=3.862 avg_d=1.084 std_dev=1.607
N1	B	0, -0.537, 1.072, 2.682, 3.855 max_d=3.855 avg_d=1.072 std_dev=1.610
O6	B	0, -0.605, 1.067, 2.739, 3.961 max_d=3.961 avg_d=1.067 std_dev=1.672
P	B	0, -0.589, 1.249, 3.087, 4.423 max_d=4.423 avg_d=1.249 std_dev=1.838
C2	B	0, -0.608, 1.248, 3.104, 4.455 max_d=4.455 avg_d=1.248 std_dev=1.856
OP1	B	0, -0.529, 1.351, 3.231, 4.593 max_d=4.593 avg_d=1.351 std_dev=1.880
C8	B	0, -0.730, 1.246, 3.221, 4.666 max_d=4.666 avg_d=1.246 std_dev=1.976
OP2	B	0, -0.659, 1.413, 3.485, 4.992 max_d=4.992 avg_d=1.413 std_dev=2.072
N7	B	0, -0.789, 1.307, 3.403, 4.936 max_d=4.936 avg_d=1.307 std_dev=2.096
N2	B	0, -0.955, 1.837, 4.629, 6.664 max_d=6.664 avg_d=1.837 std_dev=2.792

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.15	0.33	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.04	0.01	0.05	0.24	0.44	0.08
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.12	0.03
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.04	0.13	0.11	0.03
C4	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.01	0.10	0.36	0.59	0.14
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.00	0.01	0.04	0.07	0.06	0.02
C5	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.02	0.09	0.39	0.67	0.11
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.14	0.00	0.15	0.00	0.12	0.08	0.11	0.16	0.04	0.05	0.02	0.03	0.01	0.09	0.14	0.00
C6	0.02	0.00	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.02	0.06	0.33	0.60	0.04
N1	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.25	0.45	0.03
N3	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.04	0.01	0.09	0.30	0.50	0.13
N4	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.13	0.40	0.60	0.18
O2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.05	0.01	0.03	0.19	0.37	0.06
O2'	0.04	0.08	0.00	0.03	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.06	0.07	0.06	0.10	0.00	0.07	0.02	0.03	0.06	0.09	0.03
O3'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.00	0.00	0.08	0.29	0.32	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.17	0.36	0.14
O5'	0.07	0.05	0.02	0.04	0.10	0.04	0.09	0.01	0.06	0.04	0.09	0.13	0.03	0.03	0.08	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.24	0.04	0.13	0.36	0.07	0.39	0.09	0.33	0.25	0.30	0.40	0.19	0.06	0.29	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.44	0.12	0.11	0.59	0.06	0.67	0.14	0.60	0.45	0.50	0.60	0.37	0.09	0.32	0.36	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.03	0.03	0.14	0.02	0.11	0.00	0.04	0.03	0.13	0.18	0.06	0.03	0.05	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.94	0.14	0.56	0.36	0.15	0.14	0.11	0.35	0.36	0.72	1.29	0.80	0.26	0.02	0.16	1.14	0.04	0.11	0.23	0.11	0.13	0.13
C2	0.08	1.26	0.15	0.36	0.50	0.11	0.24	0.48	0.50	0.42	0.98	1.71	1.07	0.28	0.05	0.08	1.01	0.15	0.52	0.36	0.48	0.55	0.53
C2'	0.08	0.95	0.10	0.59	0.24	0.12	0.05	0.10	0.19	0.66	0.66	1.39	0.78	0.55	0.17	0.13	1.26	0.13	0.10	0.03	0.11	0.12	0.11
C3'	0.10	0.74	0.10	0.68	0.15	0.21	0.11	0.12	0.09	0.63	0.49	1.11	0.62	0.54	0.20	0.19	1.32	0.09	0.15	0.05	0.23	0.16	0.16
C4	0.16	1.23	0.17	0.16	0.60	0.28	0.39	0.72	0.61	0.18	0.99	1.56	1.09	0.05	0.19	0.17	0.74	0.21	0.74	0.49	0.72	0.71	0.73
C4'	0.11	0.71	0.22	0.82	0.29	0.43	0.11	0.36	0.25	0.26	0.54	0.96	0.62	0.20	0.05	0.19	1.31	0.20	0.39	0.15	0.46	0.39	0.39
C5	0.21	0.90	0.17	0.28	0.51	0.13	0.37	0.48	0.51	0.03	0.75	1.10	0.83	0.08	0.24	0.06	0.80	0.06	0.43	0.43	0.47	0.38	0.43
C5'	0.25	0.60	0.34	0.98	0.34	0.64	0.23	0.66	0.31	0.02	0.49	0.74	0.55	0.04	0.20	0.17	1.34	0.40	0.72	0.25	0.74	0.73	0.70
C6	0.16	0.84	0.16	0.45	0.43	0.08	0.27	0.22	0.42	0.12	0.68	1.07	0.76	0.03	0.16	0.11	0.99	0.07	0.19	0.34	0.23	0.17	0.21
N1	0.09	1.02	0.15	0.46	0.43	0.06	0.22	0.28	0.42	0.31	0.80	1.36	0.88	0.20	0.07	0.08	1.07	0.05	0.28	0.31	0.27	0.29	0.29
N3	0.10	1.37	0.16	0.22	0.57	0.24	0.31	0.68	0.59	0.37	1.08	1.83	1.16	0.22	0.10	0.17	0.87	0.23	0.73	0.44	0.69	0.75	0.73
N4	0.19	1.37	0.16	0.03	0.71	0.44	0.50	0.95	0.73	0.10	1.12	1.69	1.22	0.08	0.27	0.27	0.53	0.31	1.01	0.61	0.98	0.97	0.99
O2	0.04	1.34	0.14	0.37	0.48	0.10	0.19	0.47	0.49	0.52	1.03	1.87	1.11	0.38	0.03	0.09	1.05	0.17	0.53	0.33	0.47	0.59	0.55
O2'	0.08	0.98	0.11	0.61	0.24	0.14	0.06	0.09	0.19	0.68	0.69	1.46	0.80	0.58	0.17	0.13	1.26	0.12	0.10	0.02	0.13	0.13	0.11
O3'	0.18	0.69	0.08	0.71	0.05	0.23	0.25	0.20	0.04	0.79	0.41	1.10	0.56	0.72	0.31	0.20	1.34	0.12	0.24	0.20	0.34	0.26	0.25
O4'	0.10	0.72	0.14	0.63	0.32	0.29	0.17	0.14	0.31	0.20	0.57	0.96	0.63	0.12	0.08	0.27	1.09	0.15	0.14	0.22	0.20	0.13	0.13
O5'	0.20	0.54	0.30	0.89	0.30	0.47	0.20	0.45	0.28	0.04	0.44	0.67	0.49	0.03	0.16	0.14	1.34	0.27	0.55	0.22	0.49	0.58	0.50
OP1	0.38	0.22	0.38	1.20	0.28	1.10	0.26	1.40	0.23	0.33	0.22	0.19	0.25	0.29	0.33	0.38	1.16	0.76	1.45	0.22	1.40	1.45	1.43
OP2	0.54	0.45	0.34	0.12	0.49	0.43	0.46	0.28	0.45	0.46	0.44	0.44	0.48	0.45	0.50	0.63	0.35	0.57	0.06	0.43	0.14	0.13	0.10
P	0.31	0.32	0.39	1.00	0.30	0.60	0.28	0.68	0.29	0.26	0.32	0.32	0.32	0.26	0.29	0.14	1.23	0.41	0.85	0.28	0.68	0.88	0.76

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.27	0.00	0.15	0.01	0.14	0.27	0.15
C2	0.00	0.00	0.41	0.96	0.01	0.71	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.59	0.33	1.43	0.01	2.27	1.85	1.80
C2'	0.00	0.41	0.00	0.00	0.21	0.01	0.09	0.18	0.16	0.20	0.30	0.50	0.41	0.11	0.01	0.00	0.04	0.01	0.39	0.11	0.09	0.48	0.27
C3'	0.01	0.96	0.00	0.00	0.52	0.00	0.36	0.00	0.53	0.17	0.79	1.15	0.91	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.45	0.47	0.08	0.20
C4	0.00	0.01	0.21	0.52	0.00	0.33	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.19	0.17	0.52	0.00	0.94	0.47	0.56
C4'	0.00	0.71	0.01	0.00	0.33	0.00	0.16	0.00	0.30	0.29	0.54	0.89	0.67	0.15	0.02	0.21	0.03	0.00	0.02	0.23	0.21	0.01	0.06
C5	0.01	0.00	0.09	0.36	0.00	0.16	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.11	0.07	0.19	0.00	0.52	0.08	0.14
C5'	0.08	1.07	0.18	0.00	0.39	0.00	0.12	0.00	0.37	0.61	0.79	1.42	0.96	0.41	0.10	0.03	0.19	0.00	0.01	0.24	0.00	0.02	0.02
C6	0.00	0.00	0.16	0.53	0.00	0.30	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.27	0.14	0.53	0.00	1.00	0.58	0.59
C8	0.00	0.00	0.20	0.17	0.00	0.29	0.00	0.61	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.29	0.18	0.80	0.01	0.67	1.21	1.02
N1	0.00	0.00	0.30	0.79	0.01	0.54	0.01	0.79	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.47	0.25	1.08	0.01	1.80	1.43	1.35
N2	0.00	0.00	0.50	1.15	0.01	0.89	0.01	1.42	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.20	0.79	0.40	1.86	0.02	3.05	2.58	2.49
N3	0.00	0.00	0.41	0.91	0.00	0.67	0.00	0.96	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.48	0.33	1.26	0.00	1.90	1.42	1.48
N7	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.15	0.00	0.41	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.14	0.10	0.52	0.01	0.41	0.96	0.77
N9	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.12	0.01	0.14	0.01	0.14	0.33	0.21
O2'	0.02	0.22	0.00	0.02	0.19	0.21	0.22	0.03	0.26	0.14	0.26	0.20	0.18	0.20	0.13	0.00	0.08	0.12	0.30	0.27	0.12	0.54	0.23
O3'	0.27	0.59	0.04	0.01	0.19	0.03	0.11	0.19	0.27	0.29	0.47	0.79	0.48	0.14	0.12	0.08	0.00	0.20	0.17	0.23	0.91	0.31	0.51
O4'	0.00	0.33	0.01	0.02	0.17	0.00	0.07	0.00	0.14	0.18	0.25	0.40	0.33	0.10	0.01	0.12	0.20	0.00	0.06	0.10	0.18	0.05	0.04
O5'	0.15	1.43	0.39	0.02	0.52	0.02	0.19	0.01	0.53	0.80	1.08	1.86	1.26	0.52	0.14	0.30	0.17	0.06	0.00	0.36	0.03	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.11	0.45	0.00	0.23	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.27	0.23	0.10	0.36	0.00	0.76	0.34	0.36
OP1	0.14	2.27	0.09	0.47	0.94	0.21	0.52	0.00	1.00	0.67	1.80	3.05	1.90	0.41	0.14	0.12	0.91	0.18	0.03	0.76	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	1.85	0.48	0.08	0.47	0.01	0.08	0.02	0.58	1.21	1.43	2.58	1.42	0.96	0.33	0.54	0.31	0.05	0.01	0.34	0.01	0.00	0.01
P	0.15	1.80	0.27	0.20	0.56	0.06	0.14	0.02	0.59	1.02	1.35	2.49	1.48	0.77	0.21	0.23	0.51	0.04	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00