Doublet Group distance statistics: 54285

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.027 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.019, 0.069, 0.118, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.069 std_dev=0.049
N4	A	0, 0.020, 0.070, 0.120, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.070 std_dev=0.050
O2'	A	0, -0.017, 0.130, 0.276, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.130 std_dev=0.146
C2'	A	0, 0.047, 0.198, 0.350, 0.368 max_d=0.368 avg_d=0.198 std_dev=0.151
O4'	A	0, 0.054, 0.220, 0.387, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.220 std_dev=0.167
N3	B	0, 0.077, 0.291, 0.505, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.291 std_dev=0.214
C2	B	0, 0.074, 0.305, 0.536, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.305 std_dev=0.231
N2	B	0, 0.069, 0.301, 0.532, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.301 std_dev=0.232
C4	B	0, 0.106, 0.369, 0.633, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.369 std_dev=0.264
N1	B	0, 0.109, 0.377, 0.645, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.377 std_dev=0.268
C3'	A	0, 0.110, 0.383, 0.656, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.383 std_dev=0.273
C4'	A	0, 0.118, 0.406, 0.694, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.406 std_dev=0.288
C6	B	0, 0.128, 0.438, 0.748, 0.679 max_d=0.679 avg_d=0.438 std_dev=0.310
C5	B	0, 0.127, 0.448, 0.770, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.448 std_dev=0.322
O5'	A	0, 0.139, 0.477, 0.816, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.477 std_dev=0.338
O6	B	0, 0.136, 0.476, 0.816, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.476 std_dev=0.340
N9	B	0, 0.093, 0.439, 0.785, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.439 std_dev=0.346
O2'	B	0, 0.061, 0.429, 0.796, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.429 std_dev=0.367
C2'	B	0, 0.106, 0.478, 0.850, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.478 std_dev=0.372
C1'	B	0, 0.001, 0.381, 0.761, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.381 std_dev=0.380
N7	B	0, 0.138, 0.556, 0.975, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.556 std_dev=0.418
O3'	A	0, 0.177, 0.605, 1.033, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.605 std_dev=0.428
C8	B	0, 0.108, 0.545, 0.983, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.545 std_dev=0.438
O4'	B	0, -0.027, 0.420, 0.868, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.420 std_dev=0.448
C5'	A	0, 0.185, 0.650, 1.115, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.650 std_dev=0.465
C4'	B	0, 0.060, 0.533, 1.005, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.533 std_dev=0.472
C3'	B	0, 0.197, 0.676, 1.155, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.676 std_dev=0.479
C5'	B	0, -0.129, 0.476, 1.080, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.476 std_dev=0.605
P	A	0, 0.272, 0.930, 1.587, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.930 std_dev=0.658
OP1	B	0, 0.103, 0.819, 1.534, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.819 std_dev=0.715
O3'	B	0, 0.209, 1.009, 1.809, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.009 std_dev=0.800
OP2	A	0, 0.342, 1.179, 2.016, 1.864 max_d=1.864 avg_d=1.179 std_dev=0.837
P	B	0, 0.269, 1.195, 2.121, 2.256 max_d=2.256 avg_d=1.195 std_dev=0.926
OP2	B	0, 0.374, 1.307, 2.239, 2.115 max_d=2.115 avg_d=1.307 std_dev=0.933
OP1	A	0, 0.376, 1.317, 2.259, 2.145 max_d=2.145 avg_d=1.317 std_dev=0.942
O5'	B	0, 0.429, 1.644, 2.859, 2.899 max_d=2.899 avg_d=1.644 std_dev=1.215

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.04	0.04
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.08	0.01	0.07	0.13	0.21	0.13
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.10	0.00	0.00	0.01	0.07	0.16	0.10	0.09
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.06	0.05	0.07	0.08	0.08	0.01	0.00	0.01	0.10	0.17	0.17	0.12
C4	0.00	0.02	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.01	0.13	0.20	0.34	0.22
C4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.03	0.06	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.10	0.06	0.05
C5	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.03	0.15	0.20	0.33	0.23
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.07	0.03	0.05	0.09	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02
C6	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.11	0.13	0.23	0.16
N1	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.10	0.16	0.10
N3	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.10	0.17	0.28	0.18
N4	0.01	0.03	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.10	0.01	0.15	0.24	0.38	0.26
O2	0.02	0.01	0.10	0.08	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.10	0.10	0.03	0.05	0.14	0.17	0.10
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.10	0.00	0.03	0.03	0.07	0.17	0.15	0.11
O3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.09	0.03	0.09	0.04	0.07	0.05	0.09	0.10	0.10	0.03	0.00	0.02	0.12	0.22	0.26	0.17
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.05	0.07	0.07	0.06
O5'	0.02	0.07	0.07	0.10	0.13	0.03	0.15	0.01	0.11	0.06	0.10	0.15	0.05	0.07	0.12	0.05	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.10	0.13	0.16	0.17	0.20	0.10	0.20	0.04	0.13	0.10	0.17	0.24	0.14	0.17	0.22	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.21	0.10	0.17	0.34	0.06	0.33	0.05	0.23	0.16	0.28	0.38	0.17	0.15	0.26	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.13	0.09	0.12	0.22	0.05	0.23	0.02	0.16	0.10	0.18	0.26	0.10	0.11	0.17	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.11	0.22	0.13	0.18	0.28	0.14	0.23	0.09	0.22	0.08	0.09	0.17	0.16	0.22	0.16	0.19	0.30	0.09	0.06	0.07	0.19	0.11
C2	0.19	0.04	0.19	0.11	0.12	0.19	0.09	0.12	0.04	0.16	0.05	0.07	0.10	0.12	0.15	0.11	0.10	0.20	0.21	0.03	0.06	0.14	0.14
C2'	0.27	0.12	0.23	0.16	0.18	0.29	0.14	0.23	0.11	0.22	0.11	0.11	0.16	0.17	0.22	0.18	0.19	0.30	0.08	0.09	0.07	0.18	0.09
C3'	0.25	0.08	0.20	0.12	0.15	0.28	0.12	0.22	0.08	0.20	0.08	0.09	0.12	0.14	0.19	0.17	0.19	0.29	0.03	0.07	0.06	0.19	0.07
C4	0.21	0.02	0.20	0.14	0.15	0.20	0.13	0.12	0.07	0.22	0.02	0.11	0.08	0.17	0.19	0.09	0.05	0.21	0.24	0.06	0.08	0.14	0.16
C4'	0.26	0.06	0.19	0.10	0.16	0.29	0.12	0.26	0.06	0.20	0.04	0.05	0.13	0.14	0.20	0.18	0.22	0.31	0.06	0.04	0.09	0.21	0.11
C5	0.28	0.03	0.22	0.14	0.20	0.27	0.17	0.20	0.10	0.26	0.04	0.08	0.13	0.20	0.25	0.14	0.12	0.30	0.14	0.09	0.03	0.16	0.11
C5'	0.23	0.02	0.16	0.07	0.12	0.28	0.09	0.26	0.04	0.18	0.02	0.07	0.09	0.12	0.18	0.19	0.24	0.30	0.08	0.02	0.09	0.23	0.12
C6	0.29	0.06	0.22	0.14	0.20	0.29	0.16	0.23	0.09	0.25	0.04	0.06	0.16	0.19	0.25	0.16	0.17	0.32	0.10	0.08	0.05	0.18	0.11
N1	0.25	0.07	0.21	0.13	0.17	0.26	0.13	0.20	0.07	0.21	0.05	0.07	0.15	0.16	0.21	0.15	0.15	0.27	0.12	0.05	0.04	0.16	0.11
N3	0.17	0.02	0.18	0.13	0.11	0.17	0.09	0.08	0.03	0.16	0.03	0.09	0.07	0.12	0.14	0.09	0.05	0.17	0.26	0.01	0.09	0.13	0.17
N4	0.18	0.07	0.19	0.18	0.12	0.17	0.13	0.07	0.07	0.22	0.05	0.14	0.03	0.18	0.17	0.07	0.07	0.17	0.32	0.07	0.12	0.14	0.21
O2	0.16	0.06	0.18	0.10	0.10	0.16	0.07	0.09	0.06	0.13	0.08	0.07	0.09	0.08	0.12	0.11	0.10	0.16	0.23	0.07	0.08	0.14	0.16
O2'	0.27	0.14	0.22	0.14	0.19	0.28	0.16	0.23	0.13	0.23	0.12	0.13	0.18	0.18	0.22	0.17	0.19	0.29	0.08	0.11	0.06	0.18	0.09
O3'	0.24	0.08	0.19	0.11	0.15	0.28	0.12	0.21	0.09	0.19	0.08	0.07	0.12	0.14	0.19	0.17	0.17	0.29	0.03	0.08	0.04	0.20	0.06
O4'	0.28	0.08	0.22	0.13	0.18	0.31	0.14	0.28	0.07	0.22	0.04	0.04	0.16	0.16	0.23	0.19	0.22	0.33	0.10	0.05	0.13	0.23	0.15
O5'	0.25	0.11	0.19	0.03	0.16	0.29	0.14	0.26	0.11	0.21	0.11	0.14	0.14	0.16	0.20	0.23	0.19	0.30	0.07	0.10	0.10	0.25	0.14
OP1	0.27	0.12	0.29	0.15	0.20	0.30	0.20	0.28	0.15	0.27	0.12	0.13	0.15	0.24	0.24	0.37	0.11	0.30	0.14	0.15	0.21	0.44	0.25
OP2	0.55	0.31	0.53	0.40	0.44	0.60	0.43	0.53	0.37	0.52	0.32	0.25	0.37	0.47	0.50	0.57	0.32	0.59	0.39	0.36	0.34	0.62	0.45
P	0.31	0.18	0.30	0.15	0.24	0.35	0.23	0.32	0.20	0.29	0.18	0.19	0.21	0.26	0.28	0.35	0.08	0.35	0.16	0.20	0.19	0.40	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.21	0.00	0.16	0.01	0.08	0.12	0.08
C2	0.04	0.00	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.17	0.36	0.08	0.16	0.02	0.10	0.11	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.12	0.05	0.07	0.04	0.08	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.24	0.07	0.16	0.06	0.13
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.07	0.16	0.00	0.14	0.09	0.15	0.05	0.01	0.02	0.01	0.11	0.11	0.09	0.26	0.10
C4	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.22	0.04	0.20	0.01	0.09	0.11	0.10
C4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.07	0.06	0.02	0.00	0.07	0.05	0.00	0.01	0.02	0.13	0.21	0.04
C5	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.02	0.26	0.01	0.09	0.10	0.12
C5'	0.04	0.07	0.12	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.04	0.05	0.07	0.01	0.00	0.02	0.15	0.29	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.04	0.25	0.00	0.09	0.10	0.12
C8	0.01	0.02	0.07	0.16	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.06	0.31	0.02	0.08	0.13	0.13
N1	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.27	0.07	0.20	0.02	0.09	0.10	0.10
N2	0.04	0.00	0.08	0.14	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.46	0.09	0.15	0.03	0.12	0.12	0.12
N3	0.04	0.00	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.16	0.37	0.08	0.15	0.01	0.09	0.12	0.09
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.05	0.32	0.02	0.09	0.11	0.14
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.15	0.01	0.22	0.01	0.08	0.13	0.10
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.11	0.07	0.09	0.05	0.11	0.03	0.14	0.20	0.16	0.05	0.05	0.00	0.04	0.04	0.22	0.09	0.12	0.05	0.11
O3'	0.21	0.36	0.02	0.02	0.22	0.05	0.12	0.07	0.15	0.02	0.27	0.46	0.37	0.00	0.15	0.04	0.00	0.16	0.19	0.09	0.27	0.67	0.38
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.09	0.08	0.05	0.01	0.04	0.16	0.00	0.08	0.02	0.13	0.19	0.05
O5'	0.16	0.16	0.24	0.11	0.20	0.01	0.26	0.00	0.25	0.31	0.20	0.15	0.15	0.32	0.22	0.22	0.19	0.08	0.00	0.29	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.02	0.07	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.09	0.09	0.02	0.29	0.00	0.10	0.07	0.15
OP1	0.08	0.10	0.16	0.09	0.09	0.13	0.09	0.15	0.09	0.08	0.09	0.12	0.09	0.09	0.08	0.12	0.27	0.13	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01
OP2	0.12	0.11	0.06	0.26	0.11	0.21	0.10	0.29	0.10	0.13	0.10	0.12	0.12	0.11	0.13	0.05	0.67	0.19	0.02	0.07	0.00	0.00	0.01
P	0.08	0.10	0.13	0.10	0.10	0.04	0.12	0.01	0.12	0.13	0.10	0.12	0.09	0.14	0.10	0.11	0.38	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00