Doublet Group distance statistics: 54290

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
O2	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N4	A	0, 0.000, 0.055, 0.111, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.055 std_dev=0.055
O2'	B	0, 0.000, 0.303, 0.605, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.303 std_dev=0.303
N3	B	0, 0.000, 0.510, 1.020, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.510 std_dev=0.510
C1'	B	0, 0.000, 0.533, 1.066, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.533 std_dev=0.533
C2'	B	0, 0.000, 0.605, 1.210, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.605 std_dev=0.605
C2	B	0, 0.000, 0.648, 1.296, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.648 std_dev=0.648
O4'	B	0, 0.000, 0.764, 1.527, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.764 std_dev=0.764
C2'	A	0, 0.000, 0.818, 1.636, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.818 std_dev=0.818
O4'	A	0, 0.000, 0.820, 1.639, 1.639 max_d=1.639 avg_d=0.820 std_dev=0.820
C3'	B	0, 0.000, 0.985, 1.970, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.985 std_dev=0.985
O3'	B	0, 0.000, 1.063, 2.125, 2.125 max_d=2.125 avg_d=1.063 std_dev=1.063
C4	B	0, 0.000, 1.167, 2.334, 2.334 max_d=2.334 avg_d=1.167 std_dev=1.167
O2'	A	0, 0.000, 1.171, 2.343, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.171 std_dev=1.171
C4'	B	0, 0.000, 1.200, 2.399, 2.399 max_d=2.399 avg_d=1.200 std_dev=1.200
C3'	A	0, 0.000, 1.240, 2.480, 2.480 max_d=2.480 avg_d=1.240 std_dev=1.240
N1	B	0, 0.000, 1.304, 2.608, 2.608 max_d=2.608 avg_d=1.304 std_dev=1.304
C4'	A	0, 0.000, 1.326, 2.652, 2.652 max_d=2.652 avg_d=1.326 std_dev=1.326
N2	B	0, 0.000, 1.355, 2.710, 2.710 max_d=2.710 avg_d=1.355 std_dev=1.355
N9	B	0, 0.000, 1.393, 2.787, 2.787 max_d=2.787 avg_d=1.393 std_dev=1.393
O3'	A	0, 0.000, 1.555, 3.111, 3.111 max_d=3.111 avg_d=1.555 std_dev=1.555
O5'	A	0, 0.000, 1.659, 3.317, 3.317 max_d=3.317 avg_d=1.659 std_dev=1.659
OP2	A	0, 0.000, 1.818, 3.636, 3.636 max_d=3.636 avg_d=1.818 std_dev=1.818
C5'	A	0, 0.000, 1.841, 3.681, 3.681 max_d=3.681 avg_d=1.841 std_dev=1.841
P	A	0, 0.000, 1.934, 3.868, 3.868 max_d=3.868 avg_d=1.934 std_dev=1.934
C5'	B	0, 0.000, 1.954, 3.909, 3.909 max_d=3.909 avg_d=1.954 std_dev=1.954
O5'	B	0, 0.000, 2.181, 4.363, 4.363 max_d=4.363 avg_d=2.181 std_dev=2.181
OP1	A	0, 0.000, 2.254, 4.509, 4.509 max_d=4.509 avg_d=2.254 std_dev=2.254
C5	B	0, 0.000, 2.328, 4.655, 4.655 max_d=4.655 avg_d=2.328 std_dev=2.328
C6	B	0, 0.000, 2.411, 4.823, 4.823 max_d=4.823 avg_d=2.411 std_dev=2.411
C8	B	0, 0.000, 2.701, 5.401, 5.401 max_d=5.401 avg_d=2.701 std_dev=2.701
P	B	0, 0.000, 3.066, 6.131, 6.131 max_d=6.131 avg_d=3.066 std_dev=3.066
N7	B	0, 0.000, 3.296, 6.592, 6.592 max_d=6.592 avg_d=3.296 std_dev=3.296
OP2	B	0, 0.000, 3.345, 6.689, 6.689 max_d=6.689 avg_d=3.345 std_dev=3.345
O6	B	0, 0.000, 3.355, 6.711, 6.711 max_d=6.711 avg_d=3.355 std_dev=3.355
OP1	B	0, 0.000, 3.612, 7.223, 7.223 max_d=7.223 avg_d=3.612 std_dev=3.612

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.27	0.01	0.07	0.12	0.22	0.12
C2	0.02	0.00	0.22	0.22	0.01	0.04	0.02	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.18	0.12	0.06	0.02	0.05
C2'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.10	0.00	0.05	0.18	0.13	0.03	0.21	0.11	0.32	0.00	0.01	0.03	0.39	0.47	0.56	0.47
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.40	0.00	0.40	0.02	0.32	0.21	0.32	0.44	0.10	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.11	0.12
C4	0.00	0.01	0.10	0.40	0.00	0.15	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.19	0.02	0.43	0.35	0.31	0.36
C4'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.15	0.00	0.26	0.01	0.26	0.08	0.03	0.17	0.20	0.23	0.02	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02
C5	0.00	0.02	0.05	0.40	0.00	0.26	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.41	0.25	0.12	0.52	0.39	0.37	0.44
C5'	0.07	0.08	0.18	0.02	0.16	0.01	0.29	0.00	0.26	0.03	0.01	0.19	0.23	0.04	0.15	0.01	0.00	0.16	0.12	0.01
C6	0.00	0.01	0.13	0.32	0.00	0.26	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.41	0.15	0.17	0.41	0.24	0.16	0.29
N1	0.01	0.00	0.03	0.21	0.00	0.08	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.04	0.01	0.15	0.05	0.04	0.06
N3	0.01	0.00	0.21	0.32	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.14	0.27	0.21	0.14	0.19
N4	0.01	0.01	0.11	0.44	0.00	0.17	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.26	0.26	0.03	0.49	0.45	0.42	0.44
O2	0.03	0.00	0.32	0.10	0.01	0.20	0.02	0.23	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.25	0.26	0.32	0.03	0.06	0.14	0.09
O2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.23	0.41	0.04	0.41	0.17	0.07	0.26	0.25	0.00	0.02	0.15	0.33	0.47	0.60	0.43
O3'	0.27	0.08	0.01	0.01	0.19	0.02	0.25	0.15	0.15	0.04	0.06	0.26	0.26	0.02	0.00	0.17	0.07	0.24	0.08	0.12
O4'	0.01	0.18	0.03	0.01	0.02	0.00	0.12	0.01	0.17	0.01	0.14	0.03	0.32	0.15	0.17	0.00	0.08	0.09	0.09	0.04
O5'	0.07	0.12	0.39	0.11	0.43	0.01	0.52	0.00	0.41	0.15	0.27	0.49	0.03	0.33	0.07	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.12	0.06	0.47	0.10	0.35	0.07	0.39	0.16	0.24	0.05	0.21	0.45	0.06	0.47	0.24	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.22	0.02	0.56	0.11	0.31	0.10	0.37	0.12	0.16	0.04	0.14	0.42	0.14	0.60	0.08	0.09	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.05	0.47	0.12	0.36	0.02	0.44	0.01	0.29	0.06	0.19	0.44	0.09	0.43	0.12	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.40	0.38	0.35	0.51	0.44	0.78	0.82	0.93	0.66	0.74	0.15	0.30	0.84	0.45	0.04	0.03	0.40	1.15	1.14	1.51	1.85	1.54
C2	0.30	0.32	0.38	0.22	0.71	0.30	1.20	0.60	1.33	1.12	0.87	0.18	0.24	1.40	0.69	0.12	0.13	0.36	0.95	1.64	1.14	1.58	1.26
C2'	0.32	0.49	0.57	0.59	0.55	0.67	0.75	1.13	0.88	0.65	0.76	0.28	0.40	0.78	0.50	0.19	0.22	0.55	1.51	1.03	2.00	2.33	1.97
C3'	0.38	0.32	0.07	0.01	0.28	0.03	0.15	0.48	0.07	0.19	0.16	0.40	0.36	0.12	0.29	0.37	0.29	0.15	0.82	0.08	1.38	1.61	1.28
C4	0.28	0.18	0.34	0.14	0.68	0.19	1.14	0.43	1.13	1.15	0.66	0.30	0.13	1.39	0.71	0.13	0.18	0.28	0.73	1.32	0.81	1.21	0.95
C4'	0.33	0.31	0.04	0.05	0.29	0.05	0.24	0.42	0.21	0.25	0.25	0.32	0.32	0.22	0.30	0.29	0.18	0.13	0.69	0.13	1.15	1.32	1.06
C5	0.24	0.27	0.38	0.28	0.56	0.33	0.82	0.60	0.83	0.75	0.57	0.07	0.23	0.90	0.52	0.08	0.01	0.34	0.89	0.91	1.02	1.35	1.12
C5'	0.54	0.53	0.19	0.02	0.64	0.08	0.76	0.26	0.79	0.73	0.68	0.36	0.51	0.80	0.64	0.38	0.18	0.33	0.48	0.85	0.96	1.00	0.80
C6	0.22	0.39	0.38	0.35	0.51	0.42	0.72	0.75	0.80	0.60	0.65	0.13	0.31	0.74	0.44	0.05	0.05	0.38	1.05	0.89	1.29	1.61	1.35
N1	0.25	0.39	0.39	0.31	0.59	0.39	0.93	0.74	1.06	0.81	0.79	0.03	0.29	1.01	0.54	0.07	0.02	0.39	1.06	1.27	1.33	1.70	1.40
N3	0.30	0.23	0.35	0.13	0.73	0.19	1.29	0.45	1.34	1.27	0.80	0.32	0.16	1.57	0.76	0.14	0.22	0.31	0.78	1.65	0.90	1.35	1.05
N4	0.28	0.06	0.28	0.00	0.64	0.04	1.14	0.22	1.05	1.31	0.54	0.42	0.02	1.50	0.76	0.17	0.30	0.19	0.50	1.25	0.51	0.92	0.68
O2	0.31	0.32	0.38	0.20	0.72	0.28	1.26	0.60	1.40	1.19	0.90	0.20	0.23	1.50	0.72	0.12	0.16	0.37	0.96	1.80	1.18	1.64	1.30
O2'	0.85	1.10	1.01	1.03	1.15	1.19	1.39	1.68	1.56	1.25	1.45	0.84	0.97	1.41	1.08	0.56	0.63	1.13	2.04	1.74	2.56	2.90	2.56
O3'	0.38	0.43	0.07	0.01	0.30	0.01	0.15	0.41	0.08	0.15	0.25	0.58	0.43	0.07	0.28	0.32	0.29	0.18	0.74	0.10	1.29	1.51	1.19
O4'	0.07	0.02	0.13	0.16	0.07	0.20	0.21	0.53	0.29	0.16	0.19	0.09	0.03	0.25	0.04	0.13	0.08	0.10	0.80	0.42	1.15	1.39	1.13
O5'	0.79	0.65	0.43	0.22	0.90	0.26	1.06	0.13	1.05	1.06	0.84	0.32	0.68	1.14	0.92	0.66	0.40	0.54	0.37	1.09	0.93	0.96	0.74
OP1	0.98	0.80	0.53	0.20	1.30	0.30	1.79	0.07	1.89	1.73	1.35	0.18	0.79	2.02	1.33	0.68	0.28	0.71	0.21	2.23	0.90	0.62	0.54
OP2	1.02	0.67	0.61	0.31	1.25	0.41	1.59	0.08	1.49	1.63	1.03	0.11	0.76	1.78	1.32	0.75	0.37	0.76	0.06	1.58	0.57	0.42	0.32
P	0.95	0.72	0.56	0.27	1.18	0.35	1.53	0.00	1.53	1.53	1.11	0.20	0.76	1.72	1.22	0.73	0.36	0.70	0.15	1.70	0.72	0.57	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04
C2	0.01	0.00	0.33	0.41	0.00	0.44	0.01	0.83	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.16	0.25	1.16	0.02	1.50	1.78	1.52
C2'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.16	0.00	0.06	0.02	0.12	0.17	0.25	0.40	0.33	0.11	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.06
C3'	0.02	0.41	0.00	0.00	0.17	0.00	0.05	0.01	0.14	0.22	0.30	0.52	0.39	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.04	0.05	0.02
C4	0.00	0.00	0.16	0.17	0.00	0.18	0.01	0.31	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.12	0.42	0.00	0.51	0.60	0.55
C4'	0.01	0.44	0.00	0.00	0.18	0.00	0.04	0.00	0.14	0.27	0.32	0.56	0.42	0.18	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.04	0.07	0.01	0.13	0.15	0.15
C5'	0.01	0.83	0.02	0.01	0.31	0.00	0.06	0.00	0.25	0.50	0.60	1.10	0.77	0.37	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00
C6	0.00	0.01	0.12	0.14	0.01	0.14	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.09	0.33	0.00	0.48	0.55	0.49
C8	0.02	0.02	0.17	0.22	0.02	0.27	0.01	0.50	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.16	0.71	0.01	0.75	0.86	0.76
N1	0.00	0.01	0.25	0.30	0.01	0.32	0.01	0.60	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.19	0.82	0.02	1.12	1.32	1.12
N2	0.02	0.01	0.40	0.52	0.00	0.56	0.02	1.10	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.17	0.30	1.53	0.05	2.07	2.44	2.04
N3	0.02	0.01	0.33	0.39	0.00	0.42	0.01	0.77	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.15	0.25	1.07	0.01	1.26	1.48	1.31
N7	0.01	0.02	0.11	0.14	0.01	0.18	0.01	0.37	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.09	0.53	0.02	0.59	0.72	0.59
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.08	0.00	0.06	0.05	0.03
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.01	0.03	0.05	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.05	0.01	0.10	0.07
O3'	0.10	0.16	0.05	0.01	0.13	0.01	0.11	0.01	0.13	0.05	0.16	0.17	0.15	0.07	0.09	0.06	0.00	0.05	0.02	0.11	0.08	0.05	0.01
O4'	0.01	0.25	0.01	0.01	0.12	0.00	0.04	0.01	0.09	0.16	0.19	0.30	0.25	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05
O5'	0.00	1.16	0.04	0.03	0.42	0.01	0.07	0.00	0.33	0.71	0.82	1.53	1.07	0.53	0.08	0.05	0.02	0.01	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01
O6	0.01	0.02	0.07	0.08	0.00	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.00	0.05	0.11	0.04	0.15	0.00	0.27	0.29	0.27
OP1	0.01	1.50	0.01	0.04	0.51	0.02	0.13	0.01	0.48	0.75	1.12	2.07	1.26	0.59	0.06	0.01	0.08	0.03	0.00	0.27	0.00	0.03	0.01
OP2	0.04	1.78	0.08	0.05	0.60	0.03	0.15	0.01	0.55	0.86	1.32	2.44	1.48	0.72	0.05	0.10	0.05	0.05	0.01	0.29	0.03	0.00	0.02
P	0.04	1.52	0.06	0.02	0.55	0.01	0.15	0.00	0.49	0.76	1.12	2.04	1.31	0.59	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.27	0.01	0.02	0.00